MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 93544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015726	CGGG	2	8	22297	22304	0 %	0 %	75 %	25 %	339324177
502	NC_015726	GAT	2	6	22320	22325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324177
503	NC_015726	GCC	2	6	22374	22379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324177
504	NC_015726	ACC	2	6	22390	22395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324177
505	NC_015726	ACC	2	6	22429	22434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324177
506	NC_015726	GTG	2	6	22447	22452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324177
507	NC_015726	CGC	2	6	22454	22459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324177
508	NC_015726	ACG	2	6	22525	22530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324177
509	NC_015726	GGC	2	6	22685	22690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324177
510	NC_015726	GTA	2	6	22830	22835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324177
511	NC_015726	GC	3	6	22885	22890	0 %	0 %	50 %	50 %	339324177
512	NC_015726	CTG	2	6	22946	22951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324177
513	NC_015726	TTC	2	6	24225	24230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324178
514	NC_015726	CCA	2	6	24237	24242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324178
515	NC_015726	GGCA	2	8	24265	24272	25 %	0 %	50 %	25 %	339324178
516	NC_015726	TCC	2	6	24308	24313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324178
517	NC_015726	TG	3	6	24329	24334	0 %	50 %	50 %	0 %	339324178
518	NC_015726	GCTG	2	8	24378	24385	0 %	25 %	50 %	25 %	339324178
519	NC_015726	CGCA	2	8	24410	24417	25 %	0 %	25 %	50 %	339324178
520	NC_015726	TGC	2	6	24442	24447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324178
521	NC_015726	GCC	2	6	24468	24473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324178
522	NC_015726	TCG	2	6	24483	24488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324178
523	NC_015726	GC	3	6	24513	24518	0 %	0 %	50 %	50 %	339324178
524	NC_015726	CCT	2	6	24526	24531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324178
525	NC_015726	ATC	2	6	24551	24556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324178
526	NC_015726	CTC	2	6	24587	24592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324178
527	NC_015726	GAT	2	6	24626	24631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324178
528	NC_015726	CCG	2	6	24678	24683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324178
529	NC_015726	GGC	2	6	24758	24763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324178
530	NC_015726	TCG	2	6	24846	24851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324178
531	NC_015726	CGC	2	6	24877	24882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324178
532	NC_015726	TGAAGA	2	12	24892	24903	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	339324178
533	NC_015726	GGC	2	6	24940	24945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324178
534	NC_015726	GTTT	2	8	25085	25092	0 %	75 %	25 %	0 %	339324178
535	NC_015726	CGC	3	9	25096	25104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324178
536	NC_015726	CTT	2	6	25196	25201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324178
537	NC_015726	GCA	2	6	25234	25239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324178
538	NC_015726	ACG	2	6	25379	25384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324178
539	NC_015726	GCAA	2	8	25388	25395	50 %	0 %	25 %	25 %	339324178
540	NC_015726	GGA	2	6	25419	25424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324178
541	NC_015726	AAGC	2	8	26024	26031	50 %	0 %	25 %	25 %	339324179
542	NC_015726	CGC	2	6	26075	26080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324179
543	NC_015726	GCC	2	6	26090	26095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324179
544	NC_015726	GAC	2	6	26150	26155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324179
545	NC_015726	TCCT	2	8	26183	26190	0 %	50 %	0 %	50 %	339324179
546	NC_015726	TTG	2	6	26195	26200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324179
547	NC_015726	CGG	2	6	26456	26461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324180
548	NC_015726	AGT	2	6	26467	26472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324180
549	NC_015726	CCA	2	6	26500	26505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324180
550	NC_015726	GCGCA	2	10	26555	26564	20 %	0 %	40 %	40 %	339324180
551	NC_015726	TGA	2	6	26575	26580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324180
552	NC_015726	CGT	2	6	26599	26604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324180
553	NC_015726	AGCG	2	8	26619	26626	25 %	0 %	50 %	25 %	339324180
554	NC_015726	GTC	2	6	26705	26710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324180
555	NC_015726	GCCG	2	8	26726	26733	0 %	0 %	50 %	50 %	339324180
556	NC_015726	GC	3	6	26872	26877	0 %	0 %	50 %	50 %	339324180
557	NC_015726	TTG	2	6	26895	26900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324180
558	NC_015726	CAG	2	6	26924	26929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324180
559	NC_015726	GC	3	6	26939	26944	0 %	0 %	50 %	50 %	339324180
560	NC_015726	GAT	2	6	26987	26992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324180
561	NC_015726	TCC	2	6	27003	27008	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324180
562	NC_015726	CG	3	6	27043	27048	0 %	0 %	50 %	50 %	339324180
563	NC_015726	GCA	2	6	27196	27201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324180
564	NC_015726	CTC	2	6	27236	27241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324180
565	NC_015726	GGC	2	6	27245	27250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324180
566	NC_015726	CAG	2	6	27275	27280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324180
567	NC_015726	ACC	3	9	27336	27344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324180
568	NC_015726	GGT	2	6	27358	27363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324180
569	NC_015726	TCG	2	6	27450	27455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324180
570	NC_015726	CG	3	6	27482	27487	0 %	0 %	50 %	50 %	339324180
571	NC_015726	CGC	2	6	27504	27509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324180
572	NC_015726	GCC	2	6	27510	27515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324180
573	NC_015726	CAG	2	6	27518	27523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324180
574	NC_015726	CCT	2	6	27562	27567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324180
575	NC_015726	CAG	2	6	27590	27595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324180
576	NC_015726	CG	3	6	27616	27621	0 %	0 %	50 %	50 %	339324180
577	NC_015726	GAA	2	6	27650	27655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324180
578	NC_015726	GGC	2	6	27658	27663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324180
579	NC_015726	TCC	2	6	27714	27719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324180
580	NC_015726	GTCAT	2	10	27735	27744	20 %	40 %	20 %	20 %	339324180
581	NC_015726	CGG	2	6	27759	27764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324180
582	NC_015726	AGGT	2	8	27786	27793	25 %	25 %	50 %	0 %	339324180
583	NC_015726	GCG	2	6	27833	27838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324180
584	NC_015726	CGC	2	6	27850	27855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324180
585	NC_015726	TGCC	2	8	27913	27920	0 %	25 %	25 %	50 %	339324180
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587	NC_015726	CCT	2	6	27952	27957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324180
588	NC_015726	GGC	3	9	27974	27982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324180
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593	NC_015726	TCC	2	6	28077	28082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324180
594	NC_015726	GCG	2	6	28109	28114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324180
595	NC_015726	GTA	2	6	28121	28126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324180
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598	NC_015726	CAC	2	6	28223	28228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324180
599	NC_015726	CG	3	6	28387	28392	0 %	0 %	50 %	50 %	339324180
600	NC_015726	TGA	2	6	28414	28419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324180
601	NC_015726	CG	3	6	28517	28522	0 %	0 %	50 %	50 %	339324180
602	NC_015726	TGA	2	6	28585	28590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324180
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605	NC_015726	CCA	3	9	28738	28746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324180
606	NC_015726	GAG	2	6	28814	28819	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324180
607	NC_015726	CGT	2	6	28897	28902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324180
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609	NC_015726	CGCT	2	8	28917	28924	0 %	25 %	25 %	50 %	339324180
610	NC_015726	CGC	2	6	28937	28942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324180
611	NC_015726	CGC	4	12	28967	28978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324180
612	NC_015726	GGT	2	6	29033	29038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324180
613	NC_015726	C	6	6	29257	29262	0 %	0 %	0 %	100 %	339324181
614	NC_015726	A	6	6	29431	29436	100 %	0 %	0 %	0 %	339324181
615	NC_015726	CGG	3	9	29459	29467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324181
616	NC_015726	TGCC	2	8	29473	29480	0 %	25 %	25 %	50 %	339324181
617	NC_015726	CCGAT	2	10	29530	29539	20 %	20 %	20 %	40 %	339324181
618	NC_015726	GCAG	2	8	29567	29574	25 %	0 %	50 %	25 %	339324181
619	NC_015726	GGA	2	6	29577	29582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324181
620	NC_015726	GTG	2	6	29957	29962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324182
621	NC_015726	CCGC	2	8	30017	30024	0 %	0 %	25 %	75 %	339324182
622	NC_015726	CAC	3	9	30045	30053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324182
623	NC_015726	GGC	2	6	30066	30071	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324182
624	NC_015726	CAAG	2	8	30086	30093	50 %	0 %	25 %	25 %	339324182
625	NC_015726	TCC	2	6	30115	30120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324182
626	NC_015726	CTG	2	6	30155	30160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324182
627	NC_015726	ATG	2	6	30190	30195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324182
628	NC_015726	CTG	2	6	30261	30266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324182
629	NC_015726	GGCGA	2	10	30307	30316	20 %	0 %	60 %	20 %	339324182
630	NC_015726	GAT	3	9	30342	30350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324182
631	NC_015726	TGG	2	6	30394	30399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324182
632	NC_015726	TGT	2	6	30401	30406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324182
633	NC_015726	AGA	3	9	30407	30415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324182
634	NC_015726	GCCA	2	8	30427	30434	25 %	0 %	25 %	50 %	339324182
635	NC_015726	TGC	2	6	30453	30458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324182
636	NC_015726	TGGC	2	8	30481	30488	0 %	25 %	50 %	25 %	339324182
637	NC_015726	GCG	2	6	30645	30650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324182
638	NC_015726	GC	4	8	30654	30661	0 %	0 %	50 %	50 %	339324182
639	NC_015726	ATG	2	6	30890	30895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324183
640	NC_015726	ATGC	2	8	30945	30952	25 %	25 %	25 %	25 %	339324183
641	NC_015726	CCGG	2	8	31064	31071	0 %	0 %	50 %	50 %	339324183
642	NC_015726	GCGCG	2	10	31136	31145	0 %	0 %	60 %	40 %	339324183
643	NC_015726	ACG	2	6	32017	32022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324184
644	NC_015726	CTG	2	6	32046	32051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324184
645	NC_015726	GCG	2	6	32055	32060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324184
646	NC_015726	CAA	2	6	32239	32244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324184
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648	NC_015726	GCG	2	6	32279	32284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324184
649	NC_015726	CCG	3	9	32314	32322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324184
650	NC_015726	AAG	2	6	32345	32350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324184
651	NC_015726	CGC	2	6	32380	32385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324184
652	NC_015726	GGC	2	6	32429	32434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324184
653	NC_015726	GGC	2	6	32471	32476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324184
654	NC_015726	CAG	2	6	32546	32551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324184
655	NC_015726	GCG	2	6	32561	32566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324184
656	NC_015726	CTG	2	6	32642	32647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324184
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662	NC_015726	TCG	2	6	32830	32835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324184
663	NC_015726	CGA	2	6	32857	32862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324184
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733	NC_015726	TGG	2	6	35753	35758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324186
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741	NC_015726	GCA	2	6	36140	36145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324186
742	NC_015726	CCTGCC	2	12	36322	36333	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	339324187
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747	NC_015726	GAC	2	6	36516	36521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324187
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749	NC_015726	CGA	2	6	36580	36585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324187
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752	NC_015726	GCC	2	6	36623	36628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324187
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754	NC_015726	GCG	2	6	36702	36707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324187
755	NC_015726	GGC	3	9	36713	36721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324187
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