MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 plasmid BB2p

Total Repeats: 7823

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_015724	CGGCG	2	10	382874	382883	0 %	0 %	60 %	40 %	339324120
7002	NC_015724	GCCG	2	8	382947	382954	0 %	0 %	50 %	50 %	339324120
7003	NC_015724	CGG	2	6	382976	382981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324120
7004	NC_015724	GCG	2	6	383033	383038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324120
7005	NC_015724	CGC	2	6	383101	383106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324120
7006	NC_015724	TTG	2	6	383115	383120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324120
7007	NC_015724	TCG	2	6	383530	383535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324121
7008	NC_015724	GCT	2	6	383582	383587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324121
7009	NC_015724	GCC	2	6	383589	383594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324121
7010	NC_015724	GCT	2	6	383621	383626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324121
7011	NC_015724	TCA	2	6	383668	383673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324121
7012	NC_015724	GGC	2	6	383690	383695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324121
7013	NC_015724	GCATCT	2	12	383702	383713	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339324121
7014	NC_015724	CGA	2	6	383720	383725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324121
7015	NC_015724	CGA	2	6	383799	383804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324121
7016	NC_015724	CTT	2	6	383808	383813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324121
7017	NC_015724	CCT	2	6	383876	383881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324121
7018	NC_015724	CGC	2	6	383888	383893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324121
7019	NC_015724	CGGT	2	8	383911	383918	0 %	25 %	50 %	25 %	339324121
7020	NC_015724	TTG	2	6	384007	384012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324121
7021	NC_015724	CTG	2	6	384093	384098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324122
7022	NC_015724	CTTT	2	8	384155	384162	0 %	75 %	0 %	25 %	339324122
7023	NC_015724	GCC	2	6	384164	384169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324122
7024	NC_015724	TCC	2	6	384294	384299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324122
7025	NC_015724	GGA	2	6	384360	384365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324122
7026	NC_015724	GGGCT	2	10	384423	384432	0 %	20 %	60 %	20 %	339324122
7027	NC_015724	GCA	2	6	384448	384453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324122
7028	NC_015724	GCC	2	6	384459	384464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324122
7029	NC_015724	CGGG	2	8	384485	384492	0 %	0 %	75 %	25 %	339324122
7030	NC_015724	GCA	2	6	384581	384586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324122
7031	NC_015724	TCGC	2	8	384648	384655	0 %	25 %	25 %	50 %	339324122
7032	NC_015724	TCG	2	6	384658	384663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324122
7033	NC_015724	CGC	2	6	384680	384685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324122
7034	NC_015724	GC	3	6	384708	384713	0 %	0 %	50 %	50 %	339324122
7035	NC_015724	GC	3	6	384731	384736	0 %	0 %	50 %	50 %	339324122
7036	NC_015724	CGG	2	6	384737	384742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324122
7037	NC_015724	CAG	2	6	384824	384829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324123
7038	NC_015724	TCC	2	6	384855	384860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324123
7039	NC_015724	GAT	2	6	384890	384895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324123
7040	NC_015724	GC	3	6	385028	385033	0 %	0 %	50 %	50 %	339324123
7041	NC_015724	CAGGC	2	10	385095	385104	20 %	0 %	40 %	40 %	339324123
7042	NC_015724	ATC	2	6	385119	385124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324123
7043	NC_015724	ATCGG	2	10	385152	385161	20 %	20 %	40 %	20 %	339324123
7044	NC_015724	GAA	2	6	385211	385216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324123
7045	NC_015724	GCG	2	6	385230	385235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324123
7046	NC_015724	GCG	2	6	385363	385368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324124
7047	NC_015724	CAG	2	6	385451	385456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324124
7048	NC_015724	GT	3	6	385498	385503	0 %	50 %	50 %	0 %	339324124
7049	NC_015724	CAC	2	6	385528	385533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324124
7050	NC_015724	GAA	2	6	385554	385559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324124
7051	NC_015724	GAA	2	6	385605	385610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324124
7052	NC_015724	ACTG	2	8	386417	386424	25 %	25 %	25 %	25 %	339324125
7053	NC_015724	CCGCC	2	10	386427	386436	0 %	0 %	20 %	80 %	339324125
7054	NC_015724	CG	3	6	386498	386503	0 %	0 %	50 %	50 %	339324125
7055	NC_015724	TCT	2	6	386548	386553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339324125
7056	NC_015724	TCA	2	6	386563	386568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324125
7057	NC_015724	GGC	2	6	386642	386647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324125
7058	NC_015724	GC	3	6	386655	386660	0 %	0 %	50 %	50 %	339324125
7059	NC_015724	TGC	2	6	386662	386667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324125
7060	NC_015724	CAC	2	6	386748	386753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324125
7061	NC_015724	CGG	2	6	386815	386820	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324125
7062	NC_015724	TTG	2	6	386833	386838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324125
7063	NC_015724	AAG	2	6	386847	386852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324125
7064	NC_015724	CG	3	6	386904	386909	0 %	0 %	50 %	50 %	339324125
7065	NC_015724	GCA	2	6	386981	386986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324125
7066	NC_015724	TCGCCG	2	12	387028	387039	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339324125
7067	NC_015724	AGG	2	6	387205	387210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339324125
7068	NC_015724	AGT	2	6	387215	387220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324125
7069	NC_015724	CAGGC	2	10	387264	387273	20 %	0 %	40 %	40 %	339324125
7070	NC_015724	CAA	2	6	387276	387281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324125
7071	NC_015724	AG	3	6	387288	387293	50 %	0 %	50 %	0 %	339324125
7072	NC_015724	CGC	2	6	387338	387343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324125
7073	NC_015724	CCA	2	6	387367	387372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324125
7074	NC_015724	CCA	2	6	387527	387532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339324125
7075	NC_015724	CAG	2	6	387544	387549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324125
7076	NC_015724	GA	3	6	387562	387567	50 %	0 %	50 %	0 %	339324125
7077	NC_015724	ACG	2	6	387579	387584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324126
7078	NC_015724	AAG	2	6	387592	387597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324126
7079	NC_015724	TC	3	6	387660	387665	0 %	50 %	0 %	50 %	339324126
7080	NC_015724	GAT	2	6	387708	387713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324126
7081	NC_015724	AAG	2	6	387724	387729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324126
7082	NC_015724	GCTT	2	8	387832	387839	0 %	50 %	25 %	25 %	339324126
7083	NC_015724	CTCCAC	2	12	387849	387860	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	339324126
7084	NC_015724	ACG	2	6	387959	387964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324126
7085	NC_015724	CTC	2	6	387994	387999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339324126
7086	NC_015724	GCA	2	6	388041	388046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324126
7087	NC_015724	TCA	2	6	388066	388071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324126
7088	NC_015724	GTT	2	6	388083	388088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324126
7089	NC_015724	AAGC	2	8	388124	388131	50 %	0 %	25 %	25 %	339324126
7090	NC_015724	GGT	2	6	388132	388137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324126
7091	NC_015724	GTT	2	6	388308	388313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324126
7092	NC_015724	TCCG	2	8	388371	388378	0 %	25 %	25 %	50 %	339324126
7093	NC_015724	CGG	2	6	388472	388477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324126
7094	NC_015724	CGA	2	6	388536	388541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324126
7095	NC_015724	CAG	2	6	388553	388558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324126
7096	NC_015724	GC	3	6	388560	388565	0 %	0 %	50 %	50 %	339324126
7097	NC_015724	TTG	2	6	388573	388578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339324126
7098	NC_015724	AAG	2	6	388744	388749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339324126
7099	NC_015724	CGCC	2	8	388953	388960	0 %	0 %	25 %	75 %	339324127
7100	NC_015724	ACT	2	6	388982	388987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324127
7101	NC_015724	CTG	2	6	389077	389082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324127
7102	NC_015724	AAC	2	6	389384	389389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324128
7103	NC_015724	TC	4	8	389413	389420	0 %	50 %	0 %	50 %	339324128
7104	NC_015724	GCC	2	6	389439	389444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324128
7105	NC_015724	GGC	3	9	389451	389459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324128
7106	NC_015724	CGA	2	6	389465	389470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324128
7107	NC_015724	ACG	2	6	389493	389498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324128
7108	NC_015724	CTCCG	2	10	389504	389513	0 %	20 %	20 %	60 %	339324128
7109	NC_015724	CGG	2	6	389545	389550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324128
7110	NC_015724	GTG	2	6	389571	389576	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324128
7111	NC_015724	ATCG	2	8	389618	389625	25 %	25 %	25 %	25 %	339324128
7112	NC_015724	AGC	2	6	389700	389705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339324128
7113	NC_015724	TGG	2	6	389720	389725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324128
7114	NC_015724	ACCT	2	8	389889	389896	25 %	25 %	0 %	50 %	339324128
7115	NC_015724	GCTACG	2	12	389955	389966	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339324128
7116	NC_015724	TCA	2	6	390092	390097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324128
7117	NC_015724	CAA	2	6	390122	390127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324128
7118	NC_015724	CTCC	2	8	390160	390167	0 %	25 %	0 %	75 %	339324128
7119	NC_015724	GCG	2	6	390169	390174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324128
7120	NC_015724	GTA	2	6	390189	390194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339324128
7121	NC_015724	GCC	2	6	390320	390325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324129
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7239	NC_015724	CCGC	2	8	395922	395929	0 %	0 %	25 %	75 %	339324133
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7479	NC_015724	AGCG	2	8	406446	406453	25 %	0 %	50 %	25 %	339324143
7480	NC_015724	CAA	2	6	406499	406504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324143
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7482	NC_015724	CAA	2	6	406545	406550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324143
7483	NC_015724	GGC	2	6	406608	406613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324143
7484	NC_015724	CTG	2	6	406626	406631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324143
7485	NC_015724	GGC	2	6	406656	406661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324143
7486	NC_015724	CAA	2	6	406679	406684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324143
7487	NC_015724	CCG	2	6	406735	406740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339324143
7488	NC_015724	TGC	2	6	406798	406803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324143
7489	NC_015724	CGT	2	6	406809	406814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339324143
7490	NC_015724	AAC	2	6	406866	406871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339324143
7491	NC_015724	GC	3	6	407015	407020	0 %	0 %	50 %	50 %	339324144
7492	NC_015724	CAT	2	6	407103	407108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339324144
7493	NC_015724	GTG	2	6	407122	407127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339324144
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7499	NC_015724	CGCT	2	8	407292	407299	0 %	25 %	25 %	50 %	339324145
7500	NC_015724	CGG	2	6	407318	407323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339324145

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