MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 26592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015727	GCC	3	9	342889	342897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328111
6002	NC_015727	A	7	7	342903	342909	100 %	0 %	0 %	0 %	339328111
6003	NC_015727	AGCCA	2	10	342966	342975	40 %	0 %	20 %	40 %	339328111
6004	NC_015727	GGC	2	6	343060	343065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328111
6005	NC_015727	CG	3	6	343156	343161	0 %	0 %	50 %	50 %	339328111
6006	NC_015727	GCG	2	6	343174	343179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328111
6007	NC_015727	CGG	2	6	343204	343209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328111
6008	NC_015727	TGG	2	6	343250	343255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328111
6009	NC_015727	ACC	2	6	343360	343365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328111
6010	NC_015727	GCC	2	6	343367	343372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328111
6011	NC_015727	CAG	2	6	343389	343394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328111
6012	NC_015727	ACGA	2	8	343401	343408	50 %	0 %	25 %	25 %	339328111
6013	NC_015727	GCA	2	6	343448	343453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328111
6014	NC_015727	CAG	2	6	343485	343490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328111
6015	NC_015727	GC	3	6	343526	343531	0 %	0 %	50 %	50 %	339328111
6016	NC_015727	GC	4	8	343547	343554	0 %	0 %	50 %	50 %	339328111
6017	NC_015727	CGG	2	6	343604	343609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328111
6018	NC_015727	ACG	2	6	343672	343677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328111
6019	NC_015727	GCC	2	6	343681	343686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328111
6020	NC_015727	ATG	2	6	343720	343725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328111
6021	NC_015727	CGCC	2	8	343842	343849	0 %	0 %	25 %	75 %	339328112
6022	NC_015727	GC	3	6	343884	343889	0 %	0 %	50 %	50 %	339328112
6023	NC_015727	GCG	3	9	343965	343973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328112
6024	NC_015727	GAT	2	6	344092	344097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328112
6025	NC_015727	GC	3	6	344126	344131	0 %	0 %	50 %	50 %	339328112
6026	NC_015727	TGG	2	6	344147	344152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328112
6027	NC_015727	CGG	2	6	344163	344168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328112
6028	NC_015727	CGA	2	6	344190	344195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328112
6029	NC_015727	ACG	2	6	344243	344248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328112
6030	NC_015727	AGC	2	6	344270	344275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328112
6031	NC_015727	CGG	2	6	344279	344284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328112
6032	NC_015727	CCAG	2	8	344340	344347	25 %	0 %	25 %	50 %	339328112
6033	NC_015727	TCC	2	6	344402	344407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339328112
6034	NC_015727	CAG	2	6	344419	344424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328112
6035	NC_015727	CGG	2	6	344425	344430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328112
6036	NC_015727	GAA	2	6	344461	344466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339328112
6037	NC_015727	GCTG	2	8	344478	344485	0 %	25 %	50 %	25 %	339328112
6038	NC_015727	AGCGC	2	10	344514	344523	20 %	0 %	40 %	40 %	339328112
6039	NC_015727	ACGC	2	8	344524	344531	25 %	0 %	25 %	50 %	339328112
6040	NC_015727	CG	3	6	344639	344644	0 %	0 %	50 %	50 %	339328112
6041	NC_015727	CG	3	6	344682	344687	0 %	0 %	50 %	50 %	339328112
6042	NC_015727	GCTC	2	8	344706	344713	0 %	25 %	25 %	50 %	339328112
6043	NC_015727	CCAGCA	2	12	344724	344735	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	339328112
6044	NC_015727	ATG	2	6	344783	344788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328112
6045	NC_015727	GTC	2	6	344937	344942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328113
6046	NC_015727	GCC	2	6	344983	344988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328113
6047	NC_015727	CCA	2	6	344996	345001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328113
6048	NC_015727	CCG	2	6	345032	345037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328113
6049	NC_015727	CTGT	2	8	345092	345099	0 %	50 %	25 %	25 %	339328113
6050	NC_015727	CCAC	2	8	345115	345122	25 %	0 %	0 %	75 %	339328113
6051	NC_015727	TCG	2	6	345141	345146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328113
6052	NC_015727	GCCA	2	8	345205	345212	25 %	0 %	25 %	50 %	339328113
6053	NC_015727	CGG	2	6	345215	345220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328113
6054	NC_015727	GC	3	6	345302	345307	0 %	0 %	50 %	50 %	339328113
6055	NC_015727	TCG	2	6	345383	345388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328113
6056	NC_015727	AGC	2	6	345418	345423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328113
6057	NC_015727	CGC	2	6	345431	345436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328113
6058	NC_015727	GCC	2	6	345446	345451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328113
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6061	NC_015727	TGA	2	6	345791	345796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328114
6062	NC_015727	TCG	2	6	345800	345805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328114
6063	NC_015727	CGCAAG	2	12	345868	345879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328114
6064	NC_015727	CGT	2	6	345914	345919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328114
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6069	NC_015727	TCG	2	6	346031	346036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328114
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6072	NC_015727	TCG	2	6	346085	346090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328114
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6075	NC_015727	CAT	2	6	346170	346175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328114
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6077	NC_015727	ATC	2	6	346270	346275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328114
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6080	NC_015727	TGGC	2	8	346535	346542	0 %	25 %	50 %	25 %	339328114
6081	NC_015727	CAA	2	6	346575	346580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339328114
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6088	NC_015727	GC	3	6	346787	346792	0 %	0 %	50 %	50 %	339328114
6089	NC_015727	ACG	2	6	346820	346825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328114
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6094	NC_015727	GC	4	8	347278	347285	0 %	0 %	50 %	50 %	339328115
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6097	NC_015727	AGGGC	2	10	347413	347422	20 %	0 %	60 %	20 %	339328115
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6104	NC_015727	GC	5	10	347646	347655	0 %	0 %	50 %	50 %	339328115
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6107	NC_015727	GC	3	6	347891	347896	0 %	0 %	50 %	50 %	339328116
6108	NC_015727	CG	3	6	347914	347919	0 %	0 %	50 %	50 %	339328116
6109	NC_015727	CG	3	6	347965	347970	0 %	0 %	50 %	50 %	339328116
6110	NC_015727	CGA	2	6	348040	348045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328116
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6112	NC_015727	CGGC	2	8	348259	348266	0 %	0 %	50 %	50 %	339328116
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6119	NC_015727	CACG	2	8	348535	348542	25 %	0 %	25 %	50 %	339328116
6120	NC_015727	CAGA	2	8	348623	348630	50 %	0 %	25 %	25 %	339328116
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6122	NC_015727	CGG	2	6	348804	348809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328117
6123	NC_015727	CCGGT	2	10	348825	348834	0 %	20 %	40 %	40 %	339328117
6124	NC_015727	GGC	2	6	348838	348843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328117
6125	NC_015727	CGC	3	9	348851	348859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328117
6126	NC_015727	GCA	2	6	348871	348876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328117
6127	NC_015727	GGC	2	6	348900	348905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328117
6128	NC_015727	TGC	2	6	348949	348954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328117
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6141	NC_015727	CCGTG	2	10	349985	349994	0 %	20 %	40 %	40 %	339328118
6142	NC_015727	CG	4	8	350015	350022	0 %	0 %	50 %	50 %	339328118
6143	NC_015727	GTG	2	6	350061	350066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328118
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6145	NC_015727	CGA	2	6	350083	350088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328118
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6148	NC_015727	CGC	2	6	350318	350323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328118
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6150	NC_015727	CGG	2	6	350395	350400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328118
6151	NC_015727	GC	5	10	350448	350457	0 %	0 %	50 %	50 %	339328118
6152	NC_015727	GCGTGG	2	12	350500	350511	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	339328118
6153	NC_015727	CAT	2	6	350579	350584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328118
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6157	NC_015727	CTG	2	6	350879	350884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328119
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6159	NC_015727	TGCG	2	8	351063	351070	0 %	25 %	50 %	25 %	339328119
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6163	NC_015727	GATG	2	8	352116	352123	25 %	25 %	50 %	0 %	339328120
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6193	NC_015727	CGA	2	6	354030	354035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328122
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6199	NC_015727	GTC	2	6	354183	354188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328122
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6232	NC_015727	CGG	2	6	355873	355878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328124
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6240	NC_015727	GCC	2	6	356177	356182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328124
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6242	NC_015727	ACG	2	6	356209	356214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328124
6243	NC_015727	GGC	2	6	356259	356264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328124
6244	NC_015727	GTT	2	6	356303	356308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339328124
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6356	NC_015727	T	6	6	364501	364506	0 %	100 %	0 %	0 %	339328131
6357	NC_015727	CTA	2	6	364509	364514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328131
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6486	NC_015727	CTC	2	6	372916	372921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339328144
6487	NC_015727	AGC	2	6	372930	372935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328144
6488	NC_015727	CG	3	6	372951	372956	0 %	0 %	50 %	50 %	339328144
6489	NC_015727	CGT	2	6	372961	372966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328144
6490	NC_015727	GAG	2	6	372994	372999	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339328144
6491	NC_015727	CGCGG	2	10	373011	373020	0 %	0 %	60 %	40 %	339328144
6492	NC_015727	GTT	2	6	373032	373037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339328144
6493	NC_015727	AAC	2	6	373051	373056	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339328144
6494	NC_015727	TCCC	2	8	373094	373101	0 %	25 %	0 %	75 %	339328144
6495	NC_015727	CGA	2	6	373155	373160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328145
6496	NC_015727	CAA	2	6	373194	373199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339328145
6497	NC_015727	CGG	2	6	373256	373261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328145
6498	NC_015727	AAC	2	6	373294	373299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339328145
6499	NC_015727	GACGGC	2	12	373333	373344	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339328145
6500	NC_015727	TGC	2	6	373346	373351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328145

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