MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p5BKT015925

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015419	ACA	2	6	241	246	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268175
2	NC_015419	TAA	2	6	296	301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268175
3	NC_015419	ACA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268175
4	NC_015419	TAA	2	6	348	353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268175
5	NC_015419	CAA	2	6	403	408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268175
6	NC_015419	TTG	2	6	1287	1292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268176
7	NC_015419	TTG	2	6	1296	1301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268176
8	NC_015419	TTA	2	6	1385	1390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
9	NC_015419	ATT	2	6	1476	1481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
10	NC_015419	ATT	2	6	1537	1542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
11	NC_015419	AAT	2	6	1617	1622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268176
12	NC_015419	TCA	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268176
13	NC_015419	TTG	2	6	1671	1676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268176
14	NC_015419	AAT	2	6	1930	1935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268176
15	NC_015419	ACT	2	6	1986	1991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268176
16	NC_015419	TAT	2	6	2180	2185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
17	NC_015419	TTA	2	6	2254	2259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
18	NC_015419	CTA	2	6	2263	2268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268176
19	NC_015419	ATT	2	6	2283	2288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
20	NC_015419	TAT	2	6	2294	2299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
21	NC_015419	CTT	2	6	2327	2332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268176
22	NC_015419	ACC	2	6	2409	2414	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268176
23	NC_015419	TTC	2	6	2466	2471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268176
24	NC_015419	ATT	2	6	2484	2489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268176
25	NC_015419	CAA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268176
26	NC_015419	ATG	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268177
27	NC_015419	CTT	2	6	2900	2905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268177
28	NC_015419	AGT	2	6	2985	2990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268177
29	NC_015419	CCA	2	6	2995	3000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268177
30	NC_015419	CCT	2	6	3151	3156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	331268177
31	NC_015419	TTC	2	6	3212	3217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268177
32	NC_015419	AAC	2	6	3231	3236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268177
33	NC_015419	TTA	2	6	3257	3262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268177
34	NC_015419	TAT	2	6	3589	3594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268178
35	NC_015419	TCA	2	6	3595	3600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268178
36	NC_015419	ATC	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268178
37	NC_015419	CAA	2	6	3739	3744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268178
38	NC_015419	CCA	2	6	3750	3755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268178
39	NC_015419	AGT	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268178
40	NC_015419	CTT	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268178
41	NC_015419	ATT	2	6	4089	4094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268178
42	NC_015419	ATT	2	6	4257	4262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
43	NC_015419	ATT	2	6	4276	4281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
44	NC_015419	ATA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268179
45	NC_015419	ATT	2	6	4409	4414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
46	NC_015419	TAA	2	6	4440	4445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268179
47	NC_015419	AAT	2	6	4481	4486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268179
48	NC_015419	TCT	2	6	4487	4492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268179
49	NC_015419	ATT	2	6	4699	4704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268179
50	NC_015419	CTT	2	6	6724	6729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268180
51	NC_015419	CTT	2	6	6798	6803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268180
52	NC_015419	ATC	2	6	6830	6835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268180
53	NC_015419	ATA	2	6	6979	6984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268180
54	NC_015419	ATC	2	6	7046	7051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268180
55	NC_015419	TAT	2	6	7306	7311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268181
56	NC_015419	ATT	2	6	7327	7332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268181
57	NC_015419	CTT	2	6	7365	7370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268181
58	NC_015419	CAA	2	6	7440	7445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268181
59	NC_015419	TAT	3	9	7500	7508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268181
60	NC_015419	ATC	2	6	7528	7533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268181
61	NC_015419	ATT	2	6	7582	7587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268181
62	NC_015419	TTC	2	6	7625	7630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268181
63	NC_015419	TTA	2	6	8029	8034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268182
64	NC_015419	TAA	2	6	8048	8053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268182
65	NC_015419	TAA	2	6	8065	8070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268182
66	NC_015419	TCT	2	6	8085	8090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268182
67	NC_015419	GTT	2	6	8094	8099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268182
68	NC_015419	CAT	2	6	8198	8203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268182
69	NC_015419	CTT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268182
70	NC_015419	CAA	2	6	8371	8376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268182
71	NC_015419	TAT	2	6	8506	8511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268182
72	NC_015419	TCA	2	6	8846	8851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268183
73	NC_015419	TAA	2	6	8859	8864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268183
74	NC_015419	TAG	2	6	8943	8948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268183
75	NC_015419	ACC	2	6	9088	9093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268183
76	NC_015419	CAA	2	6	9116	9121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331268183
77	NC_015419	AGT	2	6	9145	9150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268183
78	NC_015419	TTA	2	6	9182	9187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268183
79	NC_015419	TAG	2	6	9402	9407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268183
80	NC_015419	TCT	2	6	9422	9427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268183
81	NC_015419	TAT	2	6	9504	9509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268183
82	NC_015419	TCG	2	6	9519	9524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331268183
83	NC_015419	TCT	2	6	9593	9598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268183
84	NC_015419	AAT	2	6	9619	9624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268183
85	NC_015419	TAA	2	6	9732	9737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268184
86	NC_015419	TAT	2	6	9747	9752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268184
87	NC_015419	CAG	2	6	9828	9833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331268184
88	NC_015419	TTG	2	6	9892	9897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268184
89	NC_015419	TCA	2	6	9920	9925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268184
90	NC_015419	ATC	2	6	9964	9969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268184
91	NC_015419	TTA	2	6	9974	9979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268184
92	NC_015419	TAA	2	6	9990	9995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268184
93	NC_015419	TTA	2	6	10049	10054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268184
94	NC_015419	CAC	2	6	10170	10175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331268184
95	NC_015419	TAT	2	6	10335	10340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268184
96	NC_015419	TGA	2	6	10468	10473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331268184
97	NC_015419	TAT	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268185
98	NC_015419	CTA	2	6	11351	11356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268185
99	NC_015419	TGT	2	6	11377	11382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268185
100	NC_015419	TTA	2	6	11419	11424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268185
101	NC_015419	TAT	2	6	11549	11554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268185
102	NC_015419	TCT	2	6	11599	11604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268185
103	NC_015419	TAT	2	6	11624	11629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268185
104	NC_015419	TAT	2	6	11711	11716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268185
105	NC_015419	CTT	2	6	11837	11842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268185
106	NC_015419	TGT	2	6	11892	11897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268185
107	NC_015419	ATT	2	6	11945	11950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268186
108	NC_015419	ATA	2	6	12024	12029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331268186
109	NC_015419	TAC	2	6	12090	12095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331268187
110	NC_015419	TAT	2	6	12151	12156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331268187
111	NC_015419	TTG	2	6	12173	12178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331268187
112	NC_015419	TTC	2	6	12352	12357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331268187

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.