MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 26592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015727	G	6	6	200444	200449	0 %	0 %	100 %	0 %	339327971
3502	NC_015727	GGC	2	6	200463	200468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327971
3503	NC_015727	GC	3	6	200493	200498	0 %	0 %	50 %	50 %	339327971
3504	NC_015727	CG	3	6	200500	200505	0 %	0 %	50 %	50 %	339327971
3505	NC_015727	GCA	2	6	200535	200540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327971
3506	NC_015727	ATGAGG	2	12	201434	201445	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	339327972
3507	NC_015727	CTTGC	2	10	201470	201479	0 %	40 %	20 %	40 %	339327972
3508	NC_015727	GAC	2	6	201571	201576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327972
3509	NC_015727	CGA	2	6	201600	201605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327972
3510	NC_015727	ATC	2	6	201608	201613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327972
3511	NC_015727	GGCG	2	8	201649	201656	0 %	0 %	75 %	25 %	339327972
3512	NC_015727	AAG	2	6	201657	201662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327972
3513	NC_015727	GGT	2	6	201743	201748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327972
3514	NC_015727	CGG	2	6	201780	201785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327972
3515	NC_015727	CTC	2	6	201792	201797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327972
3516	NC_015727	CGGG	2	8	201810	201817	0 %	0 %	75 %	25 %	339327972
3517	NC_015727	CGT	2	6	201850	201855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327972
3518	NC_015727	GAA	2	6	201943	201948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327972
3519	NC_015727	AAG	2	6	201953	201958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327972
3520	NC_015727	GGT	3	9	201991	201999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327972
3521	NC_015727	GTCG	2	8	202000	202007	0 %	25 %	50 %	25 %	339327972
3522	NC_015727	GAA	2	6	202018	202023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327972
3523	NC_015727	TGA	2	6	202183	202188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327973
3524	NC_015727	GC	3	6	202199	202204	0 %	0 %	50 %	50 %	339327973
3525	NC_015727	GGT	2	6	202235	202240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327973
3526	NC_015727	CG	3	6	202254	202259	0 %	0 %	50 %	50 %	339327973
3527	NC_015727	GAA	2	6	202260	202265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327973
3528	NC_015727	TTA	2	6	202273	202278	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339327973
3529	NC_015727	TCG	2	6	202327	202332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327973
3530	NC_015727	CGC	2	6	202475	202480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327973
3531	NC_015727	CAA	2	6	202553	202558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327973
3532	NC_015727	TCAA	2	8	202877	202884	50 %	25 %	0 %	25 %	339327974
3533	NC_015727	GGC	2	6	202915	202920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327974
3534	NC_015727	GC	3	6	202942	202947	0 %	0 %	50 %	50 %	339327974
3535	NC_015727	TGC	2	6	203053	203058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327974
3536	NC_015727	AGT	2	6	203063	203068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327974
3537	NC_015727	GAG	2	6	203093	203098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327974
3538	NC_015727	CCGGA	2	10	203148	203157	20 %	0 %	40 %	40 %	339327974
3539	NC_015727	AGC	2	6	203215	203220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327974
3540	NC_015727	TCC	2	6	203257	203262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339327974
3541	NC_015727	GCG	2	6	203279	203284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327974
3542	NC_015727	TGG	2	6	203317	203322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327974
3543	NC_015727	AAG	2	6	203323	203328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327974
3544	NC_015727	CG	4	8	203397	203404	0 %	0 %	50 %	50 %	339327974
3545	NC_015727	TCG	2	6	203407	203412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327974
3546	NC_015727	GC	3	6	203427	203432	0 %	0 %	50 %	50 %	339327974
3547	NC_015727	GC	3	6	203485	203490	0 %	0 %	50 %	50 %	339327974
3548	NC_015727	CTG	3	9	203541	203549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327974
3549	NC_015727	TCCAT	2	10	203555	203564	20 %	40 %	0 %	40 %	339327974
3550	NC_015727	ATC	2	6	203749	203754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327974
3551	NC_015727	TGC	2	6	203758	203763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327974
3552	NC_015727	GTT	2	6	203778	203783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327974
3553	NC_015727	AGC	3	9	203836	203844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327974
3554	NC_015727	TTC	2	6	203851	203856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327974
3555	NC_015727	CTTG	2	8	204286	204293	0 %	50 %	25 %	25 %	339327975
3556	NC_015727	ACG	2	6	204319	204324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327975
3557	NC_015727	GCC	2	6	204330	204335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327975
3558	NC_015727	TTC	2	6	204349	204354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327975
3559	NC_015727	GC	3	6	204394	204399	0 %	0 %	50 %	50 %	339327975
3560	NC_015727	ATG	2	6	204415	204420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327975
3561	NC_015727	GTC	2	6	204421	204426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327975
3562	NC_015727	AAG	2	6	204444	204449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327975
3563	NC_015727	GC	3	6	204452	204457	0 %	0 %	50 %	50 %	339327975
3564	NC_015727	CG	3	6	204463	204468	0 %	0 %	50 %	50 %	339327975
3565	NC_015727	CCA	2	6	204496	204501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339327975
3566	NC_015727	CAG	3	9	204525	204533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327975
3567	NC_015727	CGC	2	6	204576	204581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327975
3568	NC_015727	AG	3	6	204619	204624	50 %	0 %	50 %	0 %	339327975
3569	NC_015727	CGAC	2	8	204637	204644	25 %	0 %	25 %	50 %	339327975
3570	NC_015727	GCGA	2	8	204673	204680	25 %	0 %	50 %	25 %	339327975
3571	NC_015727	GGC	2	6	205013	205018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327976
3572	NC_015727	TGG	2	6	205033	205038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327976
3573	NC_015727	AGC	2	6	205118	205123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327976
3574	NC_015727	CGC	2	6	205135	205140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327976
3575	NC_015727	CAG	2	6	205177	205182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327976
3576	NC_015727	TGCA	2	8	205218	205225	25 %	25 %	25 %	25 %	339327976
3577	NC_015727	CACG	2	8	205257	205264	25 %	0 %	25 %	50 %	339327976
3578	NC_015727	CAG	2	6	205312	205317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327976
3579	NC_015727	GTCGGA	2	12	205562	205573	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339327977
3580	NC_015727	GT	4	8	205583	205590	0 %	50 %	50 %	0 %	339327977
3581	NC_015727	GATC	2	8	205617	205624	25 %	25 %	25 %	25 %	339327977
3582	NC_015727	CCGT	2	8	205751	205758	0 %	25 %	25 %	50 %	339327977
3583	NC_015727	GCCT	2	8	205821	205828	0 %	25 %	25 %	50 %	339327977
3584	NC_015727	CCCG	2	8	205909	205916	0 %	0 %	25 %	75 %	339327977
3585	NC_015727	TGG	2	6	205940	205945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327977
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3587	NC_015727	GCG	2	6	205992	205997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327977
3588	NC_015727	GGC	2	6	206310	206315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327978
3589	NC_015727	CGT	2	6	206378	206383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327978
3590	NC_015727	CCG	2	6	206516	206521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327978
3591	NC_015727	TA	3	6	206547	206552	50 %	50 %	0 %	0 %	339327978
3592	NC_015727	T	6	6	206566	206571	0 %	100 %	0 %	0 %	339327978
3593	NC_015727	ATG	2	6	206626	206631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327978
3594	NC_015727	CAG	2	6	206772	206777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327978
3595	NC_015727	CCG	3	9	206828	206836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327978
3596	NC_015727	AGG	2	6	206842	206847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327978
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3598	NC_015727	GCA	2	6	206915	206920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327978
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3601	NC_015727	TCG	2	6	208916	208921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327979
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3604	NC_015727	TGT	2	6	209006	209011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339327979
3605	NC_015727	TG	3	6	209188	209193	0 %	50 %	50 %	0 %	339327980
3606	NC_015727	GAC	2	6	209349	209354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327980
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3609	NC_015727	GCT	2	6	209482	209487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327980
3610	NC_015727	GCTT	2	8	209506	209513	0 %	50 %	25 %	25 %	339327980
3611	NC_015727	CAG	2	6	209519	209524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327980
3612	NC_015727	GCA	2	6	209611	209616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327981
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3615	NC_015727	CGGC	2	8	209688	209695	0 %	0 %	50 %	50 %	339327981
3616	NC_015727	GCC	2	6	209855	209860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327981
3617	NC_015727	GCT	2	6	209917	209922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327981
3618	NC_015727	CGAT	2	8	209975	209982	25 %	25 %	25 %	25 %	339327981
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3622	NC_015727	CGG	2	6	210200	210205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327983
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