MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 95448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015275	TTTTAG	2	12	211545	211556	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	326789285
3502	NC_015275	TTC	2	6	211563	211568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789285
3503	NC_015275	CCA	2	6	211641	211646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326789285
3504	NC_015275	TTTAAG	2	12	211648	211659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	326789285
3505	NC_015275	TTTAG	2	10	211694	211703	20 %	60 %	20 %	0 %	326789285
3506	NC_015275	TAG	2	6	211743	211748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789285
3507	NC_015275	CTT	2	6	211804	211809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789285
3508	NC_015275	T	7	7	211812	211818	0 %	100 %	0 %	0 %	326789285
3509	NC_015275	ATT	2	6	211840	211845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789285
3510	NC_015275	TAG	2	6	211854	211859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789285
3511	NC_015275	ATT	2	6	211893	211898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789285
3512	NC_015275	TG	3	6	211900	211905	0 %	50 %	50 %	0 %	326789285
3513	NC_015275	TAG	2	6	211923	211928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789285
3514	NC_015275	TTA	2	6	212021	212026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789285
3515	NC_015275	AGA	2	6	212032	212037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789285
3516	NC_015275	TAC	2	6	212237	212242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789286
3517	NC_015275	GAC	2	6	212244	212249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789286
3518	NC_015275	GTA	2	6	212278	212283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789286
3519	NC_015275	TA	3	6	212300	212305	50 %	50 %	0 %	0 %	326789286
3520	NC_015275	AGTTAA	2	12	212309	212320	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	326789286
3521	NC_015275	ATG	2	6	212327	212332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789286
3522	NC_015275	TTAGCA	2	12	212341	212352	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	326789286
3523	NC_015275	GTGA	2	8	212458	212465	25 %	25 %	50 %	0 %	326789286
3524	NC_015275	ATT	2	6	212488	212493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789286
3525	NC_015275	A	6	6	212629	212634	100 %	0 %	0 %	0 %	326789286
3526	NC_015275	TTA	2	6	212639	212644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789286
3527	NC_015275	T	6	6	212645	212650	0 %	100 %	0 %	0 %	326789286
3528	NC_015275	GTT	2	6	212683	212688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789286
3529	NC_015275	ACC	2	6	212733	212738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326789286
3530	NC_015275	A	7	7	212779	212785	100 %	0 %	0 %	0 %	326789286
3531	NC_015275	GAA	2	6	212797	212802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789286
3532	NC_015275	A	7	7	212801	212807	100 %	0 %	0 %	0 %	326789286
3533	NC_015275	A	7	7	212879	212885	100 %	0 %	0 %	0 %	326789286
3534	NC_015275	A	6	6	212931	212936	100 %	0 %	0 %	0 %	326789286
3535	NC_015275	GCTAGA	2	12	212973	212984	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	326789286
3536	NC_015275	TGAT	2	8	213035	213042	25 %	50 %	25 %	0 %	326789286
3537	NC_015275	TAC	2	6	213061	213066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789286
3538	NC_015275	TTGT	2	8	213152	213159	0 %	75 %	25 %	0 %	326789286
3539	NC_015275	GAT	2	6	213166	213171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789286
3540	NC_015275	AAG	2	6	213191	213196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789286
3541	NC_015275	ATC	2	6	213260	213265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789286
3542	NC_015275	TAG	2	6	213318	213323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789286
3543	NC_015275	TAA	2	6	213372	213377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789286
3544	NC_015275	ATG	2	6	213401	213406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789286
3545	NC_015275	CTC	2	6	213490	213495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326789287
3546	NC_015275	TCA	2	6	213511	213516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789287
3547	NC_015275	TGG	2	6	213568	213573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789287
3548	NC_015275	TTG	2	6	213611	213616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789287
3549	NC_015275	TAT	2	6	213638	213643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789287
3550	NC_015275	TAT	2	6	213648	213653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789287
3551	NC_015275	GTT	2	6	213654	213659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789287
3552	NC_015275	ACA	2	6	213862	213867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789288
3553	NC_015275	ATTT	3	12	213924	213935	25 %	75 %	0 %	0 %	326789288
3554	NC_015275	TCT	2	6	214025	214030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789288
3555	NC_015275	TTC	2	6	214065	214070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789288
3556	NC_015275	TCA	2	6	214141	214146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789288
3557	NC_015275	GAG	2	6	214199	214204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789288
3558	NC_015275	TGA	2	6	214246	214251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789288
3559	NC_015275	TTAT	2	8	214281	214288	25 %	75 %	0 %	0 %	326789288
3560	NC_015275	AAAG	2	8	214328	214335	75 %	0 %	25 %	0 %	326789288
3561	NC_015275	TA	3	6	214383	214388	50 %	50 %	0 %	0 %	326789288
3562	NC_015275	CAT	2	6	214391	214396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789288
3563	NC_015275	AGA	2	6	214435	214440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789288
3564	NC_015275	AGG	2	6	214494	214499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789288
3565	NC_015275	A	7	7	214520	214526	100 %	0 %	0 %	0 %	326789288
3566	NC_015275	AGC	2	6	214546	214551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789288
3567	NC_015275	AGT	2	6	214552	214557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789288
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3569	NC_015275	CTCA	2	8	214700	214707	25 %	25 %	0 %	50 %	326789288
3570	NC_015275	A	6	6	214756	214761	100 %	0 %	0 %	0 %	326789288
3571	NC_015275	CTT	2	6	214983	214988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789289
3572	NC_015275	TCA	2	6	215101	215106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789289
3573	NC_015275	GTT	2	6	215135	215140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789289
3574	NC_015275	CGC	2	6	215195	215200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326789289
3575	NC_015275	TAT	2	6	215238	215243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789289
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3577	NC_015275	A	7	7	215277	215283	100 %	0 %	0 %	0 %	326789289
3578	NC_015275	CTT	2	6	215315	215320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789289
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3580	NC_015275	TCA	2	6	215353	215358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789289
3581	NC_015275	TCACT	2	10	215363	215372	20 %	40 %	0 %	40 %	326789289
3582	NC_015275	GATA	2	8	215373	215380	50 %	25 %	25 %	0 %	326789289
3583	NC_015275	GCTT	2	8	215499	215506	0 %	50 %	25 %	25 %	326789289
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3586	NC_015275	AGC	2	6	215767	215772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789290
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3588	NC_015275	TA	3	6	215928	215933	50 %	50 %	0 %	0 %	326789290
3589	NC_015275	TAA	2	6	215962	215967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789290
3590	NC_015275	ATT	2	6	215984	215989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789290
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3592	NC_015275	AAG	2	6	216100	216105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789290
3593	NC_015275	AT	3	6	216196	216201	50 %	50 %	0 %	0 %	326789290
3594	NC_015275	ATT	2	6	216206	216211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789290
3595	NC_015275	TAG	2	6	216240	216245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789290
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3599	NC_015275	AATG	2	8	216400	216407	50 %	25 %	25 %	0 %	326789290
3600	NC_015275	TTA	2	6	216430	216435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789290
3601	NC_015275	GAAG	2	8	216458	216465	50 %	0 %	50 %	0 %	326789290
3602	NC_015275	GAT	2	6	216472	216477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789290
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3604	NC_015275	AAGA	2	8	216612	216619	75 %	0 %	25 %	0 %	326789291
3605	NC_015275	AAT	2	6	216665	216670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789291
3606	NC_015275	CTA	2	6	216675	216680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789291
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3609	NC_015275	CAT	2	6	216856	216861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789291
3610	NC_015275	TAAAAG	2	12	216874	216885	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	326789291
3611	NC_015275	CTT	2	6	216966	216971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789291
3612	NC_015275	TCT	2	6	216986	216991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789291
3613	NC_015275	TAA	2	6	217002	217007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789291
3614	NC_015275	CAG	3	9	217038	217046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789291
3615	NC_015275	GAAA	2	8	217158	217165	75 %	0 %	25 %	0 %	326789291
3616	NC_015275	TTATT	2	10	217173	217182	20 %	80 %	0 %	0 %	326789291
3617	NC_015275	AGA	2	6	217240	217245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789291
3618	NC_015275	T	6	6	217252	217257	0 %	100 %	0 %	0 %	326789291
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3989	NC_015275	CTT	2	6	236592	236597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789311
3990	NC_015275	T	6	6	236620	236625	0 %	100 %	0 %	0 %	326789311
3991	NC_015275	T	6	6	236742	236747	0 %	100 %	0 %	0 %	326789311
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