MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 21987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015470	AG	3	6	216041	216046	50 %	0 %	50 %	0 %	332287156
4002	NC_015470	GT	3	6	216125	216130	0 %	50 %	50 %	0 %	332287156
4003	NC_015470	GACA	2	8	216162	216169	50 %	0 %	25 %	25 %	332287156
4004	NC_015470	AG	3	6	216191	216196	50 %	0 %	50 %	0 %	332287156
4005	NC_015470	CTC	2	6	216248	216253	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287156
4006	NC_015470	ATT	2	6	216276	216281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287156
4007	NC_015470	TTG	2	6	216384	216389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287156
4008	NC_015470	GGT	2	6	216395	216400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287156
4009	NC_015470	AGC	2	6	216451	216456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287156
4010	NC_015470	TTG	2	6	216516	216521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287156
4011	NC_015470	AAG	2	6	216551	216556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287157
4012	NC_015470	GAAAG	2	10	216572	216581	60 %	0 %	40 %	0 %	332287157
4013	NC_015470	TAT	2	6	216660	216665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287157
4014	NC_015470	AGA	2	6	216687	216692	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287157
4015	NC_015470	ATTT	2	8	216743	216750	25 %	75 %	0 %	0 %	332287157
4016	NC_015470	TCA	2	6	216855	216860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287157
4017	NC_015470	GTG	2	6	216938	216943	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287157
4018	NC_015470	ACTC	2	8	216952	216959	25 %	25 %	0 %	50 %	332287157
4019	NC_015470	TTA	2	6	217046	217051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287157
4020	NC_015470	TGT	2	6	217104	217109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287157
4021	NC_015470	TG	3	6	217208	217213	0 %	50 %	50 %	0 %	332287157
4022	NC_015470	TAG	2	6	217293	217298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287157
4023	NC_015470	TAC	2	6	217309	217314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287157
4024	NC_015470	AT	3	6	217544	217549	50 %	50 %	0 %	0 %	332287158
4025	NC_015470	AGAA	2	8	217849	217856	75 %	0 %	25 %	0 %	332287158
4026	NC_015470	TTG	2	6	217861	217866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4027	NC_015470	CAAC	2	8	217916	217923	50 %	0 %	0 %	50 %	332287158
4028	NC_015470	TTC	2	6	218255	218260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287158
4029	NC_015470	AGC	2	6	218315	218320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4030	NC_015470	ATC	2	6	218321	218326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287158
4031	NC_015470	TGT	2	6	218347	218352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4032	NC_015470	GA	3	6	218378	218383	50 %	0 %	50 %	0 %	332287158
4033	NC_015470	AGT	2	6	218416	218421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287158
4034	NC_015470	GCG	2	6	218444	218449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332287158
4035	NC_015470	CTC	2	6	218453	218458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287158
4036	NC_015470	AT	3	6	218520	218525	50 %	50 %	0 %	0 %	332287158
4037	NC_015470	GTTAG	2	10	218556	218565	20 %	40 %	40 %	0 %	332287158
4038	NC_015470	CTA	2	6	218580	218585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287158
4039	NC_015470	TAAG	2	8	218624	218631	50 %	25 %	25 %	0 %	332287158
4040	NC_015470	TGGAT	2	10	218708	218717	20 %	40 %	40 %	0 %	332287158
4041	NC_015470	CTG	4	12	218770	218781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4042	NC_015470	AGG	2	6	218807	218812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287158
4043	NC_015470	TCT	2	6	218826	218831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287158
4044	NC_015470	GTT	2	6	218861	218866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4045	NC_015470	T	6	6	218988	218993	0 %	100 %	0 %	0 %	332287158
4046	NC_015470	AAT	2	6	219069	219074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287158
4047	NC_015470	TTA	2	6	219117	219122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287158
4048	NC_015470	AGA	2	6	219149	219154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287158
4049	NC_015470	CAT	2	6	219178	219183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287158
4050	NC_015470	GATT	2	8	219195	219202	25 %	50 %	25 %	0 %	332287158
4051	NC_015470	TGC	2	6	219203	219208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4052	NC_015470	AGAA	2	8	219247	219254	75 %	0 %	25 %	0 %	332287158
4053	NC_015470	TGT	2	6	219267	219272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4054	NC_015470	TGC	2	6	219343	219348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4055	NC_015470	TTCC	2	8	219352	219359	0 %	50 %	0 %	50 %	332287158
4056	NC_015470	ATT	2	6	219380	219385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287158
4057	NC_015470	GTT	2	6	219397	219402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4058	NC_015470	GCT	2	6	219456	219461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4059	NC_015470	T	6	6	219474	219479	0 %	100 %	0 %	0 %	332287158
4060	NC_015470	CAC	2	6	219571	219576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287158
4061	NC_015470	GTTG	2	8	219725	219732	0 %	50 %	50 %	0 %	332287158
4062	NC_015470	CCA	2	6	219747	219752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287158
4063	NC_015470	TTC	2	6	219803	219808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287158
4064	NC_015470	TGT	2	6	219908	219913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4065	NC_015470	TGT	2	6	219926	219931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4066	NC_015470	CAG	2	6	220024	220029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4067	NC_015470	ATC	2	6	220055	220060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287158
4068	NC_015470	GTT	2	6	220168	220173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4069	NC_015470	TAG	2	6	220180	220185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287158
4070	NC_015470	ATAG	2	8	220259	220266	50 %	25 %	25 %	0 %	332287158
4071	NC_015470	TAT	2	6	220288	220293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287158
4072	NC_015470	CAC	2	6	220351	220356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287158
4073	NC_015470	GGT	2	6	220390	220395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287158
4074	NC_015470	GA	3	6	220402	220407	50 %	0 %	50 %	0 %	332287158
4075	NC_015470	CAC	2	6	220435	220440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287158
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4077	NC_015470	CAG	2	6	220507	220512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4078	NC_015470	TGC	2	6	220517	220522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4079	NC_015470	GCA	2	6	220530	220535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4080	NC_015470	ACT	2	6	220536	220541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287158
4081	NC_015470	GATT	2	8	220601	220608	25 %	50 %	25 %	0 %	332287158
4082	NC_015470	GTTA	2	8	220613	220620	25 %	50 %	25 %	0 %	332287158
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4086	NC_015470	T	7	7	220786	220792	0 %	100 %	0 %	0 %	332287158
4087	NC_015470	GGT	2	6	220793	220798	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287158
4088	NC_015470	CCA	2	6	220869	220874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287158
4089	NC_015470	TTC	2	6	220877	220882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287158
4090	NC_015470	GCCC	2	8	220951	220958	0 %	0 %	25 %	75 %	332287158
4091	NC_015470	AC	3	6	221032	221037	50 %	0 %	0 %	50 %	332287158
4092	NC_015470	CCA	2	6	221040	221045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287158
4093	NC_015470	CCG	2	6	221124	221129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332287158
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4095	NC_015470	GTTA	2	8	221282	221289	25 %	50 %	25 %	0 %	332287158
4096	NC_015470	ATAG	2	8	221309	221316	50 %	25 %	25 %	0 %	332287158
4097	NC_015470	CCA	2	6	221319	221324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287158
4098	NC_015470	GTT	2	6	221336	221341	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
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4100	NC_015470	TGG	2	6	221362	221367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287158
4101	NC_015470	TTGTA	2	10	221372	221381	20 %	60 %	20 %	0 %	332287158
4102	NC_015470	AATGGT	2	12	221546	221557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287158
4103	NC_015470	AGG	2	6	221597	221602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287158
4104	NC_015470	CTT	2	6	221605	221610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287158
4105	NC_015470	TGC	3	9	221669	221677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4106	NC_015470	T	6	6	221678	221683	0 %	100 %	0 %	0 %	332287158
4107	NC_015470	T	6	6	221695	221700	0 %	100 %	0 %	0 %	332287158
4108	NC_015470	AAT	2	6	221714	221719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287158
4109	NC_015470	TTCC	2	8	221854	221861	0 %	50 %	0 %	50 %	332287158
4110	NC_015470	CTG	2	6	221869	221874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4111	NC_015470	CTT	2	6	221875	221880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287158
4112	NC_015470	GA	3	6	221881	221886	50 %	0 %	50 %	0 %	332287158
4113	NC_015470	AGG	2	6	221921	221926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287158
4114	NC_015470	GCT	2	6	221952	221957	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287158
4115	NC_015470	TAAA	2	8	222058	222065	75 %	25 %	0 %	0 %	332287158
4116	NC_015470	CAC	2	6	222067	222072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287158
4117	NC_015470	TTG	2	6	222077	222082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4118	NC_015470	ATC	2	6	222089	222094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287158
4119	NC_015470	TA	3	6	222144	222149	50 %	50 %	0 %	0 %	332287158
4120	NC_015470	AATG	2	8	222215	222222	50 %	25 %	25 %	0 %	332287158
4121	NC_015470	AGTAGA	2	12	222275	222286	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4122	NC_015470	TGT	2	6	222293	222298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4123	NC_015470	GTA	2	6	222303	222308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287158
4124	NC_015470	AG	3	6	222345	222350	50 %	0 %	50 %	0 %	332287158
4125	NC_015470	ATG	2	6	222421	222426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287158
4126	NC_015470	GCTTA	2	10	222503	222512	20 %	40 %	20 %	20 %	332287158
4127	NC_015470	TTTG	2	8	222523	222530	0 %	75 %	25 %	0 %	332287158
4128	NC_015470	ACT	2	6	222542	222547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287158
4129	NC_015470	CAGGAG	2	12	222556	222567	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	332287158
4130	NC_015470	AGG	3	9	222569	222577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287158
4131	NC_015470	CTA	2	6	222592	222597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287158
4132	NC_015470	TGT	2	6	222665	222670	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287158
4133	NC_015470	TGC	2	6	222690	222695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287158
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4142	NC_015470	GTA	2	6	223420	223425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287159
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4151	NC_015470	TCT	2	6	224035	224040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287159
4152	NC_015470	TTG	2	6	224085	224090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287159
4153	NC_015470	TTC	2	6	224100	224105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287159
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4155	NC_015470	CAG	2	6	224267	224272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287159
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4214	NC_015470	ACAG	2	8	227621	227628	50 %	0 %	25 %	25 %	332287162
4215	NC_015470	CA	3	6	227652	227657	50 %	0 %	0 %	50 %	332287162
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4230	NC_015470	AAGG	2	8	228594	228601	50 %	0 %	50 %	0 %	332287163
4231	NC_015470	ATT	2	6	228619	228624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287163
4232	NC_015470	ATATTT	2	12	228645	228656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287163
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4235	NC_015470	A	6	6	228810	228815	100 %	0 %	0 %	0 %	332287163
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4238	NC_015470	TAA	2	6	229025	229030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287164
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4241	NC_015470	CTT	2	6	229138	229143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287164
4242	NC_015470	TCT	2	6	229327	229332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287165
4243	NC_015470	GCAA	2	8	229339	229346	50 %	0 %	25 %	25 %	332287165
4244	NC_015470	T	6	6	229373	229378	0 %	100 %	0 %	0 %	332287165
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4246	NC_015470	GGC	2	6	229507	229512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332287165
4247	NC_015470	ATTA	2	8	229522	229529	50 %	50 %	0 %	0 %	332287165
4248	NC_015470	GA	3	6	229990	229995	50 %	0 %	50 %	0 %	332287166
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4251	NC_015470	GGT	2	6	230108	230113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287166
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4259	NC_015470	ATTT	2	8	230341	230348	25 %	75 %	0 %	0 %	332287166
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4263	NC_015470	AT	3	6	230542	230547	50 %	50 %	0 %	0 %	332287167
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4277	NC_015470	A	6	6	231372	231377	100 %	0 %	0 %	0 %	332287168
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4492	NC_015470	CA	4	8	243602	243609	50 %	0 %	0 %	50 %	332287178
4493	NC_015470	TTG	2	6	243662	243667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287178
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4496	NC_015470	GT	3	6	243959	243964	0 %	50 %	50 %	0 %	332287178
4497	NC_015470	AAAG	2	8	243985	243992	75 %	0 %	25 %	0 %	332287178
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4500	NC_015470	AAG	2	6	244282	244287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287179

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