MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Collimonas fungivorans Ter331 chromosome

Total Repeats: 111516

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015856	GC	4	8	289363	289370	0 %	0 %	50 %	50 %	340785428
6002	NC_015856	CCGGCG	2	12	289390	289401	0 %	0 %	50 %	50 %	340785428
6003	NC_015856	GGC	2	6	289433	289438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785428
6004	NC_015856	GCC	2	6	289443	289448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785428
6005	NC_015856	AGA	2	6	289484	289489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785428
6006	NC_015856	GC	3	6	289492	289497	0 %	0 %	50 %	50 %	340785428
6007	NC_015856	GAA	2	6	289503	289508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785428
6008	NC_015856	CCGCG	2	10	289532	289541	0 %	0 %	40 %	60 %	340785428
6009	NC_015856	TGG	2	6	289552	289557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785428
6010	NC_015856	GAA	2	6	289611	289616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340785428
6011	NC_015856	GCG	2	6	289659	289664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785428
6012	NC_015856	GTC	2	6	289686	289691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785428
6013	NC_015856	GCG	2	6	289757	289762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785428
6014	NC_015856	TTA	2	6	289772	289777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340785428
6015	NC_015856	TTCC	2	8	289865	289872	0 %	50 %	0 %	50 %	340785428
6016	NC_015856	GC	4	8	289889	289896	0 %	0 %	50 %	50 %	340785428
6017	NC_015856	CTG	2	6	289901	289906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785428
6018	NC_015856	GAC	2	6	289917	289922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785428
6019	NC_015856	GCT	2	6	289931	289936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785428
6020	NC_015856	GGT	2	6	289973	289978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785428
6021	NC_015856	TGG	2	6	290007	290012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785428
6022	NC_015856	TGC	2	6	290024	290029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785428
6023	NC_015856	CGC	2	6	290044	290049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785428
6024	NC_015856	CGC	2	6	290099	290104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785428
6025	NC_015856	CGA	2	6	290105	290110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785428
6026	NC_015856	AATA	2	8	290167	290174	75 %	25 %	0 %	0 %	340785428
6027	NC_015856	CAT	2	6	290245	290250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785429
6028	NC_015856	GCC	2	6	290254	290259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785429
6029	NC_015856	GCA	2	6	290321	290326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785429
6030	NC_015856	CCGA	2	8	290386	290393	25 %	0 %	25 %	50 %	340785429
6031	NC_015856	TGC	2	6	290396	290401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785429
6032	NC_015856	GCC	2	6	290427	290432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785429
6033	NC_015856	CGGC	2	8	290488	290495	0 %	0 %	50 %	50 %	340785429
6034	NC_015856	GCA	2	6	290513	290518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785429
6035	NC_015856	GC	3	6	290523	290528	0 %	0 %	50 %	50 %	340785429
6036	NC_015856	TCT	2	6	290539	290544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785429
6037	NC_015856	GGCC	2	8	290573	290580	0 %	0 %	50 %	50 %	340785429
6038	NC_015856	GC	3	6	290596	290601	0 %	0 %	50 %	50 %	340785429
6039	NC_015856	TCG	2	6	290611	290616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785429
6040	NC_015856	CAG	2	6	290628	290633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785429
6041	NC_015856	GCT	2	6	290663	290668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785429
6042	NC_015856	GCG	2	6	290686	290691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785429
6043	NC_015856	CCTGGC	2	12	290738	290749	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	340785429
6044	NC_015856	GC	3	6	290771	290776	0 %	0 %	50 %	50 %	340785429
6045	NC_015856	CGT	2	6	290804	290809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785429
6046	NC_015856	TGCC	2	8	290831	290838	0 %	25 %	25 %	50 %	340785429
6047	NC_015856	GCCA	2	8	290892	290899	25 %	0 %	25 %	50 %	340785429
6048	NC_015856	CGA	2	6	290957	290962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785429
6049	NC_015856	TGC	2	6	290979	290984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785429
6050	NC_015856	CAGC	2	8	290990	290997	25 %	0 %	25 %	50 %	340785429
6051	NC_015856	GCA	2	6	291005	291010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785429
6052	NC_015856	TGC	2	6	291026	291031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785429
6053	NC_015856	GC	3	6	291076	291081	0 %	0 %	50 %	50 %	340785429
6054	NC_015856	GCAG	2	8	291210	291217	25 %	0 %	50 %	25 %	340785429
6055	NC_015856	CTG	2	6	291225	291230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785429
6056	NC_015856	CCA	2	6	291242	291247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340785429
6057	NC_015856	GCCG	2	8	291297	291304	0 %	0 %	50 %	50 %	340785429
6058	NC_015856	CGC	2	6	291323	291328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785429
6059	NC_015856	GCGCAG	2	12	291396	291407	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	340785429
6060	NC_015856	GCG	2	6	291416	291421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785429
6061	NC_015856	GC	3	6	291472	291477	0 %	0 %	50 %	50 %	340785429
6062	NC_015856	AGGC	2	8	291543	291550	25 %	0 %	50 %	25 %	340785429
6063	NC_015856	GCGCG	2	10	291560	291569	0 %	0 %	60 %	40 %	340785429
6064	NC_015856	GCC	2	6	291600	291605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785429
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6067	NC_015856	CTG	2	6	291633	291638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785429
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6069	NC_015856	CGC	2	6	291707	291712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785429
6070	NC_015856	TGG	2	6	291743	291748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785429
6071	NC_015856	CCGCG	2	10	291776	291785	0 %	0 %	40 %	60 %	340785429
6072	NC_015856	TTC	2	6	292000	292005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785430
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6081	NC_015856	ATCG	2	8	292192	292199	25 %	25 %	25 %	25 %	340785430
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6090	NC_015856	GC	3	6	292551	292556	0 %	0 %	50 %	50 %	340785430
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6103	NC_015856	GCC	2	6	293321	293326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785431
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6105	NC_015856	GTG	2	6	293378	293383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785431
6106	NC_015856	TCT	2	6	293490	293495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785431
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6110	NC_015856	AGCC	2	8	293554	293561	25 %	0 %	25 %	50 %	340785431
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6114	NC_015856	TGC	3	9	293811	293819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785431
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6118	NC_015856	TCT	2	6	294372	294377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340785432
6119	NC_015856	GGCT	2	8	294419	294426	0 %	25 %	50 %	25 %	340785432
6120	NC_015856	CGC	2	6	294457	294462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785432
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6122	NC_015856	GCG	2	6	294501	294506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785432
6123	NC_015856	TGC	2	6	294549	294554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785432
6124	NC_015856	TGG	2	6	294561	294566	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340785432
6125	NC_015856	CGT	2	6	294582	294587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785432
6126	NC_015856	TCG	2	6	294606	294611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785432
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6133	NC_015856	ATCT	2	8	295049	295056	25 %	50 %	0 %	25 %	340785432
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6238	NC_015856	A	6	6	299196	299201	100 %	0 %	0 %	0 %	340785435
6239	NC_015856	TGGT	2	8	299263	299270	0 %	50 %	50 %	0 %	340785435
6240	NC_015856	GGTT	2	8	299325	299332	0 %	50 %	50 %	0 %	340785435
6241	NC_015856	TGC	2	6	299439	299444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785436
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6486	NC_015856	TGC	3	9	310887	310895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785445
6487	NC_015856	GCG	2	6	310897	310902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785445
6488	NC_015856	CGG	3	9	310910	310918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340785445
6489	NC_015856	T	6	6	310977	310982	0 %	100 %	0 %	0 %	340785445
6490	NC_015856	ATC	3	9	311314	311322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340785446
6491	NC_015856	CGGCAC	2	12	311337	311348	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	340785446
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6493	NC_015856	GAT	2	6	311478	311483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340785446
6494	NC_015856	GCA	2	6	311507	311512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785446
6495	NC_015856	GCA	2	6	311564	311569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340785446
6496	NC_015856	GCC	3	9	311593	311601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785446
6497	NC_015856	CGC	2	6	311616	311621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340785446
6498	NC_015856	TCG	4	12	311701	311712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340785446
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