MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydia trachomatis L2c chromosome

Total Repeats: 20299

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_015744	TTTC	2	8	240918	240925	0 %	75 %	0 %	25 %	339625574
4503	NC_015744	T	6	6	241013	241018	0 %	100 %	0 %	0 %	339625574
4504	NC_015744	T	6	6	241022	241027	0 %	100 %	0 %	0 %	339625574
4505	NC_015744	T	6	6	241073	241078	0 %	100 %	0 %	0 %	339625574
4506	NC_015744	GAAA	2	8	241269	241276	75 %	0 %	25 %	0 %	339625574
4507	NC_015744	TTA	2	6	241279	241284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625574
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4509	NC_015744	CT	3	6	241317	241322	0 %	50 %	0 %	50 %	339625574
4510	NC_015744	CTT	2	6	241343	241348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625574
4511	NC_015744	ATG	2	6	241458	241463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625575
4512	NC_015744	GTT	2	6	241483	241488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625575
4513	NC_015744	A	6	6	241551	241556	100 %	0 %	0 %	0 %	339625575
4514	NC_015744	GT	3	6	241587	241592	0 %	50 %	50 %	0 %	339625576
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4517	NC_015744	GT	3	6	241634	241639	0 %	50 %	50 %	0 %	339625576
4518	NC_015744	GTG	2	6	241684	241689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625576
4519	NC_015744	TTGG	2	8	241704	241711	0 %	50 %	50 %	0 %	339625576
4520	NC_015744	GAA	2	6	241795	241800	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625576
4521	NC_015744	GGA	2	6	241885	241890	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339625576
4522	NC_015744	TTCT	2	8	241895	241902	0 %	75 %	0 %	25 %	339625576
4523	NC_015744	GA	3	6	241913	241918	50 %	0 %	50 %	0 %	339625576
4524	NC_015744	ATT	2	6	242012	242017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625576
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4526	NC_015744	CT	3	6	242124	242129	0 %	50 %	0 %	50 %	339625576
4527	NC_015744	TCT	2	6	242147	242152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625576
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4532	NC_015744	CTT	2	6	242423	242428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339625576
4533	NC_015744	TA	3	6	242461	242466	50 %	50 %	0 %	0 %	339625576
4534	NC_015744	T	6	6	242546	242551	0 %	100 %	0 %	0 %	339625576
4535	NC_015744	ATGGA	2	10	242637	242646	40 %	20 %	40 %	0 %	339625576
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4539	NC_015744	TGG	2	6	242961	242966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625577
4540	NC_015744	CTG	2	6	243034	243039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625577
4541	NC_015744	CGC	2	6	243107	243112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339625577
4542	NC_015744	CTG	2	6	243151	243156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625577
4543	NC_015744	CAG	2	6	243175	243180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625577
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4545	NC_015744	GTT	2	6	243302	243307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625577
4546	NC_015744	AGT	2	6	243356	243361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625577
4547	NC_015744	TCG	2	6	243377	243382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625577
4548	NC_015744	CGTAG	2	10	243390	243399	20 %	20 %	40 %	20 %	339625577
4549	NC_015744	CTTT	2	8	243426	243433	0 %	75 %	0 %	25 %	339625577
4550	NC_015744	TTG	2	6	243483	243488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339625577
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4552	NC_015744	CCT	2	6	243743	243748	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339625578
4553	NC_015744	ATCG	2	8	243847	243854	25 %	25 %	25 %	25 %	339625578
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4558	NC_015744	CTG	2	6	243993	243998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625578
4559	NC_015744	GCA	3	9	244022	244030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339625578
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4562	NC_015744	CGGAA	2	10	244104	244113	40 %	0 %	40 %	20 %	339625578
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4604	NC_015744	AAGC	2	8	245898	245905	50 %	0 %	25 %	25 %	339625580
4605	NC_015744	GAT	2	6	245924	245929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625580
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4607	NC_015744	TGC	2	6	245948	245953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339625580
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4610	NC_015744	GT	4	8	246235	246242	0 %	50 %	50 %	0 %	339625580
4611	NC_015744	GA	3	6	246340	246345	50 %	0 %	50 %	0 %	339625580
4612	NC_015744	TGG	2	6	246347	246352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339625580
4613	NC_015744	TAG	2	6	246392	246397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339625580
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4618	NC_015744	ATT	2	6	246743	246748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339625581
4619	NC_015744	TG	3	6	246750	246755	0 %	50 %	50 %	0 %	339625581
4620	NC_015744	AAAG	2	8	246806	246813	75 %	0 %	25 %	0 %	339625581
4621	NC_015744	AAG	2	6	246868	246873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339625581
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