MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 21987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015470	TC	3	6	50380	50385	0 %	50 %	0 %	50 %	332287000
1002	NC_015470	TGT	2	6	50527	50532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287000
1003	NC_015470	TA	3	6	50553	50558	50 %	50 %	0 %	0 %	332287000
1004	NC_015470	ATT	2	6	50585	50590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287000
1005	NC_015470	ATG	2	6	50607	50612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287000
1006	NC_015470	AGC	2	6	50695	50700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287000
1007	NC_015470	TCC	2	6	50864	50869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287000
1008	NC_015470	AACA	2	8	50878	50885	75 %	0 %	0 %	25 %	332287000
1009	NC_015470	ACT	2	6	50896	50901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287000
1010	NC_015470	GAT	2	6	50939	50944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287000
1011	NC_015470	GCA	2	6	50957	50962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287000
1012	NC_015470	ATC	2	6	50971	50976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287000
1013	NC_015470	TCA	2	6	51108	51113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287000
1014	NC_015470	AAT	2	6	51146	51151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287000
1015	NC_015470	AGT	2	6	51190	51195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287000
1016	NC_015470	TGA	2	6	51310	51315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287000
1017	NC_015470	CCT	2	6	51389	51394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287000
1018	NC_015470	ATG	2	6	51458	51463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287000
1019	NC_015470	TTTGG	2	10	51479	51488	0 %	60 %	40 %	0 %	332287000
1020	NC_015470	CTC	2	6	51545	51550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287000
1021	NC_015470	CAA	2	6	51617	51622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287000
1022	NC_015470	CAT	2	6	51624	51629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287000
1023	NC_015470	TTG	2	6	51633	51638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287000
1024	NC_015470	AAC	2	6	51658	51663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287000
1025	NC_015470	ATT	2	6	51671	51676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287000
1026	NC_015470	TTG	3	9	51732	51740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287000
1027	NC_015470	GTT	2	6	51764	51769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287000
1028	NC_015470	GTT	2	6	51876	51881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287000
1029	NC_015470	CAG	2	6	51976	51981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287000
1030	NC_015470	ATG	2	6	52013	52018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287000
1031	NC_015470	TTA	2	6	52035	52040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287000
1032	NC_015470	CAA	2	6	52069	52074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287000
1033	NC_015470	TGA	2	6	52102	52107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287000
1034	NC_015470	C	6	6	52153	52158	0 %	0 %	0 %	100 %	332287000
1035	NC_015470	CTT	2	6	52921	52926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287001
1036	NC_015470	TTA	2	6	52938	52943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287001
1037	NC_015470	GTT	2	6	52951	52956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287001
1038	NC_015470	ACG	2	6	52976	52981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287001
1039	NC_015470	TGT	2	6	53014	53019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287001
1040	NC_015470	ATCC	2	8	53031	53038	25 %	25 %	0 %	50 %	332287001
1041	NC_015470	GT	3	6	53105	53110	0 %	50 %	50 %	0 %	332287001
1042	NC_015470	T	6	6	53139	53144	0 %	100 %	0 %	0 %	332287001
1043	NC_015470	CTT	2	6	53171	53176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287001
1044	NC_015470	T	6	6	53175	53180	0 %	100 %	0 %	0 %	332287001
1045	NC_015470	TTC	2	6	53240	53245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287001
1046	NC_015470	AT	3	6	53292	53297	50 %	50 %	0 %	0 %	332287001
1047	NC_015470	AGCA	2	8	53323	53330	50 %	0 %	25 %	25 %	332287001
1048	NC_015470	AAT	2	6	53348	53353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287001
1049	NC_015470	TTCA	2	8	53483	53490	25 %	50 %	0 %	25 %	332287001
1050	NC_015470	A	6	6	53661	53666	100 %	0 %	0 %	0 %	332287001
1051	NC_015470	TCA	2	6	53727	53732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287001
1052	NC_015470	T	6	6	53783	53788	0 %	100 %	0 %	0 %	332287001
1053	NC_015470	CGT	2	6	53846	53851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287001
1054	NC_015470	AGG	2	6	53873	53878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287001
1055	NC_015470	AAG	2	6	53903	53908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287001
1056	NC_015470	GAA	2	6	53920	53925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287001
1057	NC_015470	T	6	6	53941	53946	0 %	100 %	0 %	0 %	332287002
1058	NC_015470	CAG	2	6	53972	53977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287002
1059	NC_015470	AGG	2	6	54040	54045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287002
1060	NC_015470	CGC	2	6	54057	54062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	332287002
1061	NC_015470	ACC	2	6	54090	54095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287002
1062	NC_015470	GTAT	2	8	54136	54143	25 %	50 %	25 %	0 %	332287002
1063	NC_015470	TCA	2	6	54208	54213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287002
1064	NC_015470	CAG	2	6	54260	54265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287002
1065	NC_015470	TGT	2	6	54287	54292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287002
1066	NC_015470	GTA	2	6	54300	54305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287002
1067	NC_015470	CATA	2	8	54331	54338	50 %	25 %	0 %	25 %	332287002
1068	NC_015470	CTTATC	2	12	54351	54362	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	332287002
1069	NC_015470	TTG	2	6	54380	54385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287002
1070	NC_015470	CTT	2	6	54856	54861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287003
1071	NC_015470	TCG	2	6	54876	54881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287003
1072	NC_015470	T	7	7	54916	54922	0 %	100 %	0 %	0 %	332287003
1073	NC_015470	TCT	2	6	54942	54947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287003
1074	NC_015470	T	7	7	54962	54968	0 %	100 %	0 %	0 %	332287003
1075	NC_015470	CTT	2	6	55015	55020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287003
1076	NC_015470	ACG	2	6	55028	55033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287003
1077	NC_015470	TAA	2	6	55042	55047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287003
1078	NC_015470	CTG	2	6	55063	55068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287003
1079	NC_015470	AAATTT	2	12	55119	55130	50 %	50 %	0 %	0 %	332287003
1080	NC_015470	GCA	2	6	55131	55136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287003
1081	NC_015470	ATA	2	6	55137	55142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287003
1082	NC_015470	CTA	2	6	55273	55278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287003
1083	NC_015470	CTT	2	6	55315	55320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287003
1084	NC_015470	AGC	2	6	55337	55342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287003
1085	NC_015470	TTTTC	2	10	55348	55357	0 %	80 %	0 %	20 %	332287003
1086	NC_015470	TCA	2	6	55414	55419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287004
1087	NC_015470	AG	3	6	55435	55440	50 %	0 %	50 %	0 %	332287004
1088	NC_015470	GCT	2	6	55663	55668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287004
1089	NC_015470	GTT	2	6	55678	55683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287004
1090	NC_015470	CTT	2	6	55739	55744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287004
1091	NC_015470	GAG	2	6	55754	55759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	332287004
1092	NC_015470	TAA	2	6	55800	55805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287004
1093	NC_015470	TCA	2	6	55816	55821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287004
1094	NC_015470	TAGC	2	8	55862	55869	25 %	25 %	25 %	25 %	332287004
1095	NC_015470	CAG	2	6	55883	55888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287004
1096	NC_015470	TTG	2	6	55914	55919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287004
1097	NC_015470	TGA	2	6	55931	55936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287004
1098	NC_015470	CTGT	2	8	56041	56048	0 %	50 %	25 %	25 %	332287004
1099	NC_015470	AG	4	8	56049	56056	50 %	0 %	50 %	0 %	332287004
1100	NC_015470	TAG	2	6	56238	56243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287005
1101	NC_015470	GAA	2	6	56256	56261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287005
1102	NC_015470	TGA	2	6	56279	56284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287005
1103	NC_015470	GAA	2	6	56323	56328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287005
1104	NC_015470	CTT	2	6	56333	56338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287005
1105	NC_015470	GCT	2	6	56395	56400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287005
1106	NC_015470	CTTT	2	8	56431	56438	0 %	75 %	0 %	25 %	332287005
1107	NC_015470	AGAA	2	8	56451	56458	75 %	0 %	25 %	0 %	332287005
1108	NC_015470	GTT	2	6	56515	56520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287005
1109	NC_015470	GAAG	2	8	56620	56627	50 %	0 %	50 %	0 %	332287005
1110	NC_015470	GTA	2	6	56630	56635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287005
1111	NC_015470	CAA	2	6	56675	56680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287005
1112	NC_015470	ATT	2	6	56709	56714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287005
1113	NC_015470	CAG	2	6	56750	56755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287005
1114	NC_015470	TGC	2	6	56775	56780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287005
1115	NC_015470	CTT	2	6	56789	56794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287005
1116	NC_015470	T	6	6	56811	56816	0 %	100 %	0 %	0 %	332287005
1117	NC_015470	GTAA	2	8	56843	56850	50 %	25 %	25 %	0 %	332287005
1118	NC_015470	CTT	2	6	56858	56863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287005
1119	NC_015470	TTAG	2	8	56966	56973	25 %	50 %	25 %	0 %	332287005
1120	NC_015470	T	7	7	56990	56996	0 %	100 %	0 %	0 %	332287006
1121	NC_015470	TCT	2	6	57006	57011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287006
1122	NC_015470	TCA	2	6	57021	57026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287006
1123	NC_015470	CT	3	6	57054	57059	0 %	50 %	0 %	50 %	332287006
1124	NC_015470	GA	3	6	57082	57087	50 %	0 %	50 %	0 %	332287006
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1126	NC_015470	CTA	2	6	57223	57228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287006
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1498	NC_015470	AAAGA	2	10	78175	78184	80 %	0 %	20 %	0 %	332287023
1499	NC_015470	AAAG	2	8	78246	78253	75 %	0 %	25 %	0 %	332287023
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