MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 26592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015727	T	6	6	169948	169953	0 %	100 %	0 %	0 %	339327939
3002	NC_015727	GCAG	2	8	170007	170014	25 %	0 %	50 %	25 %	339327939
3003	NC_015727	GAC	2	6	170056	170061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327940
3004	NC_015727	GC	3	6	170096	170101	0 %	0 %	50 %	50 %	339327940
3005	NC_015727	CTTC	2	8	170167	170174	0 %	50 %	0 %	50 %	339327940
3006	NC_015727	GGCG	2	8	170182	170189	0 %	0 %	75 %	25 %	339327940
3007	NC_015727	GCC	2	6	170209	170214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327940
3008	NC_015727	GTCGC	2	10	170233	170242	0 %	20 %	40 %	40 %	339327940
3009	NC_015727	CAA	2	6	170275	170280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327940
3010	NC_015727	TGG	2	6	170337	170342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327940
3011	NC_015727	GCCTCG	2	12	170391	170402	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339327940
3012	NC_015727	GCT	2	6	170413	170418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327940
3013	NC_015727	ATC	2	6	170484	170489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327940
3014	NC_015727	C	6	6	170554	170559	0 %	0 %	0 %	100 %	339327940
3015	NC_015727	GGCC	2	8	170571	170578	0 %	0 %	50 %	50 %	339327940
3016	NC_015727	GGT	2	6	170594	170599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327940
3017	NC_015727	TAC	2	6	170723	170728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327940
3018	NC_015727	ACA	2	6	170790	170795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327940
3019	NC_015727	CAT	2	6	170824	170829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327940
3020	NC_015727	TGA	2	6	170931	170936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327940
3021	NC_015727	CCGAG	2	10	170980	170989	20 %	0 %	40 %	40 %	339327940
3022	NC_015727	GGC	2	6	170995	171000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327940
3023	NC_015727	GC	3	6	171024	171029	0 %	0 %	50 %	50 %	339327940
3024	NC_015727	ACGC	2	8	171034	171041	25 %	0 %	25 %	50 %	339327940
3025	NC_015727	GGT	2	6	171049	171054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327940
3026	NC_015727	ATC	2	6	171099	171104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327940
3027	NC_015727	GGT	2	6	171118	171123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327940
3028	NC_015727	TCA	2	6	171148	171153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327940
3029	NC_015727	CAA	2	6	171199	171204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327940
3030	NC_015727	GAGC	2	8	171214	171221	25 %	0 %	50 %	25 %	339327940
3031	NC_015727	GCC	2	6	171236	171241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327940
3032	NC_015727	GAC	2	6	171400	171405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327941
3033	NC_015727	CCG	2	6	171446	171451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327941
3034	NC_015727	GC	3	6	171462	171467	0 %	0 %	50 %	50 %	339327941
3035	NC_015727	CGG	2	6	171504	171509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327941
3036	NC_015727	CG	3	6	171627	171632	0 %	0 %	50 %	50 %	339327941
3037	NC_015727	CGG	2	6	171752	171757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327942
3038	NC_015727	GC	4	8	171789	171796	0 %	0 %	50 %	50 %	339327942
3039	NC_015727	GCA	2	6	171833	171838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327942
3040	NC_015727	AATGG	2	10	171842	171851	40 %	20 %	40 %	0 %	339327942
3041	NC_015727	TGG	2	6	171961	171966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327942
3042	NC_015727	TGCT	2	8	172062	172069	0 %	50 %	25 %	25 %	339327942
3043	NC_015727	TCA	2	6	172158	172163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327943
3044	NC_015727	GC	3	6	172219	172224	0 %	0 %	50 %	50 %	339327943
3045	NC_015727	GAC	2	6	172244	172249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327943
3046	NC_015727	CGG	2	6	172314	172319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327943
3047	NC_015727	CG	5	10	172320	172329	0 %	0 %	50 %	50 %	339327943
3048	NC_015727	CGG	2	6	172365	172370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327943
3049	NC_015727	CTG	2	6	172427	172432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327943
3050	NC_015727	CAT	2	6	172447	172452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339327943
3051	NC_015727	ACG	2	6	172527	172532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327943
3052	NC_015727	CG	3	6	172531	172536	0 %	0 %	50 %	50 %	339327943
3053	NC_015727	GCG	2	6	172555	172560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327943
3054	NC_015727	GCC	2	6	172568	172573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327943
3055	NC_015727	AGG	2	6	172662	172667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327943
3056	NC_015727	CGG	2	6	172719	172724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327943
3057	NC_015727	GGC	3	9	172774	172782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327943
3058	NC_015727	GCTG	2	8	172834	172841	0 %	25 %	50 %	25 %	339327943
3059	NC_015727	GGC	2	6	172891	172896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327943
3060	NC_015727	GCA	2	6	173302	173307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327944
3061	NC_015727	CCAG	2	8	173360	173367	25 %	0 %	25 %	50 %	339327944
3062	NC_015727	CG	3	6	173376	173381	0 %	0 %	50 %	50 %	339327944
3063	NC_015727	GCG	2	6	173455	173460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327944
3064	NC_015727	GCC	2	6	173465	173470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327944
3065	NC_015727	CCGA	2	8	173598	173605	25 %	0 %	25 %	50 %	339327944
3066	NC_015727	TCT	2	6	173612	173617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327944
3067	NC_015727	CCTGC	2	10	173622	173631	0 %	20 %	20 %	60 %	339327944
3068	NC_015727	CGGG	2	8	173641	173648	0 %	0 %	75 %	25 %	339327944
3069	NC_015727	GAT	2	6	173700	173705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327944
3070	NC_015727	GCG	2	6	173731	173736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339327944
3071	NC_015727	GC	3	6	173792	173797	0 %	0 %	50 %	50 %	339327944
3072	NC_015727	GCCAT	2	10	173824	173833	20 %	20 %	20 %	40 %	339327944
3073	NC_015727	CAGT	2	8	173839	173846	25 %	25 %	25 %	25 %	339327944
3074	NC_015727	CTG	2	6	173890	173895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327944
3075	NC_015727	GAT	2	6	173898	173903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339327944
3076	NC_015727	TTGGA	2	10	173920	173929	20 %	40 %	40 %	0 %	339327944
3077	NC_015727	CGA	2	6	173936	173941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327944
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3080	NC_015727	TACCGC	2	12	174263	174274	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339327944
3081	NC_015727	CTT	2	6	174275	174280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327944
3082	NC_015727	CTG	2	6	174297	174302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327944
3083	NC_015727	CTG	2	6	174343	174348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327944
3084	NC_015727	GGAC	2	8	174380	174387	25 %	0 %	50 %	25 %	339327944
3085	NC_015727	CGGAC	2	10	174479	174488	20 %	0 %	40 %	40 %	339327944
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3088	NC_015727	CGC	2	6	174563	174568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339327944
3089	NC_015727	AGC	2	6	174619	174624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327944
3090	NC_015727	GAAGCC	2	12	174684	174695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327944
3091	NC_015727	GC	3	6	174704	174709	0 %	0 %	50 %	50 %	339327944
3092	NC_015727	GCT	2	6	174721	174726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327944
3093	NC_015727	CGA	2	6	174731	174736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327944
3094	NC_015727	ATGC	2	8	174741	174748	25 %	25 %	25 %	25 %	339327944
3095	NC_015727	CA	3	6	174768	174773	50 %	0 %	0 %	50 %	339327944
3096	NC_015727	CCAG	2	8	176134	176141	25 %	0 %	25 %	50 %	339327945
3097	NC_015727	CTGC	2	8	176147	176154	0 %	25 %	25 %	50 %	339327945
3098	NC_015727	CGT	2	6	176169	176174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327945
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3102	NC_015727	AG	3	6	176815	176820	50 %	0 %	50 %	0 %	339327946
3103	NC_015727	ACTG	2	8	176835	176842	25 %	25 %	25 %	25 %	339327946
3104	NC_015727	AGC	2	6	176867	176872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327946
3105	NC_015727	TTC	2	6	176873	176878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339327946
3106	NC_015727	TCG	2	6	176885	176890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339327946
3107	NC_015727	CGTG	2	8	176970	176977	0 %	25 %	50 %	25 %	339327946
3108	NC_015727	TTGAG	2	10	176991	177000	20 %	40 %	40 %	0 %	339327946
3109	NC_015727	GGT	2	6	177023	177028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339327946
3110	NC_015727	GGA	2	6	177040	177045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339327946
3111	NC_015727	GA	3	6	177076	177081	50 %	0 %	50 %	0 %	339327946
3112	NC_015727	GAA	2	6	177136	177141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339327946
3113	NC_015727	GATC	2	8	177652	177659	25 %	25 %	25 %	25 %	339327947
3114	NC_015727	CAA	3	9	177746	177754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339327947
3115	NC_015727	CG	3	6	177758	177763	0 %	0 %	50 %	50 %	339327947
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3119	NC_015727	GCCG	2	8	178487	178494	0 %	0 %	50 %	50 %	339327949
3120	NC_015727	GCCC	2	8	178570	178577	0 %	0 %	25 %	75 %	339327949
3121	NC_015727	GC	3	6	178607	178612	0 %	0 %	50 %	50 %	339327949
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3123	NC_015727	AGC	2	6	178669	178674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339327949
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