MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 5468

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015724	TGG	2	6	102	107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323775
2	NC_015724	GAA	2	6	169	174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323775
3	NC_015724	CAA	2	6	392	397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323775
4	NC_015724	GCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323775
5	NC_015724	GGT	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323775
6	NC_015724	TGC	2	6	543	548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323775
7	NC_015724	GAT	2	6	607	612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323775
8	NC_015724	GAC	2	6	653	658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323775
9	NC_015724	TGA	2	6	1146	1151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323775
10	NC_015724	GCA	2	6	1203	1208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323775
11	NC_015724	CGA	2	6	1240	1245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323775
12	NC_015724	GGA	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323775
13	NC_015724	GAT	2	6	1408	1413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323776
14	NC_015724	GGC	2	6	1414	1419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323776
15	NC_015724	AGC	2	6	1535	1540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323776
16	NC_015724	CGA	2	6	1598	1603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323776
17	NC_015724	TAC	2	6	1628	1633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323776
18	NC_015724	CGT	2	6	1652	1657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323776
19	NC_015724	GAA	2	6	1924	1929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323776
20	NC_015724	AAG	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323776
21	NC_015724	GCT	2	6	2068	2073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323776
22	NC_015724	ACT	2	6	2083	2088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323776
23	NC_015724	CCG	2	6	2089	2094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323776
24	NC_015724	GCA	2	6	2160	2165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323776
25	NC_015724	CCT	2	6	2906	2911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323777
26	NC_015724	TGC	2	6	2930	2935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323777
27	NC_015724	CAT	2	6	2937	2942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323777
28	NC_015724	CAG	2	6	2970	2975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323777
29	NC_015724	CGG	2	6	3070	3075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323777
30	NC_015724	CGG	2	6	5092	5097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
31	NC_015724	GTT	2	6	5136	5141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339323778
32	NC_015724	GCA	2	6	5248	5253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
33	NC_015724	TCG	2	6	5311	5316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
34	NC_015724	CAC	3	9	5420	5428	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323778
35	NC_015724	AGC	2	6	5436	5441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
36	NC_015724	GCG	2	6	5454	5459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
37	NC_015724	GGC	2	6	5517	5522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
38	NC_015724	CCT	2	6	5638	5643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323778
39	NC_015724	CGG	2	6	5646	5651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
40	NC_015724	CAG	3	9	5666	5674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
41	NC_015724	CAC	2	6	5675	5680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323778
42	NC_015724	AGG	2	6	5781	5786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323778
43	NC_015724	GCC	2	6	5805	5810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323778
44	NC_015724	GCC	2	6	5815	5820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323778
45	NC_015724	GCC	2	6	5897	5902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323778
46	NC_015724	GCA	2	6	5941	5946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323778
47	NC_015724	TCG	2	6	6081	6086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
48	NC_015724	AGG	2	6	6132	6137	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323778
49	NC_015724	GTC	2	6	6371	6376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
50	NC_015724	TCG	2	6	6579	6584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
51	NC_015724	GCG	2	6	6589	6594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
52	NC_015724	CGG	2	6	6610	6615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
53	NC_015724	CGG	2	6	6660	6665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
54	NC_015724	GCT	2	6	6754	6759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323778
55	NC_015724	CGG	2	6	6775	6780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323778
56	NC_015724	CGA	2	6	7811	7816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
57	NC_015724	CCG	2	6	7836	7841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
58	NC_015724	CGA	2	6	7880	7885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
59	NC_015724	CGC	3	9	7906	7914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
60	NC_015724	GCC	2	6	7916	7921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
61	NC_015724	CGC	2	6	7942	7947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
62	NC_015724	CTG	2	6	7950	7955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
63	NC_015724	TGC	3	9	8008	8016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
64	NC_015724	GTT	2	6	8027	8032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339323779
65	NC_015724	GAT	2	6	8100	8105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323779
66	NC_015724	CTG	2	6	8106	8111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
67	NC_015724	CGA	2	6	8147	8152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
68	NC_015724	CTG	2	6	8265	8270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
69	NC_015724	GAG	2	6	8281	8286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323779
70	NC_015724	CGG	2	6	8330	8335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323779
71	NC_015724	GCC	2	6	8363	8368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
72	NC_015724	GAC	2	6	8421	8426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
73	NC_015724	CGC	2	6	8440	8445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
74	NC_015724	TCA	2	6	8446	8451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323779
75	NC_015724	GCC	2	6	8509	8514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
76	NC_015724	TGG	2	6	8542	8547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323779
77	NC_015724	TCC	2	6	8557	8562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323779
78	NC_015724	TGT	2	6	8572	8577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339323779
79	NC_015724	CTG	2	6	8622	8627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
80	NC_015724	CAA	2	6	8699	8704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323779
81	NC_015724	GCG	2	6	8770	8775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323779
82	NC_015724	TGC	2	6	8791	8796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323779
83	NC_015724	CGC	2	6	8834	8839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323779
84	NC_015724	GCA	3	9	8846	8854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323779
85	NC_015724	CAA	2	6	8879	8884	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323779
86	NC_015724	CTT	2	6	9259	9264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323780
87	NC_015724	GAG	2	6	9283	9288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323780
88	NC_015724	CGT	2	6	9366	9371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323780
89	NC_015724	TGA	2	6	9375	9380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323780
90	NC_015724	GTG	2	6	9623	9628	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323780
91	NC_015724	AGC	2	6	9668	9673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323780
92	NC_015724	TGA	2	6	9695	9700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323780
93	NC_015724	GGA	2	6	9717	9722	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323780
94	NC_015724	TGC	2	6	9758	9763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323780
95	NC_015724	GGA	2	6	9849	9854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323780
96	NC_015724	GAG	2	6	9905	9910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323780
97	NC_015724	ATC	2	6	9941	9946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323780
98	NC_015724	GAA	2	6	9986	9991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323780
99	NC_015724	GAA	2	6	10017	10022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323780
100	NC_015724	TGC	2	6	10033	10038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323780
101	NC_015724	GAT	2	6	10371	10376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323781
102	NC_015724	CAT	2	6	10392	10397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323781
103	NC_015724	CTG	2	6	10399	10404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
104	NC_015724	CGC	2	6	10411	10416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323781
105	NC_015724	TGC	2	6	10442	10447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
106	NC_015724	GCT	2	6	10464	10469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
107	NC_015724	GCT	3	9	10545	10553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
108	NC_015724	CTG	2	6	10666	10671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
109	NC_015724	TGC	2	6	10700	10705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
110	NC_015724	CAC	2	6	10707	10712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323781
111	NC_015724	GCT	2	6	10713	10718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
112	NC_015724	GGC	2	6	10719	10724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323781
113	NC_015724	GCA	2	6	10755	10760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323781
114	NC_015724	CTA	2	6	10819	10824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323781
115	NC_015724	ACG	2	6	10837	10842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323781
116	NC_015724	TGC	2	6	11036	11041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
117	NC_015724	GTA	2	6	11048	11053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323781
118	NC_015724	GAA	2	6	11061	11066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323781
119	NC_015724	TGC	2	6	11096	11101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
120	NC_015724	TGG	2	6	11150	11155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323781
121	NC_015724	CGG	2	6	11229	11234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323781
122	NC_015724	TGC	2	6	11252	11257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323781
123	NC_015724	AGC	2	6	11315	11320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323781
124	NC_015724	CGT	2	6	11840	11845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323782
125	NC_015724	GAA	2	6	11967	11972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323782
126	NC_015724	AGC	2	6	11986	11991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323782
127	NC_015724	CGT	2	6	12048	12053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323782
128	NC_015724	CGT	2	6	12096	12101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323782
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252	NC_015724	GTG	2	6	19814	19819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323788
253	NC_015724	CAG	2	6	19980	19985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323788
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259	NC_015724	AGC	2	6	20542	20547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323788
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500	NC_015724	GCA	2	6	36856	36861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323805

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