MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 21987

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_015470	TA	3	6	324469	324474	50 %	50 %	0 %	0 %	332287232
6002	NC_015470	GTT	2	6	324552	324557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287232
6003	NC_015470	CTT	2	6	324562	324567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287232
6004	NC_015470	GAA	2	6	324809	324814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287233
6005	NC_015470	TGT	2	6	324852	324857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287233
6006	NC_015470	AGT	2	6	324870	324875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287233
6007	NC_015470	AG	3	6	324956	324961	50 %	0 %	50 %	0 %	332287233
6008	NC_015470	CTT	2	6	324980	324985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287233
6009	NC_015470	GA	3	6	325038	325043	50 %	0 %	50 %	0 %	332287233
6010	NC_015470	TC	3	6	325045	325050	0 %	50 %	0 %	50 %	332287233
6011	NC_015470	AG	3	6	325072	325077	50 %	0 %	50 %	0 %	332287233
6012	NC_015470	TGC	2	6	325089	325094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287233
6013	NC_015470	TGCA	2	8	325147	325154	25 %	25 %	25 %	25 %	332287233
6014	NC_015470	AGA	2	6	325198	325203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287233
6015	NC_015470	TGTT	2	8	325314	325321	0 %	75 %	25 %	0 %	332287233
6016	NC_015470	GTA	2	6	325398	325403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287233
6017	NC_015470	AG	3	6	325443	325448	50 %	0 %	50 %	0 %	332287233
6018	NC_015470	GTCTTT	2	12	325489	325500	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	332287233
6019	NC_015470	AAG	2	6	325625	325630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287233
6020	NC_015470	GT	3	6	325812	325817	0 %	50 %	50 %	0 %	332287233
6021	NC_015470	CCT	2	6	325820	325825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	332287233
6022	NC_015470	G	6	6	325874	325879	0 %	0 %	100 %	0 %	332287233
6023	NC_015470	TTG	2	6	325887	325892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287233
6024	NC_015470	CTA	2	6	325935	325940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287233
6025	NC_015470	GCA	2	6	325961	325966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287233
6026	NC_015470	TGTGA	2	10	326045	326054	20 %	40 %	40 %	0 %	332287233
6027	NC_015470	C	14	14	326070	326083	0 %	0 %	0 %	100 %	332287233
6028	NC_015470	TTAG	2	8	326108	326115	25 %	50 %	25 %	0 %	332287233
6029	NC_015470	ACA	2	6	326171	326176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	332287233
6030	NC_015470	CTG	2	6	326181	326186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287233
6031	NC_015470	TG	3	6	326189	326194	0 %	50 %	50 %	0 %	332287233
6032	NC_015470	AGAACC	2	12	326236	326247	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	332287233
6033	NC_015470	T	6	6	326295	326300	0 %	100 %	0 %	0 %	332287233
6034	NC_015470	TCA	2	6	326303	326308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287233
6035	NC_015470	AGA	2	6	326325	326330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287233
6036	NC_015470	AGT	2	6	326347	326352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287233
6037	NC_015470	TTTA	2	8	326365	326372	25 %	75 %	0 %	0 %	332287233
6038	NC_015470	AGA	2	6	326418	326423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287233
6039	NC_015470	CTT	2	6	326436	326441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287233
6040	NC_015470	CCA	2	6	326465	326470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287233
6041	NC_015470	CTA	2	6	326513	326518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287233
6042	NC_015470	TGA	2	6	326523	326528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287233
6043	NC_015470	CTG	2	6	326582	326587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287233
6044	NC_015470	ATC	2	6	326590	326595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287233
6045	NC_015470	CAAA	2	8	326596	326603	75 %	0 %	0 %	25 %	332287233
6046	NC_015470	TTA	2	6	326642	326647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	332287233
6047	NC_015470	CAG	2	6	326667	326672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287233
6048	NC_015470	T	6	6	326684	326689	0 %	100 %	0 %	0 %	332287233
6049	NC_015470	T	6	6	326707	326712	0 %	100 %	0 %	0 %	332287233
6050	NC_015470	GAA	2	6	326717	326722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287233
6051	NC_015470	TTCC	2	8	326748	326755	0 %	50 %	0 %	50 %	332287233
6052	NC_015470	AAT	2	6	326921	326926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	332287233
6053	NC_015470	GTA	2	6	326996	327001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287233
6054	NC_015470	GT	3	6	327018	327023	0 %	50 %	50 %	0 %	332287233
6055	NC_015470	AAAG	2	8	327038	327045	75 %	0 %	25 %	0 %	332287233
6056	NC_015470	AGCAA	2	10	327061	327070	60 %	0 %	20 %	20 %	332287233
6057	NC_015470	CTA	2	6	327071	327076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287233
6058	NC_015470	CA	3	6	327113	327118	50 %	0 %	0 %	50 %	332287233
6059	NC_015470	AC	3	6	327125	327130	50 %	0 %	0 %	50 %	332287233
6060	NC_015470	AGT	2	6	327154	327159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287233
6061	NC_015470	CAG	2	6	327210	327215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287233
6062	NC_015470	TCT	2	6	327227	327232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	332287233
6063	NC_015470	GAA	2	6	327483	327488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	332287234
6064	NC_015470	ACTG	2	8	327508	327515	25 %	25 %	25 %	25 %	332287234
6065	NC_015470	TTG	2	6	327585	327590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287234
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6067	NC_015470	GCA	2	6	327678	327683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	332287234
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6071	NC_015470	TGC	2	6	327763	327768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287234
6072	NC_015470	TGCA	2	8	327821	327828	25 %	25 %	25 %	25 %	332287234
6073	NC_015470	AACTC	2	10	327906	327915	40 %	20 %	0 %	40 %	332287234
6074	NC_015470	AT	3	6	327972	327977	50 %	50 %	0 %	0 %	332287234
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6096	NC_015470	TGA	2	6	329218	329223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287234
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6104	NC_015470	TGCT	2	8	329473	329480	0 %	50 %	25 %	25 %	332287234
6105	NC_015470	ACC	2	6	329495	329500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	332287234
6106	NC_015470	AAGAC	2	10	329526	329535	60 %	0 %	20 %	20 %	332287234
6107	NC_015470	AGT	2	6	329693	329698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	332287234
6108	NC_015470	CAAAG	2	10	329707	329716	60 %	0 %	20 %	20 %	332287234
6109	NC_015470	AAGA	2	8	329733	329740	75 %	0 %	25 %	0 %	332287234
6110	NC_015470	AT	3	6	329812	329817	50 %	50 %	0 %	0 %	332287234
6111	NC_015470	TGT	2	6	329834	329839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	332287234
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6113	NC_015470	T	6	6	329923	329928	0 %	100 %	0 %	0 %	332287234
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6118	NC_015470	GCT	2	6	330449	330454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	332287235
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6123	NC_015470	TCA	2	6	330765	330770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287235
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6242	NC_015470	ATC	2	6	336750	336755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287237
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6370	NC_015470	TCA	2	6	344245	344250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	332287244
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6373	NC_015470	AC	3	6	344543	344548	50 %	0 %	0 %	50 %	332287245
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6487	NC_015470	TTTTC	2	10	351171	351180	0 %	80 %	0 %	20 %	332287250
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