MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 20299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015744	AAT	2	6	216443	216448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625551
4002	NC_015744	TG	3	6	216478	216483	0 %	50 %	50 %	0 %	339625551
4003	NC_015744	TG	3	6	216565	216570	0 %	50 %	50 %	0 %	339625551
4004	NC_015744	AAT	2	6	216571	216576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625551
4005	NC_015744	TTTA	2	8	216675	216682	25 %	75 %	0 %	0 %	339625552
4006	NC_015744	GTT	2	6	216707	216712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625552
4007	NC_015744	GTG	2	6	216713	216718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625552
4008	NC_015744	A	6	6	216739	216744	100 %	0 %	0 %	0 %	339625552
4009	NC_015744	AAG	2	6	217192	217197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625553
4010	NC_015744	TTA	2	6	217202	217207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625553
4011	NC_015744	CTG	2	6	217235	217240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625553
4012	NC_015744	TTTC	2	8	217303	217310	0 %	75 %	0 %	25 %	339625553
4013	NC_015744	ATG	2	6	217415	217420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625553
4014	NC_015744	GAA	2	6	217438	217443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625553
4015	NC_015744	AGG	2	6	217521	217526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625553
4016	NC_015744	GTT	2	6	217558	217563	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625553
4017	NC_015744	AAG	2	6	217685	217690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625553
4018	NC_015744	ACG	2	6	217707	217712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625553
4019	NC_015744	GTT	2	6	217736	217741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625554
4020	NC_015744	GAC	2	6	217758	217763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625554
4021	NC_015744	TTG	2	6	217799	217804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625554
4022	NC_015744	T	6	6	217822	217827	0 %	100 %	0 %	0 %	339625554
4023	NC_015744	GTT	2	6	217895	217900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625554
4024	NC_015744	CAC	2	6	217912	217917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339625554
4025	NC_015744	AAG	2	6	217955	217960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625554
4026	NC_015744	TTG	2	6	217989	217994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625554
4027	NC_015744	GAC	2	6	218000	218005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625554
4028	NC_015744	TGG	2	6	218053	218058	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625554
4029	NC_015744	CAATC	2	10	218093	218102	40 %	20 %	0 %	40 %	339625554
4030	NC_015744	ATT	2	6	218103	218108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625554
4031	NC_015744	TAT	2	6	218172	218177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625554
4032	NC_015744	TGAA	2	8	218190	218197	50 %	25 %	25 %	0 %	339625554
4033	NC_015744	AGA	2	6	218233	218238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625554
4034	NC_015744	TCCT	2	8	218241	218248	0 %	50 %	0 %	50 %	339625554
4035	NC_015744	GTT	2	6	218256	218261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625554
4036	NC_015744	A	10	10	218404	218413	100 %	0 %	0 %	0 %	339625555
4037	NC_015744	TGG	2	6	218514	218519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625555
4038	NC_015744	GTG	2	6	218573	218578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625555
4039	NC_015744	TAC	2	6	218593	218598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625555
4040	NC_015744	TTTA	2	8	218599	218606	25 %	75 %	0 %	0 %	339625555
4041	NC_015744	GA	3	6	218643	218648	50 %	0 %	50 %	0 %	339625555
4042	NC_015744	TCT	2	6	218667	218672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625555
4043	NC_015744	AAGC	2	8	218690	218697	50 %	0 %	25 %	25 %	339625555
4044	NC_015744	AAG	2	6	218705	218710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625555
4045	NC_015744	AAT	2	6	218735	218740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625555
4046	NC_015744	GAAG	2	8	218784	218791	50 %	0 %	50 %	0 %	339625556
4047	NC_015744	TTA	2	6	218871	218876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625556
4048	NC_015744	TTC	2	6	218892	218897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625556
4049	NC_015744	AAG	2	6	218899	218904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625556
4050	NC_015744	TCT	2	6	218918	218923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625556
4051	NC_015744	GCT	2	6	218935	218940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625556
4052	NC_015744	AG	3	6	218955	218960	50 %	0 %	50 %	0 %	339625556
4053	NC_015744	TTA	2	6	219040	219045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625557
4054	NC_015744	TTG	2	6	219080	219085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625557
4055	NC_015744	GCAA	2	8	219165	219172	50 %	0 %	25 %	25 %	339625557
4056	NC_015744	AGC	2	6	219182	219187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625557
4057	NC_015744	TGC	2	6	219191	219196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625557
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4059	NC_015744	AAT	2	6	219286	219291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625557
4060	NC_015744	ATGAT	2	10	219314	219323	40 %	40 %	20 %	0 %	339625557
4061	NC_015744	TGC	2	6	219327	219332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625557
4062	NC_015744	CAA	2	6	219337	219342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625557
4063	NC_015744	GTT	2	6	219346	219351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625557
4064	NC_015744	AAG	2	6	219428	219433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625557
4065	NC_015744	AGA	2	6	219507	219512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625557
4066	NC_015744	AAG	2	6	219515	219520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625557
4067	NC_015744	CTTT	2	8	219594	219601	0 %	75 %	0 %	25 %	339625558
4068	NC_015744	GAT	2	6	219649	219654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625558
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4070	NC_015744	TAAT	2	8	219740	219747	50 %	50 %	0 %	0 %	339625558
4071	NC_015744	AGG	2	6	219876	219881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625558
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4073	NC_015744	GCA	2	6	219892	219897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625558
4074	NC_015744	TGA	2	6	219942	219947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625558
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4076	NC_015744	AGC	2	6	220008	220013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625558
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4078	NC_015744	AGA	2	6	220050	220055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625558
4079	NC_015744	AGAT	2	8	220065	220072	50 %	25 %	25 %	0 %	339625558
4080	NC_015744	CGT	2	6	220122	220127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625558
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4087	NC_015744	AGAA	2	8	220533	220540	75 %	0 %	25 %	0 %	339625559
4088	NC_015744	TGA	2	6	220545	220550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625559
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4090	NC_015744	CAT	2	6	220569	220574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625559
4091	NC_015744	AAGC	2	8	220577	220584	50 %	0 %	25 %	25 %	339625559
4092	NC_015744	TG	3	6	220617	220622	0 %	50 %	50 %	0 %	339625559
4093	NC_015744	TAATT	2	10	220851	220860	40 %	60 %	0 %	0 %	339625560
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4095	NC_015744	CCT	2	6	220942	220947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625560
4096	NC_015744	CCAA	2	8	220960	220967	50 %	0 %	0 %	50 %	339625560
4097	NC_015744	AAG	2	6	221038	221043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625560
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4099	NC_015744	TCA	2	6	221063	221068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625560
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4102	NC_015744	A	6	6	221198	221203	100 %	0 %	0 %	0 %	339625560
4103	NC_015744	ATAA	2	8	221233	221240	75 %	25 %	0 %	0 %	339625560
4104	NC_015744	CA	3	6	221277	221282	50 %	0 %	0 %	50 %	339625560
4105	NC_015744	CAA	2	6	221285	221290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625560
4106	NC_015744	AAC	2	6	221292	221297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625560
4107	NC_015744	ATGA	2	8	221298	221305	50 %	25 %	25 %	0 %	339625560
4108	NC_015744	AAT	2	6	221307	221312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625560
4109	NC_015744	GAAG	2	8	221317	221324	50 %	0 %	50 %	0 %	339625560
4110	NC_015744	TCAT	2	8	221329	221336	25 %	50 %	0 %	25 %	339625560
4111	NC_015744	A	7	7	221395	221401	100 %	0 %	0 %	0 %	339625560
4112	NC_015744	TTG	2	6	221402	221407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625560
4113	NC_015744	CAA	2	6	221437	221442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625560
4114	NC_015744	GAA	2	6	221483	221488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625560
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4118	NC_015744	GA	3	6	221588	221593	50 %	0 %	50 %	0 %	339625560
4119	NC_015744	AAT	2	6	221628	221633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625560
4120	NC_015744	A	6	6	221656	221661	100 %	0 %	0 %	0 %	339625560
4121	NC_015744	TGC	2	6	221673	221678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625560
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4123	NC_015744	CCA	3	9	221691	221699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339625560
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4240	NC_015744	ATCG	2	8	226813	226820	25 %	25 %	25 %	25 %	339625563
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4242	NC_015744	TCC	2	6	226855	226860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625563
4243	NC_015744	CGAT	2	8	226892	226899	25 %	25 %	25 %	25 %	339625563
4244	NC_015744	TTCT	2	8	226900	226907	0 %	75 %	0 %	25 %	339625563
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4487	NC_015744	TAGA	2	8	240045	240052	50 %	25 %	25 %	0 %	339625573
4488	NC_015744	CTTG	2	8	240217	240224	0 %	50 %	25 %	25 %	339625574
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4492	NC_015744	TGGT	2	8	240446	240453	0 %	50 %	50 %	0 %	339625574
4493	NC_015744	TGG	2	6	240480	240485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625574
4494	NC_015744	TGG	2	6	240499	240504	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625574
4495	NC_015744	GTA	2	6	240572	240577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625574
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4497	NC_015744	ATT	2	6	240598	240603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625574
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