MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium sp. SY8519

Total Repeats: 51688

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015737	GCC	2	6	54258	54263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441115
1002	NC_015737	CTT	2	6	54296	54301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441115
1003	NC_015737	CGG	2	6	54363	54368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441115
1004	NC_015737	CTTC	2	8	54518	54525	0 %	50 %	0 %	50 %	339441115
1005	NC_015737	CG	3	6	54760	54765	0 %	0 %	50 %	50 %	339441115
1006	NC_015737	AGA	2	6	54823	54828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339441115
1007	NC_015737	ATACAT	2	12	54858	54869	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	339441115
1008	NC_015737	TTG	2	6	54910	54915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339441115
1009	NC_015737	CTG	2	6	55006	55011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441115
1010	NC_015737	GCC	2	6	55053	55058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441115
1011	NC_015737	T	6	6	55065	55070	0 %	100 %	0 %	0 %	339441115
1012	NC_015737	CCG	2	6	55094	55099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441115
1013	NC_015737	CGC	2	6	55133	55138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441115
1014	NC_015737	AGA	2	6	55189	55194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339441115
1015	NC_015737	CTGC	2	8	55217	55224	0 %	25 %	25 %	50 %	339441115
1016	NC_015737	GCT	2	6	55379	55384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441115
1017	NC_015737	CGCAG	2	10	55429	55438	20 %	0 %	40 %	40 %	339441115
1018	NC_015737	TCA	2	6	55450	55455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441115
1019	NC_015737	CCATA	2	10	55497	55506	40 %	20 %	0 %	40 %	339441115
1020	NC_015737	TCA	2	6	55528	55533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441115
1021	NC_015737	GCA	2	6	55547	55552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441115
1022	NC_015737	CCA	2	6	55571	55576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441115
1023	NC_015737	CAT	2	6	55653	55658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441115
1024	NC_015737	GATC	2	8	55730	55737	25 %	25 %	25 %	25 %	339441115
1025	NC_015737	CCA	2	6	55769	55774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441115
1026	NC_015737	CCG	3	9	55780	55788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441115
1027	NC_015737	CAT	2	6	55911	55916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441115
1028	NC_015737	GC	3	6	55949	55954	0 %	0 %	50 %	50 %	339441115
1029	NC_015737	GCC	3	9	56025	56033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441115
1030	NC_015737	GCA	2	6	56162	56167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441115
1031	NC_015737	GAT	2	6	56189	56194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441115
1032	NC_015737	CCG	2	6	56252	56257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441115
1033	NC_015737	ACC	2	6	56275	56280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441115
1034	NC_015737	T	6	6	56287	56292	0 %	100 %	0 %	0 %	339441115
1035	NC_015737	CGC	2	6	56306	56311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441115
1036	NC_015737	ATGC	2	8	56320	56327	25 %	25 %	25 %	25 %	339441115
1037	NC_015737	GCA	2	6	56331	56336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441115
1038	NC_015737	TTC	2	6	56359	56364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441115
1039	NC_015737	A	6	6	56449	56454	100 %	0 %	0 %	0 %	339441115
1040	NC_015737	CGA	2	6	56843	56848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441116
1041	NC_015737	GAT	2	6	56877	56882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441116
1042	NC_015737	CCG	2	6	56992	56997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441116
1043	NC_015737	CAC	2	6	57057	57062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441116
1044	NC_015737	GCC	2	6	57073	57078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441116
1045	NC_015737	GGC	2	6	57080	57085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441116
1046	NC_015737	TCC	2	6	57094	57099	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441116
1047	NC_015737	TAT	2	6	57101	57106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339441116
1048	NC_015737	A	6	6	57175	57180	100 %	0 %	0 %	0 %	339441116
1049	NC_015737	TC	3	6	57197	57202	0 %	50 %	0 %	50 %	339441116
1050	NC_015737	CCT	2	6	57206	57211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441116
1051	NC_015737	CGA	2	6	57239	57244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441116
1052	NC_015737	GCC	2	6	57319	57324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441116
1053	NC_015737	GCCG	2	8	57372	57379	0 %	0 %	50 %	50 %	339441116
1054	NC_015737	ATTT	2	8	57479	57486	25 %	75 %	0 %	0 %	339441116
1055	NC_015737	ATC	2	6	57514	57519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441116
1056	NC_015737	GGC	2	6	57558	57563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441116
1057	NC_015737	A	6	6	57622	57627	100 %	0 %	0 %	0 %	339441116
1058	NC_015737	AT	3	6	57748	57753	50 %	50 %	0 %	0 %	339441116
1059	NC_015737	T	7	7	57753	57759	0 %	100 %	0 %	0 %	339441116
1060	NC_015737	TCT	2	6	57796	57801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441116
1061	NC_015737	CAG	2	6	57846	57851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441116
1062	NC_015737	CAA	2	6	57992	57997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339441116
1063	NC_015737	ATTAT	2	10	58057	58066	40 %	60 %	0 %	0 %	339441116
1064	NC_015737	CAG	2	6	58068	58073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441116
1065	NC_015737	CTGC	2	8	58094	58101	0 %	25 %	25 %	50 %	339441116
1066	NC_015737	GAC	2	6	58113	58118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441116
1067	NC_015737	AGG	2	6	58172	58177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339441116
1068	NC_015737	TTG	2	6	58194	58199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339441116
1069	NC_015737	GTCT	2	8	58483	58490	0 %	50 %	25 %	25 %	339441117
1070	NC_015737	CT	3	6	58489	58494	0 %	50 %	0 %	50 %	339441117
1071	NC_015737	TCT	2	6	58572	58577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441117
1072	NC_015737	TA	4	8	58594	58601	50 %	50 %	0 %	0 %	339441117
1073	NC_015737	TTTTCT	2	12	58638	58649	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	339441117
1074	NC_015737	CCGTT	2	10	58662	58671	0 %	40 %	20 %	40 %	339441117
1075	NC_015737	T	7	7	58780	58786	0 %	100 %	0 %	0 %	339441118
1076	NC_015737	TTC	2	6	58793	58798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441118
1077	NC_015737	GAT	2	6	58826	58831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441118
1078	NC_015737	TTC	2	6	58868	58873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441118
1079	NC_015737	TCA	2	6	59153	59158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441119
1080	NC_015737	TTC	2	6	59164	59169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441119
1081	NC_015737	GCC	2	6	59173	59178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441119
1082	NC_015737	CTT	2	6	59187	59192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441119
1083	NC_015737	CCGGAT	2	12	59200	59211	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339441119
1084	NC_015737	CCT	2	6	59681	59686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441120
1085	NC_015737	T	6	6	59713	59718	0 %	100 %	0 %	0 %	339441120
1086	NC_015737	TGA	2	6	59764	59769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441120
1087	NC_015737	TCTG	2	8	59829	59836	0 %	50 %	25 %	25 %	339441120
1088	NC_015737	ACT	2	6	59850	59855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441120
1089	NC_015737	TTTC	2	8	59858	59865	0 %	75 %	0 %	25 %	339441120
1090	NC_015737	TCTG	2	8	59875	59882	0 %	50 %	25 %	25 %	339441120
1091	NC_015737	T	6	6	59949	59954	0 %	100 %	0 %	0 %	339441121
1092	NC_015737	TAA	2	6	60004	60009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339441121
1093	NC_015737	GCC	2	6	60041	60046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441121
1094	NC_015737	TCA	2	6	60096	60101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441121
1095	NC_015737	AT	4	8	60105	60112	50 %	50 %	0 %	0 %	339441121
1096	NC_015737	TCA	2	6	60144	60149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441121
1097	NC_015737	GCT	2	6	60184	60189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441121
1098	NC_015737	CTT	2	6	60254	60259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441122
1099	NC_015737	TGC	2	6	60290	60295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441122
1100	NC_015737	CTT	2	6	60305	60310	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339441122
1101	NC_015737	AAT	2	6	60423	60428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339441122
1102	NC_015737	CTC	2	6	60443	60448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441123
1103	NC_015737	TTTC	2	8	60463	60470	0 %	75 %	0 %	25 %	339441123
1104	NC_015737	GAC	2	6	60473	60478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441123
1105	NC_015737	CCA	2	6	60480	60485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339441123
1106	NC_015737	GAA	2	6	60652	60657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339441123
1107	NC_015737	CAT	2	6	60911	60916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441124
1108	NC_015737	GTC	2	6	60942	60947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441124
1109	NC_015737	A	6	6	60983	60988	100 %	0 %	0 %	0 %	339441124
1110	NC_015737	TAG	2	6	60992	60997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441124
1111	NC_015737	T	6	6	61031	61036	0 %	100 %	0 %	0 %	339441124
1112	NC_015737	CAT	2	6	61044	61049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441124
1113	NC_015737	CAT	2	6	61225	61230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339441125
1114	NC_015737	GTA	2	6	61304	61309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339441125
1115	NC_015737	TC	3	6	61312	61317	0 %	50 %	0 %	50 %	339441125
1116	NC_015737	TCC	2	6	61410	61415	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339441125
1117	NC_015737	ACA	2	6	61416	61421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339441125
1118	NC_015737	GCC	2	6	61479	61484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441125
1119	NC_015737	GCG	2	6	61555	61560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339441126
1120	NC_015737	ATTTA	2	10	61572	61581	40 %	60 %	0 %	0 %	339441126
1121	NC_015737	GCT	2	6	61608	61613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339441126
1122	NC_015737	AT	3	6	61684	61689	50 %	50 %	0 %	0 %	339441126
1123	NC_015737	CATC	2	8	61748	61755	25 %	25 %	0 %	50 %	339441126
1124	NC_015737	CCG	2	6	61762	61767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339441126
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1126	NC_015737	ACG	2	6	61865	61870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339441126
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