MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 chromosome

Total Repeats: 33117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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33002	NC_014802	ACA	3	9	1657946	1657954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315125105
33003	NC_014802	CAT	2	6	1657999	1658004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125105
33004	NC_014802	A	7	7	1658219	1658225	100 %	0 %	0 %	0 %	315125106
33005	NC_014802	GAA	2	6	1658303	1658308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315125106
33006	NC_014802	TGA	2	6	1658332	1658337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315125106
33007	NC_014802	AGC	3	9	1658356	1658364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315125106
33008	NC_014802	T	6	6	1658380	1658385	0 %	100 %	0 %	0 %	315125106
33009	NC_014802	AGT	2	6	1658473	1658478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315125106
33010	NC_014802	ATG	2	6	1658514	1658519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315125106
33011	NC_014802	ATC	2	6	1658549	1658554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125106
33012	NC_014802	CAAA	2	8	1658568	1658575	75 %	0 %	0 %	25 %	315125106
33013	NC_014802	ACCAAA	2	12	1658623	1658634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315125106
33014	NC_014802	AAG	2	6	1658673	1658678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315125106
33015	NC_014802	GCA	2	6	1658687	1658692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315125106
33016	NC_014802	AGC	2	6	1658749	1658754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315125106
33017	NC_014802	CTA	2	6	1658808	1658813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125106
33018	NC_014802	ATC	2	6	1658825	1658830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125107
33019	NC_014802	CAT	2	6	1658858	1658863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125107
33020	NC_014802	ATA	2	6	1658934	1658939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315125107
33021	NC_014802	TAAAA	2	10	1659015	1659024	80 %	20 %	0 %	0 %	315125107
33022	NC_014802	TAA	2	6	1659042	1659047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315125107
33023	NC_014802	T	7	7	1659059	1659065	0 %	100 %	0 %	0 %	315125107
33024	NC_014802	AGC	2	6	1659270	1659275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315125107
33025	NC_014802	CAA	2	6	1659286	1659291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315125107
33026	NC_014802	A	6	6	1659322	1659327	100 %	0 %	0 %	0 %	315125107
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33028	NC_014802	T	6	6	1659423	1659428	0 %	100 %	0 %	0 %	315125107
33029	NC_014802	T	8	8	1659572	1659579	0 %	100 %	0 %	0 %	315125107
33030	NC_014802	AAT	2	6	1659696	1659701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315125107
33031	NC_014802	T	6	6	1659710	1659715	0 %	100 %	0 %	0 %	315125107
33032	NC_014802	ATC	2	6	1659830	1659835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125108
33033	NC_014802	TAG	2	6	1659865	1659870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315125108
33034	NC_014802	TTC	3	9	1659896	1659904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315125108
33035	NC_014802	AGT	2	6	1659920	1659925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315125108
33036	NC_014802	GGAT	2	8	1659933	1659940	25 %	25 %	50 %	0 %	315125108
33037	NC_014802	GCA	2	6	1659969	1659974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315125108
33038	NC_014802	TTC	2	6	1660003	1660008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315125108
33039	NC_014802	T	6	6	1660073	1660078	0 %	100 %	0 %	0 %	315125108
33040	NC_014802	AAAT	2	8	1660079	1660086	75 %	25 %	0 %	0 %	315125108
33041	NC_014802	A	6	6	1660149	1660154	100 %	0 %	0 %	0 %	315125108
33042	NC_014802	AGCT	2	8	1660249	1660256	25 %	25 %	25 %	25 %	315125108
33043	NC_014802	TGA	3	9	1660276	1660284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315125108
33044	NC_014802	TATC	2	8	1660365	1660372	25 %	50 %	0 %	25 %	315125108
33045	NC_014802	TCTTT	2	10	1660398	1660407	0 %	80 %	0 %	20 %	315125108
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33048	NC_014802	T	6	6	1660570	1660575	0 %	100 %	0 %	0 %	315125108
33049	NC_014802	A	7	7	1660617	1660623	100 %	0 %	0 %	0 %	315125108
33050	NC_014802	ATC	2	6	1660667	1660672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125108
33051	NC_014802	GT	3	6	1660711	1660716	0 %	50 %	50 %	0 %	315125108
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33054	NC_014802	TGC	2	6	1660940	1660945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315125108
33055	NC_014802	AT	3	6	1660985	1660990	50 %	50 %	0 %	0 %	315125108
33056	NC_014802	CTT	2	6	1661004	1661009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315125108
33057	NC_014802	T	6	6	1661065	1661070	0 %	100 %	0 %	0 %	315125108
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33059	NC_014802	ATA	2	6	1661577	1661582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315125109
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33062	NC_014802	CTA	2	6	1661671	1661676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125109
33063	NC_014802	CCA	2	6	1661715	1661720	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315125109
33064	NC_014802	TTG	2	6	1661954	1661959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315125109
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33066	NC_014802	CAT	2	6	1662025	1662030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125109
33067	NC_014802	GAT	2	6	1662053	1662058	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315125109
33068	NC_014802	ATT	2	6	1662059	1662064	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315125109
33069	NC_014802	CTG	2	6	1662091	1662096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315125109
33070	NC_014802	TAT	2	6	1662110	1662115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315125109
33071	NC_014802	CATT	2	8	1662123	1662130	25 %	50 %	0 %	25 %	315125109
33072	NC_014802	ACC	2	6	1662131	1662136	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315125109
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33077	NC_014802	GGT	2	6	1662375	1662380	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315125109
33078	NC_014802	CAT	2	6	1662508	1662513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125109
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33084	NC_014802	TA	3	6	1662772	1662777	50 %	50 %	0 %	0 %	315125109
33085	NC_014802	TTA	2	6	1662793	1662798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315125109
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33089	NC_014802	TAAA	2	8	1663339	1663346	75 %	25 %	0 %	0 %	315125109
33090	NC_014802	GCA	2	6	1663347	1663352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315125109
33091	NC_014802	T	6	6	1663386	1663391	0 %	100 %	0 %	0 %	315125109
33092	NC_014802	TCATTT	2	12	1663422	1663433	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	315125109
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33094	NC_014802	T	6	6	1663448	1663453	0 %	100 %	0 %	0 %	315125109
33095	NC_014802	AT	3	6	1663481	1663486	50 %	50 %	0 %	0 %	315125109
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33097	NC_014802	CTAT	2	8	1663611	1663618	25 %	50 %	0 %	25 %	315125109
33098	NC_014802	ACA	2	6	1663653	1663658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315125109
33099	NC_014802	ATT	2	6	1663667	1663672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315125109
33100	NC_014802	C	6	6	1663733	1663738	0 %	0 %	0 %	100 %	315125109
33101	NC_014802	ATC	2	6	1663739	1663744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125109
33102	NC_014802	A	7	7	1663754	1663760	100 %	0 %	0 %	0 %	315125109
33103	NC_014802	TGAAC	2	10	1663803	1663812	40 %	20 %	20 %	20 %	315125109
33104	NC_014802	GAAT	2	8	1663818	1663825	50 %	25 %	25 %	0 %	315125109
33105	NC_014802	TTA	2	6	1663986	1663991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315125109
33106	NC_014802	CATC	2	8	1663999	1664006	25 %	25 %	0 %	50 %	315125109
33107	NC_014802	TCA	2	6	1664053	1664058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125109
33108	NC_014802	TGC	2	6	1664284	1664289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315125110
33109	NC_014802	T	6	6	1664416	1664421	0 %	100 %	0 %	0 %	315125110
33110	NC_014802	GAA	2	6	1664463	1664468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315125110
33111	NC_014802	A	6	6	1664530	1664535	100 %	0 %	0 %	0 %	315125110
33112	NC_014802	TCT	2	6	1664540	1664545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315125110
33113	NC_014802	TCA	2	6	1664555	1664560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315125110
33114	NC_014802	CTTTAT	2	12	1664632	1664643	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	315125110
33115	NC_014802	T	6	6	1664666	1664671	0 %	100 %	0 %	0 %	315125110
33116	NC_014802	AAAAT	2	10	1664755	1664764	80 %	20 %	0 %	0 %	315125110
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.