MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925

Total Repeats: 220

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015426	AT	3	6	257	262	50 %	50 %	0 %	0 %	331270762
2	NC_015426	AT	3	6	848	853	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
3	NC_015426	AT	4	8	994	1001	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
4	NC_015426	TA	3	6	1349	1354	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
5	NC_015426	TG	3	6	1532	1537	0 %	50 %	50 %	0 %	331270764
6	NC_015426	AT	4	8	1625	1632	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
7	NC_015426	AT	4	8	1720	1727	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
8	NC_015426	TA	4	8	2051	2058	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
9	NC_015426	TA	3	6	2080	2085	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
10	NC_015426	AT	3	6	2112	2117	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
11	NC_015426	AT	3	6	2120	2125	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
12	NC_015426	AT	4	8	2299	2306	50 %	50 %	0 %	0 %	331270764
13	NC_015426	TG	3	6	2321	2326	0 %	50 %	50 %	0 %	331270765
14	NC_015426	AT	3	6	2364	2369	50 %	50 %	0 %	0 %	331270765
15	NC_015426	TA	3	6	2488	2493	50 %	50 %	0 %	0 %	331270765
16	NC_015426	AT	3	6	2868	2873	50 %	50 %	0 %	0 %	331270765
17	NC_015426	AT	3	6	3198	3203	50 %	50 %	0 %	0 %	331270766
18	NC_015426	AT	4	8	4296	4303	50 %	50 %	0 %	0 %	331270767
19	NC_015426	AT	3	6	4341	4346	50 %	50 %	0 %	0 %	331270767
20	NC_015426	TC	3	6	6215	6220	0 %	50 %	0 %	50 %	331270769
21	NC_015426	AT	3	6	6730	6735	50 %	50 %	0 %	0 %	331270769
22	NC_015426	TA	3	6	9385	9390	50 %	50 %	0 %	0 %	331270772
23	NC_015426	TA	4	8	9406	9413	50 %	50 %	0 %	0 %	331270772
24	NC_015426	TA	3	6	9581	9586	50 %	50 %	0 %	0 %	331270772
25	NC_015426	AT	4	8	11161	11168	50 %	50 %	0 %	0 %	331270774
26	NC_015426	AG	3	6	11521	11526	50 %	0 %	50 %	0 %	331270774
27	NC_015426	TA	3	6	11657	11662	50 %	50 %	0 %	0 %	331270774
28	NC_015426	GA	3	6	12056	12061	50 %	0 %	50 %	0 %	331270774
29	NC_015426	AG	3	6	12467	12472	50 %	0 %	50 %	0 %	331270774
30	NC_015426	AT	3	6	12794	12799	50 %	50 %	0 %	0 %	331270775
31	NC_015426	GT	3	6	12870	12875	0 %	50 %	50 %	0 %	331270776
32	NC_015426	AT	3	6	12945	12950	50 %	50 %	0 %	0 %	331270776
33	NC_015426	AT	3	6	13136	13141	50 %	50 %	0 %	0 %	331270777
34	NC_015426	TA	3	6	14189	14194	50 %	50 %	0 %	0 %	331270777
35	NC_015426	TA	3	6	15273	15278	50 %	50 %	0 %	0 %	331270780
36	NC_015426	AT	5	10	15482	15491	50 %	50 %	0 %	0 %	331270780
37	NC_015426	TA	3	6	16212	16217	50 %	50 %	0 %	0 %	331270781
38	NC_015426	AT	3	6	16471	16476	50 %	50 %	0 %	0 %	331270782
39	NC_015426	TA	3	6	16554	16559	50 %	50 %	0 %	0 %	331270782
40	NC_015426	TA	4	8	16937	16944	50 %	50 %	0 %	0 %	331270782
41	NC_015426	AT	3	6	17008	17013	50 %	50 %	0 %	0 %	331270782
42	NC_015426	TA	3	6	17245	17250	50 %	50 %	0 %	0 %	331270782
43	NC_015426	AT	3	6	17572	17577	50 %	50 %	0 %	0 %	331270782
44	NC_015426	AT	3	6	18345	18350	50 %	50 %	0 %	0 %	331270783
45	NC_015426	TA	3	6	18434	18439	50 %	50 %	0 %	0 %	331270783
46	NC_015426	AC	4	8	19297	19304	50 %	0 %	0 %	50 %	331270784
47	NC_015426	TA	3	6	19599	19604	50 %	50 %	0 %	0 %	331270784
48	NC_015426	AC	3	6	20548	20553	50 %	0 %	0 %	50 %	331270784
49	NC_015426	TA	3	6	21084	21089	50 %	50 %	0 %	0 %	331270785
50	NC_015426	TA	4	8	22497	22504	50 %	50 %	0 %	0 %	331270786
51	NC_015426	AT	3	6	23183	23188	50 %	50 %	0 %	0 %	331270786
52	NC_015426	AT	3	6	23497	23502	50 %	50 %	0 %	0 %	331270787
53	NC_015426	AT	3	6	23865	23870	50 %	50 %	0 %	0 %	331270788
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58	NC_015426	TA	3	6	25904	25909	50 %	50 %	0 %	0 %	331270790
59	NC_015426	TA	3	6	25944	25949	50 %	50 %	0 %	0 %	331270790
60	NC_015426	TA	5	10	26057	26066	50 %	50 %	0 %	0 %	331270790
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62	NC_015426	TA	3	6	27634	27639	50 %	50 %	0 %	0 %	331270791
63	NC_015426	AT	3	6	27700	27705	50 %	50 %	0 %	0 %	331270791
64	NC_015426	AT	4	8	29124	29131	50 %	50 %	0 %	0 %	331270792
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66	NC_015426	AT	3	6	30270	30275	50 %	50 %	0 %	0 %	331270794
67	NC_015426	TA	3	6	30503	30508	50 %	50 %	0 %	0 %	331270794
68	NC_015426	TA	3	6	31834	31839	50 %	50 %	0 %	0 %	331270795
69	NC_015426	TA	3	6	32110	32115	50 %	50 %	0 %	0 %	331270795
70	NC_015426	AT	4	8	32656	32663	50 %	50 %	0 %	0 %	331270795
71	NC_015426	AT	3	6	33310	33315	50 %	50 %	0 %	0 %	331270796
72	NC_015426	TA	3	6	33514	33519	50 %	50 %	0 %	0 %	331270796
73	NC_015426	AT	3	6	33931	33936	50 %	50 %	0 %	0 %	331270797
74	NC_015426	TA	3	6	34072	34077	50 %	50 %	0 %	0 %	331270797
75	NC_015426	TA	3	6	35115	35120	50 %	50 %	0 %	0 %	331270799
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77	NC_015426	AT	3	6	35725	35730	50 %	50 %	0 %	0 %	331270800
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81	NC_015426	TA	3	6	37361	37366	50 %	50 %	0 %	0 %	331270801
82	NC_015426	AT	3	6	38798	38803	50 %	50 %	0 %	0 %	331270803
83	NC_015426	TA	3	6	39433	39438	50 %	50 %	0 %	0 %	331270803
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87	NC_015426	TA	3	6	41653	41658	50 %	50 %	0 %	0 %	331270805
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91	NC_015426	AT	3	6	43581	43586	50 %	50 %	0 %	0 %	331270807
92	NC_015426	AT	3	6	43731	43736	50 %	50 %	0 %	0 %	331270807
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103	NC_015426	AT	3	6	47702	47707	50 %	50 %	0 %	0 %	331270814
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110	NC_015426	TA	3	6	49566	49571	50 %	50 %	0 %	0 %	331270815
111	NC_015426	AT	4	8	49871	49878	50 %	50 %	0 %	0 %	331270816
112	NC_015426	TA	3	6	50299	50304	50 %	50 %	0 %	0 %	331270816
113	NC_015426	AT	3	6	51145	51150	50 %	50 %	0 %	0 %	331270817
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125	NC_015426	TA	3	6	57599	57604	50 %	50 %	0 %	0 %	331270824
126	NC_015426	AT	3	6	58635	58640	50 %	50 %	0 %	0 %	331270825
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.