MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 7823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015724	CG	3	6	143361	143366	0 %	0 %	50 %	50 %	339323915
3002	NC_015724	TCAAC	2	10	143437	143446	40 %	20 %	0 %	40 %	339323915
3003	NC_015724	CCGGA	2	10	143634	143643	20 %	0 %	40 %	40 %	339323916
3004	NC_015724	CCT	2	6	143804	143809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323916
3005	NC_015724	CG	3	6	143875	143880	0 %	0 %	50 %	50 %	339323916
3006	NC_015724	CT	3	6	143927	143932	0 %	50 %	0 %	50 %	339323916
3007	NC_015724	GCT	2	6	144156	144161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323916
3008	NC_015724	TCT	2	6	144256	144261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323916
3009	NC_015724	GTG	2	6	144394	144399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323917
3010	NC_015724	TCA	2	6	144416	144421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323917
3011	NC_015724	GGC	2	6	144540	144545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323917
3012	NC_015724	TGA	2	6	144558	144563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323917
3013	NC_015724	GCG	2	6	144596	144601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323917
3014	NC_015724	CGT	2	6	144610	144615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323917
3015	NC_015724	AGC	2	6	144662	144667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323917
3016	NC_015724	ACT	2	6	144731	144736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323917
3017	NC_015724	CAA	2	6	144780	144785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323917
3018	NC_015724	GGT	2	6	144825	144830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323917
3019	NC_015724	GCC	2	6	144895	144900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323917
3020	NC_015724	TCA	2	6	144914	144919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323917
3021	NC_015724	GCT	2	6	144945	144950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323917
3022	NC_015724	TGC	2	6	144957	144962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323917
3023	NC_015724	C	6	6	144984	144989	0 %	0 %	0 %	100 %	339323917
3024	NC_015724	TCA	2	6	145004	145009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323917
3025	NC_015724	TGC	2	6	145113	145118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323917
3026	NC_015724	AAG	2	6	145129	145134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323917
3027	NC_015724	CGA	2	6	145176	145181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323917
3028	NC_015724	GCC	2	6	145231	145236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323917
3029	NC_015724	CTG	2	6	145264	145269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323917
3030	NC_015724	TCG	2	6	145295	145300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323917
3031	NC_015724	GCG	2	6	145427	145432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323917
3032	NC_015724	CGG	2	6	145449	145454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323917
3033	NC_015724	ACTG	2	8	145461	145468	25 %	25 %	25 %	25 %	339323917
3034	NC_015724	CGA	2	6	145502	145507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323917
3035	NC_015724	ACGA	2	8	145522	145529	50 %	0 %	25 %	25 %	339323917
3036	NC_015724	AAG	3	9	145544	145552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323917
3037	NC_015724	GAC	2	6	145594	145599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323917
3038	NC_015724	AGGC	2	8	145694	145701	25 %	0 %	50 %	25 %	339323917
3039	NC_015724	TG	3	6	145704	145709	0 %	50 %	50 %	0 %	339323917
3040	NC_015724	CG	3	6	145723	145728	0 %	0 %	50 %	50 %	339323917
3041	NC_015724	CGG	2	6	145749	145754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323917
3042	NC_015724	GCG	2	6	145784	145789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323917
3043	NC_015724	CCG	3	9	145969	145977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323918
3044	NC_015724	TCA	2	6	146005	146010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323918
3045	NC_015724	GAA	2	6	146078	146083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323918
3046	NC_015724	CGA	2	6	146099	146104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3047	NC_015724	GAG	2	6	146109	146114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323918
3048	NC_015724	CCAC	2	8	146256	146263	25 %	0 %	0 %	75 %	339323918
3049	NC_015724	CTG	2	6	146316	146321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3050	NC_015724	ACC	2	6	146331	146336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323918
3051	NC_015724	GCG	2	6	146353	146358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323918
3052	NC_015724	CAT	2	6	146366	146371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323918
3053	NC_015724	GC	3	6	146381	146386	0 %	0 %	50 %	50 %	339323918
3054	NC_015724	CGAC	2	8	146431	146438	25 %	0 %	25 %	50 %	339323918
3055	NC_015724	TCA	2	6	146476	146481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323918
3056	NC_015724	TTGC	2	8	146508	146515	0 %	50 %	25 %	25 %	339323918
3057	NC_015724	GCG	2	6	146536	146541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323918
3058	NC_015724	GAT	2	6	146561	146566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323918
3059	NC_015724	CG	3	6	146584	146589	0 %	0 %	50 %	50 %	339323918
3060	NC_015724	CGG	2	6	146615	146620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323918
3061	NC_015724	TAC	2	6	146622	146627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323918
3062	NC_015724	GCA	2	6	146723	146728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3063	NC_015724	CGT	2	6	146738	146743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3064	NC_015724	CAA	2	6	146771	146776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323918
3065	NC_015724	ACA	2	6	146830	146835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323918
3066	NC_015724	CG	3	6	146837	146842	0 %	0 %	50 %	50 %	339323918
3067	NC_015724	CGA	2	6	146897	146902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3068	NC_015724	CGC	2	6	146972	146977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323918
3069	NC_015724	CGA	2	6	146993	146998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3070	NC_015724	GCA	2	6	147030	147035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323918
3071	NC_015724	ACC	2	6	147076	147081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323918
3072	NC_015724	CAA	2	6	147104	147109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323918
3073	NC_015724	GGC	2	6	147186	147191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323918
3074	NC_015724	ATC	2	6	147280	147285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323918
3075	NC_015724	GCC	2	6	147331	147336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323918
3076	NC_015724	CG	3	6	147430	147435	0 %	0 %	50 %	50 %	339323919
3077	NC_015724	TAC	2	6	147514	147519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323919
3078	NC_015724	GCA	2	6	147547	147552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3079	NC_015724	CAG	2	6	147679	147684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3080	NC_015724	CGG	2	6	147714	147719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323919
3081	NC_015724	GCC	2	6	147721	147726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323919
3082	NC_015724	TCG	2	6	147730	147735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3083	NC_015724	TCA	2	6	147746	147751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323919
3084	NC_015724	AGG	2	6	147755	147760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323919
3085	NC_015724	GGT	2	6	147842	147847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323919
3086	NC_015724	GAA	2	6	147912	147917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323919
3087	NC_015724	GCT	2	6	147957	147962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3088	NC_015724	TCG	2	6	148004	148009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3089	NC_015724	GCC	2	6	148135	148140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323919
3090	NC_015724	AAG	2	6	148153	148158	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323919
3091	NC_015724	AT	3	6	148234	148239	50 %	50 %	0 %	0 %	339323919
3092	NC_015724	TAA	2	6	148278	148283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339323919
3093	NC_015724	GCC	2	6	148339	148344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323919
3094	NC_015724	CAT	2	6	148410	148415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323919
3095	NC_015724	GAG	2	6	148456	148461	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323919
3096	NC_015724	ACC	2	6	148478	148483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323919
3097	NC_015724	TCA	2	6	148487	148492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323919
3098	NC_015724	ACT	2	6	148496	148501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323919
3099	NC_015724	GAA	3	9	148515	148523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323919
3100	NC_015724	GAC	2	6	148543	148548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3101	NC_015724	GTC	3	9	148563	148571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323919
3102	NC_015724	TCGG	2	8	148703	148710	0 %	25 %	50 %	25 %	339323920
3103	NC_015724	CAT	2	6	148717	148722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323920
3104	NC_015724	CGC	2	6	148783	148788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323920
3105	NC_015724	CTT	2	6	148789	148794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323920
3106	NC_015724	TCGT	2	8	148838	148845	0 %	50 %	25 %	25 %	339323920
3107	NC_015724	GCC	2	6	149002	149007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323920
3108	NC_015724	AGC	2	6	149018	149023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323920
3109	NC_015724	TGA	2	6	149028	149033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323920
3110	NC_015724	TCATCG	2	12	149067	149078	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339323920
3111	NC_015724	GCG	2	6	149096	149101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323920
3112	NC_015724	TGG	2	6	149105	149110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323920
3113	NC_015724	GAAC	2	8	149152	149159	50 %	0 %	25 %	25 %	339323920
3114	NC_015724	GCT	2	6	149176	149181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323920
3115	NC_015724	GTG	2	6	149318	149323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323920
3116	NC_015724	GTC	2	6	149324	149329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323920
3117	NC_015724	CGG	2	6	149332	149337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323920
3118	NC_015724	CGG	2	6	149365	149370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323920
3119	NC_015724	ATG	2	6	149396	149401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323920
3120	NC_015724	GGAG	2	8	149416	149423	25 %	0 %	75 %	0 %	339323920
3121	NC_015724	CTTC	2	8	149437	149444	0 %	50 %	0 %	50 %	339323920
3122	NC_015724	TTC	2	6	149457	149462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323920
3123	NC_015724	GCT	2	6	149534	149539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323921
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3129	NC_015724	GCT	2	6	149651	149656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323921
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3200	NC_015724	GTG	2	6	152927	152932	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323924
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3222	NC_015724	CCG	2	6	153943	153948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323924
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3229	NC_015724	AAG	2	6	154473	154478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323924
3230	NC_015724	GCTT	2	8	154488	154495	0 %	50 %	25 %	25 %	339323924
3231	NC_015724	AGG	2	6	154498	154503	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323924
3232	NC_015724	GAACTC	2	12	154553	154564	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	339323924
3233	NC_015724	TAC	2	6	154624	154629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323924
3234	NC_015724	ACT	3	9	154697	154705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323924
3235	NC_015724	CTG	2	6	155472	155477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323925
3236	NC_015724	CCA	2	6	155478	155483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323925
3237	NC_015724	GC	3	6	155647	155652	0 %	0 %	50 %	50 %	339323925
3238	NC_015724	AGG	2	6	155657	155662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323925
3239	NC_015724	TGA	2	6	155720	155725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323925
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3241	NC_015724	ATC	2	6	155842	155847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323925
3242	NC_015724	TGA	2	6	155864	155869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323925
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3363	NC_015724	GCA	2	6	161258	161263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323929
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3482	NC_015724	GCAG	2	8	167646	167653	25 %	0 %	50 %	25 %	339323933
3483	NC_015724	GAC	2	6	167670	167675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323933
3484	NC_015724	CGC	2	6	168295	168300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323934
3485	NC_015724	GCC	2	6	168308	168313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323934
3486	NC_015724	CG	3	6	168359	168364	0 %	0 %	50 %	50 %	339323934
3487	NC_015724	CTG	2	6	168386	168391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323934
3488	NC_015724	TTC	2	6	168392	168397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323934
3489	NC_015724	CAA	2	6	168421	168426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323934
3490	NC_015724	GCA	2	6	168450	168455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323934
3491	NC_015724	CGCC	2	8	168462	168469	0 %	0 %	25 %	75 %	339323934
3492	NC_015724	TGC	2	6	168474	168479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323934
3493	NC_015724	CG	3	6	168510	168515	0 %	0 %	50 %	50 %	339323934
3494	NC_015724	CCTG	2	8	168535	168542	0 %	25 %	25 %	50 %	339323934
3495	NC_015724	GGC	2	6	168559	168564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323934
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3498	NC_015724	CG	4	8	168679	168686	0 %	0 %	50 %	50 %	339323934
3499	NC_015724	GCA	2	6	168695	168700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323934
3500	NC_015724	GC	3	6	168743	168748	0 %	0 %	50 %	50 %	339323934

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