MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Caldicellulosiruptor lactoaceticus 6A chromosome

Total Repeats: 50672

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015949	AT	3	6	26124	26129	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
502	NC_015949	CGA	2	6	26167	26172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995347
503	NC_015949	AT	4	8	26186	26193	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
504	NC_015949	TAC	2	6	26194	26199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995347
505	NC_015949	CAT	2	6	26208	26213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995347
506	NC_015949	TATT	2	8	26335	26342	25 %	75 %	0 %	0 %	344995347
507	NC_015949	T	6	6	26345	26350	0 %	100 %	0 %	0 %	344995347
508	NC_015949	CAA	2	6	26442	26447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995347
509	NC_015949	CCAACA	3	18	26459	26476	50 %	0 %	0 %	50 %	344995347
510	NC_015949	CCGACA	2	12	26477	26488	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344995347
511	NC_015949	GACGGT	2	12	26527	26538	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	344995347
512	NC_015949	ACCGAC	2	12	26542	26553	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	344995347
513	NC_015949	GTACA	2	10	26594	26603	40 %	20 %	20 %	20 %	344995347
514	NC_015949	TGGA	2	8	26718	26725	25 %	25 %	50 %	0 %	344995347
515	NC_015949	TAT	2	6	26825	26830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995347
516	NC_015949	TGGTCA	2	12	26945	26956	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	344995347
517	NC_015949	ATA	2	6	26979	26984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995347
518	NC_015949	CAACAC	2	12	27078	27089	50 %	0 %	0 %	50 %	344995347
519	NC_015949	AAC	2	6	27103	27108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995347
520	NC_015949	CCAACA	2	12	27119	27130	50 %	0 %	0 %	50 %	344995347
521	NC_015949	CTG	2	6	27180	27185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344995347
522	NC_015949	TTAAGG	2	12	27273	27284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995347
523	NC_015949	AAGGT	2	10	27326	27335	40 %	20 %	40 %	0 %	344995347
524	NC_015949	GCA	2	6	27393	27398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995347
525	NC_015949	AGC	2	6	27403	27408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995347
526	NC_015949	AGT	2	6	27478	27483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995347
527	NC_015949	GCA	2	6	27495	27500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995347
528	NC_015949	CAA	2	6	27579	27584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995347
529	NC_015949	AAG	2	6	27599	27604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995347
530	NC_015949	TA	3	6	27614	27619	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
531	NC_015949	GAT	2	6	27620	27625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995347
532	NC_015949	AGA	2	6	27660	27665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995347
533	NC_015949	TTAAGG	2	12	27720	27731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995347
534	NC_015949	AAGGT	2	10	27773	27782	40 %	20 %	40 %	0 %	344995347
535	NC_015949	GCA	2	6	27840	27845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995347
536	NC_015949	AGC	2	6	27850	27855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995347
537	NC_015949	AGT	2	6	27925	27930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995347
538	NC_015949	GCA	2	6	27942	27947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995347
539	NC_015949	CAA	2	6	28026	28031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995347
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541	NC_015949	TA	3	6	28061	28066	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
542	NC_015949	GAT	2	6	28067	28072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995347
543	NC_015949	GCA	2	6	28112	28117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995347
544	NC_015949	GTA	2	6	28119	28124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995347
545	NC_015949	CAA	2	6	28194	28199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995347
546	NC_015949	TGT	2	6	28240	28245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995347
547	NC_015949	TGG	2	6	28348	28353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344995347
548	NC_015949	ATT	2	6	28386	28391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995347
549	NC_015949	GAT	2	6	28424	28429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995347
550	NC_015949	CAA	2	6	28467	28472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995347
551	NC_015949	TTG	2	6	28482	28487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995347
552	NC_015949	GAA	2	6	28502	28507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995347
553	NC_015949	GAA	2	6	28513	28518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995347
554	NC_015949	AG	4	8	28586	28593	50 %	0 %	50 %	0 %	344995347
555	NC_015949	ATT	2	6	28704	28709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995347
556	NC_015949	TAA	2	6	28714	28719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995347
557	NC_015949	CTT	2	6	28731	28736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	344995347
558	NC_015949	TA	3	6	28757	28762	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
559	NC_015949	TCA	2	6	28787	28792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995347
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561	NC_015949	TTA	2	6	28927	28932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995347
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563	NC_015949	GAA	2	6	29011	29016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995347
564	NC_015949	GAG	2	6	29082	29087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344995347
565	NC_015949	TAGCAA	2	12	29136	29147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	344995347
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568	NC_015949	TAT	2	6	29294	29299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	344995347
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570	NC_015949	GGA	2	6	29357	29362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	344995347
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572	NC_015949	ATA	2	6	29457	29462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995347
573	NC_015949	ATG	2	6	29475	29480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995347
574	NC_015949	ATA	2	6	29588	29593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995347
575	NC_015949	AT	3	6	29672	29677	50 %	50 %	0 %	0 %	344995347
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581	NC_015949	AGTA	2	8	30563	30570	50 %	25 %	25 %	0 %	344995348
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589	NC_015949	TGG	2	6	30984	30989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344995348
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595	NC_015949	GCA	2	6	31142	31147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995348
596	NC_015949	TGC	2	6	31169	31174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344995348
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598	NC_015949	ATG	2	6	31240	31245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995348
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600	NC_015949	AGC	2	6	31400	31405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995348
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602	NC_015949	AAT	2	6	31448	31453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995348
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604	NC_015949	A	6	6	31495	31500	100 %	0 %	0 %	0 %	344995348
605	NC_015949	ACA	3	9	31560	31568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995348
606	NC_015949	GTTT	2	8	31580	31587	0 %	75 %	25 %	0 %	344995348
607	NC_015949	CAG	2	6	31609	31614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	344995348
608	NC_015949	CTG	2	6	31672	31677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	344995348
609	NC_015949	GAA	2	6	31678	31683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	344995348
610	NC_015949	CAT	2	6	31725	31730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	344995348
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612	NC_015949	ACAT	2	8	31784	31791	50 %	25 %	0 %	25 %	344995348
613	NC_015949	GAT	2	6	31839	31844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	344995348
614	NC_015949	GC	3	6	31900	31905	0 %	0 %	50 %	50 %	344995348
615	NC_015949	TGG	2	6	31928	31933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	344995348
616	NC_015949	CAA	2	6	31969	31974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	344995348
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618	NC_015949	CA	3	6	32080	32085	50 %	0 %	0 %	50 %	344995349
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622	NC_015949	AAT	2	6	32206	32211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	344995349
623	NC_015949	GT	3	6	32241	32246	0 %	50 %	50 %	0 %	344995349
624	NC_015949	TGGA	2	8	32305	32312	25 %	25 %	50 %	0 %	344995349
625	NC_015949	TTG	2	6	32316	32321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	344995349
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