MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Clostridium lentocellum DSM 5427 chromosome

Total Repeats: 95448

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_015275	CTT	2	6	288543	288548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789350
5003	NC_015275	TCC	2	6	288576	288581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326789351
5004	NC_015275	GTA	2	6	288586	288591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789351
5005	NC_015275	ATA	2	6	288595	288600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789351
5006	NC_015275	GA	3	6	288611	288616	50 %	0 %	50 %	0 %	326789351
5007	NC_015275	ACA	2	6	288679	288684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789351
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5009	NC_015275	ATC	2	6	288765	288770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789351
5010	NC_015275	AAT	2	6	288789	288794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789351
5011	NC_015275	ATG	2	6	288889	288894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789351
5012	NC_015275	C	6	6	288909	288914	0 %	0 %	0 %	100 %	326789351
5013	NC_015275	AAC	2	6	288951	288956	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789351
5014	NC_015275	AGA	2	6	288987	288992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789351
5015	NC_015275	GAT	2	6	288993	288998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789351
5016	NC_015275	TCA	2	6	289006	289011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789351
5017	NC_015275	AAT	2	6	289092	289097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789351
5018	NC_015275	TTC	2	6	289113	289118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789351
5019	NC_015275	AAG	2	6	289182	289187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789351
5020	NC_015275	C	6	6	289212	289217	0 %	0 %	0 %	100 %	326789351
5021	NC_015275	ATA	2	6	289228	289233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789351
5022	NC_015275	AGC	2	6	289284	289289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	326789351
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5024	NC_015275	ATA	2	6	289369	289374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789351
5025	NC_015275	AAG	2	6	289452	289457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789351
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5030	NC_015275	TCT	2	6	289585	289590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	326789351
5031	NC_015275	TAA	2	6	289592	289597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789351
5032	NC_015275	T	6	6	289659	289664	0 %	100 %	0 %	0 %	326789351
5033	NC_015275	ACA	2	6	289674	289679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	326789351
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5036	NC_015275	GTT	2	6	289797	289802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789351
5037	NC_015275	TTG	2	6	289828	289833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	326789351
5038	NC_015275	AAT	3	9	289905	289913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789351
5039	NC_015275	AT	3	6	290195	290200	50 %	50 %	0 %	0 %	326789352
5040	NC_015275	TTA	2	6	290202	290207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789352
5041	NC_015275	TAG	2	6	290251	290256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789352
5042	NC_015275	AAG	2	6	290314	290319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789352
5043	NC_015275	GTG	2	6	290424	290429	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	326789352
5044	NC_015275	TAA	2	6	290432	290437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789352
5045	NC_015275	TA	3	6	290515	290520	50 %	50 %	0 %	0 %	326789352
5046	NC_015275	AAAT	2	8	290524	290531	75 %	25 %	0 %	0 %	326789352
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5053	NC_015275	TTTA	2	8	290707	290714	25 %	75 %	0 %	0 %	326789352
5054	NC_015275	CCT	2	6	290794	290799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	326789352
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5056	NC_015275	TGA	2	6	290879	290884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789352
5057	NC_015275	ATT	2	6	290889	290894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789352
5058	NC_015275	AAT	2	6	290895	290900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789352
5059	NC_015275	ATGCTA	2	12	290937	290948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	326789352
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5061	NC_015275	A	7	7	290999	291005	100 %	0 %	0 %	0 %	326789352
5062	NC_015275	AGT	2	6	291020	291025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789352
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5070	NC_015275	ATAGC	2	10	292709	292718	40 %	20 %	20 %	20 %	326789353
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5072	NC_015275	TAGT	2	8	292769	292776	25 %	50 %	25 %	0 %	326789353
5073	NC_015275	TATT	2	8	292817	292824	25 %	75 %	0 %	0 %	326789353
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5094	NC_015275	AGATG	2	10	294020	294029	40 %	20 %	40 %	0 %	326789355
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5098	NC_015275	CAAG	2	8	294118	294125	50 %	0 %	25 %	25 %	326789355
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5101	NC_015275	TAGCT	2	10	294227	294236	20 %	40 %	20 %	20 %	326789355
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5104	NC_015275	ATTTT	2	10	294366	294375	20 %	80 %	0 %	0 %	326789355
5105	NC_015275	TATGA	2	10	294447	294456	40 %	40 %	20 %	0 %	326789355
5106	NC_015275	TAC	2	6	294491	294496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	326789355
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5109	NC_015275	TC	3	6	294576	294581	0 %	50 %	0 %	50 %	326789355
5110	NC_015275	GAG	2	6	294630	294635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	326789355
5111	NC_015275	TA	3	6	294645	294650	50 %	50 %	0 %	0 %	326789355
5112	NC_015275	TAA	2	6	294719	294724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789355
5113	NC_015275	AG	3	6	294767	294772	50 %	0 %	50 %	0 %	326789355
5114	NC_015275	AAG	2	6	294793	294798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789355
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5117	NC_015275	GTGAT	2	10	294889	294898	20 %	40 %	40 %	0 %	326789355
5118	NC_015275	GAA	2	6	294924	294929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	326789355
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5120	NC_015275	ATT	2	6	295114	295119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	326789355
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5492	NC_015275	TAA	2	6	313545	313550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	326789367
5493	NC_015275	GGAAT	2	10	313551	313560	40 %	20 %	40 %	0 %	326789367
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5496	NC_015275	ATG	2	6	313718	313723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789367
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5500	NC_015275	TGA	2	6	314097	314102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	326789367

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