MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063 chromosome

Total Repeats: 689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015380	CTGCAA	2	12	1942	1953	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	330812977
2	NC_015380	ATTTTT	2	12	12810	12821	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	330812987
3	NC_015380	TTAATC	2	12	15737	15748	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	330812991
4	NC_015380	TAGCTT	2	12	16346	16357	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330812992
5	NC_015380	TAACCA	2	12	17405	17416	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	330812994
6	NC_015380	TTAATA	2	12	20059	20070	50 %	50 %	0 %	0 %	330812998
7	NC_015380	AGATTT	2	12	22707	22718	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	330813000
8	NC_015380	ACAGCA	2	12	24120	24131	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330813001
9	NC_015380	ATTTAA	2	12	26105	26116	50 %	50 %	0 %	0 %	330813004
10	NC_015380	AGACTA	2	12	29840	29851	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330813007
11	NC_015380	TATATT	2	12	31020	31031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813009
12	NC_015380	TGTTTT	2	12	31616	31627	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	330813009
13	NC_015380	TTTGTT	2	12	32184	32195	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	330813010
14	NC_015380	TAAAAA	2	12	32735	32746	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	330813010
15	NC_015380	AAAAAG	2	12	32982	32993	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	330813010
16	NC_015380	TTTTTA	2	12	33354	33365	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	330813011
17	NC_015380	TATAAA	2	12	34115	34126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813011
18	NC_015380	TATTAA	2	12	37016	37027	50 %	50 %	0 %	0 %	330813016
19	NC_015380	ATTGAA	2	12	37434	37445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	330813017
20	NC_015380	ATAAAA	2	12	42818	42829	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	330813026
21	NC_015380	CAGCGG	2	12	43254	43265	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	330813027
22	NC_015380	TGTCAT	2	12	47006	47017	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330813033
23	NC_015380	AAACAT	2	12	47018	47029	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	330813033
24	NC_015380	ACAAAA	2	12	53840	53851	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	330813043
25	NC_015380	GTCAAA	2	12	54119	54130	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330813044
26	NC_015380	ATCTTT	2	12	54416	54427	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	330813044
27	NC_015380	TAAAAA	2	12	55686	55697	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	330813044
28	NC_015380	CTTTAA	2	12	56947	56958	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	330813046
29	NC_015380	ATTTTT	2	12	57023	57034	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	330813046
30	NC_015380	TAATTT	2	12	57106	57117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813046
31	NC_015380	TAAAAT	2	12	57131	57142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813046
32	NC_015380	TTAATT	2	12	58143	58154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813047
33	NC_015380	AAATAA	2	12	59354	59365	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	330813048
34	NC_015380	ATTTTT	2	12	60564	60575	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	330813052
35	NC_015380	AATAAA	2	12	61773	61784	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	330813053
36	NC_015380	AATTCT	2	12	63241	63252	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	330813056
37	NC_015380	TTGGTC	2	12	63521	63532	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	330813056
38	NC_015380	CTTTTC	2	12	64312	64323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813057
39	NC_015380	TCTTTA	2	12	65340	65351	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	330813059
40	NC_015380	TTTCAT	2	12	66962	66973	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	330813061
41	NC_015380	GTTTTT	2	12	67943	67954	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	330813063
42	NC_015380	AATTAA	2	12	68086	68097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813063
43	NC_015380	TTTAAA	2	12	70487	70498	50 %	50 %	0 %	0 %	330813067
44	NC_015380	TAAAAT	2	12	70807	70818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813067
45	NC_015380	AATAAA	2	12	71444	71455	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	330813068
46	NC_015380	TAAAAT	2	12	77083	77094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813073
47	NC_015380	ATTTTT	2	12	77981	77992	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	330813075
48	NC_015380	TATATT	2	12	82662	82673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813080
49	NC_015380	ATTAAA	2	12	82800	82811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813080
50	NC_015380	CAAATT	2	12	84451	84462	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	330813083
51	NC_015380	TTATTG	2	12	85131	85142	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	330813083
52	NC_015380	AACATT	2	12	86095	86106	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	330813085
53	NC_015380	CCCAAA	2	12	86915	86926	50 %	0 %	0 %	50 %	330813087
54	NC_015380	TTTAAT	2	12	87525	87536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813087
55	NC_015380	TTTACC	2	12	88431	88442	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	330813088
56	NC_015380	TAATTT	2	12	89888	89899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813091
57	NC_015380	CTAGAA	2	12	95446	95457	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330813097
58	NC_015380	CAATTC	2	12	95485	95496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813097
59	NC_015380	TTTAAA	2	12	95960	95971	50 %	50 %	0 %	0 %	330813097
60	NC_015380	TAAAAA	2	12	96971	96982	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	330813097
61	NC_015380	AGAAAA	2	12	98445	98456	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	330813099
62	NC_015380	TAAAAA	2	12	100488	100499	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	330813102
63	NC_015380	TTTCTG	2	12	113744	113755	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	330813116
64	NC_015380	TAATCT	2	12	114264	114275	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	330813117
65	NC_015380	CATTCC	2	12	115546	115557	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	330813118
66	NC_015380	TTGCAA	2	12	116968	116979	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	330813119
67	NC_015380	TATCTG	2	12	117400	117411	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330813119
68	NC_015380	TTTTCA	2	12	117685	117696	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	330813120
69	NC_015380	CACATT	2	12	118634	118645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813121
70	NC_015380	ATACAA	2	12	119608	119619	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	330813123
71	NC_015380	ATTTTT	2	12	119965	119976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	330813124
72	NC_015380	CAGAAG	2	12	122122	122133	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330813125
73	NC_015380	ATCAAA	2	12	129360	129371	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	330813130
74	NC_015380	GAAAAA	2	12	130134	130145	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	330813130
75	NC_015380	ATGAGG	2	12	131069	131080	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	330813131
76	NC_015380	TGGTGC	2	12	131958	131969	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	330813132
77	NC_015380	GAAAAT	2	12	134347	134358	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	330813135
78	NC_015380	TATTTT	2	12	141850	141861	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	330813142
79	NC_015380	GTTTTA	2	12	142061	142072	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	330813142
80	NC_015380	AAATTT	2	12	145758	145769	50 %	50 %	0 %	0 %	330813148
81	NC_015380	ATAAGA	2	12	148153	148164	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	330813150
82	NC_015380	ATATTT	2	12	149951	149962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813152
83	NC_015380	CAAAAA	2	12	153209	153220	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	330813155
84	NC_015380	TAAAAA	2	12	153582	153593	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	330813156
85	NC_015380	CAAAAC	2	12	156454	156465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330813159
86	NC_015380	AGCTTT	2	12	157670	157681	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	330813161
87	NC_015380	CAAAAT	2	12	159016	159027	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	330813162
88	NC_015380	TTAAAA	2	12	161902	161913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813164
89	NC_015380	TTTGCT	2	12	162392	162403	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	330813165
90	NC_015380	TTTGCG	2	12	162761	162772	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	330813165
91	NC_015380	TAAAAA	2	12	164568	164579	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	330813169
92	NC_015380	TTGATA	2	12	165251	165262	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	330813169
93	NC_015380	TTTTCT	2	12	166246	166257	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	330813170
94	NC_015380	TTTAAT	2	12	167745	167756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813172
95	NC_015380	AAAGCA	2	12	169111	169122	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	330813174
96	NC_015380	TAATAT	2	12	170415	170426	50 %	50 %	0 %	0 %	330813174
97	NC_015380	AATTTG	2	12	171451	171462	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	330813175
98	NC_015380	GTTGAA	2	12	172898	172909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813177
99	NC_015380	TTAAAT	2	12	174818	174829	50 %	50 %	0 %	0 %	330813180
100	NC_015380	CCACCT	2	12	178424	178435	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	330813181
101	NC_015380	CATCTG	2	12	178959	178970	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330813181
102	NC_015380	TGATTT	2	12	181247	181258	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	330813183
103	NC_015380	ATCTAT	2	12	181493	181504	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	330813183
104	NC_015380	TCTTGT	3	18	182680	182697	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	330813184
105	NC_015380	TCTTGT	3	18	184850	184867	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	330813185
106	NC_015380	TAAATC	2	12	188681	188692	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	330813187
107	NC_015380	CTAAAG	2	12	191214	191225	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330813193
108	NC_015380	CTTTTT	2	12	191988	191999	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	330813194
109	NC_015380	TGTTTT	2	12	193412	193423	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	330813195
110	NC_015380	CTTACC	2	12	194360	194371	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	330813196
111	NC_015380	TCTTTT	2	12	194718	194729	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	330813196
112	NC_015380	TCTTTT	4	24	196116	196139	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	330813198
113	NC_015380	TAGACA	2	12	200922	200933	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330813201
114	NC_015380	AATTTG	2	12	204452	204463	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	330813205
115	NC_015380	TTTCTT	2	12	205885	205896	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	330813205
116	NC_015380	TTCTTT	2	12	207685	207696	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	330813207
117	NC_015380	TCCAGG	2	12	207991	208002	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330813207
118	NC_015380	TCCTAT	2	12	209608	209619	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	330813210
119	NC_015380	TCTTTT	2	12	209665	209676	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	330813210
120	NC_015380	GATTTG	2	12	209719	209730	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	330813211
121	NC_015380	GCTGGG	2	12	212497	212508	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	330813213
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472	NC_015380	GCAGTA	2	12	900088	900099	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	330813991
473	NC_015380	GCCTAG	2	12	900299	900310	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330813991
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