MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 7823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015724	CGC	2	6	48438	48443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323813
1002	NC_015724	CAGG	2	8	48526	48533	25 %	0 %	50 %	25 %	339323813
1003	NC_015724	GTC	2	6	48547	48552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323813
1004	NC_015724	CAGG	2	8	48561	48568	25 %	0 %	50 %	25 %	339323813
1005	NC_015724	GCG	2	6	48578	48583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323813
1006	NC_015724	GCA	2	6	48595	48600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323813
1007	NC_015724	GC	3	6	48639	48644	0 %	0 %	50 %	50 %	339323813
1008	NC_015724	CGT	2	6	48675	48680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323813
1009	NC_015724	CCA	2	6	48699	48704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323813
1010	NC_015724	CGC	2	6	48819	48824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323813
1011	NC_015724	GGC	2	6	48880	48885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323813
1012	NC_015724	GCCG	2	8	48906	48913	0 %	0 %	50 %	50 %	339323813
1013	NC_015724	TCGG	2	8	48917	48924	0 %	25 %	50 %	25 %	339323813
1014	NC_015724	GCA	2	6	48948	48953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323813
1015	NC_015724	GAC	2	6	48997	49002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323813
1016	NC_015724	CG	3	6	49025	49030	0 %	0 %	50 %	50 %	339323813
1017	NC_015724	CGA	2	6	49053	49058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323813
1018	NC_015724	AGG	2	6	49061	49066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323813
1019	NC_015724	TCA	2	6	49373	49378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323814
1020	NC_015724	GCG	2	6	49411	49416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323814
1021	NC_015724	GC	3	6	49475	49480	0 %	0 %	50 %	50 %	339323814
1022	NC_015724	GGC	2	6	49574	49579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323815
1023	NC_015724	GC	3	6	49585	49590	0 %	0 %	50 %	50 %	339323815
1024	NC_015724	GTC	2	6	49643	49648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323815
1025	NC_015724	ACGC	2	8	49652	49659	25 %	0 %	25 %	50 %	339323815
1026	NC_015724	GCTG	2	8	49730	49737	0 %	25 %	50 %	25 %	339323815
1027	NC_015724	TG	3	6	49761	49766	0 %	50 %	50 %	0 %	339323815
1028	NC_015724	CTC	2	6	49886	49891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339323815
1029	NC_015724	TG	3	6	49912	49917	0 %	50 %	50 %	0 %	339323815
1030	NC_015724	GCG	2	6	49938	49943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323815
1031	NC_015724	CCA	2	6	50005	50010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323815
1032	NC_015724	CGA	2	6	50014	50019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323815
1033	NC_015724	TCG	2	6	50088	50093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323815
1034	NC_015724	CGT	2	6	50104	50109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323815
1035	NC_015724	GC	3	6	50154	50159	0 %	0 %	50 %	50 %	339323815
1036	NC_015724	GGCG	2	8	50190	50197	0 %	0 %	75 %	25 %	339323815
1037	NC_015724	AGC	2	6	50201	50206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323815
1038	NC_015724	GGA	2	6	50213	50218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323815
1039	NC_015724	A	7	7	50253	50259	100 %	0 %	0 %	0 %	339323815
1040	NC_015724	TGA	2	6	50489	50494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323816
1041	NC_015724	CGG	2	6	50537	50542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323816
1042	NC_015724	GCCC	2	8	50701	50708	0 %	0 %	25 %	75 %	339323816
1043	NC_015724	GC	3	6	50729	50734	0 %	0 %	50 %	50 %	339323816
1044	NC_015724	GGTC	2	8	50742	50749	0 %	25 %	50 %	25 %	339323816
1045	NC_015724	GC	3	6	50762	50767	0 %	0 %	50 %	50 %	339323816
1046	NC_015724	TCG	2	6	50777	50782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323816
1047	NC_015724	ACGG	2	8	50797	50804	25 %	0 %	50 %	25 %	339323816
1048	NC_015724	ACCCG	2	10	50981	50990	20 %	0 %	20 %	60 %	339323817
1049	NC_015724	ATC	2	6	51062	51067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323817
1050	NC_015724	CTG	2	6	51101	51106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323817
1051	NC_015724	GCC	2	6	51111	51116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323817
1052	NC_015724	TGG	2	6	51132	51137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323817
1053	NC_015724	TGCC	2	8	51148	51155	0 %	25 %	25 %	50 %	339323817
1054	NC_015724	TGG	2	6	51156	51161	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323817
1055	NC_015724	CG	3	6	51199	51204	0 %	0 %	50 %	50 %	339323817
1056	NC_015724	CGC	2	6	51214	51219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323817
1057	NC_015724	GGC	2	6	51247	51252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323817
1058	NC_015724	CGG	2	6	51297	51302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323817
1059	NC_015724	GCT	2	6	51307	51312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323817
1060	NC_015724	CGT	2	6	51367	51372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323817
1061	NC_015724	GC	3	6	51373	51378	0 %	0 %	50 %	50 %	339323817
1062	NC_015724	CCG	2	6	51391	51396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323817
1063	NC_015724	CG	3	6	51441	51446	0 %	0 %	50 %	50 %	339323817
1064	NC_015724	CTG	2	6	51455	51460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323817
1065	NC_015724	GC	3	6	51467	51472	0 %	0 %	50 %	50 %	339323817
1066	NC_015724	GTG	2	6	51524	51529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323817
1067	NC_015724	TAC	2	6	51536	51541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323817
1068	NC_015724	CGG	2	6	51579	51584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323817
1069	NC_015724	CAG	2	6	51680	51685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323817
1070	NC_015724	GCGCC	2	10	51735	51744	0 %	0 %	40 %	60 %	339323817
1071	NC_015724	CAT	2	6	51753	51758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323817
1072	NC_015724	TGG	2	6	51791	51796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323818
1073	NC_015724	CGC	2	6	51797	51802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323818
1074	NC_015724	GCG	2	6	51856	51861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323818
1075	NC_015724	CG	3	6	51860	51865	0 %	0 %	50 %	50 %	339323818
1076	NC_015724	GCT	2	6	51891	51896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323818
1077	NC_015724	GC	3	6	51943	51948	0 %	0 %	50 %	50 %	339323818
1078	NC_015724	CGA	2	6	52064	52069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323818
1079	NC_015724	CCG	2	6	52169	52174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323818
1080	NC_015724	CGG	2	6	52184	52189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323818
1081	NC_015724	GCG	2	6	52196	52201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323818
1082	NC_015724	ATC	2	6	52321	52326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323818
1083	NC_015724	CAC	2	6	52338	52343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323818
1084	NC_015724	CGG	2	6	52391	52396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323818
1085	NC_015724	GCC	2	6	52409	52414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323818
1086	NC_015724	TCGG	2	8	52483	52490	0 %	25 %	50 %	25 %	339323818
1087	NC_015724	G	7	7	52489	52495	0 %	0 %	100 %	0 %	339323818
1088	NC_015724	GCG	2	6	52505	52510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323818
1089	NC_015724	CGT	3	9	52541	52549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323818
1090	NC_015724	CGGC	2	8	52601	52608	0 %	0 %	50 %	50 %	339323818
1091	NC_015724	CG	3	6	52628	52633	0 %	0 %	50 %	50 %	339323818
1092	NC_015724	TGA	2	6	52703	52708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323818
1093	NC_015724	CGC	2	6	52823	52828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323818
1094	NC_015724	ACCCGG	2	12	52829	52840	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	339323818
1095	NC_015724	GC	3	6	52858	52863	0 %	0 %	50 %	50 %	339323818
1096	NC_015724	TCG	2	6	52865	52870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323818
1097	NC_015724	GAC	2	6	52873	52878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323818
1098	NC_015724	ACG	2	6	52883	52888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323818
1099	NC_015724	CTG	2	6	52912	52917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323818
1100	NC_015724	CTA	2	6	52944	52949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323818
1101	NC_015724	CGC	2	6	52956	52961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323818
1102	NC_015724	GGT	2	6	52988	52993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323818
1103	NC_015724	CTA	2	6	53031	53036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323818
1104	NC_015724	TCG	2	6	53042	53047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323818
1105	NC_015724	AAG	2	6	53053	53058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323818
1106	NC_015724	CCG	2	6	53067	53072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323818
1107	NC_015724	GCG	2	6	53140	53145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323818
1108	NC_015724	GAA	2	6	53173	53178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323818
1109	NC_015724	CTG	2	6	53185	53190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323818
1110	NC_015724	GTCG	2	8	53214	53221	0 %	25 %	50 %	25 %	339323818
1111	NC_015724	GCC	3	9	53383	53391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323818
1112	NC_015724	AAC	2	6	53426	53431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323819
1113	NC_015724	CGA	2	6	53566	53571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323819
1114	NC_015724	CAG	2	6	53612	53617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323819
1115	NC_015724	ATG	2	6	53642	53647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323819
1116	NC_015724	GCAC	2	8	53675	53682	25 %	0 %	25 %	50 %	339323819
1117	NC_015724	CCACG	2	10	53689	53698	20 %	0 %	20 %	60 %	339323819
1118	NC_015724	GGA	2	6	53770	53775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323819
1119	NC_015724	GAT	3	9	53848	53856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323819
1120	NC_015724	GAC	2	6	53897	53902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323819
1121	NC_015724	CAT	2	6	53989	53994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323819
1122	NC_015724	TGA	2	6	54024	54029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323819
1123	NC_015724	GC	4	8	54052	54059	0 %	0 %	50 %	50 %	339323819
1124	NC_015724	TCT	2	6	54153	54158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323819
1125	NC_015724	CGA	2	6	54166	54171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323819
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1241	NC_015724	TGG	3	9	59345	59353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323824
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1243	NC_015724	CTG	2	6	59440	59445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323824
1244	NC_015724	GC	3	6	59506	59511	0 %	0 %	50 %	50 %	339323824
1245	NC_015724	GC	3	6	59523	59528	0 %	0 %	50 %	50 %	339323824
1246	NC_015724	GGC	3	9	59529	59537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323824
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1248	NC_015724	CGC	2	6	59561	59566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323824
1249	NC_015724	CAGG	2	8	59571	59578	25 %	0 %	50 %	25 %	339323824
1250	NC_015724	TGG	2	6	59582	59587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323824
1251	NC_015724	AGGCCG	2	12	59615	59626	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339323824
1252	NC_015724	CGC	2	6	59649	59654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323824
1253	NC_015724	GCT	2	6	59678	59683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323824
1254	NC_015724	CGGC	2	8	59717	59724	0 %	0 %	50 %	50 %	339323824
1255	NC_015724	AGGC	2	8	59760	59767	25 %	0 %	50 %	25 %	339323824
1256	NC_015724	CGGG	2	8	59774	59781	0 %	0 %	75 %	25 %	339323824
1257	NC_015724	CACC	2	8	59784	59791	25 %	0 %	0 %	75 %	339323824
1258	NC_015724	GGC	2	6	59808	59813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323824
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1260	NC_015724	TGG	2	6	59909	59914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323825
1261	NC_015724	CGC	2	6	59915	59920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323825
1262	NC_015724	CGA	2	6	60009	60014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323825
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1272	NC_015724	CTG	2	6	60253	60258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323825
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1277	NC_015724	AGGCG	2	10	60482	60491	20 %	0 %	60 %	20 %	339323825
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1285	NC_015724	GCG	2	6	60807	60812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323826
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1287	NC_015724	GGT	2	6	60907	60912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339323826
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1289	NC_015724	CGA	2	6	60960	60965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323826
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1291	NC_015724	CGGCAG	2	12	61078	61089	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339323826
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1293	NC_015724	CAA	2	6	61117	61122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339323826
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1323	NC_015724	GCCC	2	8	62064	62071	0 %	0 %	25 %	75 %	339323827
1324	NC_015724	CG	3	6	62085	62090	0 %	0 %	50 %	50 %	339323827
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1330	NC_015724	CG	3	6	62215	62220	0 %	0 %	50 %	50 %	339323827
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1351	NC_015724	GAATG	2	10	64137	64146	40 %	20 %	40 %	0 %	339323829
1352	NC_015724	TGCG	2	8	64190	64197	0 %	25 %	50 %	25 %	339323829
1353	NC_015724	CTT	2	6	64204	64209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339323829
1354	NC_015724	CGA	3	9	64248	64256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323829
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1356	NC_015724	GCC	2	6	64522	64527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323830
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1358	NC_015724	TCA	2	6	64642	64647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339323831
1359	NC_015724	GCG	2	6	64659	64664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323831
1360	NC_015724	AGG	2	6	64672	64677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339323831
1361	NC_015724	CGG	2	6	64678	64683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323831
1362	NC_015724	AAG	2	6	64712	64717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339323831
1363	NC_015724	GCG	2	6	64721	64726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323831
1364	NC_015724	GCG	2	6	64752	64757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323831
1365	NC_015724	GTC	2	6	64778	64783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323831
1366	NC_015724	CGG	2	6	64864	64869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323831
1367	NC_015724	CCA	2	6	64909	64914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323831
1368	NC_015724	GCG	2	6	64930	64935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323831
1369	NC_015724	GCA	2	6	64942	64947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339323831
1370	NC_015724	ATG	2	6	64971	64976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339323831
1371	NC_015724	CGGCC	2	10	64982	64991	0 %	0 %	40 %	60 %	339323831
1372	NC_015724	GCC	2	6	65008	65013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323831
1373	NC_015724	CCA	2	6	65014	65019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339323831
1374	NC_015724	GCT	2	6	65026	65031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339323831
1375	NC_015724	CCTGCA	2	12	65044	65055	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	339323831
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1377	NC_015724	CGC	2	6	65212	65217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339323831
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1497	NC_015724	C	6	6	70887	70892	0 %	0 %	0 %	100 %	339323839
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1500	NC_015724	GCG	2	6	71004	71009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339323839

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