MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Corynebacterium variabile DSM 44702 chromosome

Total Repeats: 2263

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015859	CACCG	2	10	162	171	20 %	0 %	20 %	60 %	340792957
2	NC_015859	ACCAC	2	10	1574	1583	40 %	0 %	0 %	60 %	340792957
3	NC_015859	CGCTG	2	10	6487	6496	0 %	20 %	40 %	40 %	340792961
4	NC_015859	GGGGA	2	10	10820	10829	20 %	0 %	80 %	0 %	340792964
5	NC_015859	GTGGG	2	10	10990	10999	0 %	20 %	80 %	0 %	340792965
6	NC_015859	CTCCG	2	10	15444	15453	0 %	20 %	20 %	60 %	340792969
7	NC_015859	CCGTG	2	10	15973	15982	0 %	20 %	40 %	40 %	340792970
8	NC_015859	CCGGT	2	10	18653	18662	0 %	20 %	40 %	40 %	340792971
9	NC_015859	AGGCG	2	10	19670	19679	20 %	0 %	60 %	20 %	340792972
10	NC_015859	CCTCG	2	10	21784	21793	0 %	20 %	20 %	60 %	340792974
11	NC_015859	CTGGG	2	10	22454	22463	0 %	20 %	60 %	20 %	340792974
12	NC_015859	GGGGA	2	10	23501	23510	20 %	0 %	80 %	0 %	340792975
13	NC_015859	GGGGC	2	10	25785	25794	0 %	0 %	80 %	20 %	340792977
14	NC_015859	GCTCC	2	10	25855	25864	0 %	20 %	20 %	60 %	340792977
15	NC_015859	GACCG	2	10	25943	25952	20 %	0 %	40 %	40 %	340792977
16	NC_015859	CCCTG	2	10	26094	26103	0 %	20 %	20 %	60 %	340792977
17	NC_015859	CCCGC	2	10	29228	29237	0 %	0 %	20 %	80 %	340792978
18	NC_015859	GACCG	2	10	29684	29693	20 %	0 %	40 %	40 %	340792978
19	NC_015859	TCCAC	2	10	30626	30635	20 %	20 %	0 %	60 %	340792979
20	NC_015859	GGAAG	2	10	34273	34282	40 %	0 %	60 %	0 %	340792982
21	NC_015859	CACCG	2	10	35496	35505	20 %	0 %	20 %	60 %	340792984
22	NC_015859	CCACC	2	10	36732	36741	20 %	0 %	0 %	80 %	340792984
23	NC_015859	GGTCT	2	10	37272	37281	0 %	40 %	40 %	20 %	340792985
24	NC_015859	GCCGG	2	10	37661	37670	0 %	0 %	60 %	40 %	340792985
25	NC_015859	GACCT	2	10	40130	40139	20 %	20 %	20 %	40 %	340792987
26	NC_015859	AGGGG	2	10	41285	41294	20 %	0 %	80 %	0 %	340792988
27	NC_015859	GGCGG	2	10	41462	41471	0 %	0 %	80 %	20 %	340792988
28	NC_015859	ACGAC	2	10	41706	41715	40 %	0 %	20 %	40 %	340792988
29	NC_015859	CATGA	2	10	41813	41822	40 %	20 %	20 %	20 %	340792988
30	NC_015859	GAACG	2	10	44397	44406	40 %	0 %	40 %	20 %	340792991
31	NC_015859	CGTCC	2	10	46401	46410	0 %	20 %	20 %	60 %	340792992
32	NC_015859	GCGCG	2	10	49427	49436	0 %	0 %	60 %	40 %	340792995
33	NC_015859	GACCG	2	10	50360	50369	20 %	0 %	40 %	40 %	340792996
34	NC_015859	AGACC	2	10	50728	50737	40 %	0 %	20 %	40 %	340792996
35	NC_015859	CGGTG	2	10	52122	52131	0 %	20 %	60 %	20 %	340792997
36	NC_015859	CCCCA	2	10	52197	52206	20 %	0 %	0 %	80 %	340792997
37	NC_015859	GCCGG	2	10	52895	52904	0 %	0 %	60 %	40 %	340792997
38	NC_015859	GGGGT	2	10	53390	53399	0 %	20 %	80 %	0 %	340792998
39	NC_015859	GGCGC	2	10	54029	54038	0 %	0 %	60 %	40 %	340792998
40	NC_015859	ACCGG	2	10	57183	57192	20 %	0 %	40 %	40 %	340793001
41	NC_015859	GTCCG	2	10	58875	58884	0 %	20 %	40 %	40 %	340793005
42	NC_015859	CCGGT	2	10	58977	58986	0 %	20 %	40 %	40 %	340793005
43	NC_015859	CTGTG	2	10	62411	62420	0 %	40 %	40 %	20 %	340793010
44	NC_015859	CCGTC	2	10	63890	63899	0 %	20 %	20 %	60 %	340793011
45	NC_015859	CAGGG	2	10	64678	64687	20 %	0 %	60 %	20 %	340793011
46	NC_015859	CGGGG	2	10	65322	65331	0 %	0 %	80 %	20 %	340793012
47	NC_015859	GGTGA	2	10	66833	66842	20 %	20 %	60 %	0 %	340793013
48	NC_015859	TGGCC	2	10	67524	67533	0 %	20 %	40 %	40 %	340793014
49	NC_015859	CGCTC	2	10	68109	68118	0 %	20 %	20 %	60 %	340793016
50	NC_015859	GACCG	2	10	76659	76668	20 %	0 %	40 %	40 %	340793018
51	NC_015859	CGCGG	2	10	76675	76684	0 %	0 %	60 %	40 %	340793018
52	NC_015859	CACCG	2	10	77280	77289	20 %	0 %	20 %	60 %	340793018
53	NC_015859	ACGGC	2	10	79490	79499	20 %	0 %	40 %	40 %	340793020
54	NC_015859	CCGTG	2	10	80037	80046	0 %	20 %	40 %	40 %	340793020
55	NC_015859	CGCGC	2	10	80515	80524	0 %	0 %	40 %	60 %	340793020
56	NC_015859	CAGGT	2	10	80837	80846	20 %	20 %	40 %	20 %	340793020
57	NC_015859	CGGGG	2	10	83199	83208	0 %	0 %	80 %	20 %	340793022
58	NC_015859	GAGCA	2	10	83450	83459	40 %	0 %	40 %	20 %	340793022
59	NC_015859	GAGAT	2	10	85538	85547	40 %	20 %	40 %	0 %	340793024
60	NC_015859	CACTG	2	10	88587	88596	20 %	20 %	20 %	40 %	340793026
61	NC_015859	GCCGG	2	10	91059	91068	0 %	0 %	60 %	40 %	340793030
62	NC_015859	GTGCT	2	10	94953	94962	0 %	40 %	40 %	20 %	340793033
63	NC_015859	GCTGC	2	10	99297	99306	0 %	20 %	40 %	40 %	340793037
64	NC_015859	CGGTC	2	10	100124	100133	0 %	20 %	40 %	40 %	340793038
65	NC_015859	TGCAC	2	10	104366	104375	20 %	20 %	20 %	40 %	340793042
66	NC_015859	GCTGA	2	10	104946	104955	20 %	20 %	40 %	20 %	340793042
67	NC_015859	CGGGC	2	10	109575	109584	0 %	0 %	60 %	40 %	340793047
68	NC_015859	ACCGG	2	10	112721	112730	20 %	0 %	40 %	40 %	340793051
69	NC_015859	CGCGT	2	10	112910	112919	0 %	20 %	40 %	40 %	340793051
70	NC_015859	CGGCT	2	10	113966	113975	0 %	20 %	40 %	40 %	340793052
71	NC_015859	CCGCC	2	10	114121	114130	0 %	0 %	20 %	80 %	340793052
72	NC_015859	TCCCG	2	10	114182	114191	0 %	20 %	20 %	60 %	340793052
73	NC_015859	CTCGA	2	10	114224	114233	20 %	20 %	20 %	40 %	340793052
74	NC_015859	CCCGG	2	10	115608	115617	0 %	0 %	40 %	60 %	340793053
75	NC_015859	CGGTG	2	10	116862	116871	0 %	20 %	60 %	20 %	340793053
76	NC_015859	CTGGG	2	10	116896	116905	0 %	20 %	60 %	20 %	340793053
77	NC_015859	CGGTG	2	10	120382	120391	0 %	20 %	60 %	20 %	340793055
78	NC_015859	GCCCG	2	10	120780	120789	0 %	0 %	40 %	60 %	340793056
79	NC_015859	GGCGT	2	10	120885	120894	0 %	20 %	60 %	20 %	340793056
80	NC_015859	TCCGG	2	10	122248	122257	0 %	20 %	40 %	40 %	340793058
81	NC_015859	CGAGC	2	10	123062	123071	20 %	0 %	40 %	40 %	340793058
82	NC_015859	CGAGG	2	10	123293	123302	20 %	0 %	60 %	20 %	340793058
83	NC_015859	TCCTG	2	10	123989	123998	0 %	40 %	20 %	40 %	340793058
84	NC_015859	CGTCC	2	10	125010	125019	0 %	20 %	20 %	60 %	340793059
85	NC_015859	CGGGC	2	10	126341	126350	0 %	0 %	60 %	40 %	340793060
86	NC_015859	CGGTG	2	10	127814	127823	0 %	20 %	60 %	20 %	340793061
87	NC_015859	GGTCG	2	10	128858	128867	0 %	20 %	60 %	20 %	340793062
88	NC_015859	GCCGG	2	10	130918	130927	0 %	0 %	60 %	40 %	340793063
89	NC_015859	CGGAC	2	10	131487	131496	20 %	0 %	40 %	40 %	340793063
90	NC_015859	CTGCG	2	10	132136	132145	0 %	20 %	40 %	40 %	340793064
91	NC_015859	AGGGG	2	10	132327	132336	20 %	0 %	80 %	0 %	340793065
92	NC_015859	GCCCC	2	10	134297	134306	0 %	0 %	20 %	80 %	340793067
93	NC_015859	CACTG	2	10	134959	134968	20 %	20 %	20 %	40 %	340793067
94	NC_015859	CGTCT	2	10	135447	135456	0 %	40 %	20 %	40 %	340793068
95	NC_015859	CGACC	2	10	135554	135563	20 %	0 %	20 %	60 %	340793068
96	NC_015859	CCGCG	2	10	136475	136484	0 %	0 %	40 %	60 %	340793068
97	NC_015859	GCTCG	2	10	137774	137783	0 %	20 %	40 %	40 %	340793068
98	NC_015859	GGCTC	2	10	138280	138289	0 %	20 %	40 %	40 %	340793068
99	NC_015859	CCGGG	2	10	138575	138584	0 %	0 %	60 %	40 %	340793068
100	NC_015859	GCGCC	2	10	139393	139402	0 %	0 %	40 %	60 %	340793069
101	NC_015859	GTGCG	2	10	139467	139476	0 %	20 %	60 %	20 %	340793069
102	NC_015859	GGCGC	2	10	146873	146882	0 %	0 %	60 %	40 %	340793076
103	NC_015859	TCGAC	2	10	147694	147703	20 %	20 %	20 %	40 %	340793077
104	NC_015859	CGGTG	2	10	148750	148759	0 %	20 %	60 %	20 %	340793078
105	NC_015859	GTGCG	2	10	148929	148938	0 %	20 %	60 %	20 %	340793078
106	NC_015859	CCGGT	2	10	149545	149554	0 %	20 %	40 %	40 %	340793079
107	NC_015859	GGACT	2	10	151275	151284	20 %	20 %	40 %	20 %	340793081
108	NC_015859	CCGAG	2	10	156383	156392	20 %	0 %	40 %	40 %	340793087
109	NC_015859	GTGCG	2	10	156590	156599	0 %	20 %	60 %	20 %	340793087
110	NC_015859	AGGGG	2	10	160271	160280	20 %	0 %	80 %	0 %	340793090
111	NC_015859	GCCCG	2	10	160557	160566	0 %	0 %	40 %	60 %	340793090
112	NC_015859	GGTCG	2	10	164568	164577	0 %	20 %	60 %	20 %	340793095
113	NC_015859	GGAGC	2	10	165526	165535	20 %	0 %	60 %	20 %	340793096
114	NC_015859	CGTCC	2	10	166926	166935	0 %	20 %	20 %	60 %	340793097
115	NC_015859	CCGCG	2	10	168799	168808	0 %	0 %	40 %	60 %	340793098
116	NC_015859	CAGGG	2	10	171506	171515	20 %	0 %	60 %	20 %	340793101
117	NC_015859	GCAGG	2	10	173118	173127	20 %	0 %	60 %	20 %	340793103
118	NC_015859	TCCGG	2	10	177497	177506	0 %	20 %	40 %	40 %	340793107
119	NC_015859	GCAGC	2	10	178685	178694	20 %	0 %	40 %	40 %	340793107
120	NC_015859	GGTCG	2	10	178737	178746	0 %	20 %	60 %	20 %	340793107
121	NC_015859	CGCGA	2	10	180234	180243	20 %	0 %	40 %	40 %	340793109
122	NC_015859	CGGGG	2	10	185006	185015	0 %	0 %	80 %	20 %	340793113
123	NC_015859	CGGCG	2	10	185053	185062	0 %	0 %	60 %	40 %	340793113
124	NC_015859	TCATG	2	10	189144	189153	20 %	40 %	20 %	20 %	340793117
125	NC_015859	CGTGG	2	10	190608	190617	0 %	20 %	60 %	20 %	340793120
126	NC_015859	CGGTC	2	10	190621	190630	0 %	20 %	40 %	40 %	340793120
127	NC_015859	GCCGA	2	10	191828	191837	20 %	0 %	40 %	40 %	340793121
128	NC_015859	AGGCC	2	10	192357	192366	20 %	0 %	40 %	40 %	340793121
129	NC_015859	TGGTG	2	10	192669	192678	0 %	40 %	60 %	0 %	340793121
130	NC_015859	GCGAG	2	10	194063	194072	20 %	0 %	60 %	20 %	340793122
131	NC_015859	CGGCG	2	10	195047	195056	0 %	0 %	60 %	40 %	340793123
132	NC_015859	GCGGT	2	10	195772	195781	0 %	20 %	60 %	20 %	340793123
133	NC_015859	CCGGC	2	10	197745	197754	0 %	0 %	40 %	60 %	340793125
134	NC_015859	CTTCG	2	10	199778	199787	0 %	40 %	20 %	40 %	340793127
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169	NC_015859	ACCGC	2	10	248176	248185	20 %	0 %	20 %	60 %	340793163
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173	NC_015859	GCGCG	2	10	273990	273999	0 %	0 %	60 %	40 %	340793186
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176	NC_015859	TCGGT	2	10	282619	282628	0 %	40 %	40 %	20 %	340793194
177	NC_015859	GGCCG	2	10	283936	283945	0 %	0 %	60 %	40 %	340793195
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245	NC_015859	CGGAA	2	10	397491	397500	40 %	0 %	40 %	20 %	340793286
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247	NC_015859	CCCTC	2	10	399330	399339	0 %	20 %	0 %	80 %	340793288
248	NC_015859	GCACC	2	10	399366	399375	20 %	0 %	20 %	60 %	340793288
249	NC_015859	AACCC	2	10	402256	402265	40 %	0 %	0 %	60 %	340793290
250	NC_015859	TCAGC	2	10	403026	403035	20 %	20 %	20 %	40 %	340793291
251	NC_015859	ACGGA	2	10	403457	403466	40 %	0 %	40 %	20 %	340793291
252	NC_015859	CGTCC	2	10	404519	404528	0 %	20 %	20 %	60 %	340793292
253	NC_015859	AGGGG	2	10	406958	406967	20 %	0 %	80 %	0 %	340793292
254	NC_015859	CTCGA	2	10	409047	409056	20 %	20 %	20 %	40 %	340793294
255	NC_015859	GAAGA	2	10	409230	409239	60 %	0 %	40 %	0 %	340793294
256	NC_015859	CCGCC	2	10	410885	410894	0 %	0 %	20 %	80 %	340793297
257	NC_015859	GTGGC	2	10	410977	410986	0 %	20 %	60 %	20 %	340793297
258	NC_015859	GACGG	2	10	412472	412481	20 %	0 %	60 %	20 %	340793299
259	NC_015859	GCGGA	2	10	413829	413838	20 %	0 %	60 %	20 %	340793301
260	NC_015859	GTCAG	2	10	414469	414478	20 %	20 %	40 %	20 %	340793302
261	NC_015859	ACCGC	2	10	415952	415961	20 %	0 %	20 %	60 %	340793303
262	NC_015859	TCGGC	2	10	418867	418876	0 %	20 %	40 %	40 %	340793308
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