MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A chromosome

Total Repeats: 5719

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015949	ATGC	2	8	544	551	25 %	25 %	25 %	25 %	344995334
2	NC_015949	ATGT	2	8	595	602	25 %	50 %	25 %	0 %	344995334
3	NC_015949	AGAC	2	8	653	660	50 %	0 %	25 %	25 %	344995334
4	NC_015949	AAAC	2	8	989	996	75 %	0 %	0 %	25 %	344995334
5	NC_015949	TGGA	2	8	2633	2640	25 %	25 %	50 %	0 %	344995335
6	NC_015949	ATCT	2	8	2710	2717	25 %	50 %	0 %	25 %	344995335
7	NC_015949	TAGA	2	8	3027	3034	50 %	25 %	25 %	0 %	344995336
8	NC_015949	GTTT	2	8	3106	3113	0 %	75 %	25 %	0 %	344995336
9	NC_015949	CTTG	2	8	3412	3419	0 %	50 %	25 %	25 %	344995336
10	NC_015949	GATT	2	8	4141	4148	25 %	50 %	25 %	0 %	344995337
11	NC_015949	TGTC	2	8	5164	5171	0 %	50 %	25 %	25 %	344995338
12	NC_015949	GCGG	2	8	5481	5488	0 %	0 %	75 %	25 %	344995338
13	NC_015949	CTTT	2	8	5731	5738	0 %	75 %	0 %	25 %	344995338
14	NC_015949	AAGA	2	8	6124	6131	75 %	0 %	25 %	0 %	344995339
15	NC_015949	AGAT	2	8	6280	6287	50 %	25 %	25 %	0 %	344995339
16	NC_015949	TGAT	2	8	6904	6911	25 %	50 %	25 %	0 %	344995340
17	NC_015949	TACT	2	8	6921	6928	25 %	50 %	0 %	25 %	344995340
18	NC_015949	GAAG	2	8	10485	10492	50 %	0 %	50 %	0 %	344995341
19	NC_015949	AGAT	2	8	10579	10586	50 %	25 %	25 %	0 %	344995341
20	NC_015949	AAAG	2	8	10589	10596	75 %	0 %	25 %	0 %	344995341
21	NC_015949	ATTA	2	8	10712	10719	50 %	50 %	0 %	0 %	344995341
22	NC_015949	AAAG	2	8	11479	11486	75 %	0 %	25 %	0 %	344995342
23	NC_015949	CCAG	2	8	11520	11527	25 %	0 %	25 %	50 %	344995342
24	NC_015949	GACA	2	8	13959	13966	50 %	0 %	25 %	25 %	344995343
25	NC_015949	ATCA	2	8	14142	14149	50 %	25 %	0 %	25 %	344995343
26	NC_015949	CAGA	2	8	14383	14390	50 %	0 %	25 %	25 %	344995343
27	NC_015949	CAAG	2	8	14591	14598	50 %	0 %	25 %	25 %	344995343
28	NC_015949	TGAC	2	8	14816	14823	25 %	25 %	25 %	25 %	344995343
29	NC_015949	AAAC	2	8	15053	15060	75 %	0 %	0 %	25 %	344995343
30	NC_015949	CAAG	2	8	15218	15225	50 %	0 %	25 %	25 %	344995343
31	NC_015949	ACAT	2	8	15607	15614	50 %	25 %	0 %	25 %	344995343
32	NC_015949	TAAG	2	8	15635	15642	50 %	25 %	25 %	0 %	344995343
33	NC_015949	GACA	2	8	15675	15682	50 %	0 %	25 %	25 %	344995343
34	NC_015949	ACAA	2	8	15757	15764	75 %	0 %	0 %	25 %	344995343
35	NC_015949	GACA	2	8	16170	16177	50 %	0 %	25 %	25 %	344995343
36	NC_015949	AAGA	2	8	16742	16749	75 %	0 %	25 %	0 %	344995344
37	NC_015949	GTTA	2	8	17834	17841	25 %	50 %	25 %	0 %	344995345
38	NC_015949	GCCA	2	8	18366	18373	25 %	0 %	25 %	50 %	344995345
39	NC_015949	GGAT	2	8	18788	18795	25 %	25 %	50 %	0 %	344995345
40	NC_015949	TGGA	2	8	20148	20155	25 %	25 %	50 %	0 %	344995345
41	NC_015949	TATG	2	8	21815	21822	25 %	50 %	25 %	0 %	344995345
42	NC_015949	GAGC	2	8	22674	22681	25 %	0 %	50 %	25 %	344995345
43	NC_015949	GGAG	2	8	22738	22745	25 %	0 %	75 %	0 %	344995345
44	NC_015949	ACAG	2	8	23400	23407	50 %	0 %	25 %	25 %	344995345
45	NC_015949	CAAT	2	8	23533	23540	50 %	25 %	0 %	25 %	344995345
46	NC_015949	GATA	2	8	23837	23844	50 %	25 %	25 %	0 %	344995346
47	NC_015949	TTTA	2	8	24238	24245	25 %	75 %	0 %	0 %	344995346
48	NC_015949	ACTA	2	8	24875	24882	50 %	25 %	0 %	25 %	344995347
49	NC_015949	TGGA	2	8	25155	25162	25 %	25 %	50 %	0 %	344995347
50	NC_015949	GACC	2	8	25727	25734	25 %	0 %	25 %	50 %	344995347
51	NC_015949	TATT	2	8	26335	26342	25 %	75 %	0 %	0 %	344995347
52	NC_015949	TGGA	2	8	26718	26725	25 %	25 %	50 %	0 %	344995347
53	NC_015949	CAAA	2	8	28812	28819	75 %	0 %	0 %	25 %	344995347
54	NC_015949	CAAT	2	8	29193	29200	50 %	25 %	0 %	25 %	344995347
55	NC_015949	AGTA	2	8	30563	30570	50 %	25 %	25 %	0 %	344995348
56	NC_015949	ACAA	2	8	31037	31044	75 %	0 %	0 %	25 %	344995348
57	NC_015949	TTGC	2	8	31410	31417	0 %	50 %	25 %	25 %	344995348
58	NC_015949	GTTT	2	8	31580	31587	0 %	75 %	25 %	0 %	344995348
59	NC_015949	ACAT	2	8	31784	31791	50 %	25 %	0 %	25 %	344995348
60	NC_015949	CAGG	2	8	32127	32134	25 %	0 %	50 %	25 %	344995349
61	NC_015949	AAGA	2	8	32180	32187	75 %	0 %	25 %	0 %	344995349
62	NC_015949	TGGA	2	8	32305	32312	25 %	25 %	50 %	0 %	344995349
63	NC_015949	TTTA	2	8	32392	32399	25 %	75 %	0 %	0 %	344995349
64	NC_015949	AACA	2	8	32991	32998	75 %	0 %	0 %	25 %	344995349
65	NC_015949	GGAA	2	8	33274	33281	50 %	0 %	50 %	0 %	344995349
66	NC_015949	ATCT	2	8	33970	33977	25 %	50 %	0 %	25 %	344995350
67	NC_015949	TCCT	2	8	34307	34314	0 %	50 %	0 %	50 %	344995350
68	NC_015949	CCAA	2	8	35018	35025	50 %	0 %	0 %	50 %	344995351
69	NC_015949	TTAT	2	8	35249	35256	25 %	75 %	0 %	0 %	344995351
70	NC_015949	TTGT	2	8	35387	35394	0 %	75 %	25 %	0 %	344995351
71	NC_015949	TTGA	2	8	35488	35495	25 %	50 %	25 %	0 %	344995351
72	NC_015949	TCAA	2	8	35564	35571	50 %	25 %	0 %	25 %	344995351
73	NC_015949	AATG	2	8	35576	35583	50 %	25 %	25 %	0 %	344995351
74	NC_015949	CAAT	2	8	36045	36052	50 %	25 %	0 %	25 %	344995351
75	NC_015949	AATA	2	8	36313	36320	75 %	25 %	0 %	0 %	344995351
76	NC_015949	GAAT	2	8	36414	36421	50 %	25 %	25 %	0 %	344995351
77	NC_015949	AGAA	2	8	36599	36606	75 %	0 %	25 %	0 %	344995352
78	NC_015949	CATG	2	8	36828	36835	25 %	25 %	25 %	25 %	344995352
79	NC_015949	GGAA	2	8	37250	37257	50 %	0 %	50 %	0 %	344995353
80	NC_015949	CATA	2	8	37663	37670	50 %	25 %	0 %	25 %	344995354
81	NC_015949	GCAG	2	8	37827	37834	25 %	0 %	50 %	25 %	344995354
82	NC_015949	CAGT	2	8	38468	38475	25 %	25 %	25 %	25 %	344995354
83	NC_015949	ACAT	2	8	38847	38854	50 %	25 %	0 %	25 %	344995355
84	NC_015949	AAAG	2	8	39183	39190	75 %	0 %	25 %	0 %	344995355
85	NC_015949	GTTT	2	8	39417	39424	0 %	75 %	25 %	0 %	344995355
86	NC_015949	ATCC	2	8	40044	40051	25 %	25 %	0 %	50 %	344995355
87	NC_015949	GAAA	2	8	40069	40076	75 %	0 %	25 %	0 %	344995355
88	NC_015949	AGCA	2	8	40533	40540	50 %	0 %	25 %	25 %	344995356
89	NC_015949	ACCA	2	8	41261	41268	50 %	0 %	0 %	50 %	344995357
90	NC_015949	ACAA	2	8	41286	41293	75 %	0 %	0 %	25 %	344995357
91	NC_015949	GATG	2	8	41636	41643	25 %	25 %	50 %	0 %	344995357
92	NC_015949	TGTT	2	8	42409	42416	0 %	75 %	25 %	0 %	344995357
93	NC_015949	CCTT	2	8	43021	43028	0 %	50 %	0 %	50 %	344995358
94	NC_015949	ACCT	2	8	43585	43592	25 %	25 %	0 %	50 %	344995359
95	NC_015949	AAAC	2	8	43710	43717	75 %	0 %	0 %	25 %	344995359
96	NC_015949	CTTC	2	8	43793	43800	0 %	50 %	0 %	50 %	344995359
97	NC_015949	GCAA	2	8	44755	44762	50 %	0 %	25 %	25 %	344995360
98	NC_015949	GTCT	2	8	45242	45249	0 %	50 %	25 %	25 %	344995360
99	NC_015949	CTCA	2	8	45449	45456	25 %	25 %	0 %	50 %	344995361
100	NC_015949	AAAG	2	8	46329	46336	75 %	0 %	25 %	0 %	344995362
101	NC_015949	ATTT	2	8	46622	46629	25 %	75 %	0 %	0 %	344995362
102	NC_015949	ATTT	2	8	47346	47353	25 %	75 %	0 %	0 %	344995363
103	NC_015949	AATG	2	8	47365	47372	50 %	25 %	25 %	0 %	344995363
104	NC_015949	ATGG	2	8	47478	47485	25 %	25 %	50 %	0 %	344995364
105	NC_015949	AAAG	2	8	47550	47557	75 %	0 %	25 %	0 %	344995364
106	NC_015949	TTTG	2	8	48067	48074	0 %	75 %	25 %	0 %	344995364
107	NC_015949	CTTT	2	8	48126	48133	0 %	75 %	0 %	25 %	344995364
108	NC_015949	ATCA	2	8	48330	48337	50 %	25 %	0 %	25 %	344995365
109	NC_015949	TGAT	2	8	48557	48564	25 %	50 %	25 %	0 %	344995365
110	NC_015949	AAAG	2	8	50624	50631	75 %	0 %	25 %	0 %	344995368
111	NC_015949	ATTT	2	8	50799	50806	25 %	75 %	0 %	0 %	344995368
112	NC_015949	GATA	2	8	50977	50984	50 %	25 %	25 %	0 %	344995368
113	NC_015949	GGAA	2	8	51465	51472	50 %	0 %	50 %	0 %	344995369
114	NC_015949	TGGA	2	8	51496	51503	25 %	25 %	50 %	0 %	344995369
115	NC_015949	GATT	2	8	52812	52819	25 %	50 %	25 %	0 %	344995370
116	NC_015949	AAGA	2	8	53771	53778	75 %	0 %	25 %	0 %	344995371
117	NC_015949	AACA	2	8	54854	54861	75 %	0 %	0 %	25 %	344995372
118	NC_015949	AAAG	2	8	55113	55120	75 %	0 %	25 %	0 %	344995372
119	NC_015949	GAAG	2	8	55500	55507	50 %	0 %	50 %	0 %	344995372
120	NC_015949	ACGA	2	8	57754	57761	50 %	0 %	25 %	25 %	344995375
121	NC_015949	TTTG	2	8	57846	57853	0 %	75 %	25 %	0 %	344995375
122	NC_015949	GCAA	2	8	57861	57868	50 %	0 %	25 %	25 %	344995375
123	NC_015949	ACAT	2	8	58093	58100	50 %	25 %	0 %	25 %	344995375
124	NC_015949	TTGA	2	8	58298	58305	25 %	50 %	25 %	0 %	344995376
125	NC_015949	GTTT	2	8	58861	58868	0 %	75 %	25 %	0 %	344995376
126	NC_015949	AGCA	2	8	59565	59572	50 %	0 %	25 %	25 %	344995377
127	NC_015949	GAGG	2	8	60427	60434	25 %	0 %	75 %	0 %	344995378
128	NC_015949	GGTT	2	8	60703	60710	0 %	50 %	50 %	0 %	344995378
129	NC_015949	CATG	2	8	60896	60903	25 %	25 %	25 %	25 %	344995378
130	NC_015949	CAGA	2	8	61996	62003	50 %	0 %	25 %	25 %	344995379
131	NC_015949	TTAG	2	8	63001	63008	25 %	50 %	25 %	0 %	344995380
132	NC_015949	CATT	2	8	63502	63509	25 %	50 %	0 %	25 %	344995380
133	NC_015949	TCAC	2	8	63919	63926	25 %	25 %	0 %	50 %	344995380
134	NC_015949	TGTT	2	8	64013	64020	0 %	75 %	25 %	0 %	344995380
135	NC_015949	CTTT	2	8	64036	64043	0 %	75 %	0 %	25 %	344995380
136	NC_015949	TCTT	2	8	64353	64360	0 %	75 %	0 %	25 %	344995380
137	NC_015949	GATG	2	8	64549	64556	25 %	25 %	50 %	0 %	344995380
138	NC_015949	CTTG	2	8	65051	65058	0 %	50 %	25 %	25 %	344995380
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