MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 53773

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_016024	ATG	2	6	224700	224705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753909
4502	NC_016024	GCTG	2	8	224725	224732	0 %	25 %	50 %	25 %	347753909
4503	NC_016024	GTCA	2	8	224763	224770	25 %	25 %	25 %	25 %	347753909
4504	NC_016024	CGG	2	6	224829	224834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753910
4505	NC_016024	CTGGCG	2	12	224835	224846	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347753910
4506	NC_016024	CTG	2	6	224860	224865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753910
4507	NC_016024	GCT	3	9	224868	224876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753910
4508	NC_016024	CTGC	2	8	224879	224886	0 %	25 %	25 %	50 %	347753910
4509	NC_016024	CGTC	2	8	224904	224911	0 %	25 %	25 %	50 %	347753910
4510	NC_016024	CCG	2	6	224923	224928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753910
4511	NC_016024	GGCCGT	2	12	224943	224954	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347753910
4512	NC_016024	GC	3	6	224976	224981	0 %	0 %	50 %	50 %	347753910
4513	NC_016024	TGG	2	6	225008	225013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753910
4514	NC_016024	TGC	2	6	225047	225052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753910
4515	NC_016024	CTGG	2	8	225063	225070	0 %	25 %	50 %	25 %	347753910
4516	NC_016024	CAC	2	6	225086	225091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347753910
4517	NC_016024	GCA	2	6	225127	225132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753910
4518	NC_016024	GGC	2	6	225143	225148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753910
4519	NC_016024	GTCC	2	8	225153	225160	0 %	25 %	25 %	50 %	347753910
4520	NC_016024	TGA	2	6	225179	225184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347753910
4521	NC_016024	CGA	2	6	225260	225265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753910
4522	NC_016024	GCC	2	6	225277	225282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753910
4523	NC_016024	GC	3	6	225288	225293	0 %	0 %	50 %	50 %	347753910
4524	NC_016024	CT	3	6	225350	225355	0 %	50 %	0 %	50 %	347753910
4525	NC_016024	CAG	2	6	225413	225418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753910
4526	NC_016024	CGT	2	6	225431	225436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753910
4527	NC_016024	GAGT	2	8	225448	225455	25 %	25 %	50 %	0 %	347753910
4528	NC_016024	TGGGGT	2	12	225493	225504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753911
4529	NC_016024	GCG	2	6	225520	225525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753911
4530	NC_016024	GGC	2	6	225554	225559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753911
4531	NC_016024	GCGG	2	8	225577	225584	0 %	0 %	75 %	25 %	347753911
4532	NC_016024	GAC	2	6	225648	225653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753911
4533	NC_016024	GC	3	6	225824	225829	0 %	0 %	50 %	50 %	347753911
4534	NC_016024	TCA	2	6	225886	225891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753911
4535	NC_016024	GCG	2	6	225898	225903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753911
4536	NC_016024	CGGC	2	8	225961	225968	0 %	0 %	50 %	50 %	347753911
4537	NC_016024	CGG	2	6	225985	225990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753911
4538	NC_016024	CGG	2	6	225992	225997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753911
4539	NC_016024	GCGCG	2	10	226034	226043	0 %	0 %	60 %	40 %	347753911
4540	NC_016024	CCG	2	6	226072	226077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753911
4541	NC_016024	AGTG	2	8	227274	227281	25 %	25 %	50 %	0 %	347753912
4542	NC_016024	CGG	2	6	227400	227405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753912
4543	NC_016024	GCGG	2	8	227435	227442	0 %	0 %	75 %	25 %	347753912
4544	NC_016024	GTC	2	6	227460	227465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753912
4545	NC_016024	GTG	2	6	227472	227477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753912
4546	NC_016024	GACA	2	8	227537	227544	50 %	0 %	25 %	25 %	347753912
4547	NC_016024	GTG	2	6	227556	227561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753912
4548	NC_016024	CGA	2	6	227573	227578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753912
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4551	NC_016024	GGT	2	6	227705	227710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753912
4552	NC_016024	GAA	2	6	227775	227780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347753912
4553	NC_016024	CG	3	6	227797	227802	0 %	0 %	50 %	50 %	347753912
4554	NC_016024	CTG	3	9	227898	227906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753912
4555	NC_016024	GTG	3	9	227946	227954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753912
4556	NC_016024	TGC	2	6	227990	227995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753912
4557	NC_016024	TGG	2	6	228055	228060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753912
4558	NC_016024	AGGC	2	8	228065	228072	25 %	0 %	50 %	25 %	347753912
4559	NC_016024	GC	3	6	228117	228122	0 %	0 %	50 %	50 %	347753912
4560	NC_016024	GC	3	6	228130	228135	0 %	0 %	50 %	50 %	347753912
4561	NC_016024	G	6	6	228233	228238	0 %	0 %	100 %	0 %	347753912
4562	NC_016024	GTC	2	6	228348	228353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753912
4563	NC_016024	CG	3	6	228363	228368	0 %	0 %	50 %	50 %	347753912
4564	NC_016024	CTG	2	6	228369	228374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753912
4565	NC_016024	GGC	2	6	228395	228400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347753912
4566	NC_016024	CG	3	6	228468	228473	0 %	0 %	50 %	50 %	347753913
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4569	NC_016024	GCT	2	6	228530	228535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753913
4570	NC_016024	CCTG	2	8	228566	228573	0 %	25 %	25 %	50 %	347753913
4571	NC_016024	CTG	2	6	228588	228593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753913
4572	NC_016024	GCTG	2	8	228623	228630	0 %	25 %	50 %	25 %	347753913
4573	NC_016024	CGC	2	6	228666	228671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753913
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4580	NC_016024	GCCC	2	8	229010	229017	0 %	0 %	25 %	75 %	347753913
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4598	NC_016024	A	6	6	229875	229880	100 %	0 %	0 %	0 %	347753913
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4601	NC_016024	GTCCG	2	10	230027	230036	0 %	20 %	40 %	40 %	347753914
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4605	NC_016024	CA	3	6	230089	230094	50 %	0 %	0 %	50 %	347753914
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4623	NC_016024	TG	3	6	230882	230887	0 %	50 %	50 %	0 %	347753915
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4746	NC_016024	GC	3	6	238518	238523	0 %	0 %	50 %	50 %	347753918
4747	NC_016024	CTT	2	6	238712	238717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347753918
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4751	NC_016024	GC	3	6	238898	238903	0 %	0 %	50 %	50 %	347753918
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4753	NC_016024	GAC	2	6	239007	239012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753918
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4867	NC_016024	GCC	2	6	245979	245984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753924
4868	NC_016024	AGC	2	6	245993	245998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753924
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4871	NC_016024	CCG	3	9	246195	246203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347753924
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4987	NC_016024	CAT	2	6	250527	250532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347753927
4988	NC_016024	GTG	2	6	250552	250557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347753927
4989	NC_016024	TCCG	2	8	250593	250600	0 %	25 %	25 %	50 %	347753927
4990	NC_016024	CGTGG	2	10	250602	250611	0 %	20 %	60 %	20 %	347753927
4991	NC_016024	CAG	2	6	250612	250617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753927
4992	NC_016024	TCG	2	6	250626	250631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753927
4993	NC_016024	GCCGC	2	10	250661	250670	0 %	0 %	40 %	60 %	347753927
4994	NC_016024	TGACCG	2	12	250698	250709	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347753927
4995	NC_016024	A	6	6	250717	250722	100 %	0 %	0 %	0 %	347753927
4996	NC_016024	GTC	2	6	250732	250737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753927
4997	NC_016024	TGC	2	6	250903	250908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347753927
4998	NC_016024	CAG	2	6	251011	251016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347753927
4999	NC_016024	T	6	6	251017	251022	0 %	100 %	0 %	0 %	347753927
5000	NC_016024	GCCA	2	8	251081	251088	25 %	0 %	25 %	50 %	347753927

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