MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 20299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015744	AG	3	6	163298	163303	50 %	0 %	50 %	0 %	339625501
3002	NC_015744	GCA	2	6	163454	163459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625501
3003	NC_015744	TTA	2	6	163526	163531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625501
3004	NC_015744	T	6	6	163614	163619	0 %	100 %	0 %	0 %	339625501
3005	NC_015744	G	6	6	163652	163657	0 %	0 %	100 %	0 %	339625501
3006	NC_015744	AAT	2	6	163707	163712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625501
3007	NC_015744	GCT	2	6	163763	163768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625501
3008	NC_015744	GGAA	2	8	163778	163785	50 %	0 %	50 %	0 %	339625501
3009	NC_015744	GCT	2	6	163808	163813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625501
3010	NC_015744	GAT	2	6	163837	163842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625501
3011	NC_015744	AAG	2	6	163948	163953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625501
3012	NC_015744	TTC	2	6	164020	164025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625501
3013	NC_015744	T	7	7	164031	164037	0 %	100 %	0 %	0 %	339625501
3014	NC_015744	GTT	2	6	164119	164124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625502
3015	NC_015744	AAGA	2	8	164173	164180	75 %	0 %	25 %	0 %	339625502
3016	NC_015744	GTTT	2	8	164189	164196	0 %	75 %	25 %	0 %	339625502
3017	NC_015744	TTC	2	6	164204	164209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625502
3018	NC_015744	AGA	2	6	164222	164227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625502
3019	NC_015744	A	6	6	164429	164434	100 %	0 %	0 %	0 %	339625503
3020	NC_015744	AGC	2	6	164477	164482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625503
3021	NC_015744	TCT	2	6	164490	164495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625503
3022	NC_015744	T	6	6	164555	164560	0 %	100 %	0 %	0 %	339625503
3023	NC_015744	TTA	2	6	164590	164595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625503
3024	NC_015744	AT	3	6	164605	164610	50 %	50 %	0 %	0 %	339625503
3025	NC_015744	CAA	2	6	164735	164740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625503
3026	NC_015744	GAA	2	6	164779	164784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625503
3027	NC_015744	CTT	2	6	164868	164873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625504
3028	NC_015744	AAG	2	6	164875	164880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625504
3029	NC_015744	AAT	2	6	164900	164905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625504
3030	NC_015744	AGC	2	6	164962	164967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625504
3031	NC_015744	CTTTT	2	10	164985	164994	0 %	80 %	0 %	20 %	339625504
3032	NC_015744	T	6	6	164991	164996	0 %	100 %	0 %	0 %	339625504
3033	NC_015744	T	7	7	165031	165037	0 %	100 %	0 %	0 %	339625504
3034	NC_015744	T	8	8	165070	165077	0 %	100 %	0 %	0 %	339625504
3035	NC_015744	TTC	2	6	165149	165154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625505
3036	NC_015744	AGG	2	6	165299	165304	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625505
3037	NC_015744	GAT	2	6	165307	165312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625505
3038	NC_015744	TCA	2	6	165367	165372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625505
3039	NC_015744	TTG	2	6	165418	165423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625505
3040	NC_015744	GAAGA	2	10	165472	165481	60 %	0 %	40 %	0 %	339625505
3041	NC_015744	ACCA	2	8	165538	165545	50 %	0 %	0 %	50 %	339625505
3042	NC_015744	GAA	2	6	165565	165570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625505
3043	NC_015744	ACC	2	6	165574	165579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339625505
3044	NC_015744	GAGT	2	8	165586	165593	25 %	25 %	50 %	0 %	339625505
3045	NC_015744	T	6	6	165593	165598	0 %	100 %	0 %	0 %	339625505
3046	NC_015744	TTA	2	6	165627	165632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625505
3047	NC_015744	GTTT	2	8	165651	165658	0 %	75 %	25 %	0 %	339625505
3048	NC_015744	T	6	6	165656	165661	0 %	100 %	0 %	0 %	339625505
3049	NC_015744	CAT	2	6	165682	165687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625505
3050	NC_015744	TA	3	6	165701	165706	50 %	50 %	0 %	0 %	339625505
3051	NC_015744	GAAA	2	8	165732	165739	75 %	0 %	25 %	0 %	339625505
3052	NC_015744	CA	3	6	165794	165799	50 %	0 %	0 %	50 %	339625505
3053	NC_015744	GCT	2	6	165817	165822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625505
3054	NC_015744	GA	3	6	165844	165849	50 %	0 %	50 %	0 %	339625505
3055	NC_015744	CCT	2	6	165873	165878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625505
3056	NC_015744	T	7	7	166089	166095	0 %	100 %	0 %	0 %	339625506
3057	NC_015744	TGC	2	6	166102	166107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625506
3058	NC_015744	AAG	2	6	166128	166133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625506
3059	NC_015744	AGA	2	6	166139	166144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625506
3060	NC_015744	A	6	6	166170	166175	100 %	0 %	0 %	0 %	339625506
3061	NC_015744	TCT	2	6	166223	166228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625506
3062	NC_015744	TTG	2	6	166231	166236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625506
3063	NC_015744	ACA	2	6	166241	166246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625506
3064	NC_015744	AG	3	6	166271	166276	50 %	0 %	50 %	0 %	339625506
3065	NC_015744	CAA	2	6	166290	166295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625506
3066	NC_015744	TCCA	2	8	166300	166307	25 %	25 %	0 %	50 %	339625506
3067	NC_015744	GTT	2	6	166326	166331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625506
3068	NC_015744	AG	3	6	166335	166340	50 %	0 %	50 %	0 %	339625506
3069	NC_015744	CAG	2	6	166368	166373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625506
3070	NC_015744	TTC	2	6	166378	166383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625506
3071	NC_015744	GAAGAG	2	12	166397	166408	50 %	0 %	50 %	0 %	339625506
3072	NC_015744	AGA	2	6	166427	166432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625506
3073	NC_015744	T	7	7	166563	166569	0 %	100 %	0 %	0 %	339625506
3074	NC_015744	TCT	2	6	166592	166597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625506
3075	NC_015744	ACT	2	6	166640	166645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625506
3076	NC_015744	TAG	2	6	166714	166719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625506
3077	NC_015744	AGG	2	6	166732	166737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625506
3078	NC_015744	TTA	2	6	166739	166744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625506
3079	NC_015744	GGC	2	6	166751	166756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339625506
3080	NC_015744	TCT	2	6	166793	166798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625506
3081	NC_015744	ACT	2	6	166823	166828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625506
3082	NC_015744	A	6	6	166899	166904	100 %	0 %	0 %	0 %	339625506
3083	NC_015744	TTC	2	6	166921	166926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625506
3084	NC_015744	T	6	6	166933	166938	0 %	100 %	0 %	0 %	339625506
3085	NC_015744	CTT	2	6	167102	167107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625506
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3088	NC_015744	A	6	6	167495	167500	100 %	0 %	0 %	0 %	339625506
3089	NC_015744	GAA	2	6	167507	167512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625506
3090	NC_015744	GAG	2	6	167513	167518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625506
3091	NC_015744	TGA	2	6	167579	167584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625506
3092	NC_015744	TTG	2	6	167606	167611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625506
3093	NC_015744	GAA	2	6	168088	168093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625507
3094	NC_015744	TCT	2	6	168097	168102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625507
3095	NC_015744	TTA	2	6	168106	168111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625507
3096	NC_015744	CTCG	2	8	168125	168132	0 %	25 %	25 %	50 %	339625507
3097	NC_015744	GAA	2	6	168135	168140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625507
3098	NC_015744	T	6	6	168190	168195	0 %	100 %	0 %	0 %	339625507
3099	NC_015744	AGC	2	6	168240	168245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625507
3100	NC_015744	TGC	2	6	168261	168266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625507
3101	NC_015744	ACT	2	6	168418	168423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625507
3102	NC_015744	TCT	2	6	168448	168453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625507
3103	NC_015744	T	6	6	168540	168545	0 %	100 %	0 %	0 %	339625507
3104	NC_015744	TAA	2	6	168573	168578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625507
3105	NC_015744	GAA	2	6	168582	168587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625507
3106	NC_015744	CA	3	6	168624	168629	50 %	0 %	0 %	50 %	339625507
3107	NC_015744	GCA	2	6	168639	168644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625507
3108	NC_015744	TCG	2	6	168680	168685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625507
3109	NC_015744	A	6	6	168689	168694	100 %	0 %	0 %	0 %	339625507
3110	NC_015744	CTT	2	6	168740	168745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625507
3111	NC_015744	T	6	6	168754	168759	0 %	100 %	0 %	0 %	339625507
3112	NC_015744	A	6	6	168762	168767	100 %	0 %	0 %	0 %	339625507
3113	NC_015744	GCA	2	6	168775	168780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625507
3114	NC_015744	TTTTCT	2	12	168787	168798	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	339625507
3115	NC_015744	TAT	2	6	168823	168828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625507
3116	NC_015744	ATTC	2	8	168835	168842	25 %	50 %	0 %	25 %	339625507
3117	NC_015744	TTA	2	6	168854	168859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625507
3118	NC_015744	TGCC	2	8	168884	168891	0 %	25 %	25 %	50 %	339625507
3119	NC_015744	TAT	2	6	168924	168929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625507
3120	NC_015744	AGTC	2	8	168985	168992	25 %	25 %	25 %	25 %	339625507
3121	NC_015744	TGCC	2	8	169001	169008	0 %	25 %	25 %	50 %	339625507
3122	NC_015744	ATG	2	6	169052	169057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625507
3123	NC_015744	GCT	2	6	169087	169092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625507
3124	NC_015744	CTGTTC	2	12	169100	169111	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	339625507
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