MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila pecorum E58 chromosome

Total Repeats: 21283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015408	TCA	2	6	75154	75159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443820
1502	NC_015408	AGA	2	6	75345	75350	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443820
1503	NC_015408	TCC	2	6	75370	75375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443820
1504	NC_015408	AAGA	2	8	75377	75384	75 %	0 %	25 %	0 %	330443820
1505	NC_015408	CTGCAA	2	12	75426	75437	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330443820
1506	NC_015408	AGA	2	6	75441	75446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443820
1507	NC_015408	TCA	2	6	75520	75525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443820
1508	NC_015408	AC	3	6	75530	75535	50 %	0 %	0 %	50 %	330443820
1509	NC_015408	TGCT	2	8	75842	75849	0 %	50 %	25 %	25 %	330443821
1510	NC_015408	TATTT	2	10	75942	75951	20 %	80 %	0 %	0 %	330443821
1511	NC_015408	A	6	6	75967	75972	100 %	0 %	0 %	0 %	330443821
1512	NC_015408	GCGAT	2	10	76122	76131	20 %	20 %	40 %	20 %	330443821
1513	NC_015408	AAC	2	6	76165	76170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443821
1514	NC_015408	ATC	2	6	76237	76242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443821
1515	NC_015408	AGC	2	6	76284	76289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443821
1516	NC_015408	AGT	2	6	76318	76323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443821
1517	NC_015408	GAT	2	6	76456	76461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443821
1518	NC_015408	T	6	6	76461	76466	0 %	100 %	0 %	0 %	330443821
1519	NC_015408	TCC	2	6	76489	76494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443821
1520	NC_015408	GAA	2	6	76579	76584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443821
1521	NC_015408	TCC	2	6	76674	76679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330443821
1522	NC_015408	TACCT	2	10	76914	76923	20 %	40 %	0 %	40 %	330443822
1523	NC_015408	TC	3	6	76943	76948	0 %	50 %	0 %	50 %	330443822
1524	NC_015408	T	8	8	76955	76962	0 %	100 %	0 %	0 %	330443822
1525	NC_015408	TCT	2	6	76966	76971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443822
1526	NC_015408	T	6	6	76987	76992	0 %	100 %	0 %	0 %	330443822
1527	NC_015408	CTT	2	6	77093	77098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443822
1528	NC_015408	TAA	2	6	77178	77183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330443822
1529	NC_015408	A	6	6	77261	77266	100 %	0 %	0 %	0 %	330443822
1530	NC_015408	CTTCT	2	10	77268	77277	0 %	60 %	0 %	40 %	330443822
1531	NC_015408	TC	3	6	77291	77296	0 %	50 %	0 %	50 %	330443822
1532	NC_015408	T	6	6	77318	77323	0 %	100 %	0 %	0 %	330443822
1533	NC_015408	ACG	2	6	77346	77351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443822
1534	NC_015408	A	6	6	77743	77748	100 %	0 %	0 %	0 %	330443823
1535	NC_015408	ATT	2	6	77768	77773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443823
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1537	NC_015408	A	8	8	77779	77786	100 %	0 %	0 %	0 %	330443823
1538	NC_015408	A	6	6	77836	77841	100 %	0 %	0 %	0 %	330443823
1539	NC_015408	TGA	2	6	77866	77871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443823
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1541	NC_015408	AAC	2	6	77967	77972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330443823
1542	NC_015408	GAA	2	6	77975	77980	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443823
1543	NC_015408	TTA	2	6	77996	78001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443823
1544	NC_015408	TTA	2	6	78258	78263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443823
1545	NC_015408	CTT	2	6	78281	78286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330443823
1546	NC_015408	GAA	2	6	78344	78349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443823
1547	NC_015408	AAG	2	6	78362	78367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443823
1548	NC_015408	TGA	2	6	78412	78417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443823
1549	NC_015408	CTAC	2	8	78423	78430	25 %	25 %	0 %	50 %	330443823
1550	NC_015408	A	7	7	78451	78457	100 %	0 %	0 %	0 %	330443823
1551	NC_015408	TAC	2	6	78488	78493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443823
1552	NC_015408	CGA	2	6	78549	78554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443823
1553	NC_015408	CT	3	6	78569	78574	0 %	50 %	0 %	50 %	330443823
1554	NC_015408	CA	3	6	78614	78619	50 %	0 %	0 %	50 %	330443823
1555	NC_015408	GTG	2	6	78657	78662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330443823
1556	NC_015408	GAA	2	6	78665	78670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443823
1557	NC_015408	GAA	2	6	78701	78706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443823
1558	NC_015408	CTTCGT	2	12	78719	78730	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	330443823
1559	NC_015408	TGG	2	6	78736	78741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330443823
1560	NC_015408	TTA	2	6	78747	78752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443823
1561	NC_015408	A	6	6	78778	78783	100 %	0 %	0 %	0 %	330443823
1562	NC_015408	AG	3	6	78799	78804	50 %	0 %	50 %	0 %	330443823
1563	NC_015408	ACG	2	6	78825	78830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330443823
1564	NC_015408	TAG	2	6	78870	78875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443823
1565	NC_015408	GA	3	6	78989	78994	50 %	0 %	50 %	0 %	330443823
1566	NC_015408	A	6	6	79000	79005	100 %	0 %	0 %	0 %	330443823
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1571	NC_015408	TCA	2	6	79301	79306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443824
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1573	NC_015408	A	8	8	79328	79335	100 %	0 %	0 %	0 %	330443824
1574	NC_015408	CT	3	6	79357	79362	0 %	50 %	0 %	50 %	330443824
1575	NC_015408	A	6	6	79397	79402	100 %	0 %	0 %	0 %	330443824
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1583	NC_015408	CCTCC	2	10	79756	79765	0 %	20 %	0 %	80 %	330443824
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1593	NC_015408	T	6	6	80076	80081	0 %	100 %	0 %	0 %	330443824
1594	NC_015408	A	6	6	80121	80126	100 %	0 %	0 %	0 %	330443824
1595	NC_015408	AAG	2	6	80193	80198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443824
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1598	NC_015408	TTA	2	6	80294	80299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330443825
1599	NC_015408	ACT	2	6	80382	80387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443825
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1602	NC_015408	GAA	2	6	80461	80466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330443825
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1608	NC_015408	TC	3	6	80783	80788	0 %	50 %	0 %	50 %	330443825
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1610	NC_015408	TG	3	6	80900	80905	0 %	50 %	50 %	0 %	330443825
1611	NC_015408	AC	3	6	80915	80920	50 %	0 %	0 %	50 %	330443825
1612	NC_015408	TCTA	2	8	80949	80956	25 %	50 %	0 %	25 %	330443825
1613	NC_015408	TC	3	6	80963	80968	0 %	50 %	0 %	50 %	330443825
1614	NC_015408	CTTC	2	8	81006	81013	0 %	50 %	0 %	50 %	330443825
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1618	NC_015408	TG	3	6	81370	81375	0 %	50 %	50 %	0 %	330443825
1619	NC_015408	CTA	2	6	81386	81391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443825
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1622	NC_015408	ATG	2	6	81629	81634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330443825
1623	NC_015408	TAC	2	6	81652	81657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330443825
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