MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB1p

Total Repeats: 26592

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015727	GGC	2	6	290290	290295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328061
5002	NC_015727	CAAT	2	8	290326	290333	50 %	25 %	0 %	25 %	339328061
5003	NC_015727	CGG	2	6	290377	290382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328061
5004	NC_015727	CGG	2	6	290434	290439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328061
5005	NC_015727	GGT	2	6	290480	290485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328061
5006	NC_015727	GCA	2	6	290541	290546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328061
5007	NC_015727	CGC	2	6	290566	290571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328061
5008	NC_015727	TGC	2	6	290578	290583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328061
5009	NC_015727	CGT	2	6	290592	290597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328061
5010	NC_015727	GGC	2	6	290624	290629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328061
5011	NC_015727	TAC	2	6	290741	290746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328061
5012	NC_015727	AAC	2	6	290849	290854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339328061
5013	NC_015727	AGC	2	6	291162	291167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328062
5014	NC_015727	TGA	2	6	291205	291210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328062
5015	NC_015727	CGT	2	6	292142	292147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328063
5016	NC_015727	GCG	2	6	292239	292244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328063
5017	NC_015727	GAAG	2	8	292328	292335	50 %	0 %	50 %	0 %	339328064
5018	NC_015727	TTTCG	2	10	292365	292374	0 %	60 %	20 %	20 %	339328064
5019	NC_015727	TGCC	2	8	292507	292514	0 %	25 %	25 %	50 %	339328064
5020	NC_015727	AGG	2	6	292549	292554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339328064
5021	NC_015727	GCC	2	6	292572	292577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328064
5022	NC_015727	CTG	3	9	292617	292625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5023	NC_015727	CGG	2	6	292634	292639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5024	NC_015727	CCA	2	6	292730	292735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328064
5025	NC_015727	TTCA	2	8	292743	292750	25 %	50 %	0 %	25 %	339328064
5026	NC_015727	CA	3	6	292768	292773	50 %	0 %	0 %	50 %	339328064
5027	NC_015727	GGCT	2	8	292819	292826	0 %	25 %	50 %	25 %	339328064
5028	NC_015727	GCT	2	6	292832	292837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5029	NC_015727	CGGT	2	8	292923	292930	0 %	25 %	50 %	25 %	339328064
5030	NC_015727	GC	3	6	292935	292940	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5031	NC_015727	GCCG	2	8	293057	293064	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5032	NC_015727	CT	3	6	293091	293096	0 %	50 %	0 %	50 %	339328064
5033	NC_015727	GTG	2	6	293100	293105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328064
5034	NC_015727	GCT	2	6	293111	293116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5035	NC_015727	CGG	2	6	293125	293130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5036	NC_015727	CGGC	2	8	293146	293153	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5037	NC_015727	GCG	2	6	293171	293176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5038	NC_015727	TGA	2	6	293251	293256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339328064
5039	NC_015727	TGC	2	6	293296	293301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5040	NC_015727	GTG	2	6	293319	293324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328064
5041	NC_015727	GC	3	6	293332	293337	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5042	NC_015727	GCTGGT	2	12	293342	293353	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339328064
5043	NC_015727	GCT	2	6	293513	293518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5044	NC_015727	GC	3	6	293549	293554	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5045	NC_015727	GCC	2	6	293636	293641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328064
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5047	NC_015727	CG	3	6	293659	293664	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5048	NC_015727	CCG	2	6	293693	293698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328064
5049	NC_015727	GAC	2	6	293748	293753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5050	NC_015727	CTG	3	9	293823	293831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5051	NC_015727	GCT	2	6	293873	293878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5052	NC_015727	CGA	2	6	293948	293953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5053	NC_015727	CGGC	2	8	293957	293964	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5054	NC_015727	GCG	2	6	293998	294003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5055	NC_015727	ATC	2	6	294103	294108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328064
5056	NC_015727	GC	3	6	294114	294119	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5057	NC_015727	GTG	2	6	294168	294173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328064
5058	NC_015727	GCC	2	6	294196	294201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328064
5059	NC_015727	AGC	2	6	294229	294234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5060	NC_015727	CAT	2	6	294266	294271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339328064
5061	NC_015727	GGC	2	6	294285	294290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5062	NC_015727	GCG	2	6	294309	294314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5063	NC_015727	GGC	2	6	294333	294338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5064	NC_015727	GCG	2	6	294347	294352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5065	NC_015727	GAG	2	6	294354	294359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339328064
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5067	NC_015727	CG	3	6	294419	294424	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5068	NC_015727	GAG	2	6	294549	294554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339328064
5069	NC_015727	GGC	2	6	294559	294564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5070	NC_015727	GCG	2	6	294648	294653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5071	NC_015727	GCG	2	6	294750	294755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5072	NC_015727	AG	3	6	294853	294858	50 %	0 %	50 %	0 %	339328064
5073	NC_015727	GGTC	2	8	294872	294879	0 %	25 %	50 %	25 %	339328064
5074	NC_015727	CG	3	6	294950	294955	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5075	NC_015727	GGC	2	6	294961	294966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
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5078	NC_015727	CGA	2	6	295079	295084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5079	NC_015727	TGCG	2	8	295090	295097	0 %	25 %	50 %	25 %	339328064
5080	NC_015727	CGT	2	6	295150	295155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5081	NC_015727	CGG	2	6	295210	295215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5082	NC_015727	TGG	2	6	295246	295251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339328064
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5084	NC_015727	ATCCG	2	10	295324	295333	20 %	20 %	20 %	40 %	339328064
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5088	NC_015727	CAA	2	6	295412	295417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339328064
5089	NC_015727	CTG	2	6	295431	295436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5090	NC_015727	GCG	2	6	295441	295446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5091	NC_015727	CGC	2	6	295447	295452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328064
5092	NC_015727	CGAAGC	2	12	295469	295480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5093	NC_015727	CG	4	8	295493	295500	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5094	NC_015727	TTG	3	9	295516	295524	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339328064
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5098	NC_015727	T	6	6	295698	295703	0 %	100 %	0 %	0 %	339328064
5099	NC_015727	GCC	2	6	295704	295709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328064
5100	NC_015727	GCG	3	9	295728	295736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5101	NC_015727	GC	3	6	295739	295744	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5102	NC_015727	GCT	2	6	295751	295756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328064
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5105	NC_015727	CTGG	2	8	295872	295879	0 %	25 %	50 %	25 %	339328064
5106	NC_015727	ACC	2	6	295882	295887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339328064
5107	NC_015727	TGGG	2	8	295969	295976	0 %	25 %	75 %	0 %	339328064
5108	NC_015727	CG	4	8	296021	296028	0 %	0 %	50 %	50 %	339328064
5109	NC_015727	GGC	2	6	296069	296074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
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5111	NC_015727	CGC	2	6	296145	296150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339328064
5112	NC_015727	GAA	2	6	296205	296210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339328064
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5114	NC_015727	CTG	2	6	296376	296381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328064
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5116	NC_015727	GCCAT	2	10	296434	296443	20 %	20 %	20 %	40 %	339328064
5117	NC_015727	CGT	2	6	296528	296533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339328064
5118	NC_015727	TGCC	2	8	296610	296617	0 %	25 %	25 %	50 %	339328064
5119	NC_015727	CTC	2	6	296619	296624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339328064
5120	NC_015727	GCG	2	6	296697	296702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
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5122	NC_015727	GGC	2	6	296726	296731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328064
5123	NC_015727	GCATCT	2	12	296818	296829	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339328064
5124	NC_015727	ACG	2	6	296860	296865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339328064
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5239	NC_015727	GC	3	6	302879	302884	0 %	0 %	50 %	50 %	339328070
5240	NC_015727	GGC	2	6	302948	302953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339328070
5241	NC_015727	CTAT	2	8	303112	303119	25 %	50 %	0 %	25 %	339328070
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5472	NC_015727	AT	3	6	315917	315922	50 %	50 %	0 %	0 %	339328085
5473	NC_015727	AAG	2	6	315926	315931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339328085
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