MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 20299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015744	CGA	2	6	24316	24321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625389
502	NC_015744	AGC	2	6	24341	24346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625389
503	NC_015744	AGC	2	6	24369	24374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625389
504	NC_015744	CTC	2	6	24496	24501	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625389
505	NC_015744	GGAT	2	8	24518	24525	25 %	25 %	50 %	0 %	339625389
506	NC_015744	AG	3	6	24558	24563	50 %	0 %	50 %	0 %	339625389
507	NC_015744	CTA	2	6	24690	24695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625389
508	NC_015744	T	6	6	24702	24707	0 %	100 %	0 %	0 %	339625389
509	NC_015744	AGC	2	6	24752	24757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625389
510	NC_015744	ATG	2	6	24785	24790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625389
511	NC_015744	AG	3	6	24912	24917	50 %	0 %	50 %	0 %	339625390
512	NC_015744	A	7	7	24935	24941	100 %	0 %	0 %	0 %	339625390
513	NC_015744	T	7	7	24950	24956	0 %	100 %	0 %	0 %	339625390
514	NC_015744	TGT	2	6	24975	24980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625390
515	NC_015744	TCT	2	6	25049	25054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625390
516	NC_015744	CAA	2	6	25063	25068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625390
517	NC_015744	CCGA	2	8	25089	25096	25 %	0 %	25 %	50 %	339625391
518	NC_015744	TTC	2	6	25174	25179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625391
519	NC_015744	GAA	2	6	25257	25262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625391
520	NC_015744	AAC	2	6	25297	25302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625391
521	NC_015744	GGC	2	6	25348	25353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339625391
522	NC_015744	TGC	2	6	25390	25395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625391
523	NC_015744	TGTGAT	2	12	25498	25509	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	339625391
524	NC_015744	AGC	2	6	25519	25524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625391
525	NC_015744	ATG	2	6	25589	25594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625391
526	NC_015744	GGA	2	6	25712	25717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625391
527	NC_015744	TTC	2	6	25735	25740	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625391
528	NC_015744	TCG	2	6	25756	25761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625391
529	NC_015744	GAG	2	6	25779	25784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625391
530	NC_015744	A	6	6	25825	25830	100 %	0 %	0 %	0 %	339625391
531	NC_015744	CTC	2	6	25839	25844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625391
532	NC_015744	TTC	2	6	25888	25893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625391
533	NC_015744	A	7	7	25923	25929	100 %	0 %	0 %	0 %	339625391
534	NC_015744	TAT	2	6	25930	25935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625391
535	NC_015744	GTT	2	6	26026	26031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625391
536	NC_015744	AAG	2	6	26171	26176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625392
537	NC_015744	TCT	2	6	26181	26186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625392
538	NC_015744	TTTCT	2	10	26199	26208	0 %	80 %	0 %	20 %	339625392
539	NC_015744	TGT	2	6	26219	26224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625392
540	NC_015744	T	6	6	26299	26304	0 %	100 %	0 %	0 %	339625393
541	NC_015744	CTT	2	6	26336	26341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625393
542	NC_015744	T	7	7	26492	26498	0 %	100 %	0 %	0 %	339625394
543	NC_015744	GA	3	6	26503	26508	50 %	0 %	50 %	0 %	339625394
544	NC_015744	AG	3	6	26558	26563	50 %	0 %	50 %	0 %	339625394
545	NC_015744	TGT	2	6	26618	26623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625394
546	NC_015744	AAAG	2	8	26646	26653	75 %	0 %	25 %	0 %	339625394
547	NC_015744	T	6	6	26673	26678	0 %	100 %	0 %	0 %	339625394
548	NC_015744	TTTTG	2	10	26710	26719	0 %	80 %	20 %	0 %	339625394
549	NC_015744	GTT	2	6	26728	26733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625394
550	NC_015744	T	6	6	26758	26763	0 %	100 %	0 %	0 %	339625394
551	NC_015744	T	6	6	26837	26842	0 %	100 %	0 %	0 %	339625394
552	NC_015744	GGT	2	6	26901	26906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625394
553	NC_015744	AGA	2	6	26980	26985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625394
554	NC_015744	AGC	2	6	26989	26994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625394
555	NC_015744	TTA	2	6	27039	27044	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625394
556	NC_015744	CAA	2	6	27055	27060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625394
557	NC_015744	TAT	2	6	27179	27184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625394
558	NC_015744	T	6	6	27195	27200	0 %	100 %	0 %	0 %	339625394
559	NC_015744	GCA	2	6	27280	27285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625394
560	NC_015744	GTT	2	6	27331	27336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625394
561	NC_015744	A	6	6	27426	27431	100 %	0 %	0 %	0 %	339625394
562	NC_015744	A	6	6	27461	27466	100 %	0 %	0 %	0 %	339625394
563	NC_015744	T	6	6	27507	27512	0 %	100 %	0 %	0 %	339625394
564	NC_015744	CTT	2	6	27582	27587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625394
565	NC_015744	GTT	2	6	27598	27603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625394
566	NC_015744	GAT	2	6	27641	27646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625394
567	NC_015744	GAG	2	6	27686	27691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625394
568	NC_015744	TTC	2	6	27737	27742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625394
569	NC_015744	GAG	2	6	27762	27767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625394
570	NC_015744	AGG	2	6	27771	27776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625394
571	NC_015744	GCCT	2	8	27779	27786	0 %	25 %	25 %	50 %	339625394
572	NC_015744	TAT	2	6	27807	27812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625394
573	NC_015744	T	6	6	27922	27927	0 %	100 %	0 %	0 %	339625394
574	NC_015744	CTAG	2	8	27953	27960	25 %	25 %	25 %	25 %	339625394
575	NC_015744	T	6	6	28002	28007	0 %	100 %	0 %	0 %	339625394
576	NC_015744	TGGC	2	8	28046	28053	0 %	25 %	50 %	25 %	339625394
577	NC_015744	ACT	2	6	28084	28089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625394
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579	NC_015744	GGA	2	6	28159	28164	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625394
580	NC_015744	TTC	2	6	28301	28306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625395
581	NC_015744	ATT	2	6	28395	28400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625395
582	NC_015744	TGA	2	6	28431	28436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625395
583	NC_015744	AAC	2	6	28472	28477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625395
584	NC_015744	TGT	2	6	28496	28501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625395
585	NC_015744	AGA	2	6	28515	28520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625395
586	NC_015744	GTT	2	6	28531	28536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625395
587	NC_015744	ATT	2	6	28560	28565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625395
588	NC_015744	TGCTC	2	10	28647	28656	0 %	40 %	20 %	40 %	339625395
589	NC_015744	AGA	2	6	28659	28664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625395
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591	NC_015744	GGA	2	6	28717	28722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625395
592	NC_015744	GAT	2	6	28755	28760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625395
593	NC_015744	CTA	2	6	28939	28944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625395
594	NC_015744	TGA	2	6	28950	28955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625395
595	NC_015744	GAG	2	6	29006	29011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625395
596	NC_015744	AGT	2	6	29112	29117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625395
597	NC_015744	AGCG	2	8	29190	29197	25 %	0 %	50 %	25 %	339625395
598	NC_015744	AAG	2	6	29246	29251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625395
599	NC_015744	AGC	2	6	29283	29288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625395
600	NC_015744	AAG	2	6	29291	29296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625395
601	NC_015744	T	6	6	29343	29348	0 %	100 %	0 %	0 %	339625395
602	NC_015744	GTT	3	9	29361	29369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625395
603	NC_015744	ATC	2	6	29410	29415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625395
604	NC_015744	TAT	2	6	29533	29538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625395
605	NC_015744	ATGTC	2	10	29549	29558	20 %	40 %	20 %	20 %	339625395
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607	NC_015744	ACA	2	6	29667	29672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625395
608	NC_015744	TTA	2	6	29730	29735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625395
609	NC_015744	AGCT	2	8	29830	29837	25 %	25 %	25 %	25 %	339625396
610	NC_015744	TG	3	6	29896	29901	0 %	50 %	50 %	0 %	339625396
611	NC_015744	GAA	2	6	29961	29966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625396
612	NC_015744	ATC	2	6	30131	30136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625397
613	NC_015744	AGA	2	6	30156	30161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625397
614	NC_015744	AAC	2	6	30183	30188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339625397
615	NC_015744	GATA	2	8	30196	30203	50 %	25 %	25 %	0 %	339625397
616	NC_015744	AC	3	6	30353	30358	50 %	0 %	0 %	50 %	339625397
617	NC_015744	TAG	2	6	30417	30422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625397
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619	NC_015744	TAG	2	6	30537	30542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625397
620	NC_015744	GC	3	6	30571	30576	0 %	0 %	50 %	50 %	339625397
621	NC_015744	T	7	7	30592	30598	0 %	100 %	0 %	0 %	339625397
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623	NC_015744	CAT	2	6	30738	30743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339625397
624	NC_015744	T	6	6	30766	30771	0 %	100 %	0 %	0 %	339625397
625	NC_015744	AG	6	12	30825	30836	50 %	0 %	50 %	0 %	339625398
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627	NC_015744	AAT	2	6	30929	30934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339625398
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