MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 2

Total Repeats: 63253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015723	TCG	2	6	42457	42462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321363
1002	NC_015723	GCT	2	6	42479	42484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321363
1003	NC_015723	GTC	3	9	42546	42554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321363
1004	NC_015723	GAA	2	6	42555	42560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339321363
1005	NC_015723	GC	3	6	42586	42591	0 %	0 %	50 %	50 %	339321363
1006	NC_015723	GCA	2	6	42689	42694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321363
1007	NC_015723	ACG	2	6	42721	42726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321363
1008	NC_015723	AGGCGA	2	12	42728	42739	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	339321363
1009	NC_015723	CAG	2	6	42753	42758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321363
1010	NC_015723	GC	3	6	42763	42768	0 %	0 %	50 %	50 %	339321363
1011	NC_015723	TCAT	2	8	42781	42788	25 %	50 %	0 %	25 %	339321363
1012	NC_015723	CGG	2	6	42839	42844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321363
1013	NC_015723	GCA	2	6	42872	42877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321363
1014	NC_015723	CGC	2	6	42921	42926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321363
1015	NC_015723	GCG	2	6	42935	42940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321363
1016	NC_015723	GCA	2	6	42941	42946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321363
1017	NC_015723	GCA	3	9	42983	42991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321363
1018	NC_015723	CAG	2	6	43020	43025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321363
1019	NC_015723	TCA	3	9	43034	43042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321363
1020	NC_015723	TCT	2	6	43049	43054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339321363
1021	NC_015723	GGC	2	6	43055	43060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321363
1022	NC_015723	CG	3	6	43601	43606	0 %	0 %	50 %	50 %	339321364
1023	NC_015723	GC	3	6	43613	43618	0 %	0 %	50 %	50 %	339321364
1024	NC_015723	AGC	2	6	43666	43671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321364
1025	NC_015723	GC	3	6	43726	43731	0 %	0 %	50 %	50 %	339321364
1026	NC_015723	GGT	2	6	43733	43738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321364
1027	NC_015723	CAG	2	6	43764	43769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321364
1028	NC_015723	CG	3	6	43938	43943	0 %	0 %	50 %	50 %	339321364
1029	NC_015723	GTC	2	6	43959	43964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321364
1030	NC_015723	TCG	2	6	43984	43989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321364
1031	NC_015723	CG	3	6	44012	44017	0 %	0 %	50 %	50 %	339321364
1032	NC_015723	CGC	2	6	44057	44062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321364
1033	NC_015723	GCGCC	2	10	44110	44119	0 %	0 %	40 %	60 %	339321364
1034	NC_015723	GCG	2	6	44153	44158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321364
1035	NC_015723	CGG	2	6	44168	44173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321364
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1037	NC_015723	GTC	2	6	44190	44195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321364
1038	NC_015723	CTG	2	6	44214	44219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321364
1039	NC_015723	CAG	2	6	44235	44240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321364
1040	NC_015723	CG	3	6	44280	44285	0 %	0 %	50 %	50 %	339321364
1041	NC_015723	GCGGTT	2	12	44292	44303	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	339321364
1042	NC_015723	GGC	2	6	44304	44309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321364
1043	NC_015723	GCG	2	6	44316	44321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321364
1044	NC_015723	AGGT	2	8	44332	44339	25 %	25 %	50 %	0 %	339321364
1045	NC_015723	CAT	2	6	44361	44366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321364
1046	NC_015723	CG	3	6	44369	44374	0 %	0 %	50 %	50 %	339321364
1047	NC_015723	GCT	2	6	44385	44390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321364
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1049	NC_015723	GCG	2	6	44414	44419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321364
1050	NC_015723	TGG	2	6	44423	44428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321364
1051	NC_015723	GCT	2	6	44459	44464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321364
1052	NC_015723	GGC	2	6	44619	44624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321365
1053	NC_015723	ACC	2	6	44656	44661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321365
1054	NC_015723	GC	3	6	44664	44669	0 %	0 %	50 %	50 %	339321365
1055	NC_015723	TGC	2	6	44672	44677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321365
1056	NC_015723	CG	3	6	44678	44683	0 %	0 %	50 %	50 %	339321365
1057	NC_015723	CGC	2	6	44696	44701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321365
1058	NC_015723	GGC	2	6	44733	44738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321365
1059	NC_015723	TTG	2	6	44755	44760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339321365
1060	NC_015723	CAG	2	6	44862	44867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321365
1061	NC_015723	GCG	2	6	44888	44893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321365
1062	NC_015723	TCG	2	6	44914	44919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321365
1063	NC_015723	GCG	2	6	44942	44947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321365
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1067	NC_015723	GC	3	6	45024	45029	0 %	0 %	50 %	50 %	339321365
1068	NC_015723	CCA	2	6	45053	45058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321365
1069	NC_015723	CAGCGG	2	12	45096	45107	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339321365
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1071	NC_015723	CAG	2	6	45186	45191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321365
1072	NC_015723	GCC	2	6	45223	45228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321365
1073	NC_015723	AAGCG	2	10	45240	45249	40 %	0 %	40 %	20 %	339321365
1074	NC_015723	GGCA	2	8	45256	45263	25 %	0 %	50 %	25 %	339321365
1075	NC_015723	CGC	2	6	45272	45277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321365
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1080	NC_015723	CAG	2	6	45411	45416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321365
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1083	NC_015723	CTC	2	6	45537	45542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339321365
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1085	NC_015723	GCC	2	6	46378	46383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321366
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1088	NC_015723	GCG	3	9	46470	46478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321366
1089	NC_015723	ACC	3	9	46505	46513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321366
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1097	NC_015723	GTG	2	6	46718	46723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321367
1098	NC_015723	CAG	2	6	46726	46731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321367
1099	NC_015723	CAC	2	6	46732	46737	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321367
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1103	NC_015723	CGC	2	6	47357	47362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321368
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1106	NC_015723	GCC	2	6	47427	47432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321369
1107	NC_015723	TCCA	2	8	47450	47457	25 %	25 %	0 %	50 %	339321369
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1111	NC_015723	GC	5	10	47627	47636	0 %	0 %	50 %	50 %	339321369
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1113	NC_015723	GCCG	2	8	47721	47728	0 %	0 %	50 %	50 %	339321369
1114	NC_015723	TCA	2	6	47756	47761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321369
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1119	NC_015723	GC	3	6	47970	47975	0 %	0 %	50 %	50 %	339321370
1120	NC_015723	GCG	2	6	48010	48015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321370
1121	NC_015723	GGT	2	6	48023	48028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321370
1122	NC_015723	ACC	2	6	48029	48034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321370
1123	NC_015723	CGG	2	6	48038	48043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321370
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1500	NC_015723	GTT	2	6	61737	61742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339321384

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