MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 2

Total Repeats: 63253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015723	GTC	2	6	238872	238877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321538
6002	NC_015723	CAC	2	6	238938	238943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321538
6003	NC_015723	CGCGG	2	10	239028	239037	0 %	0 %	60 %	40 %	339321538
6004	NC_015723	ACC	2	6	239074	239079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321538
6005	NC_015723	AGC	2	6	239157	239162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321538
6006	NC_015723	TGG	3	9	239174	239182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321538
6007	NC_015723	GGC	2	6	239445	239450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321539
6008	NC_015723	GCC	2	6	239470	239475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321539
6009	NC_015723	GC	3	6	239493	239498	0 %	0 %	50 %	50 %	339321539
6010	NC_015723	GGCT	2	8	239506	239513	0 %	25 %	50 %	25 %	339321539
6011	NC_015723	CGGCA	2	10	239530	239539	20 %	0 %	40 %	40 %	339321539
6012	NC_015723	GTG	2	6	239545	239550	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321539
6013	NC_015723	GCT	2	6	239571	239576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321539
6014	NC_015723	GCC	2	6	239601	239606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321539
6015	NC_015723	CGG	2	6	239618	239623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321539
6016	NC_015723	GCA	2	6	239649	239654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321539
6017	NC_015723	CGCTAT	2	12	239671	239682	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	339321539
6018	NC_015723	GCCA	2	8	239746	239753	25 %	0 %	25 %	50 %	339321539
6019	NC_015723	GC	3	6	239760	239765	0 %	0 %	50 %	50 %	339321539
6020	NC_015723	CTG	2	6	239803	239808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321539
6021	NC_015723	CTG	2	6	239824	239829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321539
6022	NC_015723	CGGCC	2	10	239844	239853	0 %	0 %	40 %	60 %	339321539
6023	NC_015723	CCCA	2	8	239890	239897	25 %	0 %	0 %	75 %	339321539
6024	NC_015723	GC	3	6	239904	239909	0 %	0 %	50 %	50 %	339321539
6025	NC_015723	CTG	2	6	239923	239928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321539
6026	NC_015723	TGC	2	6	239933	239938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321539
6027	NC_015723	CGG	3	9	239940	239948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321539
6028	NC_015723	CCGG	2	8	240005	240012	0 %	0 %	50 %	50 %	339321539
6029	NC_015723	CG	3	6	240031	240036	0 %	0 %	50 %	50 %	339321539
6030	NC_015723	CTGG	2	8	240096	240103	0 %	25 %	50 %	25 %	339321539
6031	NC_015723	GGC	2	6	240130	240135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321539
6032	NC_015723	ATGC	2	8	240169	240176	25 %	25 %	25 %	25 %	339321539
6033	NC_015723	CTG	2	6	240205	240210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321539
6034	NC_015723	CG	3	6	240244	240249	0 %	0 %	50 %	50 %	339321539
6035	NC_015723	CGC	2	6	240251	240256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321539
6036	NC_015723	GCCG	2	8	240306	240313	0 %	0 %	50 %	50 %	339321539
6037	NC_015723	GGC	2	6	240356	240361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321539
6038	NC_015723	GC	3	6	240363	240368	0 %	0 %	50 %	50 %	339321539
6039	NC_015723	TGG	2	6	240401	240406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321539
6040	NC_015723	GCT	2	6	240654	240659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321540
6041	NC_015723	CAG	2	6	240702	240707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321540
6042	NC_015723	GGT	2	6	240711	240716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321540
6043	NC_015723	CCA	2	6	240731	240736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321540
6044	NC_015723	CG	3	6	240781	240786	0 %	0 %	50 %	50 %	339321540
6045	NC_015723	AGCC	2	8	240868	240875	25 %	0 %	25 %	50 %	339321540
6046	NC_015723	CAA	2	6	240891	240896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339321540
6047	NC_015723	TGG	2	6	240900	240905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321540
6048	NC_015723	GCT	2	6	240906	240911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321540
6049	NC_015723	TTC	2	6	240963	240968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339321540
6050	NC_015723	CCA	2	6	241028	241033	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321540
6051	NC_015723	GC	3	6	241139	241144	0 %	0 %	50 %	50 %	339321540
6052	NC_015723	CG	3	6	241172	241177	0 %	0 %	50 %	50 %	339321540
6053	NC_015723	AAC	2	6	241186	241191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339321540
6054	NC_015723	CGG	2	6	241218	241223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321540
6055	NC_015723	CGG	2	6	241248	241253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321540
6056	NC_015723	GCG	2	6	241327	241332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321540
6057	NC_015723	GC	4	8	241344	241351	0 %	0 %	50 %	50 %	339321540
6058	NC_015723	GTG	2	6	241408	241413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321540
6059	NC_015723	GGCGC	2	10	241461	241470	0 %	0 %	60 %	40 %	339321540
6060	NC_015723	GCT	2	6	241518	241523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321540
6061	NC_015723	GC	5	10	241530	241539	0 %	0 %	50 %	50 %	339321540
6062	NC_015723	CAGC	2	8	241773	241780	25 %	0 %	25 %	50 %	339321541
6063	NC_015723	CTT	2	6	241857	241862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339321541
6064	NC_015723	GCCG	2	8	241863	241870	0 %	0 %	50 %	50 %	339321541
6065	NC_015723	TTCA	2	8	242551	242558	25 %	50 %	0 %	25 %	339321542
6066	NC_015723	CAA	2	6	242569	242574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339321542
6067	NC_015723	CTG	2	6	242591	242596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321542
6068	NC_015723	GCT	3	9	242620	242628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321542
6069	NC_015723	CGG	2	6	242638	242643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321542
6070	NC_015723	ATG	2	6	242673	242678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321542
6071	NC_015723	CCA	2	6	242742	242747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321542
6072	NC_015723	CGC	2	6	242902	242907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321542
6073	NC_015723	AGC	2	6	242919	242924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321542
6074	NC_015723	TGC	2	6	242949	242954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321542
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6077	NC_015723	TGC	2	6	243015	243020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321542
6078	NC_015723	GCAGC	2	10	243028	243037	20 %	0 %	40 %	40 %	339321542
6079	NC_015723	GC	3	6	243119	243124	0 %	0 %	50 %	50 %	339321542
6080	NC_015723	GCTGT	2	10	243170	243179	0 %	40 %	40 %	20 %	339321542
6081	NC_015723	GCTG	2	8	243226	243233	0 %	25 %	50 %	25 %	339321542
6082	NC_015723	GACCT	2	10	243257	243266	20 %	20 %	20 %	40 %	339321542
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6088	NC_015723	CG	3	6	243517	243522	0 %	0 %	50 %	50 %	339321542
6089	NC_015723	GCG	2	6	243570	243575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321542
6090	NC_015723	GTG	2	6	243578	243583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321542
6091	NC_015723	GGT	2	6	243631	243636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321542
6092	NC_015723	ATC	2	6	243641	243646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321542
6093	NC_015723	GCG	2	6	243695	243700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321542
6094	NC_015723	CG	3	6	243709	243714	0 %	0 %	50 %	50 %	339321542
6095	NC_015723	TGG	2	6	243744	243749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321542
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6102	NC_015723	CCGCA	2	10	244153	244162	20 %	0 %	20 %	60 %	339321542
6103	NC_015723	CGGC	2	8	244178	244185	0 %	0 %	50 %	50 %	339321542
6104	NC_015723	CGG	2	6	244206	244211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321542
6105	NC_015723	GAT	2	6	244241	244246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321542
6106	NC_015723	TGC	2	6	244403	244408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321543
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6109	NC_015723	CGCT	2	8	244480	244487	0 %	25 %	25 %	50 %	339321543
6110	NC_015723	CGG	2	6	244505	244510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321543
6111	NC_015723	TGT	2	6	244514	244519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339321543
6112	NC_015723	TGG	2	6	244547	244552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321543
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6117	NC_015723	GCT	2	6	244644	244649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321543
6118	NC_015723	GTG	2	6	244685	244690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321543
6119	NC_015723	GTC	2	6	244705	244710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321543
6120	NC_015723	TGG	2	6	244724	244729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321543
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6122	NC_015723	GCAC	2	8	244739	244746	25 %	0 %	25 %	50 %	339321543
6123	NC_015723	CTCGGC	2	12	244770	244781	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339321543
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6127	NC_015723	GC	3	6	244850	244855	0 %	0 %	50 %	50 %	339321543
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6143	NC_015723	GC	3	6	245293	245298	0 %	0 %	50 %	50 %	339321543
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6154	NC_015723	TGGC	2	8	245596	245603	0 %	25 %	50 %	25 %	339321543
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6232	NC_015723	GGC	2	6	248619	248624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321546
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6238	NC_015723	CAT	2	6	248721	248726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321546
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6240	NC_015723	GCG	2	6	248788	248793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321546
6241	NC_015723	CG	3	6	248792	248797	0 %	0 %	50 %	50 %	339321546
6242	NC_015723	GGT	2	6	248823	248828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321546
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6244	NC_015723	GCGCA	2	10	248851	248860	20 %	0 %	40 %	40 %	339321546
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6484	NC_015723	TCA	2	6	257777	257782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321554
6485	NC_015723	GGCC	2	8	257793	257800	0 %	0 %	50 %	50 %	339321554
6486	NC_015723	GTG	2	6	257815	257820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321554
6487	NC_015723	GCTGAC	2	12	257838	257849	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	339321554
6488	NC_015723	GCGAT	2	10	257852	257861	20 %	20 %	40 %	20 %	339321554
6489	NC_015723	TGA	2	6	257963	257968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321554
6490	NC_015723	CCG	2	6	258056	258061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321555
6491	NC_015723	GGTC	2	8	258083	258090	0 %	25 %	50 %	25 %	339321555
6492	NC_015723	GCG	2	6	258111	258116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321555
6493	NC_015723	CGA	2	6	258117	258122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321555
6494	NC_015723	CTG	2	6	258136	258141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321555
6495	NC_015723	CG	3	6	258166	258171	0 %	0 %	50 %	50 %	339321555
6496	NC_015723	GC	3	6	258183	258188	0 %	0 %	50 %	50 %	339321555
6497	NC_015723	GC	4	8	258249	258256	0 %	0 %	50 %	50 %	339321555
6498	NC_015723	GCT	2	6	258288	258293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321555
6499	NC_015723	GAC	2	6	258301	258306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321555
6500	NC_015723	TCG	2	6	258310	258315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321555

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