MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Clostridium botulinum BKT015925 plasmid p3BKT015925

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015418	AG	3	6	1533	1538	50 %	0 %	50 %	0 %	331271089
2	NC_015418	TA	4	8	1609	1616	50 %	50 %	0 %	0 %	331271089
3	NC_015418	TA	3	6	2038	2043	50 %	50 %	0 %	0 %	331271089
4	NC_015418	TA	3	6	2088	2093	50 %	50 %	0 %	0 %	331271089
5	NC_015418	TA	3	6	2452	2457	50 %	50 %	0 %	0 %	331271089
6	NC_015418	AT	3	6	2486	2491	50 %	50 %	0 %	0 %	331271089
7	NC_015418	AT	4	8	3205	3212	50 %	50 %	0 %	0 %	331271090
8	NC_015418	TA	3	6	3256	3261	50 %	50 %	0 %	0 %	331271090
9	NC_015418	AT	3	6	3588	3593	50 %	50 %	0 %	0 %	331271090
10	NC_015418	AT	3	6	3714	3719	50 %	50 %	0 %	0 %	331271090
11	NC_015418	TG	3	6	3992	3997	0 %	50 %	50 %	0 %	331271090
12	NC_015418	AT	4	8	4299	4306	50 %	50 %	0 %	0 %	331271091
13	NC_015418	TA	3	6	4350	4355	50 %	50 %	0 %	0 %	331271091
14	NC_015418	TA	3	6	4392	4397	50 %	50 %	0 %	0 %	331271091
15	NC_015418	AT	4	8	4682	4689	50 %	50 %	0 %	0 %	331271091
16	NC_015418	TG	3	6	5086	5091	0 %	50 %	50 %	0 %	331271091
17	NC_015418	TA	3	6	5119	5124	50 %	50 %	0 %	0 %	331271091
18	NC_015418	AT	3	6	5949	5954	50 %	50 %	0 %	0 %	331271092
19	NC_015418	AT	3	6	6101	6106	50 %	50 %	0 %	0 %	331271092
20	NC_015418	TA	4	8	6615	6622	50 %	50 %	0 %	0 %	331271093
21	NC_015418	TA	3	6	6645	6650	50 %	50 %	0 %	0 %	331271093
22	NC_015418	TG	3	6	7017	7022	0 %	50 %	50 %	0 %	331271094
23	NC_015418	GA	3	6	7153	7158	50 %	0 %	50 %	0 %	331271094
24	NC_015418	TA	3	6	7202	7207	50 %	50 %	0 %	0 %	331271094
25	NC_015418	AT	5	10	7461	7470	50 %	50 %	0 %	0 %	331271095
26	NC_015418	AT	3	6	7495	7500	50 %	50 %	0 %	0 %	331271095
27	NC_015418	TA	3	6	7677	7682	50 %	50 %	0 %	0 %	331271095
28	NC_015418	AT	3	6	8176	8181	50 %	50 %	0 %	0 %	331271096
29	NC_015418	TA	3	6	8563	8568	50 %	50 %	0 %	0 %	331271096
30	NC_015418	AT	3	6	9069	9074	50 %	50 %	0 %	0 %	331271096
31	NC_015418	AT	3	6	9907	9912	50 %	50 %	0 %	0 %	331271098
32	NC_015418	TA	3	6	9954	9959	50 %	50 %	0 %	0 %	331271098
33	NC_015418	AT	3	6	9983	9988	50 %	50 %	0 %	0 %	331271098
34	NC_015418	AT	4	8	10123	10130	50 %	50 %	0 %	0 %	331271098
35	NC_015418	TA	3	6	10266	10271	50 %	50 %	0 %	0 %	331271098
36	NC_015418	AT	3	6	10294	10299	50 %	50 %	0 %	0 %	331271098
37	NC_015418	AT	3	6	11153	11158	50 %	50 %	0 %	0 %	331271099
38	NC_015418	TA	4	8	11405	11412	50 %	50 %	0 %	0 %	331271099
39	NC_015418	TG	3	6	11878	11883	0 %	50 %	50 %	0 %	331271099
40	NC_015418	GA	3	6	12433	12438	50 %	0 %	50 %	0 %	331271100
41	NC_015418	TA	3	6	12481	12486	50 %	50 %	0 %	0 %	331271100
42	NC_015418	AT	3	6	12525	12530	50 %	50 %	0 %	0 %	331271100
43	NC_015418	TA	3	6	12716	12721	50 %	50 %	0 %	0 %	331271100
44	NC_015418	AT	3	6	13123	13128	50 %	50 %	0 %	0 %	331271100
45	NC_015418	AT	3	6	13883	13888	50 %	50 %	0 %	0 %	331271101
46	NC_015418	AT	4	8	14002	14009	50 %	50 %	0 %	0 %	331271101
47	NC_015418	TA	4	8	14155	14162	50 %	50 %	0 %	0 %	331271101
48	NC_015418	AT	3	6	14426	14431	50 %	50 %	0 %	0 %	331271102
49	NC_015418	AT	3	6	15173	15178	50 %	50 %	0 %	0 %	331271103
50	NC_015418	AT	3	6	16076	16081	50 %	50 %	0 %	0 %	331271105
51	NC_015418	TA	3	6	16125	16130	50 %	50 %	0 %	0 %	331271105
52	NC_015418	TA	3	6	16304	16309	50 %	50 %	0 %	0 %	331271105
53	NC_015418	TA	4	8	16634	16641	50 %	50 %	0 %	0 %	331271105
54	NC_015418	AT	3	6	16721	16726	50 %	50 %	0 %	0 %	331271105
55	NC_015418	TA	3	6	17217	17222	50 %	50 %	0 %	0 %	331271106
56	NC_015418	AG	3	6	17261	17266	50 %	0 %	50 %	0 %	331271106
57	NC_015418	AG	3	6	17282	17287	50 %	0 %	50 %	0 %	331271106
58	NC_015418	AG	3	6	17483	17488	50 %	0 %	50 %	0 %	331271106
59	NC_015418	TA	3	6	17661	17666	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
60	NC_015418	TA	3	6	17692	17697	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
61	NC_015418	AT	5	10	18073	18082	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
62	NC_015418	AT	3	6	18103	18108	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
63	NC_015418	TA	3	6	18143	18148	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
64	NC_015418	AT	3	6	18660	18665	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
65	NC_015418	TA	3	6	18973	18978	50 %	50 %	0 %	0 %	331271107
66	NC_015418	AT	3	6	19544	19549	50 %	50 %	0 %	0 %	331271108
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68	NC_015418	AT	4	8	20351	20358	50 %	50 %	0 %	0 %	331271110
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70	NC_015418	CT	3	6	20495	20500	0 %	50 %	0 %	50 %	331271110
71	NC_015418	AT	3	6	20597	20602	50 %	50 %	0 %	0 %	331271110
72	NC_015418	TA	3	6	21964	21969	50 %	50 %	0 %	0 %	331271112
73	NC_015418	TA	3	6	22172	22177	50 %	50 %	0 %	0 %	331271112
74	NC_015418	GA	3	6	22688	22693	50 %	0 %	50 %	0 %	331271112
75	NC_015418	AT	3	6	22908	22913	50 %	50 %	0 %	0 %	331271112
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78	NC_015418	AT	3	6	25743	25748	50 %	50 %	0 %	0 %	331271115
79	NC_015418	TA	3	6	26012	26017	50 %	50 %	0 %	0 %	331271115
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81	NC_015418	AT	3	6	26670	26675	50 %	50 %	0 %	0 %	331271116
82	NC_015418	TA	5	10	26808	26817	50 %	50 %	0 %	0 %	331271116
83	NC_015418	TA	4	8	27807	27814	50 %	50 %	0 %	0 %	331271118
84	NC_015418	TA	3	6	27868	27873	50 %	50 %	0 %	0 %	331271118
85	NC_015418	AT	3	6	27957	27962	50 %	50 %	0 %	0 %	331271118
86	NC_015418	AT	3	6	28925	28930	50 %	50 %	0 %	0 %	331271119
87	NC_015418	AT	3	6	29430	29435	50 %	50 %	0 %	0 %	331271119
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89	NC_015418	AT	3	6	30320	30325	50 %	50 %	0 %	0 %	331271120
90	NC_015418	AT	4	8	30842	30849	50 %	50 %	0 %	0 %	331271121
91	NC_015418	TA	5	10	31035	31044	50 %	50 %	0 %	0 %	331271121
92	NC_015418	TA	3	6	31933	31938	50 %	50 %	0 %	0 %	331271123
93	NC_015418	AT	3	6	32305	32310	50 %	50 %	0 %	0 %	331271123
94	NC_015418	TA	3	6	32559	32564	50 %	50 %	0 %	0 %	331271123
95	NC_015418	AT	3	6	33713	33718	50 %	50 %	0 %	0 %	331271124
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98	NC_015418	TA	3	6	34560	34565	50 %	50 %	0 %	0 %	331271124
99	NC_015418	AT	3	6	35269	35274	50 %	50 %	0 %	0 %	331271124
100	NC_015418	GA	3	6	35852	35857	50 %	0 %	50 %	0 %	331271125
101	NC_015418	TA	3	6	35882	35887	50 %	50 %	0 %	0 %	331271125
102	NC_015418	AT	3	6	36475	36480	50 %	50 %	0 %	0 %	331271125
103	NC_015418	AT	3	6	36781	36786	50 %	50 %	0 %	0 %	331271125
104	NC_015418	AT	3	6	37635	37640	50 %	50 %	0 %	0 %	331271126
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107	NC_015418	TA	3	6	40335	40340	50 %	50 %	0 %	0 %	331271130
108	NC_015418	TA	3	6	40489	40494	50 %	50 %	0 %	0 %	331271130
109	NC_015418	AT	4	8	41201	41208	50 %	50 %	0 %	0 %	331271131
110	NC_015418	AT	3	6	42420	42425	50 %	50 %	0 %	0 %	331271132
111	NC_015418	TA	3	6	42612	42617	50 %	50 %	0 %	0 %	331271133
112	NC_015418	TA	3	6	42693	42698	50 %	50 %	0 %	0 %	331271133
113	NC_015418	TA	3	6	43424	43429	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
114	NC_015418	TA	3	6	43501	43506	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
115	NC_015418	AT	3	6	43696	43701	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
116	NC_015418	AT	3	6	43708	43713	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
117	NC_015418	TA	4	8	43765	43772	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
118	NC_015418	TA	3	6	43841	43846	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
119	NC_015418	AT	3	6	43890	43895	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
120	NC_015418	TA	3	6	44021	44026	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
121	NC_015418	AT	3	6	44075	44080	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
122	NC_015418	AT	4	8	44087	44094	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
123	NC_015418	TA	3	6	44250	44255	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
124	NC_015418	TA	3	6	44323	44328	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
125	NC_015418	AT	3	6	44440	44445	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
126	NC_015418	TA	5	10	44452	44461	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
127	NC_015418	TA	3	6	44464	44469	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
128	NC_015418	AT	3	6	44482	44487	50 %	50 %	0 %	0 %	331271134
129	NC_015418	TA	3	6	44819	44824	50 %	50 %	0 %	0 %	331271135
130	NC_015418	AC	3	6	44943	44948	50 %	0 %	0 %	50 %	331271135
131	NC_015418	AT	4	8	44997	45004	50 %	50 %	0 %	0 %	331271135
132	NC_015418	AT	4	8	45341	45348	50 %	50 %	0 %	0 %	331271135
133	NC_015418	AT	3	6	46096	46101	50 %	50 %	0 %	0 %	331271136
134	NC_015418	TA	3	6	46115	46120	50 %	50 %	0 %	0 %	331271136
135	NC_015418	TA	4	8	46517	46524	50 %	50 %	0 %	0 %	331271136
136	NC_015418	TA	3	6	46641	46646	50 %	50 %	0 %	0 %	331271136
137	NC_015418	AT	3	6	46777	46782	50 %	50 %	0 %	0 %	331271136
138	NC_015418	TA	3	6	48574	48579	50 %	50 %	0 %	0 %	331271137
139	NC_015418	AT	3	6	49892	49897	50 %	50 %	0 %	0 %	331271138
140	NC_015418	TA	3	6	50253	50258	50 %	50 %	0 %	0 %	331271138
141	NC_015418	AT	3	6	50562	50567	50 %	50 %	0 %	0 %	331271138
142	NC_015418	TA	3	6	50629	50634	50 %	50 %	0 %	0 %	331271138
143	NC_015418	AT	3	6	50745	50750	50 %	50 %	0 %	0 %	331271138
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.