MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Pelagibacter sp. IMCC9063 chromosome

Total Repeats: 32541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015380	AAC	2	6	22648	22653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330813000
502	NC_015380	AGATTT	2	12	22707	22718	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	330813000
503	NC_015380	GCA	2	6	22771	22776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330813000
504	NC_015380	CAT	2	6	22787	22792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813000
505	NC_015380	ATT	2	6	22833	22838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813000
506	NC_015380	TTC	2	6	22913	22918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813000
507	NC_015380	TGGA	2	8	22926	22933	25 %	25 %	50 %	0 %	330813000
508	NC_015380	TC	3	6	22979	22984	0 %	50 %	0 %	50 %	330813000
509	NC_015380	TGA	2	6	23040	23045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813000
510	NC_015380	A	6	6	23059	23064	100 %	0 %	0 %	0 %	330813000
511	NC_015380	TGT	2	6	23108	23113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330813000
512	NC_015380	GAG	2	6	23116	23121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330813000
513	NC_015380	TCC	2	6	23136	23141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330813000
514	NC_015380	TCC	2	6	23145	23150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330813000
515	NC_015380	ATTC	2	8	23175	23182	25 %	50 %	0 %	25 %	330813000
516	NC_015380	TA	3	6	23193	23198	50 %	50 %	0 %	0 %	330813000
517	NC_015380	AGAA	2	8	23199	23206	75 %	0 %	25 %	0 %	330813000
518	NC_015380	TAA	3	9	23237	23245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813000
519	NC_015380	CTG	3	9	23276	23284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813000
520	NC_015380	CCCA	2	8	23285	23292	25 %	0 %	0 %	75 %	330813000
521	NC_015380	ACT	2	6	23317	23322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813000
522	NC_015380	CTA	2	6	23363	23368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813000
523	NC_015380	AAT	2	6	23395	23400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813000
524	NC_015380	AC	3	6	23416	23421	50 %	0 %	0 %	50 %	330813000
525	NC_015380	A	8	8	23422	23429	100 %	0 %	0 %	0 %	330813000
526	NC_015380	CAA	2	6	23438	23443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330813000
527	NC_015380	TGC	2	6	23473	23478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813000
528	NC_015380	A	6	6	23524	23529	100 %	0 %	0 %	0 %	330813000
529	NC_015380	AGC	2	6	23649	23654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330813000
530	NC_015380	CTA	2	6	23681	23686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813000
531	NC_015380	GCA	2	6	23737	23742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330813000
532	NC_015380	ACC	2	6	23760	23765	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330813000
533	NC_015380	TTAA	2	8	23800	23807	50 %	50 %	0 %	0 %	330813000
534	NC_015380	A	7	7	23871	23877	100 %	0 %	0 %	0 %	330813000
535	NC_015380	AAG	2	6	23954	23959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330813000
536	NC_015380	AGA	2	6	23970	23975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330813000
537	NC_015380	T	6	6	23991	23996	0 %	100 %	0 %	0 %	330813001
538	NC_015380	T	6	6	23999	24004	0 %	100 %	0 %	0 %	330813001
539	NC_015380	CCA	2	6	24039	24044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330813001
540	NC_015380	CAA	2	6	24073	24078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330813001
541	NC_015380	ACAGCA	2	12	24120	24131	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	330813001
542	NC_015380	TAA	2	6	24222	24227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813001
543	NC_015380	CAA	2	6	24229	24234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330813001
544	NC_015380	AGAT	2	8	24235	24242	50 %	25 %	25 %	0 %	330813001
545	NC_015380	TGA	2	6	24315	24320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330813002
546	NC_015380	CTTT	2	8	24353	24360	0 %	75 %	0 %	25 %	330813002
547	NC_015380	GCAA	2	8	24398	24405	50 %	0 %	25 %	25 %	330813002
548	NC_015380	AGC	2	6	24520	24525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330813002
549	NC_015380	TAA	2	6	24576	24581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813002
550	NC_015380	CTT	2	6	24592	24597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813002
551	NC_015380	ATA	3	9	24620	24628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813002
552	NC_015380	GTTT	2	8	24644	24651	0 %	75 %	25 %	0 %	330813002
553	NC_015380	TTC	2	6	24658	24663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813002
554	NC_015380	CTT	2	6	24667	24672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813002
555	NC_015380	ACC	2	6	24703	24708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330813002
556	NC_015380	TGC	2	6	24781	24786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813002
557	NC_015380	ACT	2	6	24806	24811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813002
558	NC_015380	A	6	6	24871	24876	100 %	0 %	0 %	0 %	330813002
559	NC_015380	GCT	2	6	24899	24904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330813002
560	NC_015380	TCA	3	9	24906	24914	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813002
561	NC_015380	TTA	2	6	24926	24931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813002
562	NC_015380	ATTG	2	8	24998	25005	25 %	50 %	25 %	0 %	330813002
563	NC_015380	TAA	2	6	25024	25029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813002
564	NC_015380	A	6	6	25038	25043	100 %	0 %	0 %	0 %	330813002
565	NC_015380	TTC	2	6	25058	25063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813002
566	NC_015380	GGA	2	6	25066	25071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330813002
567	NC_015380	TTA	2	6	25091	25096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330813002
568	NC_015380	ACT	2	6	25106	25111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813002
569	NC_015380	T	9	9	25121	25129	0 %	100 %	0 %	0 %	330813002
570	NC_015380	ACT	2	6	25180	25185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813002
571	NC_015380	T	6	6	25194	25199	0 %	100 %	0 %	0 %	330813002
572	NC_015380	CT	3	6	25205	25210	0 %	50 %	0 %	50 %	330813002
573	NC_015380	CAA	2	6	25227	25232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330813002
574	NC_015380	T	6	6	25256	25261	0 %	100 %	0 %	0 %	330813002
575	NC_015380	TAA	2	6	25275	25280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813002
576	NC_015380	T	7	7	25306	25312	0 %	100 %	0 %	0 %	330813002
577	NC_015380	GA	3	6	25327	25332	50 %	0 %	50 %	0 %	330813002
578	NC_015380	T	6	6	25338	25343	0 %	100 %	0 %	0 %	330813002
579	NC_015380	GTAAC	2	10	25361	25370	40 %	20 %	20 %	20 %	330813002
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581	NC_015380	CTCTT	2	10	25587	25596	0 %	60 %	0 %	40 %	330813003
582	NC_015380	TTG	2	6	25604	25609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330813003
583	NC_015380	T	8	8	25620	25627	0 %	100 %	0 %	0 %	330813003
584	NC_015380	ATA	2	6	25655	25660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813003
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588	NC_015380	TTTA	2	8	25905	25912	25 %	75 %	0 %	0 %	330813004
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592	NC_015380	ATTTAA	2	12	26105	26116	50 %	50 %	0 %	0 %	330813004
593	NC_015380	T	7	7	26121	26127	0 %	100 %	0 %	0 %	330813004
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598	NC_015380	A	6	6	26314	26319	100 %	0 %	0 %	0 %	330813004
599	NC_015380	ATTT	2	8	26361	26368	25 %	75 %	0 %	0 %	330813004
600	NC_015380	T	10	10	26366	26375	0 %	100 %	0 %	0 %	330813004
601	NC_015380	T	8	8	26399	26406	0 %	100 %	0 %	0 %	330813004
602	NC_015380	TA	3	6	26418	26423	50 %	50 %	0 %	0 %	330813004
603	NC_015380	T	6	6	26449	26454	0 %	100 %	0 %	0 %	330813004
604	NC_015380	AAT	2	6	26468	26473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813004
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610	NC_015380	T	7	7	26982	26988	0 %	100 %	0 %	0 %	330813005
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612	NC_015380	GCA	2	6	27055	27060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330813005
613	NC_015380	ATA	2	6	27080	27085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330813005
614	NC_015380	A	7	7	27128	27134	100 %	0 %	0 %	0 %	330813005
615	NC_015380	TA	5	10	27152	27161	50 %	50 %	0 %	0 %	330813005
616	NC_015380	AT	3	6	27177	27182	50 %	50 %	0 %	0 %	330813005
617	NC_015380	T	6	6	27195	27200	0 %	100 %	0 %	0 %	330813005
618	NC_015380	TTC	2	6	27209	27214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330813005
619	NC_015380	TTAC	2	8	27234	27241	25 %	50 %	0 %	25 %	330813005
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622	NC_015380	TTTA	2	8	27364	27371	25 %	75 %	0 %	0 %	330813005
623	NC_015380	T	6	6	27373	27378	0 %	100 %	0 %	0 %	330813005
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628	NC_015380	CAAT	2	8	27579	27586	50 %	25 %	0 %	25 %	330813005
629	NC_015380	TCA	2	6	27595	27600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330813005
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