MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 3166

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015275	ATTCA	2	10	667	676	40 %	40 %	0 %	20 %	326789140
2	NC_015275	GTAAA	2	10	6920	6929	60 %	20 %	20 %	0 %	326789145
3	NC_015275	CTTAA	2	10	7237	7246	40 %	40 %	0 %	20 %	326789145
4	NC_015275	ATTAT	2	10	7865	7874	40 %	60 %	0 %	0 %	326789145
5	NC_015275	TTTAT	2	10	16509	16518	20 %	80 %	0 %	0 %	326789147
6	NC_015275	ATTTA	2	10	18583	18592	40 %	60 %	0 %	0 %	326789149
7	NC_015275	ATATA	2	10	18649	18658	60 %	40 %	0 %	0 %	326789149
8	NC_015275	AATGC	2	10	20879	20888	40 %	20 %	20 %	20 %	326789152
9	NC_015275	TAAAG	2	10	21720	21729	60 %	20 %	20 %	0 %	326789153
10	NC_015275	AAAGA	2	10	21754	21763	80 %	0 %	20 %	0 %	326789153
11	NC_015275	TATTT	2	10	21830	21839	20 %	80 %	0 %	0 %	326789153
12	NC_015275	GTTAA	2	10	22622	22631	40 %	40 %	20 %	0 %	326789154
13	NC_015275	AATAT	2	10	22914	22923	60 %	40 %	0 %	0 %	326789154
14	NC_015275	GCAAG	2	10	22957	22966	40 %	0 %	40 %	20 %	326789154
15	NC_015275	AATAT	2	10	25222	25231	60 %	40 %	0 %	0 %	326789156
16	NC_015275	AAGAA	2	10	26040	26049	80 %	0 %	20 %	0 %	326789157
17	NC_015275	ATCTA	2	10	26306	26315	40 %	40 %	0 %	20 %	326789157
18	NC_015275	TTTAA	2	10	27061	27070	40 %	60 %	0 %	0 %	326789158
19	NC_015275	TCTTT	2	10	27782	27791	0 %	80 %	0 %	20 %	326789159
20	NC_015275	TTACC	2	10	31988	31997	20 %	40 %	0 %	40 %	326789164
21	NC_015275	TAAAA	2	10	32486	32495	80 %	20 %	0 %	0 %	326789164
22	NC_015275	AAATC	2	10	34466	34475	60 %	20 %	0 %	20 %	326789166
23	NC_015275	AGATT	2	10	34995	35004	40 %	40 %	20 %	0 %	326789166
24	NC_015275	TGCGT	2	10	35313	35322	0 %	40 %	40 %	20 %	326789167
25	NC_015275	TATAA	2	10	37177	37186	60 %	40 %	0 %	0 %	326789168
26	NC_015275	GATAC	2	10	37974	37983	40 %	20 %	20 %	20 %	326789169
27	NC_015275	ATTAA	2	10	38313	38322	60 %	40 %	0 %	0 %	326789169
28	NC_015275	ATTAA	2	10	40106	40115	60 %	40 %	0 %	0 %	326789170
29	NC_015275	AGGTA	2	10	41732	41741	40 %	20 %	40 %	0 %	326789172
30	NC_015275	AAAGA	2	10	43478	43487	80 %	0 %	20 %	0 %	326789174
31	NC_015275	CTTTA	2	10	44794	44803	20 %	60 %	0 %	20 %	326789176
32	NC_015275	AATGG	2	10	45578	45587	40 %	20 %	40 %	0 %	326789176
33	NC_015275	GATAA	2	10	49623	49632	60 %	20 %	20 %	0 %	326789177
34	NC_015275	GAAGA	2	10	50089	50098	60 %	0 %	40 %	0 %	326789177
35	NC_015275	TGGGG	2	10	51683	51692	0 %	20 %	80 %	0 %	326789179
36	NC_015275	AAATT	2	10	52117	52126	60 %	40 %	0 %	0 %	326789179
37	NC_015275	AGGTA	2	10	52784	52793	40 %	20 %	40 %	0 %	326789180
38	NC_015275	TGGTT	2	10	53010	53019	0 %	60 %	40 %	0 %	326789180
39	NC_015275	TGGAC	2	10	54112	54121	20 %	20 %	40 %	20 %	326789181
40	NC_015275	ATACT	2	10	54280	54289	40 %	40 %	0 %	20 %	326789181
41	NC_015275	TTACC	2	10	57417	57426	20 %	40 %	0 %	40 %	326789182
42	NC_015275	GAGAA	2	10	57527	57536	60 %	0 %	40 %	0 %	326789182
43	NC_015275	TTATA	2	10	57869	57878	40 %	60 %	0 %	0 %	326789182
44	NC_015275	TTTGC	2	10	59880	59889	0 %	60 %	20 %	20 %	326789184
45	NC_015275	TTTAT	2	10	60750	60759	20 %	80 %	0 %	0 %	326789185
46	NC_015275	CCTTT	2	10	60833	60842	0 %	60 %	0 %	40 %	326789185
47	NC_015275	GAAAG	2	10	61287	61296	60 %	0 %	40 %	0 %	326789186
48	NC_015275	GTTTT	2	10	61439	61448	0 %	80 %	20 %	0 %	326789186
49	NC_015275	ATAAA	2	10	63756	63765	80 %	20 %	0 %	0 %	326789187
50	NC_015275	ATGCA	2	10	65121	65130	40 %	20 %	20 %	20 %	326789189
51	NC_015275	GAAAA	2	10	74440	74449	80 %	0 %	20 %	0 %	326789193
52	NC_015275	ATCAT	2	10	82030	82039	40 %	40 %	0 %	20 %	326789194
53	NC_015275	CTTTT	2	10	82142	82151	0 %	80 %	0 %	20 %	326789194
54	NC_015275	TGATT	2	10	82340	82349	20 %	60 %	20 %	0 %	326789194
55	NC_015275	TGATA	2	10	91457	91466	40 %	40 %	20 %	0 %	326789196
56	NC_015275	AAATG	2	10	91601	91610	60 %	20 %	20 %	0 %	326789196
57	NC_015275	AAATG	2	10	92596	92605	60 %	20 %	20 %	0 %	326789197
58	NC_015275	AGAAA	2	10	94141	94150	80 %	0 %	20 %	0 %	326789197
59	NC_015275	AAGAT	2	10	96298	96307	60 %	20 %	20 %	0 %	326789198
60	NC_015275	TGGAG	2	10	99163	99172	20 %	20 %	60 %	0 %	326789200
61	NC_015275	GCCAT	2	10	108374	108383	20 %	20 %	20 %	40 %	326789207
62	NC_015275	CTAGA	2	10	110381	110390	40 %	20 %	20 %	20 %	326789209
63	NC_015275	AGAGT	2	10	115210	115219	40 %	20 %	40 %	0 %	326789214
64	NC_015275	TCTAG	2	10	116095	116104	20 %	40 %	20 %	20 %	326789214
65	NC_015275	ATAAG	2	10	120605	120614	60 %	20 %	20 %	0 %	326789217
66	NC_015275	CAGAT	2	10	120995	121004	40 %	20 %	20 %	20 %	326789217
67	NC_015275	ATGAT	2	10	122432	122441	40 %	40 %	20 %	0 %	326789219
68	NC_015275	AGGGG	2	10	125632	125641	20 %	0 %	80 %	0 %	326789224
69	NC_015275	ATGAA	2	10	126331	126340	60 %	20 %	20 %	0 %	326789224
70	NC_015275	GATTG	2	10	128223	128232	20 %	40 %	40 %	0 %	326789225
71	NC_015275	TTAGT	2	10	133356	133365	20 %	60 %	20 %	0 %	326789231
72	NC_015275	ATTTG	2	10	133969	133978	20 %	60 %	20 %	0 %	326789232
73	NC_015275	AGTTA	2	10	135045	135054	40 %	40 %	20 %	0 %	326789232
74	NC_015275	CCATT	2	10	135463	135472	20 %	40 %	0 %	40 %	326789233
75	NC_015275	GATAT	2	10	138114	138123	40 %	40 %	20 %	0 %	326789234
76	NC_015275	ATACC	2	10	138396	138405	40 %	20 %	0 %	40 %	326789234
77	NC_015275	AAATT	2	10	139950	139959	60 %	40 %	0 %	0 %	326789236
78	NC_015275	GGAGT	2	10	140373	140382	20 %	20 %	60 %	0 %	326789236
79	NC_015275	AGAAA	2	10	140914	140923	80 %	0 %	20 %	0 %	326789237
80	NC_015275	TTTGA	2	10	147981	147990	20 %	60 %	20 %	0 %	326789238
81	NC_015275	GGTAT	2	10	149218	149227	20 %	40 %	40 %	0 %	326789239
82	NC_015275	AGTAA	2	10	149559	149568	60 %	20 %	20 %	0 %	326789240
83	NC_015275	AAAAG	2	10	149957	149966	80 %	0 %	20 %	0 %	326789240
84	NC_015275	CATGG	2	10	158394	158403	20 %	20 %	40 %	20 %	326789241
85	NC_015275	AAAGT	2	10	161197	161206	60 %	20 %	20 %	0 %	326789243
86	NC_015275	TAAAG	2	10	163469	163478	60 %	20 %	20 %	0 %	326789245
87	NC_015275	TTTAC	2	10	163554	163563	20 %	60 %	0 %	20 %	326789245
88	NC_015275	CCAGC	2	10	164361	164370	20 %	0 %	20 %	60 %	326789245
89	NC_015275	AAAGG	2	10	168927	168936	60 %	0 %	40 %	0 %	326789249
90	NC_015275	AATGA	2	10	176322	176331	60 %	20 %	20 %	0 %	326789252
91	NC_015275	GCGAA	2	10	176656	176665	40 %	0 %	40 %	20 %	326789252
92	NC_015275	TGATT	2	10	182010	182019	20 %	60 %	20 %	0 %	326789257
93	NC_015275	AGTAC	2	10	183037	183046	40 %	20 %	20 %	20 %	326789258
94	NC_015275	TATTT	2	10	183624	183633	20 %	80 %	0 %	0 %	326789258
95	NC_015275	CATTT	2	10	184605	184614	20 %	60 %	0 %	20 %	326789259
96	NC_015275	CATCT	2	10	185486	185495	20 %	40 %	0 %	40 %	326789260
97	NC_015275	AAAGG	2	10	187641	187650	60 %	0 %	40 %	0 %	326789262
98	NC_015275	TGAAC	2	10	187906	187915	40 %	20 %	20 %	20 %	326789262
99	NC_015275	AAGAA	2	10	189157	189166	80 %	0 %	20 %	0 %	326789264
100	NC_015275	AACGA	2	10	189720	189729	60 %	0 %	20 %	20 %	326789264
101	NC_015275	AGCTG	2	10	189803	189812	20 %	20 %	40 %	20 %	326789264
102	NC_015275	AGCTT	2	10	191322	191331	20 %	40 %	20 %	20 %	326789266
103	NC_015275	AGATG	2	10	192148	192157	40 %	20 %	40 %	0 %	326789266
104	NC_015275	GAGAA	2	10	193569	193578	60 %	0 %	40 %	0 %	326789268
105	NC_015275	GTATT	2	10	195406	195415	20 %	60 %	20 %	0 %	326789270
106	NC_015275	TAAAT	2	10	199171	199180	60 %	40 %	0 %	0 %	326789275
107	NC_015275	ATACT	2	10	199949	199958	40 %	40 %	0 %	20 %	326789276
108	NC_015275	TTTAT	2	10	199966	199975	20 %	80 %	0 %	0 %	326789276
109	NC_015275	ACAAG	2	10	200009	200018	60 %	0 %	20 %	20 %	326789276
110	NC_015275	ATTCT	2	10	200513	200522	20 %	60 %	0 %	20 %	326789276
111	NC_015275	AAAAG	2	10	200838	200847	80 %	0 %	20 %	0 %	326789276
112	NC_015275	AGTTA	2	10	201483	201492	40 %	40 %	20 %	0 %	326789277
113	NC_015275	ACTGA	2	10	201704	201713	40 %	20 %	20 %	20 %	326789277
114	NC_015275	TGACA	2	10	203311	203320	40 %	20 %	20 %	20 %	326789279
115	NC_015275	TGAGC	2	10	203375	203384	20 %	20 %	40 %	20 %	326789279
116	NC_015275	TAAAA	2	10	204133	204142	80 %	20 %	0 %	0 %	326789280
117	NC_015275	CATTT	2	10	206486	206495	20 %	60 %	0 %	20 %	326789282
118	NC_015275	TTATT	2	10	208375	208384	20 %	80 %	0 %	0 %	326789283
119	NC_015275	AAATG	2	10	208547	208556	60 %	20 %	20 %	0 %	326789283
120	NC_015275	TAGCT	2	10	208715	208724	20 %	40 %	20 %	20 %	326789283
121	NC_015275	AAAAG	2	10	210447	210456	80 %	0 %	20 %	0 %	326789285
122	NC_015275	TTTAT	2	10	210795	210804	20 %	80 %	0 %	0 %	326789285
123	NC_015275	TTTAG	2	10	211694	211703	20 %	60 %	20 %	0 %	326789285
124	NC_015275	ATTAA	2	10	215269	215278	60 %	40 %	0 %	0 %	326789289
125	NC_015275	TCACT	2	10	215363	215372	20 %	40 %	0 %	40 %	326789289
126	NC_015275	TTATT	2	10	217173	217182	20 %	80 %	0 %	0 %	326789291
127	NC_015275	TAGAA	2	10	224065	224074	60 %	20 %	20 %	0 %	326789298
128	NC_015275	TTTTA	2	10	224741	224750	20 %	80 %	0 %	0 %	326789298
129	NC_015275	AATTA	2	10	226741	226750	60 %	40 %	0 %	0 %	326789301
130	NC_015275	ATTCC	2	10	228068	228077	20 %	40 %	0 %	40 %	326789303
131	NC_015275	AAGAT	2	10	229826	229835	60 %	20 %	20 %	0 %	326789305
132	NC_015275	CAGGA	2	10	231095	231104	40 %	0 %	40 %	20 %	326789306
133	NC_015275	AAATC	2	10	231530	231539	60 %	20 %	0 %	20 %	326789306
134	NC_015275	TTTTA	2	10	232033	232042	20 %	80 %	0 %	0 %	326789307
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262	NC_015275	TTTTC	2	10	439767	439776	0 %	80 %	0 %	20 %	326789470
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