MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium acetobutylicum DSM 1731 plasmid pSMBa

Total Repeats: 3849

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015686	AC	3	6	49711	49716	50 %	0 %	0 %	50 %	337735080
1002	NC_015686	CTG	2	6	49719	49724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735080
1003	NC_015686	ATT	2	6	49730	49735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735080
1004	NC_015686	GTAA	2	8	49766	49773	50 %	25 %	25 %	0 %	337735080
1005	NC_015686	AAG	2	6	49783	49788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735080
1006	NC_015686	TGC	2	6	49848	49853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735080
1007	NC_015686	ATAG	2	8	49858	49865	50 %	25 %	25 %	0 %	337735080
1008	NC_015686	AGA	2	6	49868	49873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735080
1009	NC_015686	CCA	2	6	49883	49888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	337735080
1010	NC_015686	CAAA	2	8	49899	49906	75 %	0 %	0 %	25 %	337735080
1011	NC_015686	AAG	2	6	49964	49969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735080
1012	NC_015686	TCTT	2	8	49996	50003	0 %	75 %	0 %	25 %	337735080
1013	NC_015686	TGAATT	2	12	50015	50026	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	337735080
1014	NC_015686	CTA	2	6	50118	50123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735080
1015	NC_015686	TTTC	2	8	50177	50184	0 %	75 %	0 %	25 %	337735080
1016	NC_015686	ATT	2	6	50255	50260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735080
1017	NC_015686	AAG	2	6	50261	50266	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735080
1018	NC_015686	CTTT	2	8	50267	50274	0 %	75 %	0 %	25 %	337735080
1019	NC_015686	TCT	2	6	50356	50361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735080
1020	NC_015686	ATCT	2	8	50367	50374	25 %	50 %	0 %	25 %	337735080
1021	NC_015686	AT	3	6	50376	50381	50 %	50 %	0 %	0 %	337735080
1022	NC_015686	CAA	2	6	50385	50390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735080
1023	NC_015686	GAA	2	6	50412	50417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735080
1024	NC_015686	CCAA	2	8	50476	50483	50 %	0 %	0 %	50 %	337735080
1025	NC_015686	T	6	6	50555	50560	0 %	100 %	0 %	0 %	337735080
1026	NC_015686	TAA	2	6	50577	50582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735080
1027	NC_015686	ATAA	2	8	50822	50829	75 %	25 %	0 %	0 %	337735081
1028	NC_015686	A	7	7	50923	50929	100 %	0 %	0 %	0 %	337735081
1029	NC_015686	GCA	2	6	50934	50939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735081
1030	NC_015686	GAA	2	6	50966	50971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735081
1031	NC_015686	A	6	6	51028	51033	100 %	0 %	0 %	0 %	337735081
1032	NC_015686	TGG	2	6	51058	51063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	337735081
1033	NC_015686	TTA	2	6	51094	51099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735081
1034	NC_015686	AAG	2	6	51120	51125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735081
1035	NC_015686	ATG	2	6	51189	51194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735081
1036	NC_015686	AAT	2	6	51229	51234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735081
1037	NC_015686	GGA	2	6	51272	51277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735081
1038	NC_015686	CAG	2	6	51309	51314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735081
1039	NC_015686	CAAAGG	2	12	51348	51359	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	337735081
1040	NC_015686	ATA	2	6	51414	51419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735081
1041	NC_015686	AT	4	8	51438	51445	50 %	50 %	0 %	0 %	337735081
1042	NC_015686	A	6	6	51511	51516	100 %	0 %	0 %	0 %	337735081
1043	NC_015686	GCA	2	6	51518	51523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735081
1044	NC_015686	GAC	2	6	51536	51541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735081
1045	NC_015686	AGC	2	6	51548	51553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735081
1046	NC_015686	TA	3	6	51566	51571	50 %	50 %	0 %	0 %	337735081
1047	NC_015686	TGA	2	6	51586	51591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735081
1048	NC_015686	ATG	2	6	51669	51674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735081
1049	NC_015686	TTTA	2	8	51682	51689	25 %	75 %	0 %	0 %	337735081
1050	NC_015686	TAA	2	6	51691	51696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735081
1051	NC_015686	AGG	2	6	51715	51720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735081
1052	NC_015686	AG	3	6	51733	51738	50 %	0 %	50 %	0 %	337735081
1053	NC_015686	GAAT	2	8	51747	51754	50 %	25 %	25 %	0 %	337735081
1054	NC_015686	AGA	2	6	51805	51810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735081
1055	NC_015686	GAT	2	6	51811	51816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735081
1056	NC_015686	T	6	6	51847	51852	0 %	100 %	0 %	0 %	337735081
1057	NC_015686	A	7	7	51888	51894	100 %	0 %	0 %	0 %	337735081
1058	NC_015686	ATA	2	6	51990	51995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735081
1059	NC_015686	A	6	6	52052	52057	100 %	0 %	0 %	0 %	337735081
1060	NC_015686	TGA	2	6	52174	52179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735081
1061	NC_015686	AAT	2	6	52196	52201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735081
1062	NC_015686	GA	3	6	52228	52233	50 %	0 %	50 %	0 %	337735081
1063	NC_015686	TA	3	6	52242	52247	50 %	50 %	0 %	0 %	337735081
1064	NC_015686	AT	3	6	52251	52256	50 %	50 %	0 %	0 %	337735081
1065	NC_015686	AT	4	8	52372	52379	50 %	50 %	0 %	0 %	337735082
1066	NC_015686	TTTTC	2	10	52380	52389	0 %	80 %	0 %	20 %	337735082
1067	NC_015686	T	6	6	52390	52395	0 %	100 %	0 %	0 %	337735082
1068	NC_015686	TA	3	6	52406	52411	50 %	50 %	0 %	0 %	337735082
1069	NC_015686	CAG	2	6	52418	52423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735082
1070	NC_015686	CAG	2	6	52430	52435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735082
1071	NC_015686	GCTT	2	8	52465	52472	0 %	50 %	25 %	25 %	337735082
1072	NC_015686	TA	3	6	52484	52489	50 %	50 %	0 %	0 %	337735082
1073	NC_015686	CCAG	2	8	52491	52498	25 %	0 %	25 %	50 %	337735082
1074	NC_015686	AT	3	6	52515	52520	50 %	50 %	0 %	0 %	337735082
1075	NC_015686	TGCT	2	8	52526	52533	0 %	50 %	25 %	25 %	337735082
1076	NC_015686	TTAG	2	8	52534	52541	25 %	50 %	25 %	0 %	337735082
1077	NC_015686	TA	3	6	52613	52618	50 %	50 %	0 %	0 %	337735082
1078	NC_015686	AGG	2	6	52622	52627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735082
1079	NC_015686	GGA	2	6	52632	52637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	337735082
1080	NC_015686	AT	3	6	52712	52717	50 %	50 %	0 %	0 %	337735082
1081	NC_015686	TCT	2	6	52732	52737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735082
1082	NC_015686	TAGGT	2	10	52758	52767	20 %	40 %	40 %	0 %	337735082
1083	NC_015686	GCC	2	6	52803	52808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	337735082
1084	NC_015686	TCA	2	6	52813	52818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735082
1085	NC_015686	TTCTT	2	10	52920	52929	0 %	80 %	0 %	20 %	337735082
1086	NC_015686	TA	3	6	52947	52952	50 %	50 %	0 %	0 %	337735082
1087	NC_015686	T	7	7	52968	52974	0 %	100 %	0 %	0 %	337735082
1088	NC_015686	T	6	6	53019	53024	0 %	100 %	0 %	0 %	337735082
1089	NC_015686	ATT	2	6	53026	53031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735082
1090	NC_015686	TATTC	2	10	53039	53048	20 %	60 %	0 %	20 %	337735083
1091	NC_015686	TAA	2	6	53073	53078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735083
1092	NC_015686	CCT	2	6	53142	53147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	337735083
1093	NC_015686	TTTA	2	8	53212	53219	25 %	75 %	0 %	0 %	337735083
1094	NC_015686	TTC	2	6	53223	53228	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735083
1095	NC_015686	T	6	6	53241	53246	0 %	100 %	0 %	0 %	337735083
1096	NC_015686	GCT	2	6	53359	53364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735083
1097	NC_015686	TA	4	8	53421	53428	50 %	50 %	0 %	0 %	337735083
1098	NC_015686	TTC	2	6	53461	53466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735083
1099	NC_015686	TTATT	2	10	53469	53478	20 %	80 %	0 %	0 %	337735083
1100	NC_015686	TAAG	2	8	53638	53645	50 %	25 %	25 %	0 %	337735084
1101	NC_015686	AT	3	6	53726	53731	50 %	50 %	0 %	0 %	337735084
1102	NC_015686	TTG	2	6	53785	53790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	337735084
1103	NC_015686	TGAGT	2	10	53804	53813	20 %	40 %	40 %	0 %	337735084
1104	NC_015686	GCT	2	6	53993	53998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735084
1105	NC_015686	TAT	2	6	54013	54018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735084
1106	NC_015686	ATTA	2	8	54028	54035	50 %	50 %	0 %	0 %	337735084
1107	NC_015686	CTG	2	6	54067	54072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735084
1108	NC_015686	CAATC	2	10	54084	54093	40 %	20 %	0 %	40 %	337735084
1109	NC_015686	AAG	2	6	54132	54137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735084
1110	NC_015686	ACA	2	6	54161	54166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735084
1111	NC_015686	CAA	2	6	54168	54173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735084
1112	NC_015686	GCT	2	6	54267	54272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735084
1113	NC_015686	AGC	2	6	54490	54495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735084
1114	NC_015686	ATA	2	6	54581	54586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735084
1115	NC_015686	T	7	7	54635	54641	0 %	100 %	0 %	0 %	337735085
1116	NC_015686	TAA	2	6	54669	54674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	337735085
1117	NC_015686	CAT	2	6	54780	54785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735085
1118	NC_015686	ATT	2	6	54853	54858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735085
1119	NC_015686	GCA	2	6	54863	54868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	337735085
1120	NC_015686	AGT	2	6	54889	54894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	337735085
1121	NC_015686	GCT	2	6	55013	55018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	337735085
1122	NC_015686	ATC	2	6	55075	55080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	337735085
1123	NC_015686	CTT	2	6	55099	55104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	337735085
1124	NC_015686	ATT	2	6	55225	55230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	337735085
1125	NC_015686	ACA	2	6	55250	55255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	337735085
1126	NC_015686	AGA	2	6	55262	55267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	337735085
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