MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Midichloria mitochondrii IricVA chromosome

Total Repeats: 19690

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19501	NC_015722	TAT	2	6	1167218	1167223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320506
19502	NC_015722	T	6	6	1167225	1167230	0 %	100 %	0 %	0 %	339320506
19503	NC_015722	TAA	2	6	1167279	1167284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320506
19504	NC_015722	TC	3	6	1167316	1167321	0 %	50 %	0 %	50 %	339320506
19505	NC_015722	TAC	2	6	1167371	1167376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320506
19506	NC_015722	TGTGT	2	10	1167393	1167402	0 %	60 %	40 %	0 %	339320506
19507	NC_015722	AGT	2	6	1167403	1167408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320506
19508	NC_015722	TAT	3	9	1167432	1167440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320506
19509	NC_015722	TTA	2	6	1167448	1167453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320506
19510	NC_015722	TGG	2	6	1168067	1168072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339320507
19511	NC_015722	AAG	2	6	1168091	1168096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339320507
19512	NC_015722	TAA	2	6	1168133	1168138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320507
19513	NC_015722	AAT	2	6	1168158	1168163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320507
19514	NC_015722	T	6	6	1168211	1168216	0 %	100 %	0 %	0 %	339320507
19515	NC_015722	CAG	2	6	1168218	1168223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339320507
19516	NC_015722	T	6	6	1168229	1168234	0 %	100 %	0 %	0 %	339320507
19517	NC_015722	TGG	2	6	1168236	1168241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339320507
19518	NC_015722	CTG	2	6	1169007	1169012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320508
19519	NC_015722	TGC	2	6	1169016	1169021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320508
19520	NC_015722	AAAC	2	8	1169028	1169035	75 %	0 %	0 %	25 %	339320508
19521	NC_015722	CAA	2	6	1169049	1169054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339320508
19522	NC_015722	TAA	2	6	1169092	1169097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320508
19523	NC_015722	GA	3	6	1169167	1169172	50 %	0 %	50 %	0 %	339320508
19524	NC_015722	GAT	2	6	1169205	1169210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320508
19525	NC_015722	GGT	2	6	1169266	1169271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339320508
19526	NC_015722	CTG	2	6	1170036	1170041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320509
19527	NC_015722	CTG	2	6	1170093	1170098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320509
19528	NC_015722	TTTG	2	8	1170133	1170140	0 %	75 %	25 %	0 %	339320509
19529	NC_015722	TGC	2	6	1170197	1170202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320509
19530	NC_015722	TA	3	6	1170237	1170242	50 %	50 %	0 %	0 %	339320509
19531	NC_015722	T	6	6	1170341	1170346	0 %	100 %	0 %	0 %	339320509
19532	NC_015722	T	6	6	1170353	1170358	0 %	100 %	0 %	0 %	339320509
19533	NC_015722	ATA	2	6	1170365	1170370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320509
19534	NC_015722	A	6	6	1170432	1170437	100 %	0 %	0 %	0 %	339320509
19535	NC_015722	CTT	2	6	1170445	1170450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320509
19536	NC_015722	TAG	2	6	1170454	1170459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320509
19537	NC_015722	AAT	2	6	1170463	1170468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320509
19538	NC_015722	CAA	2	6	1170563	1170568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339320509
19539	NC_015722	TC	3	6	1170587	1170592	0 %	50 %	0 %	50 %	339320509
19540	NC_015722	GCA	2	6	1170639	1170644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339320509
19541	NC_015722	TTTA	2	8	1170650	1170657	25 %	75 %	0 %	0 %	339320509
19542	NC_015722	TAA	2	6	1170683	1170688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320509
19543	NC_015722	ATT	2	6	1170924	1170929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320510
19544	NC_015722	TA	3	6	1170930	1170935	50 %	50 %	0 %	0 %	339320510
19545	NC_015722	CAG	2	6	1171049	1171054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339320510
19546	NC_015722	TA	3	6	1171098	1171103	50 %	50 %	0 %	0 %	339320510
19547	NC_015722	TGT	2	6	1171199	1171204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339320510
19548	NC_015722	TTC	2	6	1171226	1171231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339320510
19549	NC_015722	CTC	2	6	1171325	1171330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339320510
19550	NC_015722	ACCC	2	8	1171349	1171356	25 %	0 %	0 %	75 %	339320510
19551	NC_015722	CGG	2	6	1171452	1171457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339320510
19552	NC_015722	GGC	2	6	1171479	1171484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339320510
19553	NC_015722	AAT	2	6	1171497	1171502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320510
19554	NC_015722	TAT	2	6	1171509	1171514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320510
19555	NC_015722	TCC	2	6	1171519	1171524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	339320510
19556	NC_015722	AAG	2	6	1171536	1171541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339320510
19557	NC_015722	AAT	2	6	1171582	1171587	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320510
19558	NC_015722	CGT	2	6	1171589	1171594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320510
19559	NC_015722	GTTA	2	8	1171605	1171612	25 %	50 %	25 %	0 %	339320510
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19567	NC_015722	T	7	7	1171960	1171966	0 %	100 %	0 %	0 %	339320511
19568	NC_015722	TGT	2	6	1171978	1171983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339320511
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19570	NC_015722	AAT	2	6	1171991	1171996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	339320511
19571	NC_015722	TCG	2	6	1172082	1172087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320511
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19578	NC_015722	GCCAGA	2	12	1172456	1172467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339320511
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19586	NC_015722	T	6	6	1172706	1172711	0 %	100 %	0 %	0 %	339320512
19587	NC_015722	TTTTTC	2	12	1172716	1172727	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	339320512
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19591	NC_015722	CTG	2	6	1173276	1173281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320513
19592	NC_015722	T	7	7	1173282	1173288	0 %	100 %	0 %	0 %	339320513
19593	NC_015722	GTA	2	6	1173318	1173323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320514
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19597	NC_015722	ATGGAG	2	12	1173403	1173414	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	339320514
19598	NC_015722	GCT	2	6	1173425	1173430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320514
19599	NC_015722	GAT	2	6	1174053	1174058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320515
19600	NC_015722	A	6	6	1174072	1174077	100 %	0 %	0 %	0 %	339320515
19601	NC_015722	GGT	2	6	1174115	1174120	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339320515
19602	NC_015722	TTG	2	6	1174457	1174462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339320516
19603	NC_015722	CAT	2	6	1174535	1174540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320516
19604	NC_015722	TGC	2	6	1174543	1174548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339320516
19605	NC_015722	CATTT	2	10	1174563	1174572	20 %	60 %	0 %	20 %	339320516
19606	NC_015722	AGC	2	6	1174574	1174579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339320516
19607	NC_015722	AGC	2	6	1174611	1174616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339320516
19608	NC_015722	TCA	2	6	1174723	1174728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339320516
19609	NC_015722	GTA	2	6	1174765	1174770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339320516
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19612	NC_015722	CCAC	2	8	1174885	1174892	25 %	0 %	0 %	75 %	339320517
19613	NC_015722	T	7	7	1174895	1174901	0 %	100 %	0 %	0 %	339320517
19614	NC_015722	ATT	2	6	1175006	1175011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320517
19615	NC_015722	T	6	6	1175018	1175023	0 %	100 %	0 %	0 %	339320517
19616	NC_015722	TAT	2	6	1175058	1175063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320517
19617	NC_015722	TTA	2	6	1175067	1175072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339320517
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