MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p2BKT015925

Total Repeats: 251

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015426	CAAA	2	8	312	319	75 %	0 %	0 %	25 %	331270762
2	NC_015426	TAAT	2	8	416	423	50 %	50 %	0 %	0 %	331270763
3	NC_015426	GAAA	2	8	754	761	75 %	0 %	25 %	0 %	331270764
4	NC_015426	AAAT	2	8	816	823	75 %	25 %	0 %	0 %	331270764
5	NC_015426	GCAA	2	8	1559	1566	50 %	0 %	25 %	25 %	331270764
6	NC_015426	TTTA	2	8	2010	2017	25 %	75 %	0 %	0 %	331270764
7	NC_015426	CCTT	2	8	2632	2639	0 %	50 %	0 %	50 %	331270765
8	NC_015426	ATGA	2	8	5108	5115	50 %	25 %	25 %	0 %	331270767
9	NC_015426	AACT	2	8	5178	5185	50 %	25 %	0 %	25 %	331270767
10	NC_015426	TAAA	2	8	5757	5764	75 %	25 %	0 %	0 %	331270769
11	NC_015426	GAAA	2	8	6115	6122	75 %	0 %	25 %	0 %	331270769
12	NC_015426	ATTT	2	8	6130	6137	25 %	75 %	0 %	0 %	331270769
13	NC_015426	AGAA	2	8	6594	6601	75 %	0 %	25 %	0 %	331270769
14	NC_015426	TAGT	2	8	8492	8499	25 %	50 %	25 %	0 %	331270771
15	NC_015426	TTGT	2	8	8712	8719	0 %	75 %	25 %	0 %	331270771
16	NC_015426	TAAT	2	8	9252	9259	50 %	50 %	0 %	0 %	331270772
17	NC_015426	TTTA	2	8	9277	9284	25 %	75 %	0 %	0 %	331270772
18	NC_015426	TATT	2	8	9564	9571	25 %	75 %	0 %	0 %	331270772
19	NC_015426	TTAT	2	8	9572	9579	25 %	75 %	0 %	0 %	331270772
20	NC_015426	TATC	2	8	10287	10294	25 %	50 %	0 %	25 %	331270773
21	NC_015426	TACT	2	8	10491	10498	25 %	50 %	0 %	25 %	331270773
22	NC_015426	AAAT	2	8	11978	11985	75 %	25 %	0 %	0 %	331270774
23	NC_015426	TAAT	2	8	12092	12099	50 %	50 %	0 %	0 %	331270774
24	NC_015426	GAAA	2	8	12116	12123	75 %	0 %	25 %	0 %	331270774
25	NC_015426	TTAT	2	8	12485	12492	25 %	75 %	0 %	0 %	331270774
26	NC_015426	TTTA	2	8	12877	12884	25 %	75 %	0 %	0 %	331270776
27	NC_015426	TATG	2	8	12901	12908	25 %	50 %	25 %	0 %	331270776
28	NC_015426	AAAG	2	8	13107	13114	75 %	0 %	25 %	0 %	331270777
29	NC_015426	TGAT	2	8	14179	14186	25 %	50 %	25 %	0 %	331270777
30	NC_015426	TAAT	2	8	15388	15395	50 %	50 %	0 %	0 %	331270780
31	NC_015426	AATG	2	8	15531	15538	50 %	25 %	25 %	0 %	331270780
32	NC_015426	AGAA	2	8	16881	16888	75 %	0 %	25 %	0 %	331270782
33	NC_015426	AAAG	2	8	17373	17380	75 %	0 %	25 %	0 %	331270782
34	NC_015426	TACA	2	8	17437	17444	50 %	25 %	0 %	25 %	331270782
35	NC_015426	ATCT	2	8	18513	18520	25 %	50 %	0 %	25 %	331270783
36	NC_015426	AGTT	2	8	18546	18553	25 %	50 %	25 %	0 %	331270783
37	NC_015426	AATC	2	8	20217	20224	50 %	25 %	0 %	25 %	331270784
38	NC_015426	GAAG	2	8	20331	20338	50 %	0 %	50 %	0 %	331270784
39	NC_015426	CGTA	2	8	20977	20984	25 %	25 %	25 %	25 %	331270785
40	NC_015426	AATT	2	8	21042	21049	50 %	50 %	0 %	0 %	331270785
41	NC_015426	TACA	2	8	21252	21259	50 %	25 %	0 %	25 %	331270785
42	NC_015426	CAAT	2	8	21833	21840	50 %	25 %	0 %	25 %	331270785
43	NC_015426	ATGT	2	8	22431	22438	25 %	50 %	25 %	0 %	331270786
44	NC_015426	ATTT	2	8	22806	22813	25 %	75 %	0 %	0 %	331270786
45	NC_015426	AAGA	2	8	23077	23084	75 %	0 %	25 %	0 %	331270786
46	NC_015426	TCCC	2	8	24052	24059	0 %	25 %	0 %	75 %	331270788
47	NC_015426	TAAA	2	8	24583	24590	75 %	25 %	0 %	0 %	331270789
48	NC_015426	TAAA	2	8	25448	25455	75 %	25 %	0 %	0 %	331270789
49	NC_015426	TAGT	2	8	25511	25518	25 %	50 %	25 %	0 %	331270790
50	NC_015426	TATT	2	8	25553	25560	25 %	75 %	0 %	0 %	331270790
51	NC_015426	TCAA	2	8	25726	25733	50 %	25 %	0 %	25 %	331270790
52	NC_015426	TTGA	2	8	26339	26346	25 %	50 %	25 %	0 %	331270790
53	NC_015426	CCAT	2	8	26441	26448	25 %	25 %	0 %	50 %	331270790
54	NC_015426	TAAT	2	8	26491	26498	50 %	50 %	0 %	0 %	331270790
55	NC_015426	AATT	2	8	26510	26517	50 %	50 %	0 %	0 %	331270790
56	NC_015426	TGGA	2	8	27078	27085	25 %	25 %	50 %	0 %	331270791
57	NC_015426	ATTA	2	8	27606	27613	50 %	50 %	0 %	0 %	331270791
58	NC_015426	TTTA	2	8	27674	27681	25 %	75 %	0 %	0 %	331270791
59	NC_015426	TACA	2	8	27867	27874	50 %	25 %	0 %	25 %	331270792
60	NC_015426	ATTC	2	8	27941	27948	25 %	50 %	0 %	25 %	331270792
61	NC_015426	TTTG	2	8	28304	28311	0 %	75 %	25 %	0 %	331270792
62	NC_015426	GAAA	2	8	29205	29212	75 %	0 %	25 %	0 %	331270793
63	NC_015426	TGGT	2	8	29772	29779	0 %	50 %	50 %	0 %	331270794
64	NC_015426	TTCA	2	8	30147	30154	25 %	50 %	0 %	25 %	331270794
65	NC_015426	CAAA	2	8	30754	30761	75 %	0 %	0 %	25 %	331270794
66	NC_015426	AATG	2	8	31700	31707	50 %	25 %	25 %	0 %	331270795
67	NC_015426	TAAA	2	8	32053	32060	75 %	25 %	0 %	0 %	331270795
68	NC_015426	ATCA	2	8	32095	32102	50 %	25 %	0 %	25 %	331270795
69	NC_015426	GAAA	2	8	32616	32623	75 %	0 %	25 %	0 %	331270795
70	NC_015426	TTAT	2	8	33199	33206	25 %	75 %	0 %	0 %	331270796
71	NC_015426	ATTC	2	8	34090	34097	25 %	50 %	0 %	25 %	331270797
72	NC_015426	AGAT	2	8	34248	34255	50 %	25 %	25 %	0 %	331270798
73	NC_015426	CATC	2	8	35212	35219	25 %	25 %	0 %	50 %	331270799
74	NC_015426	TCTA	2	8	35251	35258	25 %	50 %	0 %	25 %	331270799
75	NC_015426	AATA	2	8	35311	35318	75 %	25 %	0 %	0 %	331270799
76	NC_015426	TTTA	2	8	35625	35632	25 %	75 %	0 %	0 %	331270800
77	NC_015426	TAAA	2	8	36179	36186	75 %	25 %	0 %	0 %	331270801
78	NC_015426	GAAA	2	8	36537	36544	75 %	0 %	25 %	0 %	331270801
79	NC_015426	AGAA	2	8	37016	37023	75 %	0 %	25 %	0 %	331270801
80	NC_015426	AGTA	2	8	37850	37857	50 %	25 %	25 %	0 %	331270802
81	NC_015426	ATAA	2	8	37895	37902	75 %	25 %	0 %	0 %	331270802
82	NC_015426	TAGA	2	8	38034	38041	50 %	25 %	25 %	0 %	331270802
83	NC_015426	ATCA	2	8	38459	38466	50 %	25 %	0 %	25 %	331270803
84	NC_015426	ATTT	2	8	39137	39144	25 %	75 %	0 %	0 %	331270803
85	NC_015426	TTTA	2	8	39179	39186	25 %	75 %	0 %	0 %	331270803
86	NC_015426	TAAA	2	8	39449	39456	75 %	25 %	0 %	0 %	331270803
87	NC_015426	ATTA	2	8	39497	39504	50 %	50 %	0 %	0 %	331270803
88	NC_015426	ATCT	2	8	40689	40696	25 %	50 %	0 %	25 %	331270804
89	NC_015426	AAAC	2	8	40762	40769	75 %	0 %	0 %	25 %	331270804
90	NC_015426	TCAT	2	8	40936	40943	25 %	50 %	0 %	25 %	331270804
91	NC_015426	GATA	2	8	41223	41230	50 %	25 %	25 %	0 %	331270804
92	NC_015426	TACT	2	8	41585	41592	25 %	50 %	0 %	25 %	331270805
93	NC_015426	AACT	2	8	42441	42448	50 %	25 %	0 %	25 %	331270806
94	NC_015426	TCTT	2	8	42487	42494	0 %	75 %	0 %	25 %	331270806
95	NC_015426	TATT	2	8	42708	42715	25 %	75 %	0 %	0 %	331270806
96	NC_015426	TACA	2	8	42780	42787	50 %	25 %	0 %	25 %	331270806
97	NC_015426	CATC	2	8	43432	43439	25 %	25 %	0 %	50 %	331270807
98	NC_015426	TGAT	2	8	43482	43489	25 %	50 %	25 %	0 %	331270807
99	NC_015426	TTTA	2	8	43620	43627	25 %	75 %	0 %	0 %	331270807
100	NC_015426	CAAG	2	8	43888	43895	50 %	0 %	25 %	25 %	331270807
101	NC_015426	ATAA	2	8	44666	44673	75 %	25 %	0 %	0 %	331270808
102	NC_015426	ATTA	2	8	44873	44880	50 %	50 %	0 %	0 %	331270808
103	NC_015426	TCTT	2	8	45211	45218	0 %	75 %	0 %	25 %	331270809
104	NC_015426	TTTC	2	8	45645	45652	0 %	75 %	0 %	25 %	331270809
105	NC_015426	TTCA	2	8	46725	46732	25 %	50 %	0 %	25 %	331270811
106	NC_015426	ATTG	2	8	46766	46773	25 %	50 %	25 %	0 %	331270812
107	NC_015426	TACT	2	8	47226	47233	25 %	50 %	0 %	25 %	331270813
108	NC_015426	TTTA	2	8	47392	47399	25 %	75 %	0 %	0 %	331270813
109	NC_015426	TTTC	2	8	47708	47715	0 %	75 %	0 %	25 %	331270814
110	NC_015426	TATT	2	8	48512	48519	25 %	75 %	0 %	0 %	331270815
111	NC_015426	CATA	2	8	48782	48789	50 %	25 %	0 %	25 %	331270815
112	NC_015426	TAGA	2	8	49070	49077	50 %	25 %	25 %	0 %	331270815
113	NC_015426	TTTC	2	8	49534	49541	0 %	75 %	0 %	25 %	331270815
114	NC_015426	CATT	2	8	50923	50930	25 %	50 %	0 %	25 %	331270817
115	NC_015426	TAAA	2	8	52124	52131	75 %	25 %	0 %	0 %	331270818
116	NC_015426	ATGT	2	8	52409	52416	25 %	50 %	25 %	0 %	331270818
117	NC_015426	TACT	2	8	52508	52515	25 %	50 %	0 %	25 %	331270818
118	NC_015426	TTAT	2	8	53390	53397	25 %	75 %	0 %	0 %	331270819
119	NC_015426	TACT	2	8	53435	53442	25 %	50 %	0 %	25 %	331270819
120	NC_015426	TTTC	2	8	53987	53994	0 %	75 %	0 %	25 %	331270820
121	NC_015426	AAAT	2	8	54452	54459	75 %	25 %	0 %	0 %	331270820
122	NC_015426	TTTC	2	8	54467	54474	0 %	75 %	0 %	25 %	331270820
123	NC_015426	TTTA	2	8	54825	54832	25 %	75 %	0 %	0 %	331270820
124	NC_015426	TAAG	2	8	55090	55097	50 %	25 %	25 %	0 %	331270821
125	NC_015426	TAAA	2	8	55182	55189	75 %	25 %	0 %	0 %	331270821
126	NC_015426	ACAT	2	8	55477	55484	50 %	25 %	0 %	25 %	331270821
127	NC_015426	TCAT	2	8	55508	55515	25 %	50 %	0 %	25 %	331270821
128	NC_015426	GCTA	2	8	56171	56178	25 %	25 %	25 %	25 %	331270822
129	NC_015426	TTTC	2	8	57309	57316	0 %	75 %	0 %	25 %	331270823
130	NC_015426	AATT	2	8	57407	57414	50 %	50 %	0 %	0 %	331270823
131	NC_015426	ATTA	2	8	57479	57486	50 %	50 %	0 %	0 %	331270823
132	NC_015426	TATT	2	8	58076	58083	25 %	75 %	0 %	0 %	331270824
133	NC_015426	TTGA	2	8	58844	58851	25 %	50 %	25 %	0 %	331270826
134	NC_015426	TCAA	2	8	58983	58990	50 %	25 %	0 %	25 %	331270827
135	NC_015426	ATGT	2	8	59999	60006	25 %	50 %	25 %	0 %	331270829
136	NC_015426	AGAA	2	8	60799	60806	75 %	0 %	25 %	0 %	331270831
137	NC_015426	ATTT	2	8	61614	61621	25 %	75 %	0 %	0 %	331270832
138	NC_015426	TTTG	2	8	62155	62162	0 %	75 %	25 %	0 %	331270833
139	NC_015426	ATTT	2	8	62352	62359	25 %	75 %	0 %	0 %	331270833
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.