MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 1

Total Repeats: 93544

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_015726	CAA	2	6	203533	203538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324361
5002	NC_015726	TGC	2	6	203576	203581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5003	NC_015726	CCG	2	6	203623	203628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324361
5004	NC_015726	TTC	2	6	203641	203646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324361
5005	NC_015726	CGG	2	6	203658	203663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324361
5006	NC_015726	CGCTG	2	10	203664	203673	0 %	20 %	40 %	40 %	339324361
5007	NC_015726	TGGC	2	8	203727	203734	0 %	25 %	50 %	25 %	339324361
5008	NC_015726	GCG	2	6	203744	203749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324361
5009	NC_015726	CTGG	2	8	203766	203773	0 %	25 %	50 %	25 %	339324361
5010	NC_015726	GGT	2	6	203817	203822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324361
5011	NC_015726	TTC	2	6	203839	203844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324361
5012	NC_015726	CTG	2	6	203845	203850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5013	NC_015726	CCGTTC	2	12	203878	203889	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	339324361
5014	NC_015726	CTG	2	6	203995	204000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5015	NC_015726	CTG	2	6	204007	204012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5016	NC_015726	GAC	2	6	204021	204026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5017	NC_015726	GCCAG	2	10	204057	204066	20 %	0 %	40 %	40 %	339324361
5018	NC_015726	CAC	2	6	204107	204112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324361
5019	NC_015726	CTG	2	6	204122	204127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5020	NC_015726	GGCACC	2	12	204139	204150	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339324361
5021	NC_015726	GCT	2	6	204159	204164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5022	NC_015726	GTG	2	6	204232	204237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324361
5023	NC_015726	TATC	2	8	204258	204265	25 %	50 %	0 %	25 %	339324361
5024	NC_015726	TGG	2	6	204269	204274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324361
5025	NC_015726	GTG	2	6	204304	204309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324361
5026	NC_015726	TGC	2	6	204344	204349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324361
5027	NC_015726	CCAA	2	8	204362	204369	50 %	0 %	0 %	50 %	339324361
5028	NC_015726	GCG	3	9	204390	204398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324361
5029	NC_015726	GGC	2	6	204559	204564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324362
5030	NC_015726	GCC	2	6	204569	204574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324362
5031	NC_015726	GAC	2	6	204593	204598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324362
5032	NC_015726	GCGCTG	2	12	204599	204610	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339324362
5033	NC_015726	GCCG	2	8	204613	204620	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5034	NC_015726	CAC	2	6	204643	204648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324362
5035	NC_015726	CGG	2	6	204679	204684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324362
5036	NC_015726	CCG	2	6	204690	204695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324362
5037	NC_015726	GCT	2	6	204700	204705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324362
5038	NC_015726	GGC	2	6	204709	204714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324362
5039	NC_015726	GC	3	6	204803	204808	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5040	NC_015726	CCA	2	6	204873	204878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324362
5041	NC_015726	GCG	2	6	204921	204926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324362
5042	NC_015726	GCG	2	6	205026	205031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324362
5043	NC_015726	GC	3	6	205103	205108	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5044	NC_015726	CGC	2	6	205120	205125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324362
5045	NC_015726	GGC	2	6	205129	205134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324362
5046	NC_015726	GC	3	6	205171	205176	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5047	NC_015726	GCCG	2	8	205186	205193	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5048	NC_015726	ACC	2	6	205208	205213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324362
5049	NC_015726	GC	3	6	205272	205277	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5050	NC_015726	CAGG	2	8	205291	205298	25 %	0 %	50 %	25 %	339324362
5051	NC_015726	CTT	2	6	205300	205305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324362
5052	NC_015726	GC	4	8	205312	205319	0 %	0 %	50 %	50 %	339324362
5053	NC_015726	CTA	2	6	205369	205374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324362
5054	NC_015726	AGGC	2	8	205384	205391	25 %	0 %	50 %	25 %	339324362
5055	NC_015726	CG	3	6	205412	205417	0 %	0 %	50 %	50 %	339324363
5056	NC_015726	AGC	2	6	205459	205464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5057	NC_015726	CCA	3	9	205481	205489	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324363
5058	NC_015726	GAG	2	6	205540	205545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324363
5059	NC_015726	CAG	2	6	205584	205589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5060	NC_015726	TCA	2	6	205628	205633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324363
5061	NC_015726	CGA	2	6	205640	205645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5062	NC_015726	GCC	2	6	205648	205653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324363
5063	NC_015726	GCG	3	9	205712	205720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324363
5064	NC_015726	GCA	2	6	205760	205765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5065	NC_015726	AGCG	2	8	205780	205787	25 %	0 %	50 %	25 %	339324363
5066	NC_015726	GCC	2	6	205815	205820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324363
5067	NC_015726	GC	3	6	205826	205831	0 %	0 %	50 %	50 %	339324363
5068	NC_015726	GAT	2	6	205833	205838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324363
5069	NC_015726	GGC	2	6	205842	205847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324363
5070	NC_015726	TTG	2	6	205861	205866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324363
5071	NC_015726	CGCC	2	8	205880	205887	0 %	0 %	25 %	75 %	339324363
5072	NC_015726	CGC	2	6	205898	205903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324363
5073	NC_015726	GGT	2	6	205914	205919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324363
5074	NC_015726	CAG	4	12	205965	205976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5075	NC_015726	CCA	2	6	205977	205982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324363
5076	NC_015726	GGC	2	6	205991	205996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324363
5077	NC_015726	AAG	2	6	205999	206004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324363
5078	NC_015726	ACC	2	6	206020	206025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324363
5079	NC_015726	GCG	2	6	206042	206047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324363
5080	NC_015726	GC	3	6	206049	206054	0 %	0 %	50 %	50 %	339324363
5081	NC_015726	CAG	2	6	206079	206084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5082	NC_015726	GCC	2	6	206110	206115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324363
5083	NC_015726	CAG	2	6	206118	206123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5084	NC_015726	CTG	2	6	206130	206135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5085	NC_015726	GCCA	2	8	206155	206162	25 %	0 %	25 %	50 %	339324363
5086	NC_015726	GCC	2	6	206172	206177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324363
5087	NC_015726	GCGCCG	2	12	206221	206232	0 %	0 %	50 %	50 %	339324363
5088	NC_015726	GCA	2	6	206246	206251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5089	NC_015726	CCA	2	6	206303	206308	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324363
5090	NC_015726	GCC	2	6	206320	206325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324363
5091	NC_015726	CG	3	6	206342	206347	0 %	0 %	50 %	50 %	339324363
5092	NC_015726	CAG	2	6	206400	206405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5093	NC_015726	CAG	2	6	206424	206429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324363
5094	NC_015726	CGG	2	6	206430	206435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324363
5095	NC_015726	GCG	2	6	206453	206458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324363
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5097	NC_015726	GAA	2	6	206499	206504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324363
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5099	NC_015726	CCG	2	6	206818	206823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324364
5100	NC_015726	CG	3	6	206864	206869	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5101	NC_015726	GGC	2	6	206887	206892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324364
5102	NC_015726	GCCC	2	8	206911	206918	0 %	0 %	25 %	75 %	339324364
5103	NC_015726	GGC	2	6	206939	206944	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324364
5104	NC_015726	AGC	2	6	207003	207008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324364
5105	NC_015726	AGC	2	6	207027	207032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324364
5106	NC_015726	GCC	3	9	207065	207073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324364
5107	NC_015726	GCT	2	6	207115	207120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324364
5108	NC_015726	GC	4	8	207145	207152	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5109	NC_015726	GGCAGT	2	12	207153	207164	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339324364
5110	NC_015726	CAGG	2	8	207187	207194	25 %	0 %	50 %	25 %	339324364
5111	NC_015726	GGC	2	6	207215	207220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324364
5112	NC_015726	CGA	3	9	207265	207273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324364
5113	NC_015726	GC	3	6	207323	207328	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5114	NC_015726	GC	3	6	207331	207336	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5115	NC_015726	TTCGGC	2	12	207386	207397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324364
5116	NC_015726	CTG	2	6	207434	207439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324364
5117	NC_015726	CG	4	8	207453	207460	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5118	NC_015726	CGC	2	6	207496	207501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324364
5119	NC_015726	GC	4	8	207500	207507	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5120	NC_015726	CG	4	8	207519	207526	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5121	NC_015726	AGA	2	6	207543	207548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324364
5122	NC_015726	TCCG	2	8	207592	207599	0 %	25 %	25 %	50 %	339324364
5123	NC_015726	TGC	2	6	207642	207647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324364
5124	NC_015726	GC	4	8	207656	207663	0 %	0 %	50 %	50 %	339324364
5125	NC_015726	GCC	2	6	207688	207693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324364
5126	NC_015726	GCG	2	6	207720	207725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324364
5127	NC_015726	GCG	2	6	207738	207743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324364
5128	NC_015726	ACG	2	6	207744	207749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324364
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5130	NC_015726	CCG	2	6	207902	207907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324365
5131	NC_015726	GCCG	2	8	207909	207916	0 %	0 %	50 %	50 %	339324365
5132	NC_015726	CCA	2	6	207944	207949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324365
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5140	NC_015726	CGA	2	6	208190	208195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324365
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5143	NC_015726	ATC	2	6	208327	208332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324365
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5149	NC_015726	CG	3	6	208601	208606	0 %	0 %	50 %	50 %	339324365
5150	NC_015726	GGCA	2	8	208618	208625	25 %	0 %	50 %	25 %	339324365
5151	NC_015726	CGG	2	6	208640	208645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324365
5152	NC_015726	GCA	2	6	208700	208705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324365
5153	NC_015726	GATA	2	8	208726	208733	50 %	25 %	25 %	0 %	339324365
5154	NC_015726	AGC	2	6	208738	208743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324365
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5230	NC_015726	ATG	2	6	212198	212203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324369
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5233	NC_015726	TCG	2	6	212321	212326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324369
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5235	NC_015726	TGG	2	6	212355	212360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324369
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5238	NC_015726	CG	3	6	212538	212543	0 %	0 %	50 %	50 %	339324369
5239	NC_015726	CAC	2	6	212575	212580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324369
5240	NC_015726	CGC	2	6	212613	212618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324369
5241	NC_015726	GCA	2	6	212655	212660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324369
5242	NC_015726	CCA	2	6	212661	212666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324369
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5244	NC_015726	CTG	2	6	212701	212706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324369
5245	NC_015726	GAT	2	6	212731	212736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324369
5246	NC_015726	TGC	2	6	212778	212783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324369
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5355	NC_015726	CGA	2	6	217621	217626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324374
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5361	NC_015726	CG	3	6	217911	217916	0 %	0 %	50 %	50 %	339324374
5362	NC_015726	GGC	2	6	217993	217998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324374
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5365	NC_015726	CAAGCG	2	12	218023	218034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324374
5366	NC_015726	ACC	2	6	218046	218051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324374
5367	NC_015726	TGC	2	6	218055	218060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324374
5368	NC_015726	GCA	2	6	218110	218115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324374
5369	NC_015726	CCG	2	6	218129	218134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324374
5370	NC_015726	GCT	2	6	218164	218169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324374
5371	NC_015726	GAT	2	6	218194	218199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324374
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5375	NC_015726	TGG	2	6	218385	218390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324375
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5385	NC_015726	CAC	2	6	218771	218776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324375
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5389	NC_015726	TGA	2	6	218839	218844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324375
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5391	NC_015726	GCT	2	6	218917	218922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324375
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5474	NC_015726	GCATCC	2	12	221748	221759	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339324377
5475	NC_015726	TGC	2	6	221781	221786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324377
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5481	NC_015726	GCC	2	6	221969	221974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324377
5482	NC_015726	GGCGC	2	10	221975	221984	0 %	0 %	60 %	40 %	339324377
5483	NC_015726	GCA	2	6	221995	222000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324377
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5485	NC_015726	GC	3	6	222033	222038	0 %	0 %	50 %	50 %	339324377
5486	NC_015726	CTT	2	6	222121	222126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324377
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5488	NC_015726	GCC	2	6	222231	222236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324377
5489	NC_015726	ATC	2	6	222245	222250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324377
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