MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 chromosome

Total Repeats: 14550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014774	CTT	2	6	548	553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121752
2	NC_014774	TCA	2	6	583	588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121752
3	NC_014774	CAT	2	6	680	685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121752
4	NC_014774	CAT	2	6	764	769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121752
5	NC_014774	AAT	2	6	778	783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121752
6	NC_014774	GCA	2	6	790	795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121752
7	NC_014774	CGC	2	6	883	888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315121752
8	NC_014774	GAT	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121752
9	NC_014774	CAT	3	9	950	958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121752
10	NC_014774	ACA	2	6	1138	1143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121752
11	NC_014774	AGA	2	6	1194	1199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121752
12	NC_014774	TTG	2	6	1286	1291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121752
13	NC_014774	AGA	2	6	1419	1424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121752
14	NC_014774	TTC	2	6	1426	1431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121752
15	NC_014774	CAA	2	6	1955	1960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121753
16	NC_014774	GAT	2	6	1964	1969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121753
17	NC_014774	CAT	2	6	2025	2030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121753
18	NC_014774	CAA	2	6	2052	2057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121753
19	NC_014774	TAA	2	6	2203	2208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121753
20	NC_014774	AAC	2	6	2229	2234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121753
21	NC_014774	TCC	2	6	2260	2265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121753
22	NC_014774	CAA	2	6	2316	2321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121753
23	NC_014774	TGT	2	6	2324	2329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121753
24	NC_014774	ATT	2	6	2416	2421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121753
25	NC_014774	ACT	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121753
26	NC_014774	TTG	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121753
27	NC_014774	TAA	2	6	2681	2686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
28	NC_014774	AAT	2	6	2709	2714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
29	NC_014774	CAT	2	6	2737	2742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121754
30	NC_014774	TTG	2	6	2762	2767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121754
31	NC_014774	ATA	2	6	2774	2779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
32	NC_014774	TAT	2	6	2870	2875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121754
33	NC_014774	ATT	2	6	3030	3035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121754
34	NC_014774	GAA	2	6	3045	3050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121754
35	NC_014774	ATT	2	6	3068	3073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121754
36	NC_014774	AAT	2	6	3075	3080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
37	NC_014774	TAA	2	6	3125	3130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
38	NC_014774	AAT	2	6	3225	3230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
39	NC_014774	TGT	2	6	3285	3290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121754
40	NC_014774	TAA	2	6	3335	3340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
41	NC_014774	AAT	2	6	3371	3376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
42	NC_014774	CCA	2	6	3386	3391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121754
43	NC_014774	ATC	2	6	3407	3412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121754
44	NC_014774	AAT	2	6	3426	3431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
45	NC_014774	TTA	2	6	3531	3536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121754
46	NC_014774	TAG	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121754
47	NC_014774	CCT	2	6	3597	3602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121754
48	NC_014774	TAG	2	6	3616	3621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121754
49	NC_014774	GCC	2	6	3673	3678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315121754
50	NC_014774	CAA	2	6	3694	3699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121754
51	NC_014774	GTT	2	6	3748	3753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121754
52	NC_014774	CAA	2	6	3824	3829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121754
53	NC_014774	CAC	2	6	3935	3940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121754
54	NC_014774	ATA	2	6	4048	4053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
55	NC_014774	AAT	2	6	4085	4090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121754
56	NC_014774	AAG	2	6	4169	4174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121754
57	NC_014774	TCT	2	6	4289	4294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121755
58	NC_014774	AAC	2	6	4544	4549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121755
59	NC_014774	TAA	2	6	4779	4784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121755
60	NC_014774	TCA	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121755
61	NC_014774	ATT	2	6	4870	4875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121755
62	NC_014774	ATT	2	6	4960	4965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121755
63	NC_014774	TAA	2	6	5023	5028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121755
64	NC_014774	CAT	2	6	5037	5042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121755
65	NC_014774	AGA	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121755
66	NC_014774	TAA	2	6	5583	5588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121756
67	NC_014774	AAT	2	6	5771	5776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121756
68	NC_014774	AGC	2	6	5789	5794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121756
69	NC_014774	TTC	2	6	5813	5818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121756
70	NC_014774	ATG	2	6	6891	6896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121757
71	NC_014774	ATC	3	9	6929	6937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121757
72	NC_014774	TGT	2	6	6940	6945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121757
73	NC_014774	AGT	2	6	6948	6953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121757
74	NC_014774	AAT	2	6	7107	7112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121757
75	NC_014774	GTA	2	6	7156	7161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121757
76	NC_014774	CAA	2	6	7190	7195	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121757
77	NC_014774	GGA	2	6	7250	7255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315121757
78	NC_014774	AGA	2	6	7298	7303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121757
79	NC_014774	TGG	2	6	7401	7406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315121757
80	NC_014774	AAC	2	6	7446	7451	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121758
81	NC_014774	CAC	2	6	7509	7514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121758
82	NC_014774	GAG	2	6	7575	7580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315121758
83	NC_014774	CTC	2	6	7642	7647	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121758
84	NC_014774	CTA	2	6	7659	7664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121758
85	NC_014774	CGA	2	6	7678	7683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121758
86	NC_014774	ACA	2	6	7748	7753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121758
87	NC_014774	TAC	2	6	8364	8369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121759
88	NC_014774	CGA	2	6	8449	8454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121759
89	NC_014774	GCA	2	6	9100	9105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121760
90	NC_014774	CTT	2	6	9206	9211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121760
91	NC_014774	TCT	2	6	9581	9586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121761
92	NC_014774	ATC	2	6	9640	9645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121761
93	NC_014774	TCA	2	6	9719	9724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121761
94	NC_014774	TCA	2	6	9776	9781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121761
95	NC_014774	TTG	2	6	9804	9809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121761
96	NC_014774	TAA	2	6	9912	9917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121761
97	NC_014774	TCT	2	6	9959	9964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121761
98	NC_014774	TAG	2	6	10104	10109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121761
99	NC_014774	ATC	2	6	10177	10182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121761
100	NC_014774	GCT	2	6	10224	10229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315121761
101	NC_014774	TGG	2	6	10669	10674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315121762
102	NC_014774	ATC	2	6	10729	10734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121762
103	NC_014774	ATT	2	6	10866	10871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121762
104	NC_014774	CCG	2	6	10971	10976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315121762
105	NC_014774	AGC	2	6	11032	11037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121762
106	NC_014774	CTT	2	6	11100	11105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121762
107	NC_014774	AAT	2	6	11143	11148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121762
108	NC_014774	GGA	3	9	11303	11311	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315121762
109	NC_014774	AAT	2	6	11389	11394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121762
110	NC_014774	TCA	2	6	11472	11477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121762
111	NC_014774	ACA	2	6	11487	11492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121762
112	NC_014774	CAA	2	6	11675	11680	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121763
113	NC_014774	CTC	2	6	11841	11846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	315121763
114	NC_014774	CGT	2	6	11980	11985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315121763
115	NC_014774	TCT	2	6	12083	12088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121763
116	NC_014774	GGA	2	6	12099	12104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315121763
117	NC_014774	CTA	2	6	12841	12846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121764
118	NC_014774	GAA	2	6	12852	12857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121764
119	NC_014774	ATA	2	6	12904	12909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121764
120	NC_014774	CTT	2	6	12914	12919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121764
121	NC_014774	AAC	2	6	12958	12963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121764
122	NC_014774	ATA	3	9	13051	13059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121765
123	NC_014774	ATC	2	6	13186	13191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121765
124	NC_014774	ATT	2	6	13237	13242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121765
125	NC_014774	TCA	2	6	13247	13252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121765
126	NC_014774	TAG	2	6	13305	13310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121765
127	NC_014774	ATA	2	6	13352	13357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121765
128	NC_014774	GCA	2	6	13493	13498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121765
129	NC_014774	CAA	2	6	13695	13700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121766
130	NC_014774	ATT	2	6	13951	13956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121766
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