MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pecorum E58 chromosome

Total Repeats: 21283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015408	CAT	2	6	187869	187874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443919
3502	NC_015408	ATT	2	6	187975	187980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443919
3503	NC_015408	CCAA	2	8	188014	188021	50 %	0 %	0 %	50 %	330443919
3504	NC_015408	C	6	6	188040	188045	0 %	0 %	0 %	100 %	330443919
3505	NC_015408	TC	5	10	188082	188091	0 %	50 %	0 %	50 %	330443919
3506	NC_015408	TGC	2	6	188105	188110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443919
3507	NC_015408	TGA	2	6	188204	188209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443919
3508	NC_015408	TTTC	2	8	188241	188248	0 %	75 %	0 %	25 %	330443919
3509	NC_015408	TTCA	2	8	188308	188315	25 %	50 %	0 %	25 %	330443919
3510	NC_015408	AGC	2	6	188804	188809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443920
3511	NC_015408	TCT	2	6	188833	188838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443920
3512	NC_015408	CAA	4	12	188857	188868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443920
3513	NC_015408	CTT	2	6	188872	188877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443920
3514	NC_015408	TCT	2	6	188878	188883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443920
3515	NC_015408	CTC	2	6	188888	188893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443920
3516	NC_015408	TCT	2	6	188917	188922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443920
3517	NC_015408	CT	3	6	188967	188972	0 %	50 %	0 %	50 %	330443920
3518	NC_015408	A	8	8	188981	188988	100 %	0 %	0 %	0 %	330443920
3519	NC_015408	A	8	8	189073	189080	100 %	0 %	0 %	0 %	330443920
3520	NC_015408	TTG	2	6	189095	189100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443920
3521	NC_015408	GCA	2	6	189115	189120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443920
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3523	NC_015408	CTTA	2	8	189264	189271	25 %	50 %	0 %	25 %	330443920
3524	NC_015408	CT	3	6	189274	189279	0 %	50 %	0 %	50 %	330443920
3525	NC_015408	ATT	2	6	189285	189290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443920
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3527	NC_015408	ATA	2	6	189383	189388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443920
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3529	NC_015408	CTAT	2	8	189667	189674	25 %	50 %	0 %	25 %	330443920
3530	NC_015408	A	7	7	189764	189770	100 %	0 %	0 %	0 %	330443920
3531	NC_015408	A	6	6	189867	189872	100 %	0 %	0 %	0 %	330443920
3532	NC_015408	CT	3	6	189913	189918	0 %	50 %	0 %	50 %	330443920
3533	NC_015408	AG	3	6	189922	189927	50 %	0 %	50 %	0 %	330443920
3534	NC_015408	CT	3	6	189961	189966	0 %	50 %	0 %	50 %	330443920
3535	NC_015408	ACA	2	6	189973	189978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443920
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3537	NC_015408	T	6	6	190060	190065	0 %	100 %	0 %	0 %	330443920
3538	NC_015408	A	6	6	190081	190086	100 %	0 %	0 %	0 %	330443921
3539	NC_015408	GCT	2	6	190130	190135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443921
3540	NC_015408	A	7	7	190139	190145	100 %	0 %	0 %	0 %	330443921
3541	NC_015408	ACCTT	2	10	190246	190255	20 %	40 %	0 %	40 %	330443921
3542	NC_015408	TCT	2	6	190311	190316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443921
3543	NC_015408	AAC	2	6	190339	190344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443921
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3545	NC_015408	A	6	6	190646	190651	100 %	0 %	0 %	0 %	330443921
3546	NC_015408	ATC	2	6	190653	190658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443921
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3549	NC_015408	AGCA	2	8	190885	190892	50 %	0 %	25 %	25 %	330443921
3550	NC_015408	TGG	3	9	190909	190917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330443921
3551	NC_015408	CT	3	6	190935	190940	0 %	50 %	0 %	50 %	330443921
3552	NC_015408	TCA	2	6	190943	190948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443921
3553	NC_015408	CAT	3	9	190959	190967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443921
3554	NC_015408	AAG	2	6	191026	191031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443921
3555	NC_015408	AAG	2	6	191051	191056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443921
3556	NC_015408	AGA	2	6	191063	191068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443921
3557	NC_015408	TGT	2	6	191112	191117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443922
3558	NC_015408	T	6	6	191133	191138	0 %	100 %	0 %	0 %	330443922
3559	NC_015408	GCT	2	6	191203	191208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443922
3560	NC_015408	CTA	2	6	191246	191251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443922
3561	NC_015408	TATGC	2	10	191273	191282	20 %	40 %	20 %	20 %	330443922
3562	NC_015408	AAC	2	6	191473	191478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443922
3563	NC_015408	CAA	2	6	191514	191519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443922
3564	NC_015408	AATG	2	8	191539	191546	50 %	25 %	25 %	0 %	330443922
3565	NC_015408	CTT	2	6	191615	191620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443922
3566	NC_015408	ACA	2	6	191656	191661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443922
3567	NC_015408	TCA	2	6	191699	191704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443922
3568	NC_015408	TAT	2	6	191737	191742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443922
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3570	NC_015408	TTC	2	6	191982	191987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443922
3571	NC_015408	A	6	6	192044	192049	100 %	0 %	0 %	0 %	330443922
3572	NC_015408	GAA	2	6	192053	192058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443922
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3574	NC_015408	AG	3	6	192166	192171	50 %	0 %	50 %	0 %	330443922
3575	NC_015408	TA	3	6	192249	192254	50 %	50 %	0 %	0 %	330443923
3576	NC_015408	GAA	2	6	192278	192283	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443923
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3580	NC_015408	TAA	2	6	192397	192402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443923
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3582	NC_015408	GTT	2	6	192413	192418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443923
3583	NC_015408	TCCA	2	8	192439	192446	25 %	25 %	0 %	50 %	330443923
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3587	NC_015408	AAG	2	6	192871	192876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443923
3588	NC_015408	GAG	2	6	193059	193064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330443923
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3590	NC_015408	TC	3	6	193113	193118	0 %	50 %	0 %	50 %	330443923
3591	NC_015408	AGA	2	6	193192	193197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443923
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3593	NC_015408	CT	3	6	193315	193320	0 %	50 %	0 %	50 %	330443923
3594	NC_015408	TGT	2	6	193337	193342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443923
3595	NC_015408	TATTT	2	10	193375	193384	20 %	80 %	0 %	0 %	330443923
3596	NC_015408	TTC	2	6	193417	193422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443924
3597	NC_015408	AAC	2	6	193449	193454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443924
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3601	NC_015408	GCT	2	6	193648	193653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443924
3602	NC_015408	TCGTC	2	10	193705	193714	0 %	40 %	20 %	40 %	330443924
3603	NC_015408	TAAG	2	8	193747	193754	50 %	25 %	25 %	0 %	330443924
3604	NC_015408	AAG	2	6	193804	193809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443924
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3606	NC_015408	GAA	2	6	193839	193844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443924
3607	NC_015408	AAT	2	6	193874	193879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443924
3608	NC_015408	TGCT	2	8	193898	193905	0 %	50 %	25 %	25 %	330443924
3609	NC_015408	AT	3	6	194009	194014	50 %	50 %	0 %	0 %	330443924
3610	NC_015408	TAG	2	6	194025	194030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443924
3611	NC_015408	ATC	2	6	194055	194060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443924
3612	NC_015408	AAT	2	6	194063	194068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443924
3613	NC_015408	TTG	3	9	194132	194140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330443924
3614	NC_015408	TA	3	6	194173	194178	50 %	50 %	0 %	0 %	330443924
3615	NC_015408	CTG	2	6	194291	194296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443924
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3618	NC_015408	TAT	2	6	194449	194454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443924
3619	NC_015408	GTA	2	6	194484	194489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443924
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3623	NC_015408	GCTT	2	8	194600	194607	0 %	50 %	25 %	25 %	330443924
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3989	NC_015408	GCT	2	6	212962	212967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330443935
3990	NC_015408	CTT	3	9	213036	213044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443935
3991	NC_015408	GAA	2	6	213101	213106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443935
3992	NC_015408	AC	3	6	213383	213388	50 %	0 %	0 %	50 %	330443935
3993	NC_015408	A	8	8	213431	213438	100 %	0 %	0 %	0 %	330443935
3994	NC_015408	TAA	2	6	213475	213480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443935
3995	NC_015408	TA	3	6	213523	213528	50 %	50 %	0 %	0 %	330443935
3996	NC_015408	CAAA	2	8	213531	213538	75 %	0 %	0 %	25 %	330443935
3997	NC_015408	T	7	7	213559	213565	0 %	100 %	0 %	0 %	330443935
3998	NC_015408	GAA	2	6	213573	213578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443935
3999	NC_015408	GAC	2	6	213651	213656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443935
4000	NC_015408	ATA	2	6	213673	213678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443935

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