MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Candidatus Liberibacter solanacearum CLso-ZC1 chromosome

Total Repeats: 23860

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014774	GGA	2	6	161744	161749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315121913
3002	NC_014774	A	6	6	161793	161798	100 %	0 %	0 %	0 %	315121913
3003	NC_014774	TCAA	2	8	161816	161823	50 %	25 %	0 %	25 %	315121913
3004	NC_014774	T	6	6	161824	161829	0 %	100 %	0 %	0 %	315121913
3005	NC_014774	ACAA	2	8	161860	161867	75 %	0 %	0 %	25 %	315121913
3006	NC_014774	TCT	2	6	161876	161881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121913
3007	NC_014774	GAG	2	6	161922	161927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315121913
3008	NC_014774	GTT	2	6	161945	161950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121913
3009	NC_014774	A	7	7	161995	162001	100 %	0 %	0 %	0 %	315121913
3010	NC_014774	AGA	2	6	162010	162015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121913
3011	NC_014774	A	6	6	162032	162037	100 %	0 %	0 %	0 %	315121913
3012	NC_014774	A	6	6	162063	162068	100 %	0 %	0 %	0 %	315121913
3013	NC_014774	ATC	2	6	162073	162078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121913
3014	NC_014774	A	7	7	162106	162112	100 %	0 %	0 %	0 %	315121913
3015	NC_014774	TAT	2	6	162187	162192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121913
3016	NC_014774	AGA	2	6	162217	162222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121913
3017	NC_014774	AACA	2	8	162223	162230	75 %	0 %	0 %	25 %	315121913
3018	NC_014774	A	6	6	162232	162237	100 %	0 %	0 %	0 %	315121913
3019	NC_014774	ATA	2	6	162252	162257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121913
3020	NC_014774	TAC	2	6	162373	162378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121913
3021	NC_014774	CT	3	6	162461	162466	0 %	50 %	0 %	50 %	315121913
3022	NC_014774	AAC	2	6	162544	162549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121913
3023	NC_014774	ATT	2	6	162567	162572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121913
3024	NC_014774	GTC	2	6	162573	162578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315121913
3025	NC_014774	TTG	2	6	162582	162587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121913
3026	NC_014774	CAA	2	6	162594	162599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121913
3027	NC_014774	A	6	6	162636	162641	100 %	0 %	0 %	0 %	315121913
3028	NC_014774	ATC	2	6	162655	162660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121913
3029	NC_014774	CGA	2	6	162700	162705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121913
3030	NC_014774	GGA	2	6	162749	162754	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	315121913
3031	NC_014774	ATT	2	6	162853	162858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121913
3032	NC_014774	CG	3	6	162861	162866	0 %	0 %	50 %	50 %	315121913
3033	NC_014774	AATC	2	8	162953	162960	50 %	25 %	0 %	25 %	315121913
3034	NC_014774	ATT	2	6	163066	163071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121913
3035	NC_014774	T	7	7	163167	163173	0 %	100 %	0 %	0 %	315121913
3036	NC_014774	A	7	7	163276	163282	100 %	0 %	0 %	0 %	315121913
3037	NC_014774	GAA	2	6	163352	163357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121913
3038	NC_014774	A	6	6	163395	163400	100 %	0 %	0 %	0 %	315121913
3039	NC_014774	AATGA	2	10	163418	163427	60 %	20 %	20 %	0 %	315121913
3040	NC_014774	ACA	2	6	163491	163496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121913
3041	NC_014774	ACT	2	6	163835	163840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121914
3042	NC_014774	ACG	2	6	163842	163847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121914
3043	NC_014774	CCA	2	6	163851	163856	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	315121914
3044	NC_014774	GAC	2	6	163869	163874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121914
3045	NC_014774	TAT	3	9	163886	163894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121914
3046	NC_014774	ATC	2	6	163959	163964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121914
3047	NC_014774	ATC	2	6	164022	164027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121914
3048	NC_014774	ACA	2	6	164029	164034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121914
3049	NC_014774	CTT	2	6	164110	164115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121914
3050	NC_014774	CAA	2	6	164126	164131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121914
3051	NC_014774	AGA	2	6	164136	164141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121914
3052	NC_014774	ATC	2	6	164193	164198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121914
3053	NC_014774	AAT	2	6	164245	164250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121914
3054	NC_014774	TAT	2	6	164285	164290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121914
3055	NC_014774	GA	3	6	164306	164311	50 %	0 %	50 %	0 %	315121914
3056	NC_014774	CAA	2	6	164438	164443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121914
3057	NC_014774	AAT	2	6	164499	164504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121914
3058	NC_014774	TG	3	6	164507	164512	0 %	50 %	50 %	0 %	315121914
3059	NC_014774	CTT	2	6	164542	164547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121914
3060	NC_014774	AGA	2	6	164565	164570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121914
3061	NC_014774	GAAC	2	8	164575	164582	50 %	0 %	25 %	25 %	315121914
3062	NC_014774	TAC	2	6	164603	164608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121914
3063	NC_014774	AGA	2	6	164634	164639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121914
3064	NC_014774	T	6	6	164713	164718	0 %	100 %	0 %	0 %	315121914
3065	NC_014774	CTT	2	6	164733	164738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121914
3066	NC_014774	ATT	2	6	164751	164756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121914
3067	NC_014774	TTC	2	6	164763	164768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121914
3068	NC_014774	TTC	2	6	164832	164837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121914
3069	NC_014774	TCTG	2	8	164929	164936	0 %	50 %	25 %	25 %	315121914
3070	NC_014774	ATA	2	6	164944	164949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121914
3071	NC_014774	ATG	2	6	164979	164984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	315121914
3072	NC_014774	GA	3	6	165017	165022	50 %	0 %	50 %	0 %	315121914
3073	NC_014774	CAT	2	6	165035	165040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121914
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3075	NC_014774	CT	3	6	165167	165172	0 %	50 %	0 %	50 %	315121914
3076	NC_014774	CTT	2	6	165185	165190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121914
3077	NC_014774	CTG	2	6	165302	165307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315121914
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3079	NC_014774	AAAG	2	8	165454	165461	75 %	0 %	25 %	0 %	315121914
3080	NC_014774	CTT	2	6	165497	165502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121914
3081	NC_014774	AAC	2	6	165504	165509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121914
3082	NC_014774	ACA	2	6	165622	165627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121914
3083	NC_014774	CAT	2	6	165674	165679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121914
3084	NC_014774	CAT	3	9	165698	165706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121914
3085	NC_014774	TTA	2	6	165707	165712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121914
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3087	NC_014774	TTA	2	6	165743	165748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121914
3088	NC_014774	ACA	2	6	165763	165768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121914
3089	NC_014774	AAT	2	6	165799	165804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121914
3090	NC_014774	ATA	2	6	165831	165836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121914
3091	NC_014774	GGAT	2	8	165841	165848	25 %	25 %	50 %	0 %	315121914
3092	NC_014774	AGGA	2	8	165858	165865	50 %	0 %	50 %	0 %	315121914
3093	NC_014774	GCT	2	6	165898	165903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315121914
3094	NC_014774	AAGG	2	8	165907	165914	50 %	0 %	50 %	0 %	315121914
3095	NC_014774	ACA	2	6	166012	166017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121914
3096	NC_014774	TTA	2	6	166057	166062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121914
3097	NC_014774	TGTAT	2	10	166818	166827	20 %	60 %	20 %	0 %	315121915
3098	NC_014774	T	7	7	166854	166860	0 %	100 %	0 %	0 %	315121915
3099	NC_014774	TATTC	2	10	166873	166882	20 %	60 %	0 %	20 %	315121915
3100	NC_014774	ATT	2	6	167034	167039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121915
3101	NC_014774	CTG	2	6	167087	167092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	315121915
3102	NC_014774	CTA	2	6	167106	167111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121915
3103	NC_014774	TAT	2	6	167136	167141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121915
3104	NC_014774	CCTC	2	8	167147	167154	0 %	25 %	0 %	75 %	315121915
3105	NC_014774	A	6	6	167163	167168	100 %	0 %	0 %	0 %	315121915
3106	NC_014774	CTA	2	6	167201	167206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121915
3107	NC_014774	ACA	2	6	167211	167216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	315121915
3108	NC_014774	TCT	2	6	167232	167237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121915
3109	NC_014774	CTTT	2	8	167281	167288	0 %	75 %	0 %	25 %	315121915
3110	NC_014774	A	6	6	167315	167320	100 %	0 %	0 %	0 %	315121915
3111	NC_014774	TGAA	2	8	167336	167343	50 %	25 %	25 %	0 %	315121915
3112	NC_014774	T	8	8	167345	167352	0 %	100 %	0 %	0 %	315121915
3113	NC_014774	AGA	2	6	167424	167429	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121915
3114	NC_014774	GCC	2	6	167431	167436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	315121915
3115	NC_014774	AGC	2	6	167442	167447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	315121915
3116	NC_014774	A	6	6	167484	167489	100 %	0 %	0 %	0 %	315121915
3117	NC_014774	GAA	2	6	167533	167538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121915
3118	NC_014774	TA	3	6	167545	167550	50 %	50 %	0 %	0 %	315121915
3119	NC_014774	CAAAAT	2	12	167573	167584	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	315121915
3120	NC_014774	GAA	2	6	167644	167649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121915
3121	NC_014774	ATT	2	6	167662	167667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	315121915
3122	NC_014774	AGA	2	6	167813	167818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	315121915
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3124	NC_014774	ATCT	2	8	167853	167860	25 %	50 %	0 %	25 %	315121915
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3238	NC_014774	TTG	2	6	174020	174025	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	315121920
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3240	NC_014774	ATGGA	2	10	174086	174095	40 %	20 %	40 %	0 %	315121920
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3243	NC_014774	AACA	2	8	174391	174398	75 %	0 %	0 %	25 %	315121920
3244	NC_014774	ATC	2	6	174404	174409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121920
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3477	NC_014774	AAGC	2	8	186761	186768	50 %	0 %	25 %	25 %	315121933
3478	NC_014774	CT	3	6	186787	186792	0 %	50 %	0 %	50 %	315121933
3479	NC_014774	CAAA	2	8	186864	186871	75 %	0 %	0 %	25 %	315121933
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3483	NC_014774	ATC	2	6	187326	187331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121933
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3491	NC_014774	CAT	2	6	187982	187987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121933
3492	NC_014774	TCT	2	6	188042	188047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121933
3493	NC_014774	TGG	2	6	188193	188198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	315121933
3494	NC_014774	TCT	3	9	188228	188236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	315121933
3495	NC_014774	TCA	2	6	188260	188265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	315121933
3496	NC_014774	ATCC	2	8	188354	188361	25 %	25 %	0 %	50 %	315121933
3497	NC_014774	AAT	2	6	188430	188435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	315121933
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3499	NC_014774	ACTC	2	8	188616	188623	25 %	25 %	0 %	50 %	315121934
3500	NC_014774	AG	3	6	188652	188657	50 %	0 %	50 %	0 %	315121934

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