MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 21987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21501	NC_015470	CAA	2	6	1148098	1148103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287904
21502	NC_015470	CCCTG	2	10	1148138	1148147	0 %	20 %	20 %	60 %	332287904
21503	NC_015470	AAG	3	9	1148265	1148273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287904
21504	NC_015470	ATTCT	2	10	1148341	1148350	20 %	60 %	0 %	20 %	332287904
21505	NC_015470	TTA	2	6	1148400	1148405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287904
21506	NC_015470	GAAAA	2	10	1148438	1148447	80 %	0 %	20 %	0 %	332287904
21507	NC_015470	GAA	2	6	1148455	1148460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287904
21508	NC_015470	A	6	6	1148459	1148464	100 %	0 %	0 %	0 %	332287904
21509	NC_015470	CAG	2	6	1148479	1148484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287904
21510	NC_015470	AAC	2	6	1148497	1148502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287904
21511	NC_015470	A	8	8	1148507	1148514	100 %	0 %	0 %	0 %	332287904
21512	NC_015470	TTAC	2	8	1148558	1148565	25 %	50 %	0 %	25 %	332287904
21513	NC_015470	TGA	2	6	1148586	1148591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287904
21514	NC_015470	AAAG	2	8	1148626	1148633	75 %	0 %	25 %	0 %	332287904
21515	NC_015470	TGC	2	6	1148688	1148693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287904
21516	NC_015470	CGA	2	6	1148695	1148700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287904
21517	NC_015470	ATT	2	6	1148714	1148719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287904
21518	NC_015470	ACT	2	6	1148755	1148760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287904
21519	NC_015470	TCA	3	9	1148798	1148806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287905
21520	NC_015470	CTT	2	6	1148808	1148813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287905
21521	NC_015470	ATCA	2	8	1148821	1148828	50 %	25 %	0 %	25 %	332287905
21522	NC_015470	CTT	2	6	1148838	1148843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287905
21523	NC_015470	AGAA	2	8	1148932	1148939	75 %	0 %	25 %	0 %	332287905
21524	NC_015470	CAA	2	6	1149093	1149098	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287905
21525	NC_015470	CAT	2	6	1149124	1149129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287905
21526	NC_015470	GCT	2	6	1149137	1149142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287905
21527	NC_015470	A	6	6	1149150	1149155	100 %	0 %	0 %	0 %	332287905
21528	NC_015470	CGG	2	6	1149189	1149194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	332287905
21529	NC_015470	TCGC	2	8	1149201	1149208	0 %	25 %	25 %	50 %	332287905
21530	NC_015470	TTC	2	6	1149255	1149260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287905
21531	NC_015470	TTC	2	6	1149310	1149315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287905
21532	NC_015470	TTG	2	6	1149326	1149331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287905
21533	NC_015470	TCT	2	6	1149387	1149392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287905
21534	NC_015470	CTGT	2	8	1149458	1149465	0 %	50 %	25 %	25 %	332287905
21535	NC_015470	TAC	2	6	1149546	1149551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287905
21536	NC_015470	AGT	2	6	1149621	1149626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287905
21537	NC_015470	GGAT	2	8	1150246	1150253	25 %	25 %	50 %	0 %	332287906
21538	NC_015470	A	7	7	1150302	1150308	100 %	0 %	0 %	0 %	332287906
21539	NC_015470	CAT	2	6	1150316	1150321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287906
21540	NC_015470	AAATAA	2	12	1150383	1150394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	332287906
21541	NC_015470	CCCTT	2	10	1150435	1150444	0 %	40 %	0 %	60 %	332287906
21542	NC_015470	GTT	2	6	1150456	1150461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287906
21543	NC_015470	CTC	2	6	1150463	1150468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287906
21544	NC_015470	TCT	2	6	1150607	1150612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287906
21545	NC_015470	GCA	2	6	1150620	1150625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287906
21546	NC_015470	TTC	2	6	1150671	1150676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287906
21547	NC_015470	AAC	2	6	1150764	1150769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287906
21548	NC_015470	A	7	7	1150845	1150851	100 %	0 %	0 %	0 %	332287906
21549	NC_015470	CT	4	8	1150867	1150874	0 %	50 %	0 %	50 %	332287906
21550	NC_015470	TGCC	2	8	1150884	1150891	0 %	25 %	25 %	50 %	332287906
21551	NC_015470	TTTGG	2	10	1150903	1150912	0 %	60 %	40 %	0 %	332287906
21552	NC_015470	GAA	3	9	1150915	1150923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287906
21553	NC_015470	TAT	2	6	1150944	1150949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287906
21554	NC_015470	CGCTC	2	10	1151041	1151050	0 %	20 %	20 %	60 %	332287906
21555	NC_015470	AGA	2	6	1151199	1151204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287906
21556	NC_015470	CTG	2	6	1151216	1151221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287906
21557	NC_015470	CAA	2	6	1151258	1151263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287906
21558	NC_015470	TTTC	2	8	1151290	1151297	0 %	75 %	0 %	25 %	332287906
21559	NC_015470	GCA	2	6	1151367	1151372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287906
21560	NC_015470	CCTAC	3	15	1151377	1151391	20 %	20 %	0 %	60 %	332287906
21561	NC_015470	TCC	2	6	1151444	1151449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287906
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21563	NC_015470	CAT	2	6	1151481	1151486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287906
21564	NC_015470	A	6	6	1151553	1151558	100 %	0 %	0 %	0 %	332287906
21565	NC_015470	TTAG	2	8	1151592	1151599	25 %	50 %	25 %	0 %	332287907
21566	NC_015470	ACA	2	6	1151640	1151645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287907
21567	NC_015470	TGA	2	6	1151689	1151694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287907
21568	NC_015470	ACG	2	6	1151738	1151743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287907
21569	NC_015470	CTC	2	6	1151769	1151774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287907
21570	NC_015470	CAAG	2	8	1151775	1151782	50 %	0 %	25 %	25 %	332287907
21571	NC_015470	TAGG	2	8	1151800	1151807	25 %	25 %	50 %	0 %	332287907
21572	NC_015470	CCTC	2	8	1151824	1151831	0 %	25 %	0 %	75 %	332287907
21573	NC_015470	GTG	2	6	1151867	1151872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	332287907
21574	NC_015470	TC	3	6	1151888	1151893	0 %	50 %	0 %	50 %	332287907
21575	NC_015470	GAT	2	6	1151934	1151939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287907
21576	NC_015470	GAA	2	6	1151991	1151996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287907
21577	NC_015470	TCTA	2	8	1152001	1152008	25 %	50 %	0 %	25 %	332287907
21578	NC_015470	CTT	2	6	1152041	1152046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287907
21579	NC_015470	TAC	2	6	1152071	1152076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287907
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21586	NC_015470	TC	4	8	1152304	1152311	0 %	50 %	0 %	50 %	332287908
21587	NC_015470	GTAT	2	8	1152336	1152343	25 %	50 %	25 %	0 %	332287908
21588	NC_015470	GAG	2	6	1152354	1152359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287908
21589	NC_015470	ACA	2	6	1152377	1152382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287908
21590	NC_015470	ACC	2	6	1152384	1152389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287908
21591	NC_015470	AAAATC	2	12	1152470	1152481	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	332287908
21592	NC_015470	AGG	2	6	1152496	1152501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287908
21593	NC_015470	CAG	2	6	1152522	1152527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287908
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21595	NC_015470	ATTA	2	8	1152593	1152600	50 %	50 %	0 %	0 %	332287908
21596	NC_015470	TAC	2	6	1152632	1152637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287908
21597	NC_015470	CTA	2	6	1152725	1152730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287908
21598	NC_015470	A	6	6	1152730	1152735	100 %	0 %	0 %	0 %	332287908
21599	NC_015470	GAA	2	6	1152782	1152787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287908
21600	NC_015470	CT	3	6	1152803	1152808	0 %	50 %	0 %	50 %	332287908
21601	NC_015470	GAA	3	9	1152809	1152817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287908
21602	NC_015470	TCA	2	6	1152865	1152870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287908
21603	NC_015470	AACGGA	2	12	1152890	1152901	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	332287908
21604	NC_015470	CTAT	2	8	1152909	1152916	25 %	50 %	0 %	25 %	332287908
21605	NC_015470	CGTT	2	8	1152945	1152952	0 %	50 %	25 %	25 %	332287908
21606	NC_015470	TTC	2	6	1153005	1153010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287908
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21608	NC_015470	A	6	6	1153181	1153186	100 %	0 %	0 %	0 %	332287908
21609	NC_015470	TAT	2	6	1153205	1153210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287908
21610	NC_015470	GAA	2	6	1153235	1153240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287908
21611	NC_015470	AGAT	2	8	1153305	1153312	50 %	25 %	25 %	0 %	332287908
21612	NC_015470	CAG	2	6	1153326	1153331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287908
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21615	NC_015470	T	7	7	1153447	1153453	0 %	100 %	0 %	0 %	332287909
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21728	NC_015470	CTT	2	6	1159195	1159200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287916
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