MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 chromosome

Total Repeats: 33117

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_014802	CTT	2	6	245738	245743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315123842
5002	NC_014802	GATT	2	8	245759	245766	25 %	50 %	25 %	0 %	315123842
5003	NC_014802	AAAG	2	8	245853	245860	75 %	0 %	25 %	0 %	315123842
5004	NC_014802	T	7	7	246318	246324	0 %	100 %	0 %	0 %	315123843
5005	NC_014802	GAT	2	6	246333	246338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123843
5006	NC_014802	CTTT	2	8	246348	246355	0 %	75 %	0 %	25 %	315123843
5007	NC_014802	TTTC	2	8	246391	246398	0 %	75 %	0 %	25 %	315123843
5008	NC_014802	T	7	7	246479	246485	0 %	100 %	0 %	0 %	315123843
5009	NC_014802	ATTG	2	8	246506	246513	25 %	50 %	25 %	0 %	315123843
5010	NC_014802	TCC	2	6	246605	246610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315123843
5011	NC_014802	GCTATA	2	12	246762	246773	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	315123843
5012	NC_014802	A	6	6	246846	246851	100 %	0 %	0 %	0 %	315123843
5013	NC_014802	TATT	2	8	246857	246864	25 %	75 %	0 %	0 %	315123843
5014	NC_014802	TTG	2	6	246901	246906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315123843
5015	NC_014802	TGA	2	6	246995	247000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123843
5016	NC_014802	AAT	2	6	247070	247075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315123843
5017	NC_014802	TG	3	6	247208	247213	0 %	50 %	50 %	0 %	315123844
5018	NC_014802	TCA	2	6	247350	247355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123844
5019	NC_014802	AC	3	6	247396	247401	50 %	0 %	0 %	50 %	315123844
5020	NC_014802	T	6	6	247416	247421	0 %	100 %	0 %	0 %	315123844
5021	NC_014802	T	7	7	247430	247436	0 %	100 %	0 %	0 %	315123844
5022	NC_014802	CT	3	6	247463	247468	0 %	50 %	0 %	50 %	315123844
5023	NC_014802	TG	3	6	247499	247504	0 %	50 %	50 %	0 %	315123844
5024	NC_014802	CTT	2	6	247561	247566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315123844
5025	NC_014802	ATC	2	6	247622	247627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123844
5026	NC_014802	ATAATT	2	12	247628	247639	50 %	50 %	0 %	0 %	315123844
5027	NC_014802	TCT	2	6	247704	247709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315123844
5028	NC_014802	TTC	2	6	247787	247792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315123844
5029	NC_014802	GGT	2	6	247808	247813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315123844
5030	NC_014802	GTTT	2	8	247836	247843	0 %	75 %	25 %	0 %	315123844
5031	NC_014802	GTA	2	6	247856	247861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123844
5032	NC_014802	TGA	2	6	247867	247872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123844
5033	NC_014802	T	6	6	247883	247888	0 %	100 %	0 %	0 %	315123844
5034	NC_014802	ATC	2	6	247958	247963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123844
5035	NC_014802	AAT	2	6	248020	248025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315123844
5036	NC_014802	ATC	2	6	248042	248047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123844
5037	NC_014802	ATA	2	6	248076	248081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315123844
5038	NC_014802	TGA	2	6	248172	248177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123844
5039	NC_014802	TGCTT	2	10	248354	248363	0 %	60 %	20 %	20 %	315123844
5040	NC_014802	CTG	2	6	248404	248409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315123844
5041	NC_014802	ACC	2	6	248414	248419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315123844
5042	NC_014802	ACC	2	6	248480	248485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315123844
5043	NC_014802	ATG	2	6	248552	248557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123844
5044	NC_014802	TAG	2	6	248590	248595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123844
5045	NC_014802	T	6	6	248632	248637	0 %	100 %	0 %	0 %	315123844
5046	NC_014802	T	6	6	248675	248680	0 %	100 %	0 %	0 %	315123844
5047	NC_014802	TCT	2	6	248688	248693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315123844
5048	NC_014802	GTG	2	6	248730	248735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315123844
5049	NC_014802	T	6	6	248762	248767	0 %	100 %	0 %	0 %	315123844
5050	NC_014802	CAT	2	6	248795	248800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123844
5051	NC_014802	TTG	2	6	249035	249040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315123844
5052	NC_014802	ACA	2	6	249063	249068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315123844
5053	NC_014802	CCA	2	6	249204	249209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315123844
5054	NC_014802	TTGCAC	2	12	249214	249225	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	315123844
5055	NC_014802	T	7	7	249241	249247	0 %	100 %	0 %	0 %	315123844
5056	NC_014802	TCA	2	6	249276	249281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123844
5057	NC_014802	CAG	2	6	249397	249402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315123844
5058	NC_014802	T	6	6	249436	249441	0 %	100 %	0 %	0 %	315123844
5059	NC_014802	TGC	2	6	249503	249508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315123844
5060	NC_014802	T	6	6	249525	249530	0 %	100 %	0 %	0 %	315123844
5061	NC_014802	TCT	2	6	249632	249637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315123844
5062	NC_014802	T	7	7	249682	249688	0 %	100 %	0 %	0 %	315123845
5063	NC_014802	T	6	6	249717	249722	0 %	100 %	0 %	0 %	315123845
5064	NC_014802	TTCTTT	2	12	249783	249794	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	315123845
5065	NC_014802	T	6	6	249879	249884	0 %	100 %	0 %	0 %	315123845
5066	NC_014802	GA	3	6	249944	249949	50 %	0 %	50 %	0 %	315123845
5067	NC_014802	AATTT	2	10	249950	249959	40 %	60 %	0 %	0 %	315123845
5068	NC_014802	CAA	2	6	249980	249985	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315123845
5069	NC_014802	AAAT	2	8	250006	250013	75 %	25 %	0 %	0 %	315123845
5070	NC_014802	ATC	2	6	250128	250133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123845
5071	NC_014802	TCA	2	6	250159	250164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123845
5072	NC_014802	T	6	6	250177	250182	0 %	100 %	0 %	0 %	315123845
5073	NC_014802	ACA	2	6	250204	250209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315123845
5074	NC_014802	ATT	2	6	250746	250751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315123846
5075	NC_014802	GGA	2	6	250759	250764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315123846
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5077	NC_014802	TCC	2	6	250890	250895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315123846
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5079	NC_014802	ATTG	3	12	251045	251056	25 %	50 %	25 %	0 %	315123846
5080	NC_014802	AT	3	6	251070	251075	50 %	50 %	0 %	0 %	315123846
5081	NC_014802	TAG	2	6	251093	251098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123846
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5083	NC_014802	GCAAA	2	10	251167	251176	60 %	0 %	20 %	20 %	315123846
5084	NC_014802	GCA	2	6	251778	251783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315123847
5085	NC_014802	AGC	2	6	252047	252052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315123847
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5087	NC_014802	CTT	2	6	252064	252069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315123847
5088	NC_014802	AAT	2	6	252161	252166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315123847
5089	NC_014802	TTGG	2	8	252205	252212	0 %	50 %	50 %	0 %	315123847
5090	NC_014802	CTT	2	6	252235	252240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315123847
5091	NC_014802	TAG	2	6	252268	252273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123847
5092	NC_014802	TTC	2	6	252278	252283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315123847
5093	NC_014802	ACA	2	6	252300	252305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315123847
5094	NC_014802	AAC	2	6	252323	252328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315123847
5095	NC_014802	ATTTT	2	10	252339	252348	20 %	80 %	0 %	0 %	315123847
5096	NC_014802	TAA	2	6	252472	252477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315123847
5097	NC_014802	ACCTGA	2	12	252479	252490	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	315123847
5098	NC_014802	T	6	6	252562	252567	0 %	100 %	0 %	0 %	315123847
5099	NC_014802	TGT	2	6	252626	252631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315123847
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5101	NC_014802	GA	3	6	252724	252729	50 %	0 %	50 %	0 %	315123847
5102	NC_014802	AAATT	2	10	252747	252756	60 %	40 %	0 %	0 %	315123847
5103	NC_014802	TGAAAT	2	12	252766	252777	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	315123847
5104	NC_014802	GTT	3	9	252785	252793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315123847
5105	NC_014802	T	8	8	252816	252823	0 %	100 %	0 %	0 %	315123847
5106	NC_014802	AAT	2	6	252829	252834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315123847
5107	NC_014802	ATTT	2	8	252852	252859	25 %	75 %	0 %	0 %	315123847
5108	NC_014802	T	6	6	252862	252867	0 %	100 %	0 %	0 %	315123848
5109	NC_014802	T	6	6	252938	252943	0 %	100 %	0 %	0 %	315123848
5110	NC_014802	TAT	2	6	252971	252976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315123848
5111	NC_014802	A	6	6	253025	253030	100 %	0 %	0 %	0 %	315123848
5112	NC_014802	TCA	2	6	253035	253040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123848
5113	NC_014802	CTT	2	6	253219	253224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315123848
5114	NC_014802	CTT	2	6	253240	253245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315123848
5115	NC_014802	CATG	2	8	253319	253326	25 %	25 %	25 %	25 %	315123848
5116	NC_014802	CTT	2	6	253384	253389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315123848
5117	NC_014802	TCCA	3	12	253748	253759	25 %	25 %	0 %	50 %	315123848
5118	NC_014802	CTG	2	6	253768	253773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315123848
5119	NC_014802	T	7	7	253780	253786	0 %	100 %	0 %	0 %	315123848
5120	NC_014802	ATA	2	6	254278	254283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315123849
5121	NC_014802	TGG	2	6	254336	254341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315123849
5122	NC_014802	ATT	2	6	254355	254360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315123849
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5242	NC_014802	A	8	8	261978	261985	100 %	0 %	0 %	0 %	315123855
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5249	NC_014802	TGG	2	6	262228	262233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315123855
5250	NC_014802	AGA	2	6	262318	262323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315123855
5251	NC_014802	AGAA	2	8	262325	262332	75 %	0 %	25 %	0 %	315123855
5252	NC_014802	TTA	2	6	262344	262349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315123855
5253	NC_014802	ATCA	2	8	262361	262368	50 %	25 %	0 %	25 %	315123855
5254	NC_014802	A	6	6	262372	262377	100 %	0 %	0 %	0 %	315123855
5255	NC_014802	CAA	2	6	262386	262391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315123855
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5257	NC_014802	ATG	2	6	262488	262493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123855
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5260	NC_014802	TAC	2	6	263590	263595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123856
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5262	NC_014802	CGT	2	6	263738	263743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315123856
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5264	NC_014802	TTTA	2	8	263759	263766	25 %	75 %	0 %	0 %	315123856
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5270	NC_014802	T	6	6	263923	263928	0 %	100 %	0 %	0 %	315123856
5271	NC_014802	TTAA	2	8	263986	263993	50 %	50 %	0 %	0 %	315123856
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5280	NC_014802	A	6	6	264511	264516	100 %	0 %	0 %	0 %	315123857
5281	NC_014802	AAG	2	6	264571	264576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315123857
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5289	NC_014802	TTTAA	2	10	264801	264810	40 %	60 %	0 %	0 %	315123857
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5299	NC_014802	A	6	6	265451	265456	100 %	0 %	0 %	0 %	315123858
5300	NC_014802	CATGG	2	10	265471	265480	20 %	20 %	40 %	20 %	315123858
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5363	NC_014802	CATTT	2	10	269343	269352	20 %	60 %	0 %	20 %	315123861
5364	NC_014802	TCA	2	6	269374	269379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315123861
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5368	NC_014802	TTGAT	2	10	269498	269507	20 %	60 %	20 %	0 %	315123862
5369	NC_014802	TGA	2	6	269513	269518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123862
5370	NC_014802	T	7	7	269568	269574	0 %	100 %	0 %	0 %	315123862
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5497	NC_014802	AGC	2	6	276201	276206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315123870
5498	NC_014802	TA	3	6	276273	276278	50 %	50 %	0 %	0 %	315123870
5499	NC_014802	TTTTTC	2	12	276294	276305	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	315123870
5500	NC_014802	GAT	2	6	276327	276332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315123870

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