MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Capnocytophaga canimorsus Cc5 chromosome

Total Repeats: 47521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015846	CTT	2	6	187478	187483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340620948
3502	NC_015846	T	6	6	187482	187487	0 %	100 %	0 %	0 %	340620948
3503	NC_015846	GTT	2	6	187533	187538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620948
3504	NC_015846	CCTT	2	8	187634	187641	0 %	50 %	0 %	50 %	340620948
3505	NC_015846	TGTAT	2	10	187650	187659	20 %	60 %	20 %	0 %	340620948
3506	NC_015846	AAGA	2	8	187678	187685	75 %	0 %	25 %	0 %	340620948
3507	NC_015846	TCA	2	6	187702	187707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620948
3508	NC_015846	CAC	2	6	188000	188005	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340620948
3509	NC_015846	TCC	2	6	188119	188124	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340620948
3510	NC_015846	A	6	6	188125	188130	100 %	0 %	0 %	0 %	340620948
3511	NC_015846	TTA	2	6	188135	188140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620948
3512	NC_015846	TCA	2	6	188192	188197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620948
3513	NC_015846	TTA	2	6	188600	188605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620949
3514	NC_015846	T	6	6	188628	188633	0 %	100 %	0 %	0 %	340620949
3515	NC_015846	TGAT	2	8	188668	188675	25 %	50 %	25 %	0 %	340620949
3516	NC_015846	AAC	2	6	188678	188683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340620949
3517	NC_015846	TTCC	2	8	188693	188700	0 %	50 %	0 %	50 %	340620949
3518	NC_015846	CTT	3	9	188723	188731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340620949
3519	NC_015846	CCA	2	6	188755	188760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340620949
3520	NC_015846	TCT	2	6	188785	188790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340620949
3521	NC_015846	TGA	2	6	188797	188802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620949
3522	NC_015846	TTA	2	6	188818	188823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620949
3523	NC_015846	ACT	2	6	188929	188934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620950
3524	NC_015846	GTA	2	6	188949	188954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620950
3525	NC_015846	G	6	6	188973	188978	0 %	0 %	100 %	0 %	340620950
3526	NC_015846	GCT	2	6	189066	189071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340620950
3527	NC_015846	TCCT	2	8	189164	189171	0 %	50 %	0 %	50 %	340620950
3528	NC_015846	ATA	2	6	189182	189187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620950
3529	NC_015846	TTC	2	6	189203	189208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340620950
3530	NC_015846	CAC	3	9	189326	189334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340620950
3531	NC_015846	ATA	2	6	189360	189365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620950
3532	NC_015846	AGG	2	6	189389	189394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340620950
3533	NC_015846	ATCA	2	8	189398	189405	50 %	25 %	0 %	25 %	340620950
3534	NC_015846	A	6	6	189408	189413	100 %	0 %	0 %	0 %	340620950
3535	NC_015846	A	6	6	189506	189511	100 %	0 %	0 %	0 %	340620950
3536	NC_015846	ATA	2	6	189612	189617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620950
3537	NC_015846	ACT	2	6	189819	189824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620950
3538	NC_015846	T	7	7	189881	189887	0 %	100 %	0 %	0 %	340620950
3539	NC_015846	ACC	3	9	189921	189929	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340620950
3540	NC_015846	TCA	2	6	189930	189935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620950
3541	NC_015846	CAC	2	6	189961	189966	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340620950
3542	NC_015846	CCA	2	6	189970	189975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340620950
3543	NC_015846	GGT	2	6	189995	190000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620950
3544	NC_015846	T	6	6	190028	190033	0 %	100 %	0 %	0 %	340620950
3545	NC_015846	ATC	2	6	190430	190435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620951
3546	NC_015846	ACT	2	6	190442	190447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620951
3547	NC_015846	T	6	6	190472	190477	0 %	100 %	0 %	0 %	340620951
3548	NC_015846	TTC	2	6	190494	190499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340620951
3549	NC_015846	TGC	2	6	190537	190542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340620951
3550	NC_015846	T	6	6	190553	190558	0 %	100 %	0 %	0 %	340620951
3551	NC_015846	T	6	6	190669	190674	0 %	100 %	0 %	0 %	340620951
3552	NC_015846	ATT	2	6	190772	190777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620951
3553	NC_015846	T	7	7	190788	190794	0 %	100 %	0 %	0 %	340620951
3554	NC_015846	ATT	2	6	190841	190846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620951
3555	NC_015846	CAA	2	6	190929	190934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340620951
3556	NC_015846	GCT	2	6	191003	191008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340620951
3557	NC_015846	ATT	2	6	191027	191032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620951
3558	NC_015846	TGA	2	6	191040	191045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620951
3559	NC_015846	GCA	2	6	191090	191095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340620951
3560	NC_015846	ATTT	2	8	191141	191148	25 %	75 %	0 %	0 %	340620951
3561	NC_015846	ACA	2	6	191159	191164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340620951
3562	NC_015846	TGC	2	6	191199	191204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340620951
3563	NC_015846	CTT	2	6	191314	191319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340620951
3564	NC_015846	ATT	2	6	191375	191380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620951
3565	NC_015846	ATT	2	6	191414	191419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620951
3566	NC_015846	TATC	2	8	191446	191453	25 %	50 %	0 %	25 %	340620951
3567	NC_015846	TGG	2	6	191590	191595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620951
3568	NC_015846	GTTTC	2	10	191599	191608	0 %	60 %	20 %	20 %	340620951
3569	NC_015846	CCTT	2	8	191654	191661	0 %	50 %	0 %	50 %	340620951
3570	NC_015846	GTA	2	6	191672	191677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620951
3571	NC_015846	GCGGAA	2	12	191828	191839	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	340620952
3572	NC_015846	AGGAA	2	10	191940	191949	60 %	0 %	40 %	0 %	340620952
3573	NC_015846	CAT	2	6	192012	192017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620952
3574	NC_015846	T	6	6	192020	192025	0 %	100 %	0 %	0 %	340620952
3575	NC_015846	CCA	2	6	192074	192079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340620952
3576	NC_015846	CAT	2	6	192183	192188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620952
3577	NC_015846	T	6	6	192193	192198	0 %	100 %	0 %	0 %	340620952
3578	NC_015846	AT	3	6	192223	192228	50 %	50 %	0 %	0 %	340620952
3579	NC_015846	GGC	2	6	192239	192244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340620952
3580	NC_015846	TAC	2	6	192305	192310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620952
3581	NC_015846	AAT	2	6	192346	192351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620952
3582	NC_015846	GCT	2	6	192361	192366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340620952
3583	NC_015846	TTG	2	6	192452	192457	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340620952
3584	NC_015846	CAT	2	6	192590	192595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620952
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3586	NC_015846	GAT	2	6	192723	192728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620952
3587	NC_015846	TTTC	2	8	192740	192747	0 %	75 %	0 %	25 %	340620952
3588	NC_015846	AT	3	6	192766	192771	50 %	50 %	0 %	0 %	340620952
3589	NC_015846	GTTT	2	8	192879	192886	0 %	75 %	25 %	0 %	340620953
3590	NC_015846	TAA	2	6	192917	192922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620953
3591	NC_015846	ATA	2	6	193002	193007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620953
3592	NC_015846	AGCGT	2	10	193008	193017	20 %	20 %	40 %	20 %	340620953
3593	NC_015846	A	6	6	193128	193133	100 %	0 %	0 %	0 %	340620953
3594	NC_015846	AAG	2	6	193157	193162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620953
3595	NC_015846	CTG	2	6	193256	193261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340620953
3596	NC_015846	ATC	2	6	193288	193293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620953
3597	NC_015846	T	6	6	193302	193307	0 %	100 %	0 %	0 %	340620953
3598	NC_015846	A	6	6	193357	193362	100 %	0 %	0 %	0 %	340620953
3599	NC_015846	T	7	7	193367	193373	0 %	100 %	0 %	0 %	340620953
3600	NC_015846	CAAA	2	8	193445	193452	75 %	0 %	0 %	25 %	340620953
3601	NC_015846	TGC	2	6	193462	193467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340620953
3602	NC_015846	T	6	6	193508	193513	0 %	100 %	0 %	0 %	340620953
3603	NC_015846	TCA	2	6	193706	193711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620953
3604	NC_015846	T	6	6	193764	193769	0 %	100 %	0 %	0 %	340620953
3605	NC_015846	ATA	2	6	193783	193788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	340620953
3606	NC_015846	TCA	2	6	193879	193884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620953
3607	NC_015846	AGC	2	6	194013	194018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340620953
3608	NC_015846	T	6	6	194043	194048	0 %	100 %	0 %	0 %	340620953
3609	NC_015846	T	6	6	194066	194071	0 %	100 %	0 %	0 %	340620953
3610	NC_015846	CTT	2	6	194093	194098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340620953
3611	NC_015846	AAAG	2	8	194138	194145	75 %	0 %	25 %	0 %	340620953
3612	NC_015846	TCA	2	6	194212	194217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	340620953
3613	NC_015846	GGT	2	6	194245	194250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340620953
3614	NC_015846	AAATT	2	10	194291	194300	60 %	40 %	0 %	0 %	340620953
3615	NC_015846	TTCAG	2	10	194359	194368	20 %	40 %	20 %	20 %	340620953
3616	NC_015846	AAC	2	6	194410	194415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	340620953
3617	NC_015846	T	7	7	194533	194539	0 %	100 %	0 %	0 %	340620953
3618	NC_015846	CTT	2	6	194654	194659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340620954
3619	NC_015846	AAG	2	6	194675	194680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620954
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3621	NC_015846	AGT	2	6	194730	194735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620954
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3995	NC_015846	TAT	2	6	215149	215154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340620975
3996	NC_015846	ACC	2	6	215177	215182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340620975
3997	NC_015846	ATG	2	6	215231	215236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340620975
3998	NC_015846	AAG	2	6	215237	215242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340620975
3999	NC_015846	A	7	7	215326	215332	100 %	0 %	0 %	0 %	340620975
4000	NC_015846	A	6	6	215469	215474	100 %	0 %	0 %	0 %	340620976

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