MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Chlamydophila psittaci RD1

Total Repeats: 21515

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_014796	TTC	2	6	241854	241859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376430
4503	NC_014796	AGA	2	6	241867	241872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376430
4504	NC_014796	TGA	2	6	241902	241907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376430
4505	NC_014796	TTG	2	6	241952	241957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376430
4506	NC_014796	CGG	2	6	241959	241964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392376430
4507	NC_014796	TTG	2	6	241970	241975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376430
4508	NC_014796	ATT	2	6	242005	242010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376430
4509	NC_014796	ATG	2	6	242075	242080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376430
4510	NC_014796	ATG	2	6	242107	242112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376430
4511	NC_014796	GCA	2	6	242137	242142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376430
4512	NC_014796	AAG	2	6	242159	242164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376430
4513	NC_014796	A	6	6	242182	242187	100 %	0 %	0 %	0 %	392376430
4514	NC_014796	TCA	2	6	242193	242198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376430
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4516	NC_014796	AT	3	6	242333	242338	50 %	50 %	0 %	0 %	392376430
4517	NC_014796	TGA	2	6	242457	242462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376430
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4519	NC_014796	ATT	2	6	242482	242487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376430
4520	NC_014796	TGA	2	6	242526	242531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376430
4521	NC_014796	GAA	2	6	242575	242580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376430
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4523	NC_014796	TTTAG	2	10	242646	242655	20 %	60 %	20 %	0 %	392376430
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4525	NC_014796	T	7	7	242747	242753	0 %	100 %	0 %	0 %	392376431
4526	NC_014796	GCA	2	6	242777	242782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376431
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4528	NC_014796	ATG	2	6	242903	242908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376431
4529	NC_014796	ACT	2	6	242921	242926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376431
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4533	NC_014796	TTTA	2	8	243120	243127	25 %	75 %	0 %	0 %	392376431
4534	NC_014796	ATCG	2	8	243167	243174	25 %	25 %	25 %	25 %	392376431
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4538	NC_014796	CTG	2	6	243382	243387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376432
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4542	NC_014796	GTTGT	2	10	243451	243460	0 %	60 %	40 %	0 %	392376432
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4544	NC_014796	GGTA	2	8	243516	243523	25 %	25 %	50 %	0 %	392376432
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4551	NC_014796	AAAG	2	8	243987	243994	75 %	0 %	25 %	0 %	392376432
4552	NC_014796	TTA	2	6	244172	244177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	392376433
4553	NC_014796	TTTA	2	8	244230	244237	25 %	75 %	0 %	0 %	392376433
4554	NC_014796	AAG	2	6	244284	244289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376433
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4557	NC_014796	GCA	2	6	244513	244518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376433
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4560	NC_014796	GAA	2	6	244589	244594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376433
4561	NC_014796	GTT	2	6	244684	244689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376433
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4563	NC_014796	TTTCCT	2	12	244837	244848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392376433
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4565	NC_014796	GA	3	6	244973	244978	50 %	0 %	50 %	0 %	392376433
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4570	NC_014796	T	8	8	245186	245193	0 %	100 %	0 %	0 %	392376434
4571	NC_014796	GTT	2	6	245222	245227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392376434
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4579	NC_014796	TTATC	2	10	245756	245765	20 %	60 %	0 %	20 %	392376434
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4592	NC_014796	AGC	2	6	246283	246288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392376435
4593	NC_014796	ATGG	2	8	246390	246397	25 %	25 %	50 %	0 %	392376435
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4599	NC_014796	G	6	6	246817	246822	0 %	0 %	100 %	0 %	392376436
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4603	NC_014796	ATC	2	6	246918	246923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376436
4604	NC_014796	TAACA	2	10	246982	246991	60 %	20 %	0 %	20 %	392376436
4605	NC_014796	TCA	2	6	247090	247095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376436
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4607	NC_014796	GAATC	2	10	247121	247130	40 %	20 %	20 %	20 %	392376436
4608	NC_014796	T	6	6	247141	247146	0 %	100 %	0 %	0 %	392376436
4609	NC_014796	GTTT	2	8	247242	247249	0 %	75 %	25 %	0 %	392376436
4610	NC_014796	GTA	2	6	247272	247277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376436
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4613	NC_014796	TAG	2	6	247445	247450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376436
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4615	NC_014796	GGA	2	6	247467	247472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392376436
4616	NC_014796	GTA	2	6	247473	247478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392376436
4617	NC_014796	ACA	2	6	247480	247485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392376436
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4620	NC_014796	ATC	2	6	247608	247613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392376436
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4992	NC_014796	CGTGG	2	10	266942	266951	0 %	20 %	60 %	20 %	392376455
4993	NC_014796	G	6	6	266950	266955	0 %	0 %	100 %	0 %	392376455
4994	NC_014796	AAG	2	6	266965	266970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376455
4995	NC_014796	GTAA	2	8	267029	267036	50 %	25 %	25 %	0 %	392376455
4996	NC_014796	CAAG	2	8	267175	267182	50 %	0 %	25 %	25 %	392376455
4997	NC_014796	AAGAT	2	10	267198	267207	60 %	20 %	20 %	0 %	392376455
4998	NC_014796	AAGA	2	8	267236	267243	75 %	0 %	25 %	0 %	392376455
4999	NC_014796	AAG	2	6	267288	267293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392376455
5000	NC_014796	CTG	2	6	267318	267323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392376455

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