MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 95448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015275	CTG	2	6	185298	185303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789260
3002	NC_015275	TA	3	6	185315	185320	50 %	50 %	0 %	0 %	326789260
3003	NC_015275	TGA	2	6	185344	185349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789260
3004	NC_015275	GTAA	2	8	185352	185359	50 %	25 %	25 %	0 %	326789260
3005	NC_015275	CCT	2	6	185375	185380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326789260
3006	NC_015275	AATAAA	2	12	185393	185404	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	326789260
3007	NC_015275	TAT	2	6	185431	185436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789260
3008	NC_015275	CATCT	2	10	185486	185495	20 %	40 %	0 %	40 %	326789260
3009	NC_015275	CAA	2	6	185539	185544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789260
3010	NC_015275	GCA	2	6	185601	185606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789260
3011	NC_015275	AAT	2	6	185627	185632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789260
3012	NC_015275	CAA	2	6	185697	185702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789260
3013	NC_015275	TA	4	8	185725	185732	50 %	50 %	0 %	0 %	326789260
3014	NC_015275	GTAA	2	8	185741	185748	50 %	25 %	25 %	0 %	326789260
3015	NC_015275	AGG	2	6	185766	185771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789260
3016	NC_015275	AAT	2	6	185801	185806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789260
3017	NC_015275	TAAG	2	8	185861	185868	50 %	25 %	25 %	0 %	326789260
3018	NC_015275	CTA	2	6	185938	185943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789260
3019	NC_015275	AAAG	2	8	185969	185976	75 %	0 %	25 %	0 %	326789260
3020	NC_015275	CTT	2	6	186033	186038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789261
3021	NC_015275	TAG	2	6	186041	186046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789261
3022	NC_015275	ATA	2	6	186060	186065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789261
3023	NC_015275	TAA	2	6	186152	186157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789261
3024	NC_015275	TTC	2	6	186168	186173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789261
3025	NC_015275	TAA	2	6	186188	186193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789261
3026	NC_015275	GTT	2	6	186262	186267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789261
3027	NC_015275	GCA	2	6	186358	186363	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789261
3028	NC_015275	CAG	2	6	186416	186421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789261
3029	NC_015275	ATC	2	6	186447	186452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789261
3030	NC_015275	TCT	2	6	186460	186465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789261
3031	NC_015275	ATA	2	6	186496	186501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789261
3032	NC_015275	AGT	2	6	186519	186524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789261
3033	NC_015275	ATG	2	6	186531	186536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789261
3034	NC_015275	CT	3	6	186609	186614	0 %	50 %	0 %	50 %	326789261
3035	NC_015275	TCT	2	6	186637	186642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789261
3036	NC_015275	TAC	2	6	186657	186662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789261
3037	NC_015275	A	6	6	186747	186752	100 %	0 %	0 %	0 %	326789261
3038	NC_015275	ACT	2	6	186756	186761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789261
3039	NC_015275	GTA	2	6	186799	186804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789261
3040	NC_015275	GATA	2	8	186815	186822	50 %	25 %	25 %	0 %	326789261
3041	NC_015275	CT	3	6	186824	186829	0 %	50 %	0 %	50 %	326789261
3042	NC_015275	T	7	7	186864	186870	0 %	100 %	0 %	0 %	326789261
3043	NC_015275	CGG	2	6	186917	186922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326789261
3044	NC_015275	TAG	2	6	186953	186958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789261
3045	NC_015275	ATA	2	6	187129	187134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789261
3046	NC_015275	TCC	2	6	187167	187172	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326789262
3047	NC_015275	AGGTAC	2	12	187181	187192	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	326789262
3048	NC_015275	TAA	2	6	187199	187204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789262
3049	NC_015275	CAT	2	6	187303	187308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789262
3050	NC_015275	CTA	2	6	187435	187440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789262
3051	NC_015275	GCT	2	6	187482	187487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	326789262
3052	NC_015275	ACA	2	6	187515	187520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789262
3053	NC_015275	ATTT	2	8	187568	187575	25 %	75 %	0 %	0 %	326789262
3054	NC_015275	A	7	7	187613	187619	100 %	0 %	0 %	0 %	326789262
3055	NC_015275	AAAGG	2	10	187641	187650	60 %	0 %	40 %	0 %	326789262
3056	NC_015275	TCC	2	6	187740	187745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326789262
3057	NC_015275	TCA	2	6	187794	187799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789262
3058	NC_015275	TAA	2	6	187802	187807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789262
3059	NC_015275	TG	3	6	187812	187817	0 %	50 %	50 %	0 %	326789262
3060	NC_015275	GAAG	2	8	187887	187894	50 %	0 %	50 %	0 %	326789262
3061	NC_015275	TGAAC	2	10	187906	187915	40 %	20 %	20 %	20 %	326789262
3062	NC_015275	TGCCAG	2	12	187969	187980	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	326789262
3063	NC_015275	TAA	2	6	188056	188061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789262
3064	NC_015275	T	6	6	188453	188458	0 %	100 %	0 %	0 %	326789263
3065	NC_015275	TTC	2	6	188615	188620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789263
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3067	NC_015275	TAG	2	6	188716	188721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789263
3068	NC_015275	GTGG	2	8	188724	188731	0 %	25 %	75 %	0 %	326789263
3069	NC_015275	TAA	2	6	188761	188766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789263
3070	NC_015275	ATA	2	6	188775	188780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789263
3071	NC_015275	CCA	2	6	189088	189093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326789264
3072	NC_015275	CAA	2	6	189124	189129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789264
3073	NC_015275	AAGAA	2	10	189157	189166	80 %	0 %	20 %	0 %	326789264
3074	NC_015275	CAG	2	6	189170	189175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789264
3075	NC_015275	TCT	2	6	189220	189225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789264
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3077	NC_015275	TAA	2	6	189330	189335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789264
3078	NC_015275	ATAC	2	8	189337	189344	50 %	25 %	0 %	25 %	326789264
3079	NC_015275	GTT	2	6	189360	189365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789264
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3083	NC_015275	AATA	2	8	189579	189586	75 %	25 %	0 %	0 %	326789264
3084	NC_015275	TAGAGT	2	12	189617	189628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789264
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3087	NC_015275	AACGA	2	10	189720	189729	60 %	0 %	20 %	20 %	326789264
3088	NC_015275	TAA	2	6	189749	189754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789264
3089	NC_015275	TCT	2	6	189766	189771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789264
3090	NC_015275	AGCTG	2	10	189803	189812	20 %	20 %	40 %	20 %	326789264
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3094	NC_015275	TTTG	2	8	189982	189989	0 %	75 %	25 %	0 %	326789264
3095	NC_015275	AAT	2	6	190016	190021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789264
3096	NC_015275	TAA	2	6	190025	190030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789264
3097	NC_015275	TAG	2	6	190109	190114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789265
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3099	NC_015275	CTT	2	6	190122	190127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789265
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3101	NC_015275	AGG	2	6	190179	190184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789265
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3103	NC_015275	AG	3	6	190224	190229	50 %	0 %	50 %	0 %	326789265
3104	NC_015275	TTTC	2	8	190233	190240	0 %	75 %	0 %	25 %	326789265
3105	NC_015275	TTC	2	6	190252	190257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789265
3106	NC_015275	ATG	2	6	190325	190330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789265
3107	NC_015275	CTA	2	6	190358	190363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789265
3108	NC_015275	TAA	2	6	190968	190973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789266
3109	NC_015275	GAA	2	6	191020	191025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789266
3110	NC_015275	GCG	2	6	191159	191164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	326789266
3111	NC_015275	TAG	2	6	191169	191174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789266
3112	NC_015275	AAAG	2	8	191204	191211	75 %	0 %	25 %	0 %	326789266
3113	NC_015275	TC	3	6	191212	191217	0 %	50 %	0 %	50 %	326789266
3114	NC_015275	AGA	2	6	191242	191247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789266
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3117	NC_015275	AGCTT	2	10	191322	191331	20 %	40 %	20 %	20 %	326789266
3118	NC_015275	ATT	2	6	191346	191351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789266
3119	NC_015275	A	7	7	191445	191451	100 %	0 %	0 %	0 %	326789266
3120	NC_015275	AGT	2	6	191492	191497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789266
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