MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Capnocytophaga canimorsus Cc5 chromosome

Total Repeats: 971

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015846	TATCCA	2	12	1910	1921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620782
2	NC_015846	CAAATA	2	12	11365	11376	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340620790
3	NC_015846	ACTTTA	2	12	13348	13359	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340620791
4	NC_015846	GGTAAA	2	12	15167	15178	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340620792
5	NC_015846	TATTTT	2	12	16237	16248	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	340620793
6	NC_015846	GCGTTG	2	12	19118	19129	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	340620796
7	NC_015846	CTTAAA	2	12	26794	26805	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340620805
8	NC_015846	CCAACA	2	12	33363	33374	50 %	0 %	0 %	50 %	340620810
9	NC_015846	CCCTTT	2	12	37106	37117	0 %	50 %	0 %	50 %	340620813
10	NC_015846	TAAAAA	2	12	39129	39140	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	340620816
11	NC_015846	TTTGGT	2	12	40735	40746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620818
12	NC_015846	ATTCGT	2	12	42751	42762	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340620819
13	NC_015846	AATGAA	2	12	44839	44850	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340620819
14	NC_015846	TCTATT	2	12	49234	49245	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340620822
15	NC_015846	TCCGAA	2	12	49895	49906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340620823
16	NC_015846	ATGTTT	2	12	51081	51092	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340620823
17	NC_015846	GAAATC	2	12	52124	52135	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340620824
18	NC_015846	ATAGTC	2	12	56215	56226	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340620828
19	NC_015846	TCTAAA	2	12	58249	58260	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340620830
20	NC_015846	TTTATG	2	12	61484	61495	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340620832
21	NC_015846	AGAAGT	2	12	65198	65209	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340620835
22	NC_015846	CCTAAT	2	12	72919	72930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620838
23	NC_015846	TATGAG	2	12	76156	76167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620838
24	NC_015846	GGTTTG	2	12	77781	77792	0 %	50 %	50 %	0 %	340620839
25	NC_015846	GTATTT	2	12	79369	79380	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340620840
26	NC_015846	CTAATT	2	12	84300	84311	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340620846
27	NC_015846	ACTAAT	2	12	85625	85636	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340620846
28	NC_015846	AAAACA	2	12	87014	87025	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	340620846
29	NC_015846	GATATT	2	12	88314	88325	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340620847
30	NC_015846	ACCAAC	2	12	92904	92915	50 %	0 %	0 %	50 %	340620850
31	NC_015846	TCATAT	2	12	93030	93041	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340620850
32	NC_015846	TTCAGG	2	12	94048	94059	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340620852
33	NC_015846	GGTAAT	2	12	101009	101020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620860
34	NC_015846	AGGATT	2	12	101588	101599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620861
35	NC_015846	TTGGAA	2	12	102624	102635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620863
36	NC_015846	GCCTCC	2	12	102778	102789	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	340620863
37	NC_015846	ATTTGA	2	12	104211	104222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340620863
38	NC_015846	AAAACA	2	12	104734	104745	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	340620864
39	NC_015846	CTTCTA	2	12	105010	105021	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340620865
40	NC_015846	AATATC	2	12	107950	107961	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340620869
41	NC_015846	TATTGA	2	12	110404	110415	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340620872
42	NC_015846	GTAAAA	2	12	112894	112905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340620876
43	NC_015846	GTTTTT	2	12	114669	114680	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	340620878
44	NC_015846	ATTGTT	2	12	114903	114914	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340620878
45	NC_015846	TGATTT	2	12	114922	114933	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340620878
46	NC_015846	TCCCTG	2	12	125573	125584	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	340620886
47	NC_015846	TTTCTT	2	12	127287	127298	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340620888
48	NC_015846	AGCAAA	2	12	128923	128934	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	340620888
49	NC_015846	GCTCGT	2	12	131525	131536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340620889
50	NC_015846	ACCGAA	2	12	135830	135841	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	340620893
51	NC_015846	TTTGCT	2	12	141850	141861	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	340620900
52	NC_015846	CCAAAA	2	12	144525	144536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340620903
53	NC_015846	CTACCT	2	12	151093	151104	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	340620912
54	NC_015846	TGCCAG	2	12	152714	152725	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340620916
55	NC_015846	AATTTT	2	12	155088	155099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620920
56	NC_015846	TTCCTG	2	12	159222	159233	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	340620925
57	NC_015846	CTTTTT	2	12	159681	159692	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340620925
58	NC_015846	ATGGTA	2	12	161896	161907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620927
59	NC_015846	GCTAAA	2	12	164232	164243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340620929
60	NC_015846	ATTTGA	2	12	164521	164532	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340620929
61	NC_015846	GCTTGA	2	12	169490	169501	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340620932
62	NC_015846	CTTTTT	2	12	170998	171009	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340620933
63	NC_015846	TATGGA	2	12	178686	178697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620939
64	NC_015846	TTTTGG	2	12	183182	183193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620943
65	NC_015846	TGAAGA	2	12	183311	183322	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340620943
66	NC_015846	TACGGA	2	12	185302	185313	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340620945
67	NC_015846	TACAGG	2	12	185962	185973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340620946
68	NC_015846	TTTGAG	2	12	187164	187175	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	340620947
69	NC_015846	GCGGAA	2	12	191828	191839	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	340620952
70	NC_015846	TTCAGA	2	12	199924	199935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340620957
71	NC_015846	TGAAAA	2	12	201313	201324	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340620961
72	NC_015846	CGGAAT	2	12	202452	202463	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340620963
73	NC_015846	TTTTCA	2	12	209311	209322	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340620969
74	NC_015846	TGGTAA	2	12	212046	212057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620972
75	NC_015846	ATAATT	2	12	214952	214963	50 %	50 %	0 %	0 %	340620975
76	NC_015846	CAGAAA	2	12	218011	218022	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	340620978
77	NC_015846	TTCAAC	2	12	218853	218864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620979
78	NC_015846	CGGTGG	3	18	218967	218984	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	340620979
79	NC_015846	TTCAAC	2	12	219867	219878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620981
80	NC_015846	GTTTTG	2	12	223445	223456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620984
81	NC_015846	TTTCAA	2	12	226550	226561	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340620988
82	NC_015846	TTTCAT	2	12	226682	226693	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340620988
83	NC_015846	ATTTCG	2	12	230436	230447	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340620990
84	NC_015846	TTTTCT	2	12	233193	233204	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340620992
85	NC_015846	TGCTTT	2	12	234719	234730	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	340620994
86	NC_015846	GCTTTA	2	12	242809	242820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340621001
87	NC_015846	AATTTC	2	12	244125	244136	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340621002
88	NC_015846	TATGGT	2	12	246421	246432	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	340621004
89	NC_015846	TTTCTG	2	12	247320	247331	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	340621004
90	NC_015846	TTTCAA	2	12	253240	253251	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340621006
91	NC_015846	AAAGCA	2	12	253518	253529	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	340621006
92	NC_015846	TCAGCA	2	12	262928	262939	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340621012
93	NC_015846	CTTGAG	2	12	262992	263003	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	340621012
94	NC_015846	CTTGTT	2	12	263079	263090	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	340621012
95	NC_015846	AATACG	2	12	265164	265175	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340621014
96	NC_015846	AAATGC	2	12	265754	265765	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340621015
97	NC_015846	TTTTTG	2	12	269091	269102	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	340621020
98	NC_015846	TTGATT	2	12	273479	273490	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340621021
99	NC_015846	GCTTGT	2	12	277167	277178	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	340621025
100	NC_015846	ATAGTG	2	12	279033	279044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340621026
101	NC_015846	AACGAA	2	12	281756	281767	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	340621030
102	NC_015846	TTTACC	2	12	286970	286981	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340621034
103	NC_015846	TTGAAA	2	12	287439	287450	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340621036
104	NC_015846	AAAACC	2	12	290247	290258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340621041
105	NC_015846	ACTTTT	2	12	293033	293044	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340621044
106	NC_015846	AGCCAT	2	12	293626	293637	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340621045
107	NC_015846	GATATT	2	12	296015	296026	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	340621048
108	NC_015846	AATTGA	2	12	296170	296181	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340621048
109	NC_015846	TAAAAC	2	12	306747	306758	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340621060
110	NC_015846	TTACAT	2	12	308155	308166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340621061
111	NC_015846	CATTTC	2	12	316053	316064	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	340621068
112	NC_015846	TGAGCG	2	12	317030	317041	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340621068
113	NC_015846	TGACGG	2	12	319220	319231	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340621070
114	NC_015846	TGACGG	2	12	319382	319393	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	340621070
115	NC_015846	CAGAGA	2	12	319460	319471	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	340621070
116	NC_015846	ACAGAA	2	12	320756	320767	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	340621071
117	NC_015846	TAAGGA	2	12	321311	321322	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340621071
118	NC_015846	ACAATA	2	12	329195	329206	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340621081
119	NC_015846	GCGTGG	2	12	331023	331034	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	340621084
120	NC_015846	CAAAAA	2	12	332022	332033	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	340621084
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123	NC_015846	TTTCAA	2	12	335165	335176	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340621086
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230	NC_015846	TGCCAG	2	12	628844	628855	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	340621363
231	NC_015846	CTTTCG	2	12	630557	630568	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	340621365
232	NC_015846	AAAGAC	2	12	631683	631694	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	340621367
233	NC_015846	TGAAAG	2	12	635725	635736	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340621371
234	NC_015846	CTGTAA	2	12	643349	643360	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340621379
235	NC_015846	AATCGA	2	12	646071	646082	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340621380
236	NC_015846	TTGCGT	2	12	647286	647297	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	340621381
237	NC_015846	AAATTG	2	12	648214	648225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	340621381
238	NC_015846	TTTTTC	2	12	652319	652330	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	340621387
239	NC_015846	AGCTAA	2	12	661232	661243	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340621394
240	NC_015846	AAATGA	2	12	661413	661424	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340621394
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243	NC_015846	TCGGCT	2	12	666319	666330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340621401
244	NC_015846	AATCCT	2	12	670766	670777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340621404
245	NC_015846	AATTGG	2	12	675373	675384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340621409
246	NC_015846	AGCTGA	2	12	681372	681383	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340621416
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249	NC_015846	TTTACA	2	12	701232	701243	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340621433
250	NC_015846	ACGATA	2	12	703188	703199	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340621436
251	NC_015846	AAACAA	2	12	704195	704206	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	340621437
252	NC_015846	TGAAGA	2	12	704415	704426	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340621437
253	NC_015846	TTTGGA	2	12	705832	705843	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	340621438
254	NC_015846	GCTGAA	2	12	706040	706051	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340621438
255	NC_015846	GTTAGA	2	12	706696	706707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340621438
256	NC_015846	GTGCGT	2	12	707098	707109	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	340621439
257	NC_015846	TTGCTT	2	12	708651	708662	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	340621443
258	NC_015846	TGGAAA	2	12	709620	709631	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	340621444
259	NC_015846	GTTTTT	2	12	714644	714655	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	340621450
260	NC_015846	CCAATG	2	12	720439	720450	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	340621453
261	NC_015846	AAGGAA	2	12	720898	720909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340621453
262	NC_015846	GGTGAA	2	12	721005	721016	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	340621453
263	NC_015846	CTTATA	2	12	722539	722550	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340621453
264	NC_015846	ATACCT	2	12	722617	722628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340621453
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266	NC_015846	TACACC	2	12	723227	723238	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	340621453
267	NC_015846	GCTACT	2	12	724926	724937	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340621453
268	NC_015846	TAGTGA	2	12	725258	725269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340621453
269	NC_015846	CGTTAA	2	12	725903	725914	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	340621453
270	NC_015846	TAGCAG	2	12	727291	727302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340621453
271	NC_015846	CGGCAA	2	12	729658	729669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340621453
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284	NC_015846	CTTTGG	2	12	745934	745945	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	340621468
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341	NC_015846	TACCGC	2	12	876444	876455	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	340621594
342	NC_015846	TTGTTT	2	12	876682	876693	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	340621595
343	NC_015846	CATTTT	2	12	879510	879521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340621596
344	NC_015846	TAGCAA	2	12	880439	880450	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340621597
345	NC_015846	TTTTGA	2	12	881269	881280	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	340621598
346	NC_015846	ATGTGG	2	12	881596	881607	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	340621598
347	NC_015846	TCAAAT	2	12	884143	884154	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340621599
348	NC_015846	ACAAAT	2	12	884854	884865	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340621600
349	NC_015846	TATCGT	2	12	885973	885984	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	340621602
350	NC_015846	TTGCTT	2	12	891492	891503	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	340621605
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449	NC_015846	GTTTTC	2	12	1186350	1186361	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	340621889
450	NC_015846	TAAATA	2	12	1191358	1191369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340621893
451	NC_015846	GATAAA	2	12	1193165	1193176	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340621894
452	NC_015846	ATGCAA	2	12	1199411	1199422	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	340621900
453	NC_015846	TAAAGA	2	12	1200176	1200187	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340621901
454	NC_015846	GAAAAA	2	12	1210905	1210916	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	340621910
455	NC_015846	ACAAAT	2	12	1212722	1212733	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	340621912
456	NC_015846	TTCCTC	2	12	1213691	1213702	0 %	50 %	0 %	50 %	340621914
457	NC_015846	ACGATG	2	12	1214861	1214872	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340621917
458	NC_015846	ACGATG	2	12	1216367	1216378	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	340621919
459	NC_015846	TTCAAA	2	12	1218104	1218115	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	340621920
460	NC_015846	TCCTAA	2	12	1218631	1218642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340621920
461	NC_015846	GGCTTT	2	12	1219982	1219993	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	340621921
462	NC_015846	AAATGA	2	12	1222222	1222233	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	340621924
463	NC_015846	TTGGCT	2	12	1222310	1222321	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	340621924
464	NC_015846	AAAGCA	2	12	1227001	1227012	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	340621929
465	NC_015846	CATTTT	2	12	1233689	1233700	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340621936
466	NC_015846	TTTCTC	2	12	1234293	1234304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340621936
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476	NC_015846	TATTAC	2	12	1259474	1259485	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	340621962
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480	NC_015846	TTATCT	2	12	1265423	1265434	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	340621967
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483	NC_015846	TCAGCT	2	12	1272046	1272057	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	340621975
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