MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cupriavidus necator N-1 chromosome 2

Total Repeats: 63253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015723	GCT	2	6	219999	220004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321520
5502	NC_015723	CGG	2	6	220018	220023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321520
5503	NC_015723	ATC	2	6	220034	220039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321520
5504	NC_015723	CAG	2	6	220146	220151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321520
5505	NC_015723	AGC	2	6	220166	220171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321520
5506	NC_015723	CGA	2	6	220176	220181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321520
5507	NC_015723	GCA	2	6	220206	220211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321520
5508	NC_015723	GGCGC	2	10	220218	220227	0 %	0 %	60 %	40 %	339321520
5509	NC_015723	GC	4	8	220293	220300	0 %	0 %	50 %	50 %	339321520
5510	NC_015723	GCC	2	6	220338	220343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321520
5511	NC_015723	CGG	3	9	220358	220366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321520
5512	NC_015723	TGA	2	6	220370	220375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321520
5513	NC_015723	TGC	2	6	220412	220417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321520
5514	NC_015723	GTCG	2	8	220422	220429	0 %	25 %	50 %	25 %	339321520
5515	NC_015723	CTA	2	6	220434	220439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321520
5516	NC_015723	CGGC	2	8	220440	220447	0 %	0 %	50 %	50 %	339321520
5517	NC_015723	GC	3	6	220451	220456	0 %	0 %	50 %	50 %	339321520
5518	NC_015723	CGG	2	6	220513	220518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321520
5519	NC_015723	GCC	2	6	220520	220525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321520
5520	NC_015723	CTG	2	6	220546	220551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321520
5521	NC_015723	GCA	2	6	220662	220667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321521
5522	NC_015723	GGC	2	6	220673	220678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321521
5523	NC_015723	GC	3	6	220708	220713	0 %	0 %	50 %	50 %	339321521
5524	NC_015723	CCGA	2	8	220727	220734	25 %	0 %	25 %	50 %	339321521
5525	NC_015723	TGC	2	6	220737	220742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321521
5526	NC_015723	GCA	2	6	220854	220859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321521
5527	NC_015723	GCGG	2	8	220864	220871	0 %	0 %	75 %	25 %	339321521
5528	NC_015723	CGT	2	6	220872	220877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321521
5529	NC_015723	TCG	2	6	220886	220891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321521
5530	NC_015723	GCG	2	6	220901	220906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321521
5531	NC_015723	CGC	2	6	220937	220942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321521
5532	NC_015723	CAC	2	6	220966	220971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	339321521
5533	NC_015723	GGC	2	6	220978	220983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321521
5534	NC_015723	TCG	2	6	221009	221014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321521
5535	NC_015723	CGC	2	6	221074	221079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321521
5536	NC_015723	TGGC	2	8	221108	221115	0 %	25 %	50 %	25 %	339321521
5537	NC_015723	GATG	2	8	221145	221152	25 %	25 %	50 %	0 %	339321521
5538	NC_015723	GCA	2	6	221178	221183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321521
5539	NC_015723	CCAGG	2	10	221247	221256	20 %	0 %	40 %	40 %	339321521
5540	NC_015723	GTGC	2	8	221334	221341	0 %	25 %	50 %	25 %	339321521
5541	NC_015723	TGC	2	6	221364	221369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321521
5542	NC_015723	GCC	2	6	221431	221436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321521
5543	NC_015723	CAG	2	6	221518	221523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321521
5544	NC_015723	GTC	2	6	221551	221556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321521
5545	NC_015723	GAC	3	9	221620	221628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321521
5546	NC_015723	CGC	2	6	221661	221666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321521
5547	NC_015723	GGCGCA	2	12	221733	221744	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	339321521
5548	NC_015723	CG	3	6	221751	221756	0 %	0 %	50 %	50 %	339321521
5549	NC_015723	GCA	2	6	221817	221822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321521
5550	NC_015723	GC	3	6	221879	221884	0 %	0 %	50 %	50 %	339321521
5551	NC_015723	GGC	2	6	221944	221949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321521
5552	NC_015723	GC	3	6	221969	221974	0 %	0 %	50 %	50 %	339321521
5553	NC_015723	TGCC	2	8	222007	222014	0 %	25 %	25 %	50 %	339321521
5554	NC_015723	GCC	2	6	222055	222060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321521
5555	NC_015723	GCC	2	6	222118	222123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321521
5556	NC_015723	CG	3	6	222130	222135	0 %	0 %	50 %	50 %	339321521
5557	NC_015723	GA	3	6	222158	222163	50 %	0 %	50 %	0 %	339321521
5558	NC_015723	GCA	2	6	222203	222208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321522
5559	NC_015723	CAG	2	6	222237	222242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321522
5560	NC_015723	CGC	2	6	222305	222310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321522
5561	NC_015723	CTGC	2	8	222311	222318	0 %	25 %	25 %	50 %	339321522
5562	NC_015723	TGG	2	6	222332	222337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321522
5563	NC_015723	CCAG	2	8	222338	222345	25 %	0 %	25 %	50 %	339321522
5564	NC_015723	CTG	2	6	222381	222386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321522
5565	NC_015723	CGA	2	6	222539	222544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321522
5566	NC_015723	CG	3	6	222632	222637	0 %	0 %	50 %	50 %	339321522
5567	NC_015723	GC	3	6	222642	222647	0 %	0 %	50 %	50 %	339321522
5568	NC_015723	GC	3	6	222656	222661	0 %	0 %	50 %	50 %	339321522
5569	NC_015723	ATG	2	6	222697	222702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321522
5570	NC_015723	GAA	2	6	222732	222737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339321522
5571	NC_015723	TGC	2	6	222746	222751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321522
5572	NC_015723	TGG	2	6	222767	222772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321522
5573	NC_015723	CATCAC	2	12	222789	222800	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	339321522
5574	NC_015723	CG	3	6	222825	222830	0 %	0 %	50 %	50 %	339321522
5575	NC_015723	GTG	3	9	222865	222873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321522
5576	NC_015723	TCA	2	6	222917	222922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321522
5577	NC_015723	TCG	3	9	222934	222942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321522
5578	NC_015723	GCG	2	6	223020	223025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321522
5579	NC_015723	GTCGAG	2	12	223032	223043	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339321522
5580	NC_015723	GCC	2	6	223044	223049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321522
5581	NC_015723	TGG	2	6	223064	223069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321522
5582	NC_015723	CGC	2	6	223085	223090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321522
5583	NC_015723	CCGG	2	8	223259	223266	0 %	0 %	50 %	50 %	339321523
5584	NC_015723	CTG	2	6	223288	223293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321523
5585	NC_015723	TCC	2	6	223312	223317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339321523
5586	NC_015723	GGCGAT	2	12	223335	223346	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339321523
5587	NC_015723	CGG	2	6	223355	223360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321523
5588	NC_015723	GCAC	2	8	223464	223471	25 %	0 %	25 %	50 %	339321523
5589	NC_015723	TGG	2	6	223478	223483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321523
5590	NC_015723	GAG	2	6	223504	223509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	339321523
5591	NC_015723	CG	3	6	223522	223527	0 %	0 %	50 %	50 %	339321523
5592	NC_015723	GCG	2	6	223532	223537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321523
5593	NC_015723	ATC	2	6	223636	223641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339321523
5594	NC_015723	GCCTGC	2	12	223652	223663	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	339321523
5595	NC_015723	GCT	2	6	223668	223673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321523
5596	NC_015723	CGA	2	6	223674	223679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321523
5597	NC_015723	CGCT	2	8	223705	223712	0 %	25 %	25 %	50 %	339321523
5598	NC_015723	TGA	2	6	223719	223724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321523
5599	NC_015723	CTACCA	2	12	223734	223745	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	339321523
5600	NC_015723	CGA	2	6	223755	223760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321523
5601	NC_015723	CG	5	10	223799	223808	0 %	0 %	50 %	50 %	339321523
5602	NC_015723	ATGC	2	8	223870	223877	25 %	25 %	25 %	25 %	339321523
5603	NC_015723	GCT	2	6	223878	223883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321523
5604	NC_015723	TCG	2	6	223939	223944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321523
5605	NC_015723	TGC	2	6	223964	223969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321523
5606	NC_015723	GCT	2	6	223992	223997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321523
5607	NC_015723	AGA	2	6	224030	224035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339321523
5608	NC_015723	TGC	2	6	224036	224041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321523
5609	NC_015723	GCA	2	6	224070	224075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321523
5610	NC_015723	CGCGG	2	10	224093	224102	0 %	0 %	60 %	40 %	339321523
5611	NC_015723	TCG	2	6	224132	224137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321523
5612	NC_015723	GCA	2	6	224166	224171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321523
5613	NC_015723	GGC	2	6	224172	224177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321523
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5615	NC_015723	AC	3	6	224376	224381	50 %	0 %	0 %	50 %	339321524
5616	NC_015723	TGG	2	6	224397	224402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321524
5617	NC_015723	GCGCC	2	10	224403	224412	0 %	0 %	40 %	60 %	339321524
5618	NC_015723	CGG	3	9	224413	224421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321524
5619	NC_015723	GC	3	6	224435	224440	0 %	0 %	50 %	50 %	339321524
5620	NC_015723	CGC	2	6	224458	224463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321524
5621	NC_015723	AGC	2	6	224472	224477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321524
5622	NC_015723	CGT	2	6	224479	224484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321524
5623	NC_015723	GGC	2	6	224539	224544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321524
5624	NC_015723	GCT	2	6	224560	224565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321524
5625	NC_015723	GTG	2	6	224573	224578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321524
5626	NC_015723	GTC	2	6	224656	224661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321524
5627	NC_015723	TGG	2	6	224676	224681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321524
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5630	NC_015723	TGG	2	6	224718	224723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321524
5631	NC_015723	GCA	2	6	224775	224780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321524
5632	NC_015723	CG	3	6	224806	224811	0 %	0 %	50 %	50 %	339321524
5633	NC_015723	GCT	2	6	224827	224832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321524
5634	NC_015723	AGC	4	12	224849	224860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321524
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5636	NC_015723	TGG	2	6	224865	224870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321524
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5641	NC_015723	GCCG	2	8	225061	225068	0 %	0 %	50 %	50 %	339321524
5642	NC_015723	CGC	2	6	225072	225077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321524
5643	NC_015723	AGC	2	6	225098	225103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321524
5644	NC_015723	GC	3	6	225102	225107	0 %	0 %	50 %	50 %	339321524
5645	NC_015723	GC	3	6	225171	225176	0 %	0 %	50 %	50 %	339321524
5646	NC_015723	CCG	2	6	225324	225329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	339321525
5647	NC_015723	GCT	2	6	225355	225360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321525
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5649	NC_015723	CTG	2	6	225395	225400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321525
5650	NC_015723	CGA	2	6	225412	225417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321525
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5653	NC_015723	GC	3	6	225542	225547	0 %	0 %	50 %	50 %	339321525
5654	NC_015723	GGGC	2	8	225565	225572	0 %	0 %	75 %	25 %	339321525
5655	NC_015723	CGCTGG	2	12	225588	225599	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	339321525
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5660	NC_015723	GAT	2	6	225814	225819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321525
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5664	NC_015723	CGG	2	6	225972	225977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321525
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5669	NC_015723	GGGC	2	8	226156	226163	0 %	0 %	75 %	25 %	339321525
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5679	NC_015723	CG	3	6	226593	226598	0 %	0 %	50 %	50 %	339321526
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5694	NC_015723	TGC	2	6	227073	227078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321526
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5701	NC_015723	CGG	2	6	227272	227277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321526
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5729	NC_015723	GTG	2	6	228224	228229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321527
5730	NC_015723	ATG	2	6	228288	228293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321527
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5732	NC_015723	CTG	2	6	228397	228402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321527
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5734	NC_015723	CTG	2	6	228422	228427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321527
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5736	NC_015723	TTC	2	6	228494	228499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339321527
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5738	NC_015723	CGGTG	2	10	228511	228520	0 %	20 %	60 %	20 %	339321527
5739	NC_015723	TCGC	2	8	228524	228531	0 %	25 %	25 %	50 %	339321527
5740	NC_015723	CG	3	6	228570	228575	0 %	0 %	50 %	50 %	339321527
5741	NC_015723	CTG	2	6	228632	228637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321527
5742	NC_015723	CGA	2	6	228649	228654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339321527
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5744	NC_015723	CTG	2	6	228674	228679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321527
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5864	NC_015723	CGG	2	6	232704	232709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321530
5865	NC_015723	TGG	2	6	232772	232777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321530
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5867	NC_015723	CATG	2	8	232882	232889	25 %	25 %	25 %	25 %	339321531
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5985	NC_015723	CGT	2	6	238336	238341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321537
5986	NC_015723	GC	4	8	238352	238359	0 %	0 %	50 %	50 %	339321537
5987	NC_015723	GCAC	2	8	238393	238400	25 %	0 %	25 %	50 %	339321537
5988	NC_015723	CGT	2	6	238489	238494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339321537
5989	NC_015723	GGT	2	6	238508	238513	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339321537
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5993	NC_015723	GAT	2	6	238622	238627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339321537
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5999	NC_015723	GGC	3	9	238803	238811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339321538
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