MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063 chromosome

Total Repeats: 32541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015380	TAA	2	6	105659	105664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813113
3002	NC_015380	AGA	2	6	105668	105673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330813113
3003	NC_015380	AATG	2	8	105728	105735	50 %	25 %	25 %	0 %	330813113
3004	NC_015380	AGG	2	6	105752	105757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330813113
3005	NC_015380	AAAT	2	8	105797	105804	75 %	25 %	0 %	0 %	330813113
3006	NC_015380	AAC	2	6	105836	105841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330813113
3007	NC_015380	TATC	2	8	105970	105977	25 %	50 %	0 %	25 %	330813113
3008	NC_015380	TAT	2	6	106022	106027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813113
3009	NC_015380	AAT	2	6	106035	106040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813113
3010	NC_015380	A	10	10	106054	106063	100 %	0 %	0 %	0 %	330813113
3011	NC_015380	ATT	2	6	106073	106078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813113
3012	NC_015380	AT	3	6	106102	106107	50 %	50 %	0 %	0 %	330813113
3013	NC_015380	TAAA	2	8	106124	106131	75 %	25 %	0 %	0 %	330813113
3014	NC_015380	A	8	8	111361	111368	100 %	0 %	0 %	0 %	330813114
3015	NC_015380	A	6	6	111374	111379	100 %	0 %	0 %	0 %	330813114
3016	NC_015380	TAA	2	6	111395	111400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813114
3017	NC_015380	T	8	8	111416	111423	0 %	100 %	0 %	0 %	330813114
3018	NC_015380	T	6	6	111433	111438	0 %	100 %	0 %	0 %	330813114
3019	NC_015380	T	6	6	111440	111445	0 %	100 %	0 %	0 %	330813114
3020	NC_015380	GAA	2	6	111487	111492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330813114
3021	NC_015380	A	6	6	111508	111513	100 %	0 %	0 %	0 %	330813114
3022	NC_015380	T	9	9	111534	111542	0 %	100 %	0 %	0 %	330813114
3023	NC_015380	TAA	2	6	111561	111566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813114
3024	NC_015380	A	7	7	111565	111571	100 %	0 %	0 %	0 %	330813114
3025	NC_015380	TTA	2	6	111572	111577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813114
3026	NC_015380	GTT	2	6	111580	111585	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330813114
3027	NC_015380	A	6	6	111602	111607	100 %	0 %	0 %	0 %	330813114
3028	NC_015380	TTA	2	6	111610	111615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813114
3029	NC_015380	A	6	6	111620	111625	100 %	0 %	0 %	0 %	330813114
3030	NC_015380	TAT	2	6	111711	111716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813114
3031	NC_015380	AAAAC	2	10	111726	111735	80 %	0 %	0 %	20 %	330813114
3032	NC_015380	TAC	2	6	111793	111798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813114
3033	NC_015380	CAA	2	6	111801	111806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330813114
3034	NC_015380	GAT	2	6	111811	111816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813114
3035	NC_015380	A	7	7	111836	111842	100 %	0 %	0 %	0 %	330813114
3036	NC_015380	T	6	6	111858	111863	0 %	100 %	0 %	0 %	330813114
3037	NC_015380	A	6	6	111905	111910	100 %	0 %	0 %	0 %	330813114
3038	NC_015380	A	6	6	111987	111992	100 %	0 %	0 %	0 %	330813114
3039	NC_015380	TGA	2	6	111993	111998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813114
3040	NC_015380	T	6	6	112007	112012	0 %	100 %	0 %	0 %	330813114
3041	NC_015380	GAT	2	6	112027	112032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813114
3042	NC_015380	CTTA	2	8	112070	112077	25 %	50 %	0 %	25 %	330813114
3043	NC_015380	A	6	6	112077	112082	100 %	0 %	0 %	0 %	330813114
3044	NC_015380	ATA	2	6	112127	112132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813114
3045	NC_015380	TGA	2	6	112175	112180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813114
3046	NC_015380	TCT	2	6	112207	112212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813114
3047	NC_015380	TAA	2	6	112248	112253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813114
3048	NC_015380	TGC	2	6	112275	112280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813114
3049	NC_015380	CAACT	2	10	112374	112383	40 %	20 %	0 %	40 %	330813114
3050	NC_015380	GAA	2	6	112436	112441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330813114
3051	NC_015380	ATT	2	6	112459	112464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813114
3052	NC_015380	ATA	2	6	112526	112531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813114
3053	NC_015380	AATT	2	8	112536	112543	50 %	50 %	0 %	0 %	330813114
3054	NC_015380	CTTC	2	8	112558	112565	0 %	50 %	0 %	50 %	330813114
3055	NC_015380	A	7	7	112569	112575	100 %	0 %	0 %	0 %	330813114
3056	NC_015380	AAATG	2	10	112584	112593	60 %	20 %	20 %	0 %	330813114
3057	NC_015380	ACT	2	6	112648	112653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813114
3058	NC_015380	CTT	2	6	112664	112669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813115
3059	NC_015380	CTT	2	6	112675	112680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813115
3060	NC_015380	ATC	2	6	112736	112741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813115
3061	NC_015380	CTC	2	6	112781	112786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330813115
3062	NC_015380	TAA	2	6	112792	112797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813115
3063	NC_015380	TGG	2	6	112811	112816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330813115
3064	NC_015380	ATA	2	6	112866	112871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813115
3065	NC_015380	TTG	4	12	112971	112982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330813115
3066	NC_015380	CTT	2	6	113055	113060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813115
3067	NC_015380	TTA	2	6	113064	113069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813115
3068	NC_015380	TCT	2	6	113081	113086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813115
3069	NC_015380	TTTTA	2	10	113280	113289	20 %	80 %	0 %	0 %	330813116
3070	NC_015380	A	6	6	113289	113294	100 %	0 %	0 %	0 %	330813116
3071	NC_015380	CTG	2	6	113295	113300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813116
3072	NC_015380	T	8	8	113329	113336	0 %	100 %	0 %	0 %	330813116
3073	NC_015380	TAA	2	6	113357	113362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813116
3074	NC_015380	T	7	7	113363	113369	0 %	100 %	0 %	0 %	330813116
3075	NC_015380	CAT	2	6	113384	113389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813116
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3078	NC_015380	CTTT	2	8	113524	113531	0 %	75 %	0 %	25 %	330813116
3079	NC_015380	TTA	2	6	113548	113553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813116
3080	NC_015380	T	7	7	113627	113633	0 %	100 %	0 %	0 %	330813116
3081	NC_015380	CT	3	6	113637	113642	0 %	50 %	0 %	50 %	330813116
3082	NC_015380	T	8	8	113717	113724	0 %	100 %	0 %	0 %	330813116
3083	NC_015380	TTTCTG	2	12	113744	113755	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	330813116
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3086	NC_015380	T	6	6	113842	113847	0 %	100 %	0 %	0 %	330813116
3087	NC_015380	TC	3	6	113850	113855	0 %	50 %	0 %	50 %	330813116
3088	NC_015380	ATTT	2	8	113885	113892	25 %	75 %	0 %	0 %	330813116
3089	NC_015380	TAGA	2	8	113912	113919	50 %	25 %	25 %	0 %	330813116
3090	NC_015380	ATT	2	6	113953	113958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813116
3091	NC_015380	TAA	2	6	113994	113999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813116
3092	NC_015380	T	9	9	114010	114018	0 %	100 %	0 %	0 %	330813116
3093	NC_015380	AAC	2	6	114061	114066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330813117
3094	NC_015380	ATC	2	6	114111	114116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813117
3095	NC_015380	A	6	6	114124	114129	100 %	0 %	0 %	0 %	330813117
3096	NC_015380	AATT	2	8	114152	114159	50 %	50 %	0 %	0 %	330813117
3097	NC_015380	TAATCT	2	12	114264	114275	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	330813117
3098	NC_015380	ACC	2	6	114358	114363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330813117
3099	NC_015380	TG	3	6	114377	114382	0 %	50 %	50 %	0 %	330813117
3100	NC_015380	TCA	2	6	114466	114471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813117
3101	NC_015380	CTT	2	6	114485	114490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813117
3102	NC_015380	TGC	2	6	114516	114521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813117
3103	NC_015380	TG	3	6	114525	114530	0 %	50 %	50 %	0 %	330813117
3104	NC_015380	TTTAG	2	10	114592	114601	20 %	60 %	20 %	0 %	330813117
3105	NC_015380	T	6	6	114610	114615	0 %	100 %	0 %	0 %	330813117
3106	NC_015380	TCC	2	6	114645	114650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330813117
3107	NC_015380	TCCA	2	8	114686	114693	25 %	25 %	0 %	50 %	330813117
3108	NC_015380	GAT	2	6	114700	114705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813117
3109	NC_015380	AAG	2	6	114743	114748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330813117
3110	NC_015380	ACC	2	6	114756	114761	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330813117
3111	NC_015380	TTC	2	6	114790	114795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813117
3112	NC_015380	T	8	8	114834	114841	0 %	100 %	0 %	0 %	330813117
3113	NC_015380	TTC	2	6	114867	114872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813117
3114	NC_015380	TC	3	6	114890	114895	0 %	50 %	0 %	50 %	330813117
3115	NC_015380	T	7	7	114929	114935	0 %	100 %	0 %	0 %	330813117
3116	NC_015380	TCT	2	6	114940	114945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813117
3117	NC_015380	TAT	2	6	114984	114989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813117
3118	NC_015380	GAA	2	6	115000	115005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330813117
3119	NC_015380	T	6	6	115032	115037	0 %	100 %	0 %	0 %	330813117
3120	NC_015380	CAG	2	6	115149	115154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330813118
3121	NC_015380	CTA	2	6	115164	115169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813118
3122	NC_015380	AAT	2	6	115186	115191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813118
3123	NC_015380	TTC	2	6	115192	115197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813118
3124	NC_015380	ACC	2	6	115252	115257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330813118
3125	NC_015380	CA	3	6	115306	115311	50 %	0 %	0 %	50 %	330813118
3126	NC_015380	AAT	2	6	115315	115320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813118
3127	NC_015380	TG	3	6	115344	115349	0 %	50 %	50 %	0 %	330813118
3128	NC_015380	T	8	8	115354	115361	0 %	100 %	0 %	0 %	330813118
3129	NC_015380	ATT	2	6	115421	115426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813118
3130	NC_015380	CCAGC	2	10	115467	115476	20 %	0 %	20 %	60 %	330813118
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3133	NC_015380	CATTCC	2	12	115546	115557	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	330813118
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3140	NC_015380	CAA	2	6	115971	115976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330813118
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3142	NC_015380	TGT	2	6	116107	116112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330813118
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3147	NC_015380	TGA	2	6	116256	116261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813119
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3149	NC_015380	ATCA	2	8	116294	116301	50 %	25 %	0 %	25 %	330813119
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3152	NC_015380	GCT	2	6	116467	116472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813119
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3155	NC_015380	ATC	2	6	116510	116515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813119
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3162	NC_015380	CT	3	6	116892	116897	0 %	50 %	0 %	50 %	330813119
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3232	NC_015380	AT	3	6	119657	119662	50 %	50 %	0 %	0 %	330813124
3233	NC_015380	T	6	6	119662	119667	0 %	100 %	0 %	0 %	330813124
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3237	NC_015380	TC	3	6	119787	119792	0 %	50 %	0 %	50 %	330813124
3238	NC_015380	CAT	2	6	119872	119877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813124
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3240	NC_015380	ATTTTT	2	12	119965	119976	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	330813124
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3242	NC_015380	TGC	2	6	120085	120090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813124
3243	NC_015380	TTA	2	6	120108	120113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813124
3244	NC_015380	ATTT	2	8	120114	120121	25 %	75 %	0 %	0 %	330813124
3245	NC_015380	T	6	6	120119	120124	0 %	100 %	0 %	0 %	330813124
3246	NC_015380	TCT	2	6	120200	120205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813124
3247	NC_015380	T	9	9	120209	120217	0 %	100 %	0 %	0 %	330813124
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