MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 95448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015275	AGGT	2	8	158432	158439	25 %	25 %	50 %	0 %	326789241
2502	NC_015275	AGA	2	6	158457	158462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789241
2503	NC_015275	AAC	2	6	158469	158474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789241
2504	NC_015275	GAAATT	2	12	158842	158853	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	326789242
2505	NC_015275	A	6	6	158858	158863	100 %	0 %	0 %	0 %	326789242
2506	NC_015275	A	6	6	158871	158876	100 %	0 %	0 %	0 %	326789242
2507	NC_015275	TTA	2	6	158888	158893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789242
2508	NC_015275	TGT	2	6	158896	158901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789242
2509	NC_015275	TTC	2	6	158911	158916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789242
2510	NC_015275	ACA	2	6	158942	158947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789242
2511	NC_015275	GTA	2	6	158948	158953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789242
2512	NC_015275	GAT	2	6	158978	158983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789242
2513	NC_015275	TGAA	2	8	158997	159004	50 %	25 %	25 %	0 %	326789242
2514	NC_015275	AAG	2	6	159015	159020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789242
2515	NC_015275	AAC	2	6	159105	159110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789242
2516	NC_015275	TA	3	6	159168	159173	50 %	50 %	0 %	0 %	326789242
2517	NC_015275	AAC	2	6	159284	159289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789242
2518	NC_015275	CAA	2	6	159299	159304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789242
2519	NC_015275	TGTAGG	2	12	159322	159333	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	326789242
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2521	NC_015275	A	6	6	159508	159513	100 %	0 %	0 %	0 %	326789242
2522	NC_015275	ATT	2	6	159560	159565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789242
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2524	NC_015275	A	6	6	159676	159681	100 %	0 %	0 %	0 %	326789242
2525	NC_015275	CTA	2	6	159699	159704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789242
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2529	NC_015275	GA	3	6	159885	159890	50 %	0 %	50 %	0 %	326789242
2530	NC_015275	AGA	2	6	159898	159903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789242
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2533	NC_015275	ATGG	2	8	160132	160139	25 %	25 %	50 %	0 %	326789242
2534	NC_015275	GAA	2	6	160169	160174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789242
2535	NC_015275	TAG	2	6	160185	160190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789242
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2537	NC_015275	TGCT	2	8	160294	160301	0 %	50 %	25 %	25 %	326789242
2538	NC_015275	CAG	2	6	160332	160337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789242
2539	NC_015275	TTA	2	6	160354	160359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789242
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2541	NC_015275	GGT	2	6	160391	160396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789242
2542	NC_015275	TGA	2	6	160456	160461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789242
2543	NC_015275	TGG	2	6	160481	160486	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789242
2544	NC_015275	GAA	2	6	160511	160516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789242
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2547	NC_015275	CTTT	2	8	160674	160681	0 %	75 %	0 %	25 %	326789242
2548	NC_015275	ATC	2	6	160711	160716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789242
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2550	NC_015275	ATG	2	6	160818	160823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789242
2551	NC_015275	AAG	2	6	160827	160832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789242
2552	NC_015275	AGA	2	6	160855	160860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789242
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2555	NC_015275	CTT	2	6	160927	160932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789243
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2557	NC_015275	AGA	3	9	160959	160967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789243
2558	NC_015275	GA	3	6	160966	160971	50 %	0 %	50 %	0 %	326789243
2559	NC_015275	AAT	2	6	160972	160977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789243
2560	NC_015275	AAG	2	6	161035	161040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789243
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2562	NC_015275	AAAGT	2	10	161197	161206	60 %	20 %	20 %	0 %	326789243
2563	NC_015275	TAC	2	6	161220	161225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789243
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2571	NC_015275	CTA	2	6	162071	162076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789244
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2573	NC_015275	TAG	2	6	162102	162107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789244
2574	NC_015275	TAC	2	6	162174	162179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789244
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2584	NC_015275	TATT	2	8	162488	162495	25 %	75 %	0 %	0 %	326789244
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2588	NC_015275	GATA	2	8	162782	162789	50 %	25 %	25 %	0 %	326789245
2589	NC_015275	CTT	2	6	162799	162804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789245
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2592	NC_015275	TG	3	6	162870	162875	0 %	50 %	50 %	0 %	326789245
2593	NC_015275	TTC	2	6	162906	162911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789245
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2596	NC_015275	AT	3	6	162978	162983	50 %	50 %	0 %	0 %	326789245
2597	NC_015275	ATT	2	6	163070	163075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789245
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2601	NC_015275	GTT	2	6	163295	163300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789245
2602	NC_015275	AGG	2	6	163349	163354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789245
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2604	NC_015275	CCG	2	6	163416	163421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	326789245
2605	NC_015275	TTA	2	6	163422	163427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789245
2606	NC_015275	TAAAG	2	10	163469	163478	60 %	20 %	20 %	0 %	326789245
2607	NC_015275	TTA	2	6	163485	163490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789245
2608	NC_015275	CAT	2	6	163534	163539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789245
2609	NC_015275	TTTAC	2	10	163554	163563	20 %	60 %	0 %	20 %	326789245
2610	NC_015275	GTAA	2	8	163595	163602	50 %	25 %	25 %	0 %	326789245
2611	NC_015275	TAC	2	6	163619	163624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789245
2612	NC_015275	GTA	2	6	163656	163661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789245
2613	NC_015275	ATA	3	9	163668	163676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789245
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2615	NC_015275	ACC	2	6	163763	163768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	326789245
2616	NC_015275	TTGG	2	8	163797	163804	0 %	50 %	50 %	0 %	326789245
2617	NC_015275	ATT	2	6	163808	163813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789245
2618	NC_015275	CGAT	2	8	163863	163870	25 %	25 %	25 %	25 %	326789245
2619	NC_015275	ATT	2	6	163961	163966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789245
2620	NC_015275	TTC	2	6	164002	164007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789245
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2622	NC_015275	TCA	2	6	164073	164078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789245
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2990	NC_015275	CCT	2	6	185017	185022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326789260
2991	NC_015275	TCA	2	6	185031	185036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789260
2992	NC_015275	CTT	2	6	185062	185067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789260
2993	NC_015275	TAA	2	6	185119	185124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789260
2994	NC_015275	AT	3	6	185145	185150	50 %	50 %	0 %	0 %	326789260
2995	NC_015275	AAG	2	6	185156	185161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789260
2996	NC_015275	ATA	2	6	185178	185183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789260
2997	NC_015275	TAG	3	9	185212	185220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789260
2998	NC_015275	CTA	2	6	185227	185232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789260
2999	NC_015275	TAA	2	6	185239	185244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789260
3000	NC_015275	ATC	2	6	185276	185281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789260

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